Especialistas Seniores em Covid-19 com atuação no Brasil

Rafaela Salgado Ferreira

É farmacêutica (UFMG) e doutora em Química e Química Biológica (University of California San Francisco, EUA). Realizou pós-doutorado na Universidade de São Paulo (2010) e atuou como pesquisadora visitante no Centre de Biochimie Structurale (Montpellier, França) em 2018. Desde 2011 é filiada ao Departamento de Bioquímica e Imunologia da UFMG e coordenadora do Laboratório de Modelagem Molecular e Planejamento Fármacos, no qual emprega técnicas computacionais e experimentais para desenvolvimento de novos ligantes para alvos terapêuticos. Trabalha na área de desenvolvimento racional de fármacos desde seu doutorado, com expertise nas áreas de triagem virtual de bases de dados, docking molecular, modelagem comparativa e biologia estrutural. Recentemente teve seu trabalho reconhecido através dos prêmios ?L?Oréal-UNESCO-ABC Para Mulheres na Ciência 2017, Categoria Química? e ?L?Oréal-UNESCO For Women in Science International Rising Talent 2018?. É Bolsista de Produtividade em Pesquisa pelo CNPq (nível 2, Comitê de Biotecnologia) desde 2015. É mãe de um filho, e esteve de licença maternidade de março a setembro de 2019. (Texto informado pelo autor)

  • https://lattes.cnpq.br/7569627567234135 (14/09/2021)
  • Rótulo/Grupo:
  • Bolsa CNPq: Nível 2
  • Período de análise:
  • Endereço: Universidade Federal de Minas Gerais, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Bioquímica e Imunologia. Av. Antônio Carlos, 6627 Pampulha 31270901 - Belo Horizonte, MG - Brasil Telefone: (31) 34093031
  • Grande área: Ciências Exatas e da Terra
  • Área: Química
  • Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

Prêmios e títulos

Participação em eventos

Organização de eventos

Lista de colaborações

Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

  • Total de projetos de pesquisa (13)
    1. 2020-Atual. Aplicacao de calculos de variacao de energia livre baseados em dinamicas moleculares na descoberta de farmacos
      Descrição: O objetivo principal do presente projeto é propor novos inibidores competitivos para os principais alvos de doenças negligenciadas como a Doença de Chagas (Cruzaína), Zika (NS3), e Doença do Sono (Rodesaína), utilizando abordagens in silico de bioinformática estrutural e biologia computacional. Com essas abordagens estimativas de afinidade de dezenas de moléculas no âmbito de uma campanha de otimização de um ou um pequeno grupo de protótipos serão obtidas. As seguintes etapas serão realizadas: (i) quantificar o processo de ligação de pequenos sistemas de um receptor biológico e uma pequena molécula orgânica, perfazendo um total da ordem de 50.000 partículas, para dezenas de moléculas selecionadas através da técnica de adaptative biasing force; (ii) propor modificações estruturais nos compostos com similaridade aos compostos líderes mais promissores, criando possíveis análogos otimizados da série; (iii) Avaliar a diferença de afinidade entre os compostos gerados a partir de cálculo de perturbação de energia livre, de forma a priorizar entre os análogos para avaliação experimental.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (3) . Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador / Lucianna Helene dos Santos - Integrante.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    2. 2017-2018. Desenvolvimento racional de inibidores de proteases para tratamento de doencas negligenciadas
      Descrição: Neste projeto visamos a obtenção de compostos para tratamento das doenças de Chagas e Zika, enfermidades negligenciadas para as quais há urgente necessidade de desenvolvimento de novas terapias. Para tanto, propõe-se estratégias baseada em alvos moleculares essenciais para os agentes etiológicos: as proteases cruzaína, de Trypanosoma cruzi, e NS2B-NS3 do vírus Zika (NS2B-NS3ZV). Desta forma, o objetivo geral da proposta é a otimização de inibidores enzimáticos quanto a sua potência contra a enzimas e atividade em modelos celulares, através de uma abordagem moderna de química medicinal e computacional, o planejamento racional de fármacos baseado na estrutura das proteínas-alvo. Serão empregados como pontos de partida inibidores de cruzaína recentemente descobertos em nosso grupo de pesquisa e inibidores de NS2B-NS3ZV ou de outras proteases homólogas de outros flavivírus, já descritas na literatura. No caso da enzima cruzaína, os inibidores competitivos Amb7 (IC50 = 3 µM) e Amb12 (IC50 = 27 µM) foram selecionados para otimização e desenvolvimento de potenciais candidatos a fármacos. A partir da avaliação de construídas bibliotecas virtuais de análogos destes compostos, empregando a técnica de docking molecular e estruturas cristalográficas da proteína, serão selecionados compostos para síntese e posterior avaliação em ensaios bioquímicos contra a enzima. Com o objetivo de priorizar inibidores seletivos, possivelmente mais seguros para eventual aplicação na clínica, será determinada a potência contra dos compostos também contra as catepsinas humanas L e B. Finalmente, será determinada da potência dos inibidores de cruzaína contra o parasito T. cruzi. O desenvolvimento de inibidores da enzima NS2B-NS3ZV também será realizado de forma racional, empregando a estrutura cristalográfica recentemente determinada para um complexo desta proteína com um inibidor. Para planejamento dos novos inibidores serão também consideradas informações sobre outros já descritos, e de centenas inibidores de enzimas homólogas dos vírus dengue e West Nile. A partir de docking molecular destes compostos e de outros análogos comercialmente disponíveis, serão selecionados os compostos para posterior avaliação contra a enzima. Os inibidores identificados serão também avaliados em neurônios infectados pelo Zika vírus. A partir da abordagem proposta espera-se determinar a relação estrutura-atividade para os compostos Amb7 e Amb12 e obter análogos potentes contra a cruzaína (IC50 idealmente submicromolar) e atividade contra o parasito T. cruzi. Há perspectiva de continuidade do trabalho através de avaliação da atividade em modelos animais de doença de Chagas, além de determinação de outras características relevantes para o desenvolvimento de fármacos, como perfil farmacocinético. A identificação de inibidores de NS2B-NS3ZV capazes de inibir replicação viral contribuirá para validação deste alvo, além de fornecer pontos de partida para futuros esforços de otimização. Assim, moléculas descobertas e caracterizadas no decorrer deste projeto poderão ser otimizadas para emprego na clínica contra duas doenças relevantes no atual contexto brasileiro e mundial.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador. Financiador(es): LOreal Brasil Comercial de Cosmeticos - Auxílio financeiro.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    3. 2016-Atual. Otimizacao de inibidores de cisteino proteases para desenvolvimento de candidatos a farmacos para a Doenca de Chagas e doenca do sono
      Descrição: A doença de Chagas e a doença do sono africana são doenças tropicais negligenciadas, para as quais há necessidade urgente de fármacos com maior eficácia e menor toxicidade. Para tanto, uma estratégia promissora é a identificação de inibidores de proteínas essenciais para o parasito. Neste contexto, as cisteíno-proteases são alvos validados, dado sua importância biológica em diversos processos durante o ciclo de vida parasitário. A enzima cruzaína, principal cisteíno-protease do Trypanosoma cruzi, está entre os alvos terapêuticos mais estudados para a doença de Chagas. Similarmente, a enzima rodesaína, do parasito Trypanosoma brucei, constitui um alvo validado para a doença do sono, sendo essencial para o parasito e importante para a penetração da barreira hematoencefálica. Além de importância biológica destas proteínas, a determinação de estruturas cristalográficas destas em complexo com inibidores forneceu bases para estratégias modernas de planejamento racional de novas moléculas. Finalmente, devido a alta similaridade entre as enzimas cruzaína e rodesaína, comumente inibidores são capazes de inibir ambas, permitindo uma estratégia altamente atrativa de planejamento de fármacos simultaneamente efetivos contra duas doenças. Recentemente avaliamos o conjunto de 400 compostos Malaria box, disponibilizado pela organização Medicines for Malaria Venture, contra as enzimas cruzaína e rodesaína. Dentre os compostos avaliados, 74 causaram pelo menos 50% de inibição de pelo menos uma das enzimas, sendo identificados 52 inibidores de cruzaína e 55 de rodesaína, entre os quais 38 são inibidores de ambas proteínas. Observou-se também que a maioria destas moléculas apresentou atividade inibitória apenas caso fosse pré-incubadasm com a enzima, como é característico de inibidores que se ligam covalentemente a proteínas. No entanto, foram identificados ainda 19 inibidores capazes de inibir estas enzimas mesmo na ausência de incubação, como esperado para inibidores competitivos reversíveis. A partir destes resultados foram selecionadas 15 moléculas para caracterização detalhada, incluindo determinação de sua potência contra cada enzima e o modo de inibição enzimático. Os ensaios confirmatórios incluíram confirmação da atividade inibitória a 10 µM, determinação de IC50, determinação de mecanismo de inibição e ensaios para verificação de agregação, com avaliação da atividade inibitória em diversas concentrações do detergente Triton X-100 e após pré-incubação com albumina bovina. Desta forma foram validados dois inibidores competitivos de cruzaína, Amb7 e Amb12, que foram selecionados como pontos de partida para otimização e desenvolvimento de potenciais candidatos a fármacos. O presente projeto se direciona a este objetivo.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    4. 2014-2017. DETERMINACAO DA ESTRUTURA TRIDIMENSIONAL DA CISTEINO-PROTEASE CPB DE LEISHMANIA BRAZILIENSIS E DESENVOLVIMENTO DE INIBIDORES ENZIMATICOS COMO CANDIDATOS A FARMACOS PARA TRATAMENTO DE LEISHMANIOSE
      Descrição: A leishmaniose é uma doença negligenciada endêmica principalmente nas Américas, na Ásia e na África. No período de 2007 a 2012 foram reportados cerca de 300.000 casos de leismaniose visceral e 1 milhão de casos da forma cutânea da doença. O tratamento atual é baseado em antimoniais pentavalentes, como o estibogluconato de sódio (Pentostan) e o antimoniato de N-metil glucamina (Glucantime), e a segunda escolha de tratamento são os fármacos pentamidina e a anfotericina B que, além de serem tóxicas, são de difícil administração. Outros compostos vêm sendo estudados quanto à sua atividade leishmanicida, porém ainda não se tem um fármaco que apresente um bom índice terapêutico e uma baixa toxicidade. Assim, a procura de novos compostos com maior eficácia contra as Leishmania spp e de baixa toxicidade para as células de mamífero, é necessária. Tendo em vista a necessidade de novos medicamentos para a leishmaniose, propõe-se neste projeto o desenvolvimento de inibidores de cisteíno protease B (CPB) de Leishmania (Viannia) braziliensis. As cisteíno proteases parasitárias são importantes para diversas funções essenciais no ciclo de vida dos parasitos, como nutrição, evasão da resposta imune do hospedeiro, infecção de células e diferenciação dos parasitos. Dezenas de cisteíno proteases foram identificadas em leishmania, sendo a CPB a protease mais estudada. As proteases CPA e CPB são essenciais para autofagia e para diferenciação para amastigotas, e mutantes que não expressam estas enzimas são caracterizados por perda de virulência e redução da infecção em macrófagos e em camundongos. CPB é uma protease do Clan A, família C1 e do tipo semelhante a catepsina L, assim como as enzimas cruzaína e rodesaína, de T. cruzi e T. brucei. Diversas isoformas desta enzima estão presentes em Leishmania (19 isoformas em L. mexicana e 8 em L. major), organizadas em tandem. A expressão desta proteína está relacionada a imunomodulação, envolvendo síntese de IL-4, desenvolvimento da resposta Th2 e inibição de resposta Th1. CPB está envolvida ainda na degradação do fator de transcrição NF-?B, suprimindo a expressão de IL-12. Inibidores de CPB vem sendo propostos através de avaliação de produtos naturais e de triagem experimental em larga escala (high-throughput screening - HTS), empregando biblioteca de compostos de alta diversidade química. Estudos recentes nesta área fornecem importantes informações sobre a enzima CPB como alvo terapêutico. Em primeiro lugar, esta é uma proteína que apresenta alta drogabilidade, ou seja, há alto potencial de modulação por pequenas moléculas com características de fármacos. Além disso, a possibilidade de desenvolvimento de inibidores seletivos para enzimas parasitárias é importante para evitar toxicidade de medicamentos que atuem por inibição de CPB. Finalmente, este estudo ilustra o potencial de descoberta de inibidores de CPB a partir da avaliação de inibidores de enzimas homólogas. Associado a importância biológica da CPB, estas informações motivam a proposta de caracterização estrutural e de desenvolvimento de inibidores desta enzima, proposta neste projeto. Para tanto, propõe-se o emprego de técnicas de biologia estrutural, triagem de inibidores de cisteíno-proteases e parasitologia. Através do emprego da técnica de cristalografia, pretende-se determinar a estrutura tridimensional desta enzima, permitindo a futura aplicação de técnicas de planejamento racional de fármacos, como docking molecular e dinâmica molecular. A triagem experimental de inibidores de cisteíno-proteases, por enzimologia, e a subsequente avaliação da atividade anti-parasitária dos compostos, permitirão a descoberta e caracterização de compostos que posteriormente podem ser otimizados para o desenvolvimento de fármacos para tratamento de leishmaniose.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (5) . Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador / renata b. de oliveira - Integrante / ana cristina lima leite - Integrante / Ronaldo A P Nagem - Integrante / carlos roberto alves - Integrante / Saulo Fernandes de Andrade - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    5. 2014-2016. Descoberta E Planejamento Racional De Inibidores De Cisteino- E Metaloproteases: Potenciais Candidatos A Farmacos Para Doencas Negligenciadas
      Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador / Oliveira, Renata B. de - Integrante / lucas bleicher - Integrante / Liza Figueiredo Felicori Vilela - Integrante / Ronaldo A P Nagem - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Bolsa.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    6. 2014-2015. Competicao Internacional de Sistemas Biologicos Modificados ( iGEM) Desenvolvimento de uma bacteria detectora de multiplos marcadores prognosticos de Doencas Cardiovasculares
      Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Integrante / Liza Figueiredo Felicori Vilela - Coordenador / Clara Guerra Duarte - Integrante / Carlos Alberto Xavier Gonçalves - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    7. 2013-2020. Rede de Cooperacao Academica para o Estudo e Desenvolvimento de Ferramentas para a Genomica Estrutural e Funcional
      Descrição: A UFMG e a USP têm tradicionalmente apoiado iniciativas inovadoras, incentivando áreas de vanguarda na pesquisa e promovendo a excelência em seus programas de Pós-graduação. Como parte desta política, entre os anos de 2002 e 2003, em resposta ao edital BIOMICRO induzido pela CAPES, ambas as Universidades criaram Programas de Doutorado em Bioinformática. Na UFMG, a iniciativa congregou os Departamentos de Bioquímica e Imunologia (DBI) e de Ciência da Computação (DCC) juntamente com cinco outros Departamentos pertencentes aos Institutos de Ciências Biológicas e de Ciências Exatas e Escola de Engenharia. O programa da UFMG está sediado no Instituto de Ciências Biológicas, que concentra o maior número de professores do curso. Na USP a iniciativa congregou 6 escolas: Instituto de Matemática e Estatística, Instituto de Química, Instituto de Biociências, Instituto de Ciências Biomédicas, Faculdade de Medicina Veterinária, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, e Instituto de Física de São Carlos. O programa da USP está sediado no Instituto de Matemática e Estatística. Até poucos anos atrás estes eram os dois únicos programas do gênero existentes no País. A relação entre os dois programas foi sempre de grande parceria e várias ações conjuntas foram tomadas sem um vínculo oficial. Por outro lado, entre o Programa de Bioinformática da UFMG e o programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular da UFPA existe uma parceria oficial desde 2008, com a aprovação do projeto Procad entre os Professores Vasco Azevedo e Artur Silva. Deste projeto já resultaram muitos benefícios com o compartilhamento de competências, tecnologias e infra-estruturas. Hoje o Professor Vasco Azevedo e Artur Silva são professores permanentes nos dois programas. Da iniciativa PROCAD UFMG UFPA formaram-se, em três turmas induzidas em bioinformática, 30 mestres e 10 doutores, sendo que 5 destes egressos atualmente são professores concursados na UFPA e atuam no ensino de graduação e pós-graduação em bioinformática para os cursos de Ciências Biológicas, Biotecnologia e Biomedicina. Nesta parceria houve um marco que deve ser destacado que foi o fato de sermos o maior depositário de genomas completos juntos ao NCBI na América Latina, através da Rede Paraense de Genômica e Proteômica. Graças ao apoio recebido através da CAPES Procad a UFPA estará submetendo a CAPES proposta de criação de um curso de Bioinformática em nível de pós-graduação, vinculado ao futuro Instituto de Biotecnologia. Esta proposta congregará professores dos Institutos de Ciências Biológicas, Exatas e da Saúde e será o primeiro programa desta natureza na Amazônia. Na UFPR, os primeiros passos relacionados à Bioinformática iniciaram no ano 2005 com a colaboração entre o Núcleo de Fixação de Nitrogênio (NFN) do Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular (Setor de Ciências Biológicas) e o curso de Tecnologia em Sistemas de Informação (TSI - Setor de Educação Profissional e Tecnológica - SEPT). O NFN coordena, desde 2008, o INCT da Fixação Biológica de Nitrogênio e dispõe de infra-estrutura de ponta para geração de dados biológicos nas áreas de genômica, transcriptômica, proteômica e metagenômica. Os projetos desenvolvidos pelo PPG em Bioinformática da UFPR permitiram a aquisição de expertise na aplicação de técnicas de Inteligência Artificial (IA) para montagem, fechamento e anotação de genomas de procariotos. Desde então, técnicas para validação de montagens de genomas, de reconhecimento de padrões em biologia molecular tem sido aplicada com sucesso. Em 2012, os Programas de Bioinformática da UFMG e UFPR, liderados pelos docentes José Miguel Ortega (UFMG) e Emanuel Maltempi de Souza (UFPR), iniciaram uma parceria de trabalho fomentada pelo projeto Procad nas áreas de Genômica, Proteômica e Sistemas de Bioinformação (tecnologia Web Service). O projeto já viabilizou compartilhamento. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Integrante / lucas bleicher - Integrante / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Coordenador / Liza Figueiredo Felicori Vilela - Integrante / Miguel L Ortega - Integrante / Alan Mitchell Durham - Integrante / Artur Luiz da Costa da Silva - Integrante / Maria Berenice Reynaud Steffens - Integrante.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
      Descrição: CAPES Edital nº 51/2013 BIOLOGIA COMPUTACIONAL. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Artur Luis da Costa da Silva - Integrante / Vasco - Coordenador / CARNEIRO, ADRIANA - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    8. 2013-2017. Rational development of cysteine and metalloprotease inhibitors as leads for neglected diseases drug development
      Descrição: Despite the high prevalence of neglected diseases, there is very low investment from pharmaceutical companies in this field, and the need for new treatments is urgent. Therefore, there is interest in the discovery of inhibitors of proteins which are essential for the development of such diseases. In this project we propose to develop new inhibitors for key enzymes involved in Chagas disease, African sleeping sickness and in the toxic effects of snake venom bites. In all cases the currently available therapies are inadequate, presenting efficacy and toxicity problems. The targets chosen in this work are the cysteine proteases cruzain and rhodesain, targets for Chagas disease and African sleeping sickness, respectively, and the metalloproteases atroxlysin-I and leucurolysin-a, important toxins from snake venoms. These proteins have been chosen based on their validation as molecular targets and on the availability of structural information, which will be extremely helpful to allow rational drug design strategies. We propose to employ several computational techniques in the discovery and development of protease inhibitors, making the process more rational, efficient and cheaper than solely experimental approaches. Initially, to discover new classes of inhibitors, we will apply virtual screening of large compound databases. Then, the optimization of the compounds discovered will be guided by molecular dynamics simulations and free energy calculations. All hypothesis provided by computational experiments will be experimentally validated, with determination of the potency and mechanism of action of all inhibitors. The most promising compounds will also be co-crystalized with the respective enzymes, providing a solid basis for further rational development of more potent inhibitors. In the case of cruzain and rhodesain inhibitors, compounds will also be evaluated against the relevant parasites.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (2) . Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador / klaus liedl - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    9. 2013-2014. Estudos de relacao estrutura-atividade e modelagem molecular de uma serie de tiosemicarbazonas contra as enzimas parasitarias rodesaina e cruzaina
      Descrição: A doença de Chagas e a doença do sono são classificadas como doenças parasitárias negligenciadas, pois apesar de sua alta prevalência e impacto social, os poucos fármacos disponíveis para o seu tratamento apresentam problemas quanto à eficácia, toxicidade ou custos elevados. Portanto, há necessidade de descoberta de novos candidatos a fármacos para estas enfermidades, sendo importante a identificação de alvos moleculares cuja modulação promova a cura das respectivas doenças. As cisteíno-proteases destacam-se entre os alvos identificados para diversas doenças parasitárias por desempenhar diversas funções nos ciclos de vida dos parasitos. Neste projeto propõe-se a otimização de inibidores das cisteíno-proteases cruzaína de Trypanosoma cruzi e rodesaína de Trypanosoma brucei. A partir de um inibidor da rodesaína previamente identificado pelo nosso grupo, foi sintetizada uma série de análogos, que também foram avaliados contra esta enzima. Neste projeto propõe-se a avaliação destes compostos contra a cruzaína, em ensaios bioquímicos e por modelagem molecular. Estes estudos permitirão a identificação de novos inibidores de cruzaína, determinação de diferenças de relação estrutura-atividade (REA) para essas enzimas e estabelecimento das bases moleculares para as diferenças observadas. Os inibidores identificados serão também avaliados contra os parasitos T. cruzi e T. brucei, permitindo que sejam identificados compostos-líder para o desenvolvimento de novos fármacos. Valor concedido: R$ 7.000. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    10. 2012-2014. Planejamento Racional, Sintese e Avaliacao da Atividade Tripanocida de Inibidores Potenciais da Tripanotiona Redutase: Base para o Desenvolvimento de Novos Farmacos para Tratamento da Doenca de Chagas
      Descrição: A busca de alvos que possam ser explorados no desenvolvimento de novos fármacos tripanocidas é de extrema importância em vista dos problemas relacionados à quimioterapia existente para o tratamento da doença de Chagas. A tripanotiona redutase (TR) é uma enzima fundamental para os tripanosomatídeos, pois mantém um ambiente redutor no interior do parasito, evitando, assim, a morte do mesmo por stress oxidativo. Além disso, a estrutura desta enzima apresenta diferenças significativas em relação à da glutationa redutase, enzima com função correspondente no homem. A diferença estrutural entre estas enzimas é importante, pois permite o planejamento de fármacos mais seletivos e, conseqüentemente, menos tóxicos. Estas características tornam a TR um alvo promissor para ser explorado e a busca de inibidores desta enzima é uma alternativa que merece ser estudada. Dando continuidade aos trabalhos de pesquisa desenvolvidos por nosso grupo na busca de novos agentes tripanocidas e inibidores da TR, objetivou-se no presente projeto, a síntese e avaliação biológica de novos inibidores potenciais da TR. A estrutura desses inibidores foi planejada utilizando-se diarilfuranos inibidores da TR como protótipos. Ensaios de inibição da enzima TR pelos compostos planejados e sintetizados nesse trabalho serão conduzidos in vitro. Em paralelo, serão realizados ensaios com enzima GR, para avaliação da seletividade dos compostos. Todos os compostos sintetizados também serão avaliados in vitro contra T. cruzi.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Integrante / renata b. de oliveira - Coordenador / thais h a silva - Integrante / Alvaro Jose Romanha - Integrante / Policarpo A. S. Júnior - Integrante / Saulo F. P. Braga - Integrante / Mario Steindel - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    11. 2012-2014. PLANEJAMENTO RACIONAL, SINTESE E AVALIACAO DA ATIVIDADE BIOLOGICA DE INIBIDORES DAS ENZIMAS CRUZAINA E RODESAINA PARA DESENVOLVIMENTO DE CANDIDATOS A FARMACOS PARA TRATAMENTO DE TRIPANOSSOMIASES
      Descrição: A doença de Chagas e a doença do sono são doenças parasitárias negligenciadas, pois apesar de sua alta prevalência e impacto social, os fármacos disponíveis para o seu tratamento são escassos e apresentam problemas quanto à eficácia, toxicidade ou custos elevados. Portanto, há necessidade de descoberta de novos candidatos a fármacos para estas enfermidades, sendo importante a identificação de alvos moleculares cuja modulação promova a cura das respectivas doenças. Dentre os alvos validados para diversas doenças parasitárias, destacam-se as cisteíno-proteases, que desempenham diversas funções nos ciclos de vida dos parasitos. Neste projeto propõe-se a descoberta de inibidores das cisteíno-proteases cruzaína de Trypanosoma cruzi e rodesaína de Trypanosoma brucei. Para tanto propõe-se a otimização de um inibidor de cruzaína previamente descrito, através das técnicas de planejamento racional de fármacos e simplificação molecular, e o emprego de triagem experimental de bases de dados, possibilitando a descoberta de novas classes de inibidores. Os compostos desenvolvidos serão caracterizados quanto a sua potência e mecanismo de ação contra as enzimas, atividade antiparasitária, citotoxicidade e toxicidade aguda em camundongos. Deste modo, serão caracterizados quanto a diversas propriedades relevantes para o desenvolvimento de medicamento, fornecendo bases essenciais para a validação de novos candidatos a fármacos contra estas doenças.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (1) . Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador / Oliveira, Renata B. de - Integrante / ronaldo alves pinto nagem - Integrante / Filipe Silva Villela - Integrante / Saulo Fehelberg Pinho Braga - Integrante / Conor Caffrey - Integrante / Luana Faria da Cruz - Integrante / Pollyanne Lacerda Coelho - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    12. 2012-2014. Sintese e Avaliacao da Atividade Esquistossomicida de Nitroaromaticos: Base para o Desenvolvimento de Novos Farmacos para Tratamento da Esquistossomose
      Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Integrante / renata b. de oliveira - Coordenador / Conor Caffrey - Integrante / elaine maria de souza fagundes - Integrante / Marcela Silva Lopes - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    13. 2012-2013. APLICACAO DE TRIAGEM EXPERIMENTAL,TRIAGEM VIRTUAL E PLANEJAMENTO RACIONAL DE FARMACOS PARA TRATAMENTO DE TRIPANOSSOMIASES E ESQUISTOSSOMOSE: DESCOBERTA DE INIBIDORES DE CISTEINO-PROTEASES PARASITARIAS
      Descrição: A doença de Chagas, a doença do sono e a esquistossomose são classificadas como doenças parasitárias negligenciadas, pois apesar de sua alta prevalência e impacto social, os fármacos disponíveis para o seu tratamento são escassos e apresentam problemas quanto à eficácia, toxicidade ou custos elevados. Portanto, há necessidade de descoberta de novos candidatos a fármacos para estas enfermidades, sendo importante a identificação de alvos moleculares cuja modulação promova a cura das respectivas doenças. Dentre os alvos identificados para diversas doenças parasitárias, destacam-se as cisteíno-proteases, que desempenham diversas funções nos ciclos de vida dos parasitos. Neste projeto propõe-se a descoberta de inibidores das cisteíno-proteases cruzaína de Trypanosoma cruzi, rodesaína de Trypanosoma brucei e SmCB1 de Schistosoma mansoni. Para tanto propõe-se o emprego de triagem experimental e triagem virtual de bases de dados, seguida pela validação bioquímica dos compostos ativos. A seguir, a determinação do mecanismo de ação dos inibidores e de estruturas cristalográficas dos complexos enzima ? inibidor permite a otimização destes a partir do planejamento racional de fármacos.O presente projeto consiste em uma abordagem multidisciplinar, com o emprego de técnicas computacionais em conjunto com técnicas experimentais de bioquímica e biologia estrutural, além de incluir colaborações com grupos de parasitologia e síntese orgânica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rafaela Salgado Ferreira - Coordenador. Financiador(es): Universidade Federal de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.

Prêmios e títulos

  • Total de prêmios e títulos (15)
    1. Prêmio "International Rising Talents", L'Oréal-UNESCO For Women in Science.. 2018.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    2. Honra ao Mérito concedida a Thales do Valle Moreira, pela apresentação do poster ?Investigação de inibidores da cruzaína e rodesaína por triagem virtual e experimental da Pathogens box?, IX Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos (LNCC, 2018).. 2018.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    3. Honra ao Mérito concedida a Elany Barbosa da Silva, pela apresentação do poster ?Otimização e avaliação biológica de uma classede inibidores competitivos das enzimas parasitárias cruzaína e rodesaína?, IX Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos (LNCC, 2018).. 2018.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    4. Honra ao Mérito concedida a Luan Carvalho Martins,pela apresentação do poster ?Investigation of the binding mode of a novel cruzain inhibitor by docking, molecular dynamics, ab initio and MM/PBSA, IX Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos (LNCC, 2018).. 2018.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    5. Indicação como um dos 12 ?Mineiros do Ano de 2017?, Revista Encontro.. 2018.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    6. Bolsa de Produtividade CNPq nivel PQ2 - Descoberta e otimização de inibidores de proteases para desenvolvimento de candidatos a fármacos para tratamento de doenças negligenciadas - vigência 2018-2022, CNPq.. 2018.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    7. Prêmio Para Mulheres na Ciência - Categoria Química, L?Oréal, Unesco e Academia Brasileira de Ciências.. 2017.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    8. Prêmio de melhor poster para Raoni A. Souza, pelo trabalho ?Assessing the interactions between snake venom metalloproteinases and hydroxamate compounds inhibitors using molecular dynamics...", IV Escola brasileira de modelagem molecular.. 2017.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    9. Melhor trabalho na categoria - Best Education and Public Engagement, Overgrad, na competição "International Genetically Engineered Machine (iGEM) 2015", International Genetically Engineered Machine (iGEM).. 2015.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    10. Trabalho selecionado entre os cinco melhores na categoria Best Integrated Human Practices, Overgrad", competição "International Genetically Engineered Machine (iGEM) Competition 2015 - Giant Jamboree", International Genetically Engineered Machine (iGEM).. 2015.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    11. Prêmio de melhor poster para Raoni A. Souza, pelo trabalho ?Molecular simulations of snake venom metalloproteinases complexed with broad-spectrum hydroxamate inhibitors?, 44a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular.. 2015.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    12. Prêmio de melhor poster para Raoni de Almeida Souza, pelo trabalho ?Structural comparative modeling of a snake venoms metalloproteinases atroxlysin-I?, II Escola brasileira de modelagem molecular.. 2013.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    13. Menção honrosa para Raoni de Almeida Souza, pelo trabalho ?Identification of inhibitors of snake venom class P-I metalloproteases using molecular modeling techniques?, 9th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biolo.. 2013.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    14. Global Health Travel Award - Congresso: Drug Discovery for Protozoan Parasites, Keystone Symposia.. 2012.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.
    15. Menção honrosa para Raoni de Almeida Souza, pelo trabalho ?Identification of snake venom class P-I metalloproteases inhibitors using molecular simulation and docking methodologies?, 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biolo.. 2012.
      Membro: Rafaela Salgado Ferreira.

Participação em eventos

  • Total de participação em eventos (40)
    1. ISCB-Latin America, SoIBio and BioNetMx Virtual Symposium.Women in STEM panel. 2020. (Simpósio).
    2. Gordon Research Conference on Proteolytic Enzymes and Their Inhibitors. Discovery and Characterization of Parasitic Cysteine Protease Inhibitors from ?Open Access Malaria Box?. 2018. (Congresso).
    3. World Science Day for Peace and Development - UNESCO.The Human right to science and the rights of scientific researchers: accessibility and equality of opportunities. 2018. (Outra).
    4. XLIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Biofísica. RATIONAL DRUG DESIGN TOWARDS NEW TREATMENTS FOR NEGLECTED AND EMERGING DISEASES. 2018. (Congresso).
    5. Computer Aided Drug Design Gordon Research Conference. Discovery, Characterization and Computer-Aided Optimization of New Classes of Cruzain and Rhodesain Inhibitors Among Malaria Box Compounds. 2017. (Congresso).
    6. II WORKSHOP BIOTECNOLOGIA EM PRODUTOS FARMACÊUTICOS: DESENVOLVIMENTO, PRODUÇÃO E REGULAMENTAÇÃO.Triagem Virtual no Planejamento e Desenvolvimento de Fármacos. 2016. (Simpósio).
    7. 44a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. NOVEL THIOPHENOL-THIOSEMICARBAZONES DERIVATIVES AS CRUZAIN INHIBITORS. 2015. (Congresso).
    8. I Curso de Verão de Engenharia de Máquinas Biológicas.Introdução a Biologia Molecular. 2015. (Oficina).
    9. III WORKSHOP EM MÉTODOS COMPUTACIONAIS APLICADOS ÀS CIÊNCIAS FARMACÊUTICAS - PROF. SUELY LINS GALDINO.Triagem virtual: uma abordagem racional para descoberta de moléculas bioativas. 2015. (Simpósio).
    10. International Genetically Engeneered Machine (iGEM) Competition 2015 - Giant Jamboree. Leishmania: from pathogens to drug delivery systems. 2015. (Olimpíada).
    11. I Workshop de Jovens Pesquisadores em Planejamento e Desenvolvimento de Fármacos.Descoberta e Otimização de Inibidores das Enzimas Cruzaína e Rodesaína. 2015. (Simpósio).
    12. X European Workshop in Drug Design. Discovery and Characterization of Cruzain and Rhodesain Small Molecule Inhibitors Through Experimental Screening. 2015. (Congresso).
    13. 1st Symposium on Current Topics in Molecular Biophysics.Analysis of the interaction between Coq10 protein and Q6 coenzyme through comparative modelling and docking studies. 2014. (Simpósio).
    14. 7th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry. Molecular simplification as strategy for designing of potential inhibitors of the cysteine protease cruzain. 2014. (Congresso).
    15. Brazilian Symposium on Chemistry and Physiology of Proteases and their Inhibitors.Discovery of Cruzain and Rhodesain Small Molecule Inhibitors Through Experimental Screening. 2014. (Simpósio).
    16. International Genetically Engineered Machines - iGEM - Giant Jamborree 2014. ColonYeast. 2014. (Olimpíada).
    17. Proteolytic Enzymes and Their Inhibitors - Gordon Research Conference. Synthesis, Biological Evaluation and Structure-Activity Relationships of Potent Noncovalent and Nonpeptidic Cruzain Inhibitors as Anti-Trypanosoma cruzi Agents. 2014. (Congresso).
    18. SIMCIFAR 2014.Cruzaína e rodesaína: alvos moleculares para o desenvolvimento de antitripanossomatídeos. 2014. (Simpósio).
    19. VII Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biologicos. Triagem Virtual em Larga Escala. 2014. (Congresso).
    20. 36a Reunião Anual da SBQ. Planejamento, síntese e avaliação biológica de novos inibidores da enzima cruzaína de Trypanosoma cruzi. 2013. (Congresso).
    21. Workshop on Proteases in Medical Parasitology.Overview of Protease Assays. 2013. (Outra).
    22. XLII Reunião Anual da SBBq. Discovery and Structure-Activity Relationships for a Series of Thiosemicarbazones as Potent Cruzain and Rhodesain Inhibitors. 2013. (Congresso).
    23. 44o Congresso Brasileiro de Farmacologia e Terapêutica Experimental. Basic Concepts on Rational Planning of Drugs. 2012. (Congresso).
    24. 44o Congresso Brasileiro de Farmacologia e Terapêutica Experimental. Examples of drug development from rational planning. 2012. (Congresso).
    25. 44o Congresso Brasileiro de Farmacologia e Terapêutica Experimental. Strategies of rational planning of drugs. 2012. (Congresso).
    26. 6th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry. 2012. (Congresso).
    27. Farmácia e Cosméticos - Avanços Biotecnológicos na Farmacologia e Cosmetodologia.Planejamento Racional de Fármacos. 2012. (Outra).
    28. Keystone Symposia - Drug discovery for protozoan parasites. 2012. (Congresso).
    29. Sao Paulo School of Advanced Science: Advanced Topics in Computational Biology/ Agrochemical and Drug Design. Molecular docking with Autodock Vina. 2012. (Congresso).
    30. VI Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. 2012. (Outra).
    31. XLI Reunião Anual da SBBq. Discovery of low micromolar noncompetitive inhibitors of the enzyme rhodesain. 2012. (Congresso).
    32. 34a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química. Planejamento de fármacos baseado na estrutura do receptor de inibidores não-covalentes de enzima cruzaína de Trypanosoma cruzi. 2011. (Congresso).
    33. Computer Aided Drug Design Gordon Research Conference. 2011. (Congresso).
    34. I Escola Brasileira de Modelagem Molecular (EBMM 2011). 2011. (Outra).
    35. X-meeting. Structure-based optimization of noncovalent cruzain inhibitors. 2011. (Congresso).
    36. XVII Escola de Verão em Química Farmacêutica e Medicinal. 2011. (Outra).
    37. 5th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry. Development of a structure-based virtual screening strategy for new inhibitors for Trypanosoma brucei aldolase. 2010. (Congresso).
    38. The 239th ACS National Meeting. 2010. (Congresso).
    39. XIV Workshop da Pós-Graduação do Instituto de Física de São Carlos.XIV Workshop da Pós-Graduação do Instituto de Física de São Carlos. 2010. (Outra).
    40. XXXI Simpósio Acadêmico de Estudos Farmacêuticos.Curso de Modelagem Molecular. 2010. (Simpósio).

Organização de eventos

  • Total de organização de eventos (5)
    1. FERREIRA, R.S.. III Curso de Verão de Engenharia de Máquinas Biológicas. 2017. (Outro).. . 0.
    2. Saraiva, A. M.; CHAPMAN, A. D. ; Thompson, Alexander ; CARTOLANO JÚNIOR, E.A. ; STEVENSON, R. D.. TDWG Meeting 2016. 2016. Congresso
    3. VILELA, L. F. F. ; FERREIRA, R.S.. II Curso de Verão de Engenharia de Máquinas Biológicas. 2016. Outro
    4. VILELA, L. F. F. ; Ferreira, R. S. ; DUARTE, C. G. ; GONCALVES, C. A. X. ; BATISTA, R. P. ; MIRANDA, M. ; CHAME, D. ; MENDES, T. ; RIBEIRO, L.. I Curso de Verão de Engenharia de Máquinas Biológicas. 2015. Outro
    5. FERREIRA, R. S.; VILELA, L. F. F. ; ORTEGA, J. M. ; AZEVEDO, V. A. C.. Curso CBAB: Bioinformática Estrutural e Análises do Proteoma. 2013. Outro

Lista de colaborações

  • Colaborações endôgenas (16)
    • Rafaela Salgado Ferreira ⇔ Adriano Defini Andricopulo (12.0)
      1. PEREIRA, GLAÉCIA AN ; SANTOS, LUCIANNA H ; WANG, STEVEN C ; MARTINS, LUAN C ; VILLELA, FILIPE S ; LIAO, WEITING ; DESSOY, MARCO A ; DIAS, LUIZ C ; ANDRICOPULO, ADRIANO D ; COSTA, MARIANA AF ; NAGEM, RONALDO AP ; CAFFREY, CONOR R ; LIEDL, KLAUS R ; CAFFARENA, ERNESTO R ; FERREIRA, RAFAELA S. Benzimidazole inhibitors of the major cysteine protease of Trypanosoma brucei. Future Medicinal Chemistry. v. 11, p. 1537-1551, issn: 1756-8919, 2019.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. FERREIRA, R. A. A. ; PAULI, I. ; SAMPAIO, T. S. ; SOUZA, M. L. ; FERREIRA, L. L. G. ; MAGALHAES, L. G. ; REZENDE JUNIOR, C. O. ; FERREIRA, R. S. ; KROGH, R. ; Dias, L.C. ; ANDRICOPULO, A. D.. Structure-Based and Molecular Modeling Studies for the Discovery of Cyclic Imides as Reversible Cruzain Inhibitors with Potent Anti-Trypanosoma cruzi Activity. Frontiers in Chemistry. v. 7, p. 1000, issn: 2296-2646, 2019.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      3. FERREIRA, LEONARDO L. G. ; Ferreira, Rafaela S. ; PALOMINO, DAVID L. ; ANDRICOPULO, ADRIANO D.. Structure-Based Virtual Screening and Biochemical Evaluation for the Identification of Novel Trypanosoma Brucei Aldolase Inhibitors. CURRENT TOPICS IN MEDICINAL CHEMISTRY. v. 18, p. 397-405, issn: 1568-0266, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      4. PAULI, IVANI ; FERREIRA, LEONARDO G ; DE SOUZA, MARIANA L ; Oliva, Glaucius ; Ferreira, Rafaela S ; DESSOY, MARCO A ; SLAFER, BRIAN W ; DIAS, LUIZ C ; Andricopulo, Adriano D. Molecular modeling and structure-activity relationships for a series of benzimidazole derivatives as cruzain inhibitors. Future Medicinal Chemistry. v. ., p. 1000-1017, issn: 1756-8919, 2017.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      5. FERREIRA, RAFAELA S. ; DESSOY, MARCO A. ; PAULI, IVANI ; SOUZA, MARIANA L. ; KROGH, RENATA ; SALES, ANA I. L. ; Oliva, Glaucius ; DIAS, LUIZ C. ; ANDRICOPULO, ADRIANO D.. Synthesis, Biological Evaluation, and Structure-Activity Relationships of Potent Noncovalent and Nonpeptidic Cruzain Inhibitors as Anti- Trypanosoma cruzi Agents. Journal of Medicinal Chemistry. v. 57, p. 140217171629005, issn: 0022-2623, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      6. FERREIRA, R. S. ; ANDRICOPULO, A. D.. Structure-Based Drug Design to Overcome Drug Resistance: Challenges and Opportunities. Current Pharmaceutical Design (Print). v. 20, p. 687-693, issn: 1381-6128, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      7. FERREIRA, R. S. ; GUIDO, R. V. C. ; ANDRICOPULO, A. D. ; OLIVA, G.. In Silico Screening Strategies for Novel Inhibitors of Parasitic Diseases. Expert Opinion on Drug Discovery (Print). v. 6, p. 481-489, issn: 1746-0441, 2011.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      8. SOUZA, M. L. ; FERREIRA, R. S. ; TROSSINI, G. H. G. ; ANDRICOPULO, A. D.. Triagem virtual de candidatos a novos inibidores da enzima cruzaína de Trypanosoma cruzi. Em: 34a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2011, Florianópolis. 34a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, v. MED020, 2011.
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      9. FERREIRA, R. S. ; DESSOY, M. A. ; DIAS, L. C. ; OLIVA, G. ; ANDRICOPULO, A. D.. Planejamento de fármacos baseado na estrutura do receptor de inibidores não-covalentes de enzima cruzaína de Trypanosoma cruzi. Em: 34a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2011, Florianópolis. 34a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, v. MED070, 2011.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      10. SOUZA, M. L. ; TROSSINI, G. H. G. ; FERREIRA, R. S. ; ANDRICOPULO, A. D.. Triagem virtual de inibidores da enzima cruzaína de Trypanosoma cruzi. Em: 33a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2009, Águas de Lindóia. 33a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, v. MED014, 2010.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      11. SOUZA, M. L. ; TROSSINI, G. H. G. ; FERREIRA, R. S. ; ANDRICOPULO, A. D.. Structure-based virtual screening strategy for inhibitors of cruzain from Trypanosoma cruzi. Em: 5th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, 2010, Ouro Preto. 5th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, v. 67, 2010.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      12. FERREIRA, R. S.; FERREIRA, L. L. G. ; ANDRICOPULO, A. D.. Development of a structure-based virtual screening strategy for new inhibitors for Trypanosoma brucei aldolase. Em: 5th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, 2010, Ouro Preto. 5th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, v. 100, 2010.
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    • Rafaela Salgado Ferreira ⇔ Vasco Ariston de Carvalho Azevedo (6.0)
      1. OLIVEIRA, ALBERTO ; TEIXEIRA, PAMMELLA ; AZEVEDO, MARCELA ; JAMAL, SYED BABAR ; Tiwari, Sandeep ; ALMEIDA, SINTIA ; Silva, Artur ; Barh, Debmalya ; DORNELES, ELAINE MARIA SELES ; HAAS, DIONEI JOAQUIM ; HEINEMANN, MARCOS BRYAN ; GHOSH, PREETAM ; LAGE, ANDREY PEREIRA ; FIGUEIREDO, HENRIQUE ; FERREIRA, RAFAELA SALGADO ; Azevedo, Vasco. Corynebacterium pseudotuberculosis may be under anagenesis and biovar Equi forms biovar Ovis: a phylogenic inference from sequence and structural analysis. BMC Microbiology (Online). v. 16, p. 10101010-101010, issn: 1471-2180, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. FOLADOR, EDSON LUIZ ; DE CARVALHO, PAULO VINÍCIUS SANCHES DALTRO ; SILVA, WANDERSON MARQUES ; FERREIRA, RAFAELA SALGADO ; Silva, Artur ; GROMIHA, MICHAEL ; GHOSH, PREETAM ; Barh, Debmalya ; AZEVEDO, VASCO ; RÖTTGER, RICHARD. In silico identification of essential proteins in Corynebacterium pseudotuberculosis based on protein-protein interaction networks. BMC Systems Biology. v. 10, p. 10101010-101010, issn: 1752-0509, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      3. FOLADOR, EDSON LUIZ ; OLIVEIRA JUNIOR, A. F. ; TIWARI, S. ; JAMAL, S. B. ; FERREIRA, R. S. ; BARH, DEBMALYA ; GOSH, P. ; SILVA, A. L. C. ; AZEVEDO, V. A. C.. In Silico Protein-protein Interactions: Avoiding Ddata and Method Siases over Sensitivity and Specificity. Current Protein and Peptide Science. v. 16, p. 1010100-1010100, issn: 1389-2037, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      4. RADUSKY, L. C. ; Hassan, S. S. ; LANZAROTTI, E. ; Tiwari, S. ; JAMAL, SYED BABAR ; ALI, J. ; FERREIRA, Rafaela. S. ; BARH, D. ; Artur Luiz da Costa da Silva ; TURJANSKI, A. ; AZEVEDO, V.. An integrated structural proteomics approach along the druggable genome of Corynebacterium pseudotuberculosis species for putative druggable targets.. BMC Genomics. v. 16, p. 1010100-1010100, issn: 1471-2164, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      5. FOLADOR, EDSON LUIZ ; HASSAN, SYED SHAH ; LEMKE, NEY ; BARH, DEBMALYA ; SILVA, ARTUR ; FERREIRA, RAFAELA SALGADO ; AZEVEDO, VASCO. An improved interolog mapping-based computational prediction of protein-protein interactions with increased network coverage. Integrative Biology: a new journal of quantitative biosciences from nano to macro. v. ., p. 1-1, issn: 1757-9694, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      6. Hassan, S. S. ; Tiwari, S. ; GUIMARAES, L. C. ; JAMAL, H ; FOLADOR, EDSON L ; SHARMA, N. ; SOARES, S. C. ; DE ALMEIDA, S. S. ; ALI, A. ; POVOA, F. ; ABREU, V. A. C. ; Jain, N. ; BHATTACHARYA, ANTARIPA ; JUNEJA, LUCKY ; MIYOSHI, A ; Artur Luiz da Costa da Silva ; Barh, D. ; TURJANSKI, A. ; AZEVEDO, V ; FERREIRA, Rafaela. S.. Proteome Scale Comparative Modeling for Conserved Drug and Vaccine Targets Identification in Corynebacterium pseudotuberculosis. BMC Genomics. v. 15, p. 1471-2164, issn: 1471-2164, 2014.
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    • Rafaela Salgado Ferreira ⇔ Milena Botelho Pereira Soares (5.0)
      1. CARDOSO, MARCOS VERÍSSIMO DE OLIVEIRA ; OLIVEIRA FILHO, GEVANIO BEZERRA DE ; SIQUEIRA, LUCIANNA RABELO PESSOA DE ; ESPÍNDOLA, JOSÉ WANDERLAN PONTES ; SILVA, ELANY BARBOSA DA ; MENDES, ANDRESA PEREIRA DE OLIVEIRA ; PEREIRA, VALÉRIA RÊGO ALVES ; CASTRO, MARIA CAROLINA ACCIOLY BRELAZ DE ; Ferreira, Rafaela Salgado ; VILLELA, FILIPE SILVA ; COSTA, FRANCIELLY MORAIS RODRIGUES DA ; Meira, Cássio Santana ; Moreira, Diogo Rodrigo Magalhães ; Soares, Milena Botelho Pereira ; Leite, Ana Cristina Lima. 2-(phenylthio)ethylidene derivatives as anti-Trypanosoma cruzi compounds: Structural design, synthesis and antiparasitic activity. EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY. v. 180, p. 191-203, issn: 0223-5234, 2019.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. ESPÍNDOLA, JOSÉ WANDERLAN PONTES ; CARDOSO, MARCOS VERÍSSIMO DE OLIVEIRA ; FILHO, GEVANIO BEZERRA DE OLIVEIRA ; OLIVEIRA E SILVA, DAYANE ALBUQUERQUE ; Moreira, Diogo Rodrigo Magalhaes ; BASTOS, TANIRA MATUTINO ; SIMONE, CARLOS ALBERTO DE ; SOARES, MILENA BOTELHO PEREIRA ; VILLELA, FILIPE SILVA ; FERREIRA, RAFAELA SALGADO ; CASTRO, MARIA CAROLINA ACCIOLY BRELAZ DE ; Pereira, Valéria Rego Alves ; MURTA, SILVANE MARIA FONSECA ; SALES JUNIOR, POLICARPO ADEMAR ; ROMANHA, ALVARO JOSÉ ; Leite, Ana Cristina Lima. Synthesis and structure-activity relationship study of a new series of antiparasitic aryloxyl thiosemicarbazones inhibiting Trypanosoma cruzi cruzain. European Journal of Medicinal Chemistry. v. 101, p. 818-835, issn: 0223-5234, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      3. DE OLIVEIRA FILHO, GEVANIO BEZERRA ; DE OLIVEIRA CARDOSO, MARCOS VERÍSSIMO ; ESPÍNDOLA, JOSÉ WANDERLAN PONTES ; FERREIRA, LUIZ FELIPE GOMES REBELLO ; DE SIMONE, CARLOS ALBERTO ; FERREIRA, RAFAELA SALGADO ; COELHO, POLLYANNE LACERDA ; MEIRA, CÁSSIO SANTANA ; MAGALHAES MOREIRA, DIOGO RODRIGO ; SOARES, MILENA BOTELHO PEREIRA ; LIMA LEITE, ANA CRISTINA. Structural design, synthesis and pharmacological evaluation of 4-thiazolidinones against Trypanosoma cruzi. Bioorganic & Medicinal Chemistry (Print). v. 23, p. 7478-7486, issn: 0968-0896, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      4. Filho, José Mauricio Santos ; Moreira, Diogo Rodrigo M. ; de Simone, Carlos Alberto ; Ferreira, Rafaela Salgado ; McKerrow, James H. ; Meira, Cássio Santana ; Guimarães, Elisalva Teixeira ; Soares, Milena Botelho Pereira. Optimization of anti-Trypanosoma cruzi oxadiazoles leads to identification of compounds with efficacy in infected mice. Bioorganic & Medicinal Chemistry (Print). v. 20, p. 6423-6433, issn: 0968-0896, 2012.
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      5. MOREIRA, DIOGO RODRIGO MAGALHAES ; MEIRA, C. S. ; COSTA, SALVANA PRISCYLLA MANSO ; HERNANDES, MARCELO ZALDINI ; RABELLO, MARCELO MONTENEGRO ; DE OLIVEIRA FILHO, GEVANIO BEZERRA ; DE MELO, CRISTIANE MOUTINHO LAGOS ; DA ROCHA, LUCAS FERREIRA ; DE SIMONE, CARLOS ALBERTO ; FERREIRA, RAFAELA SALGADO ; FRADICO, JORDANA RODRIGUES BARBOSA ; MEIRA, CÁSSIO SANTANA ; GUIMARÃES, ELISALVA TEIXEIRA ; SRIVASTAVA, RAJENDRA MOHAN ; PEREIRA, VALÉRIA RÊGO ALVES ; SOARES, M. B. P. ; LEITE, ANA CRISTINA LIMA. Structural Investigation of Anti- Trypanosoma cruzi 2-Iminothiazolidin-4-ones Allows the Identification of Agents with Efficacy in Infected Mice. Journal of Medicinal Chemistry. v. 55, p. 121120133634004, issn: 0022-2623, 2012.
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    • Rafaela Salgado Ferreira ⇔ Luiz Carlos Dias (4.0)
      1. PEREIRA, GLAÉCIA AN ; SANTOS, LUCIANNA H ; WANG, STEVEN C ; MARTINS, LUAN C ; VILLELA, FILIPE S ; LIAO, WEITING ; DESSOY, MARCO A ; DIAS, LUIZ C ; ANDRICOPULO, ADRIANO D ; COSTA, MARIANA AF ; NAGEM, RONALDO AP ; CAFFREY, CONOR R ; LIEDL, KLAUS R ; CAFFARENA, ERNESTO R ; FERREIRA, RAFAELA S. Benzimidazole inhibitors of the major cysteine protease of Trypanosoma brucei. Future Medicinal Chemistry. v. 11, p. 1537-1551, issn: 1756-8919, 2019.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. FERREIRA, R. A. A. ; PAULI, I. ; SAMPAIO, T. S. ; SOUZA, M. L. ; FERREIRA, L. L. G. ; MAGALHAES, L. G. ; REZENDE JUNIOR, C. O. ; FERREIRA, R. S. ; KROGH, R. ; Dias, L.C. ; ANDRICOPULO, A. D.. Structure-Based and Molecular Modeling Studies for the Discovery of Cyclic Imides as Reversible Cruzain Inhibitors with Potent Anti-Trypanosoma cruzi Activity. Frontiers in Chemistry. v. 7, p. 1000, issn: 2296-2646, 2019.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      3. PAULI, IVANI ; FERREIRA, LEONARDO G ; DE SOUZA, MARIANA L ; Oliva, Glaucius ; Ferreira, Rafaela S ; DESSOY, MARCO A ; SLAFER, BRIAN W ; DIAS, LUIZ C ; Andricopulo, Adriano D. Molecular modeling and structure-activity relationships for a series of benzimidazole derivatives as cruzain inhibitors. Future Medicinal Chemistry. v. ., p. 1000-1017, issn: 1756-8919, 2017.
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      4. FERREIRA, RAFAELA S. ; DESSOY, MARCO A. ; PAULI, IVANI ; SOUZA, MARIANA L. ; KROGH, RENATA ; SALES, ANA I. L. ; Oliva, Glaucius ; DIAS, LUIZ C. ; ANDRICOPULO, ADRIANO D.. Synthesis, Biological Evaluation, and Structure-Activity Relationships of Potent Noncovalent and Nonpeptidic Cruzain Inhibitors as Anti- Trypanosoma cruzi Agents. Journal of Medicinal Chemistry. v. 57, p. 140217171629005, issn: 0022-2623, 2014.
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    • Rafaela Salgado Ferreira ⇔ Sergio Costa Oliveira (3.0)
      1. MAMBELLI, FÁBIO ; SANTOS, BRUNO P. O. ; MORAIS, SUELLEN B. ; GIMENEZ, ENRICO G. T. ; ASTONI, DUANA C. DOS S. ; BRAGA, AMANDA D. ; Ferreira, Rafaela S. ; AMARAL, FLÁVIO A. ; DE MAGALHÃES, MARIANA T. Q. ; C. OLIVEIRA, SERGIO. S. mansoni SmKI-1 Kunitz-domain: Leucine point mutation at P1 site generates enhanced neutrophil elastase inhibitory activity. PLoS Neglected Tropical Diseases. v. 15, p. e0009007, issn: 1935-2735, 2021.
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      2. FAHEL, JÚLIA S. ; VIEIRA, RAFAEL P. ; MARINHO, FÁBIO V. ; SANTOS, VIVIANE C. ; DE ASSIS, JOÃO VITOR ; CORSETTI, PATRÍCIA P. ; Ferreira, Rafaela S. ; DE ALMEIDA, MAURO V. ; OLIVEIRA, SERGIO C.. JVA, an isoniazid analogue, is a bioactive compound against a clinical isolate of the Mycobacterium avium complex. TUBERCULOSIS. v. 115, p. 108-112, issn: 1472-9792, 2019.
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      3. MORAIS, SUELLEN B. ; FIGUEIREDO, BARBARA C. ; ASSIS, NATAN R. G. ; ALVARENGA, DEBORA M. ; DE MAGALHÃES, MARIANA T. Q. ; Ferreira, Rafaela S. ; VIEIRA, ANGÉLICA T. ; MENEZES, GUSTAVO B. ; OLIVEIRA, SERGIO C.. Schistosoma mansoni SmKI-1 serine protease inhibitor binds to elastase and impairs neutrophil function and inflammation. PLoS Pathogens. v. 14, p. e1006870, issn: 1553-7374, 2018.
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    • Rafaela Salgado Ferreira ⇔ Santuza Maria Ribeiro Teixeira (1.0)
      1. SANTOS, VIVIANE CORRÊA ; OLIVEIRA, ANTONIO EDSON ROCHA ; CAMPOS, AUGUSTO CÉSAR BROILO ; REIS-CUNHA, JOÃO LUÍS ; Bartholomeu, Daniella Castanheira ; Teixeira, Santuza Maria Ribeiro ; LIMA, ANA PAULA C. A. ; FERREIRA, RAFAELA SALGADO. The gene repertoire of the main cysteine protease of Trypanosoma cruzi, cruzipain, reveals four sub-types with distinct active sites. Scientific Reports. v. 11, p. 18231, issn: 2045-2322, 2021.
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    • Rafaela Salgado Ferreira ⇔ Abelardo Silva Júnior (1.0)
      1. MOREIRA, GABRIELA ALVES ; DE ALMEIDA LIMA, GRAZIELA DOMINGUES ; SIQUEIRA, RAONI PAIS ; DE ANDRADE BARROS, MARCUS VINÍCIUS ; ADJANOHOUN, ABRAHAM LANDRY MAHUVI ; SANTOS, VIVIANE CORRÊA ; DE ALMEIDA ALVES BARBOSA, ÉVERTON ; LOTERIO, ROBSON KRIIGER ; DE PAIVA, JANINE CERQUEIRA ; GONÇALVES, VICTOR HUGO SOUSA ; DE SOUZA VIOL, LÍVIA CRISTINA ; DE ALMEIDA MARQUES DA SILVA, EDUARDO ; JÚNIOR, ABELARDO SILVA ; ALMEIDA, MÁRCIA ROGÉRIA ; FIETTO, JULIANA LOPES RANGEL ; MACHADO-NEVES, MARIANA ; FERREIRA, RAFAELA SALGADO ; TEIXEIRA, RÓBSON RICARDO ; BRESSAN, GUSTAVO COSTA. Antimetastatic effect of the pharmacological inhibition of serine/arginine-rich protein kinases (SRPK) in murine melanoma. TOXICOLOGY AND APPLIED PHARMACOLOGY. v. 356, p. 214-223, issn: 0041-008X, 2018.
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    • Rafaela Salgado Ferreira ⇔ Eduardo Antonio Ferraz Coelho (1.0)
      1. BRAGA, S. F. P. ; ALVES, E. V. P. ; FERREIRA, R. S. ; FRADICO, J. R. B. ; LAGE, P. S. ; DUARTE, M. C. ; RIBEIRO, T. G. ; S. JUNIOR, P. A. ; ROMANHA, A. J. ; TONINI, M. L. ; STEINDEL, M. ; COELHO, E. F. ; OLIVEIRA, R. B.. Synthesis and Evaluation of the Antiparasitic Activity of Bis-(arylmethylidene) cycloalkanones. European Journal of Medicinal Chemistry. v. 71, p. 282-289, issn: 0223-5234, 2013.
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    • Rafaela Salgado Ferreira ⇔ Erna Geessien Kroon (1.0)
      1. ANDRADE, ADRIANA S. ; Ferreira, Rafaela S. ; GUEDES, MARIA ISABEL M. C. ; DIAS, JAMILE ; PINHEIRO, MARIANA A. ; ARIAS, NIDIA ESTHER C. ; REIS, ERIK V. S. ; DE SOUZA, FERNANDA G. ; KROON, ERNA G.. Dengue virus 3 genotype I shows natural changes in heparan sulphate binding sites, cell interactions, and neurovirulence in a mouse model. JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY. v. 102, p. .-., issn: 0022-1317, 2021.
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    • Rafaela Salgado Ferreira ⇔ Gerd Bruno da Rocha (1.0)
      1. ROCHA, RAFAEL E. O. ; CHAVES, ELTON J. F. ; FISCHER, PEDRO H. C. ; COSTA, LEON S. C. ; GRILLO, IGOR BARDEN ; DA CRUZ, LUIZ E. G. ; GUEDES, FABIANA C. ; DA SILVEIRA, CARLOS H. ; SCOTTI, MARCUS T. ; CAMARGO, ALEX D. ; MACHADO, KARINA S. ; WERHLI, ADRIANO V. ; Ferreira, Rafaela S. ; ROCHA, GERD B. ; DE LIMA, LEONARDO H. F.. A higher flexibility at the SARS-CoV-2 main protease active site compared to SARS-CoV and its potentialities for new inhibitor virtual screening targeting multi-conformers. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS. v. ., p. 1-21, issn: 0739-1102, 2021.
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    • Rafaela Salgado Ferreira ⇔ Sérgio Oliveira De Paula (1.0)
      1. OLIVEIRA, ANA FLÁVIA C. DA S. ; DE SOUZA, ANA PAULA M. ; DE OLIVEIRA, ANDRÉ S. ; DA SILVA, MILENE L. ; DE OLIVEIRA, FABRÍCIO M. ; SANTOS, EDJON G. ; DA SILVA, ÍTALO ESPOSTI P. ; Ferreira, Rafaela S. ; VILLELA, FILIPE S. ; MARTINS, FELIPE T. ; LEAL, DANIEL H.S. ; VAZ, BONIEK G. ; TEIXEIRA, RÓBSON R. ; DE PAULA, SERGIO O.. Zirconium catalyzed synthesis of 2-arylidene Indan-1,3-diones and evaluation of their inhibitory activity against NS2B-NS3 WNV protease. EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY. v. 149, p. 98-109, issn: 0223-5234, 2018.
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    • Rafaela Salgado Ferreira ⇔ Gustavo Henrique Goulart Trossini (1.0)
      1. VITAL, DRIELLI G. ; DAMASCENO, FLÁVIA ; RAPADO, LUDMILA N. ; SILBER, ARIEL M. ; VILELLA, FILIPE S. ; Ferreira, Rafaela S. ; MALTAROLLO, VINÍCIUS G. ; TROSSINI, GUSTAVO H. G.. Aplication of bioisosterism in design of the semicarbazone derivatives: A theoretical and experimental study. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. v. 35, p. 1-62, issn: 1538-0254, 2016.
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    • Rafaela Salgado Ferreira ⇔ Nubia Boechat Andrade (1.0)
      1. PEREIRA, G. A. N. ; PINHEIRO, L. C. S. ; BOECHAT, N. ; Ferreira, R. S.. DISCOVERY OF A NON-COMPETITIVE INIHIBITOR SERIES AGAINST CRUZAIN, A CYSTEINE PROTEASE OF T. CRUZI. Em: 23rd International Congress of the IUBMB and 44th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (SBBq), 2015, Foz do Iguaçu. 23rd International Congress of the IUBMB and 44th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (SBBq). São Paulo: SBBq, v. 01, p. 8203-8203, 2015.
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    • Rafaela Salgado Ferreira ⇔ Maria do Carmo Alves de Lima (1.0)
      1. SILVA-JÚNIOR, E.F. ; SILVA, E.P.S. ; FRANÇA, P.H.B. ; SILVA, J.P.N. ; BARRETO, E.O. ; SILVA, E.B. ; FERREIRA, R.S. ; GATTO, C.C. ; MOREIRA, D.R.M. ; SIQUEIRA-NETO, J.L. ; MENDONÇA-JÚNIOR, F.J.B. ; LIMA, M.C.A. ; BORTOLUZZI, J.H. ; SCOTTI, M.T. ; Scotti, L. ; MENEGHETTI, M.R. ; AQUINO, T.M. ; ARAÚJO-JÚNIOR, J.X.. Design, synthesis, molecular docking and biological evaluation of thiophen-2-iminothiazolidine derivatives for use against Trypanosoma cruzi. Bioorganic & Medicinal Chemistry (Print). v. 39, p. 4228-4240, issn: 0968-0896, 2016.
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    • Rafaela Salgado Ferreira ⇔ Liza Figueiredo Felicori Vilela (1.0)
      1. BEN YEKHLEF, RAMLA ; Felicori, Liza ; SANTOS, LUCIANNA HELENE ; F. B. OLIVEIRA, CAMILA ; FADHLOUN, RAOUDHA ; TORABI, ELHAM ; SHAHBAZZADEH, DELAVAR ; POOSHANG BAGHERI, KAMRAN ; SALGADO FERREIRA, RAFAELA ; BORCHANI, LAMIA. Antigenic and Substrate Preference Differences between Scorpion and Spider Dermonecrotic Toxins, a Comparative Investigation. Toxins. v. 12, p. 631, issn: 2072-6651, 2020.
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    • Rafaela Salgado Ferreira ⇔ Raquel Cardoso de Melo Minardi (1.0)
      1. FASSIO, ALEXANDRE VICTOR ; SANTOS, LUCIANNA H. ; SILVEIRA, SABRINA A. ; Ferreira, Rafaela S. ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO. nAPOLI: a graph-based strategy to detect and visualize conserved protein-ligand interactions in large-scale. IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. v. ., p. 1-1, issn: 1545-5963, 2019.
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(*) Relatório criado com produções desde 2010 até 2021
Data de processamento: 06/11/2021 15:23:24