Especialistas Seniores em Covid-19 com atuação no Brasil

Gerd Bruno da Rocha

Gerd Bruno Rocha é Professor Associado IV da Universidade Federal da Paraíba (UFPB), João Pessoa, Brasil, desde 2006. concluiu o doutorado em Química pela Universidade Federal de Pernambuco (UFPE) em 2002. Gerd Rocha publicou 77 artigos científicos e possui experiência em Química Teórica, atuando nos seguintes assuntos: desenvolvimento de métodos de química quântica semiempíricos; complexos de lantanídeos; Programação em GPU; computação de alto desempenho; métodos de escalonamento linear; simulações moleculares de sistemas biológicos e químicos; e cálculo de estrutura eletrônica de biomoléculas e processos biomoleculares. Orientou seis dissertações de mestrado e quatro teses de doutorado. Co-orientou 8 dissertações de mestrado e uma tese de doutorado além de ter orientado mais de 30 trabalhos de iniciação científica nas áreas de Química e Física. Recebeu 17 prêmios e/ou homenagens. Entre 2004 e 2020 coordenou 9 projetos de pesquisa. Em seu currículo Lattes os termos mais freqüentes na contextualização da produção científica, tecnológica e artístico-cultural são: Sparkle Model, Métodos semi-empíricos, Semiempirical methods, Linear Scaling Methods, GPU, Lanthanide Complexes, Modelo Sparkle, Parametrização, Complexos de lantanídeos, mesoionic compounds, Nonlinear Optics e AM1/TDHF. Informações adicionais sobre suas atividades científicas e grupo de pesquisa podem ser encontradas em https://www.quantum-chem.pro.br/. (Texto informado pelo autor)

https://lattes.cnpq.br/9404945858555096 (28/09/2021)

Rótulo/Grupo:

Bolsa CNPq: Nível 1D

Período de análise:

Endereço: Universidade Federal da Paraíba, Centro de Ciências Exatas e da Natureza - Campus I, Departamento de Química. Campus I Cid. Universitária 58036300 - João Pessoa, PB - Brasil Telefone: (83) 32167590 Ramal: 25 Fax: (83) 32167433 URL da Homepage: https://www.quimica.ufpb.br

Grande área: Ciências Exatas e da Terra

Área: Química

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (38)
1. CHAVES, E. J. F. ; CRUZ, L. E. G. ; PADILHA, I. Q. M. ; SILVEIRA, C. H. ; ARAUJO, D. A. M. ; ROCHA, G. B.. Discovery of RTA ricin subunit inhibitors: a computational study using PM7 quantum chemical method and steered molecular dynamics. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS. v. SN, p. 1-19, issn: 0739-1102, 2021.
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2. ROCHA, RAFAEL E. O. ; CHAVES, ELTON J. F. ; FISCHER, PEDRO H. C. ; COSTA, LEON S. C. ; GRILLO, IGOR BARDEN ; DA CRUZ, LUIZ E. G. ; GUEDES, FABIANA C. ; DA SILVEIRA, CARLOS H. ; SCOTTI, MARCUS T. ; CAMARGO, ALEX D. ; MACHADO, KARINA S. ; WERHLI, ADRIANO V. ; FERREIRA, RAFAELA S. ; Rocha, Gerd B. ; DE LIMA, LEONARDO H. F.. A higher flexibility at the SARS-CoV-2 main protease active site compared to SARS-CoV and its potentialities for new inhibitor virtual screening targeting multi-conformers. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS. v. x, p. 1-21, issn: 0739-1102, 2021.
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3. ROCHA-SANTOS, ACASSIO ; CHAVES, ELTON JOSÉ FERREIRA ; GRILLO, IGOR BARDEN ; DE FREITAS, AMANARA SOUZA ; ARAÚJO, DEMÉTRIUS ANTÔNIO MACHADO ; Rocha, Gerd Bruno. Thermochemical and Quantum Descriptor Calculations for Gaining Insight into Ricin Toxin A (RTA) Inhibitors. ACS Omega. v. 6, p. 8764-8777, issn: 2470-1343, 2021.
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4. SOUZA JR., JOSELITO ; MARTINS, EVANDRO ; SOUZA, HELIVALDO ; DE OLIVEIRA, RAFAEL ; ALVES, FRANCINARA ; LIMA, EDELTRUDES ; CORDEIRO, LAÍSA ; TRINDADE, EMMELY ; LIRA, BRUNO ; ROCHA, GERD ; DE ATHAYDE-FILHO, PETRONIO ; BARBOSA-FILHO, JOSÉ. Synthesis, Spectroscopic Characterization, DFT Calculations and Preliminary Antifungal Activity of New Piperine Derivatives. JOURNAL OF THE BRAZILIAN CHEMICAL SOCIETY. v. 32, p. 490-502, issn: 0103-5053, 2021.
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5. DE OLIVEIRA, OSMAIR VITAL ; Rocha, Gerd B. ; PALUCH, ANDREW S. ; COSTA, LUCIANO T.. Repurposing approved drugs as inhibitors of SARS-CoV-2-S-protein from molecular modeling and virtual screening. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS. v. 39, p. 3924-3933, issn: 0739-1102, 2021.
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6. KAYA, YELIZ ; ERÇA', AY'E ; SERDARO'LU, GONCAGÜL ; KAYA, SAVA' ; GRILLO, IGOR BARDEN ; Rocha, Gerd Bruno. Synthesis, spectroscopic characterization, DFT calculations, and molecular docking studies of new unsymmetric bishydrazone derivatives. JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE. v. xx, p. 131224-131224, issn: 0022-2860, 2021.
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11. VILELA, RAQUEL ; COSTA, NORMANDO ; SOUZA, HELIVALDO ; CRUZ, LUIZ ; DE ASSIS, KELYONARA ; LIMA, EDELTRUDES ; CORDEIRO, LAÍSA ; LIRA, BRUNO ; DE ATHAYDE-FILHO, PETRONIO ; ROCHA, GERD ; BARBOSA-FILHO, JOSÉ. Synthesis, in silico Study, Theoretical Stereochemistry Elucidation and Antifungal Activity of New Imides Derived from Safrole. JOURNAL OF THE BRAZILIAN CHEMICAL SOCIETY. v. 31, p. 2091-2103, issn: 0103-5053, 2020.
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12. GRILLO, IGOR BARDEN ; BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGGIERO ; TIMMERS, LUIS FERNANDO S. M. ; CACERES, RAFAEL A. ; DE SOUZA, OSMAR NORBERTO ; FIELD, MARTIN J. ; Rocha, Gerd Bruno. Theoretical characterization of the shikimate 5-dehydrogenase reaction from Mycobacterium tuberculosis by hybrid QC/MM simulations and quantum chemical descriptors. JOURNAL OF MOLECULAR MODELING. v. 26, p. 297, issn: 1610-2940, 2020.
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13. MARTINS, EVANDRO PAULO SOARES ; LIMA, EDELTRUDES DE OLIVEIRA ; MARTINS, FELIPE TERRA ; DE ALMEIDA VASCONCELLOS, MÁRIO LUIZ ARAÚJO ; Rocha, Gerd Bruno. Synthesis, spectroscopic characterization, DFT studies, and preliminary antimicrobial evaluation of new antimony(III) and bismuth(III) complexes derived from 1,3,5-triazine. JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE. v. 1183, p. 373-383, issn: 0022-2860, 2019.
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14. SOARES MARTINS, EVANDRO PAULO ; Rocha, Gerd Bruno ; DE ALENCAR SIMONI, JOSÉ ; DE PAIVA ESPÍNOLA, JOSÉ GERALDO. Synthesis, thermochemical and quantum chemical studies on antimony(III) and bismuth(III) complexes with 2,2?-bipyridine and 1,10-phenanthroline. THERMOCHIMICA ACTA. v. 676, p. 234-240, issn: 0040-6031, 2019.
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17. MELO, MARCELO C R ; BERNARDI, RAFAEL C ; RUDACK, TILL ; SCHEURER, MAXIMILIAN ; RIPLINGER, CHRISTOPH ; PHILLIPS, JAMES C ; MAIA, JULIO D C ; ROCHA, GERD B ; RIBEIRO, JOÃO V ; STONE, JOHN E ; NEESE, FRANK ; SCHULTEN, KLAUS ; LUTHEY-SCHULTEN, ZAIDA. NAMD goes quantum: an integrative suite for hybrid simulations. NATURE METHODS. v. 15, p. 351-354, issn: 1548-7091, 2018.
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38. Junior, Cláudio G.L. ; de Assis, Priscila A.C. ; Silva, Fábio P.L. ; SOUSA, SUERVY C.O. ; DE ANDRADE, NATÁLIA G. ; Barbosa, Ticiano P. ; Nerís, Patrícia L.N. ; Segundo, Luiz V.G. ; ANJOS, ÍTALO C. ; Carvalho, Gabriel A.U. ; Rocha, Gerd B. ; Oliveira, Márcia R. ; Vasconcellos, Mário L.A.A.. Efficient synthesis of 16 aromatic Morita-Baylis-Hillman adducts: Biological evaluation on Leishmania amazonensis and Leishmania chagasi. BIOORGANIC CHEMISTRY. v. 38, p. 279-284, issn: 0045-2068, 2010.
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Livros publicados/organizados ou edições (0)
Capítulos de livros publicados (0)
Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (1)
1. MAIA, J. D. C. ; CABRAL, L. A. F. ; ROCHA, G. B.. Cálculos de Química Quântica em GPUs: proposta de um algoritmo paralelo para a pseudodiagonalização de matrizes simétricas usando a plataforma NVIDIA/CUDA. Em: BRESCI - VIII Brazilian e-Science Workshop, v. 1, 2014.
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Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (47)
1. Anésio, I.L. ; Martins, Evandro P. S. ; ATHAYDE FILHO, Petrônio F de ; LIMA, M. V. ; LIMA, P. S. V. ; ALVES, F. S. ; SOUZA, H. D. S. ; SOARES, F. S. ; Rocha, G.B. ; SOUSA, A. P.. Estudo Teórico das Propriedades Vibracionais de Mesoiônicos da classe 1,3-Tiazólio-5-Tiolato. Em: 59o Congresso Brasileiro de Química, 2019, João Pessoa - PB. Anais do 59o Congresso Brasileiro de Química, v. S/N, p. xx, 2019.
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2. CHAVES, E. J. F. ; CRUZ, L. E. G. ; Rocha, G.B.. Interplay entre o docking molecular e a função escore usando métodos QM/QM e QM/MM. Em: VI Encontro de Química da UFPB, 2019, João Pessoa - PB. Anais do VI encontro de química da UFPB, v. S/N, 2019.
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3. CHAVES, E. J. F. ; PADILHA, I. Q. M. ; SILVA FILHO, Demétrio A da ; Rocha, G.B.. Obtenção de Novos Inibidores de RTA (Ricina) por meio de Triagem Virtual em Larga Escala e Steered Molecular Dynamics. Em: I ENCONTRO CIENTÍFICO DOS PROGRAMAS DE PÓS-GRADUAÇÃO DO CENTRO DE BIOTECNOLOGIA, 2019, João Pessoa. Anais do I ENCONTRO CIENTÍFICO DOS PROGRAMAS DE PÓS-GRADUAÇÃO DO CENTRO DE BIOTECNOLOGIA, v. S/N, 2019.
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4. CRUZ, L. E. G. ; VILELA, R. F. ; SOUZA, H. D. S. ; ASSIS, K. M. S. ; LIRA, Bruno F ; ATHAYDE FILHO, P. F. ; Rocha, Gerd B.. Elucidação da estéreo química de um derivado do safrol através de cálculos de RMN de 13C e 1H usando DFT e a técnica DP4. Em: XX Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2019, João Pessoa. Anais do XX Simpósio Brasileiro de Química Teórica, v. S/N, 2019.
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15. SANTOS, A. R. ; CHAVES, E. J. F. ; CARVALHO, G. A. U. ; Rocha, Gerd Bruno. Semiempirical ?Hbind calculations for interactions between the RTA and RTB subunits and ricin inhibitors. Em: XIX Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2017, Águas de Lindóia. Anais do XIX Simpósio Brasileiro de Química Teórica, v. SN, 2017.
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16. CRUZ, L. E. G. ; ROCHA, G. B. ; SANTANA, Sidney Ramos de. Conformational Search using QMDFF force-field to find conformers of Ln(III) complexes with flexible ligands in solution. Em: 18th International Conference on Luminescence, 2017, João Pessoa. Book of Abstract of 18th International Conference on Luminescence, v. SN, 2017.
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17. CHAVES, E. J. F. ; ROCHA, G. B. ; PADILHA, I. Q. M. ; ARAUJO, D. A. M.. Simulação molecular de ligantes de Ricina: Uma abordagem por Steered Molecular Dynamics. Em: VIII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 2016, Petrópolis - RJ. Livro de resumos da VIII EMMSB, v. S/N, 2016.
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18. MAIA, J. D. C. ; ROCHA, G. B.. Purificação da Matriz Densidade Utilizando Bibliotecas de Álgebra Linear para GPU. Em: VIII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 2016, Petrópolis - RJ. Livro de resumos da VIII EMMSB, v. S/N, 2016.
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19. FREITAS, A. S. ; ROCHA, G. B.. Cálculo do DeltaHlig de inibidor da ricina através de métodos semiempíricos. Em: VII Encontro Regional da SBQ Nordeste, 2016, Recife. Anais do VII Encontro Regional da SBQ Nordeste, v. SN, 2016.
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20. CRUZ, L. E. G. ; SANTANA, S. R. ; ROCHA, G. B.. CÁLCULOS DFT DE COMPLEXOS DE Gd3+ COM LIGANTES MACROCÍCLICOS USADOS COMO AGENTES DE CONTRASTES EM MRI. Em: VII Encontro Regional da SBQ Nordeste, 2016, Recife. Anais do VII Encontro Regional da SBQ Nordeste, v. SN, 2016.
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21. ANJOS, Italo Curvelo dos ; ROCHA, G. B.. Assessing intra- and intermolecular interactions in mesoionic compounds. Em: ChemBond 2016, 2016, Dresden. ChemBond 2016 Abstract Book, v. SN, 2016.
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22. ANJOS, Italo Curvelo dos ; ROCHA, G. B.. Assessing the Mesoionic Compounds Definitions by QTAIM, NBO and Spackman charge models. Em: Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2015, Pirenópolis, GO. Anais do Simpósio Brasileiro de Química Teórica, v. 1, 2015.
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23. MAIA, J. D. C. ; ROCHA, G. B.. Purificação da Matriz Densidade Usando Operações de Álgebra Linear Esparsas baseadas em Orbitais Moleculares Localizados para GPUs. Em: Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2015, Pirenópolis, GO. Anais do Simpósio Brasileiro de Química Teórica, v. 1, 2015.
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24. Martins, Evandro P. S. ; ROCHA, G. B.. Conformational analysis, NBO and QTAIM Study of the Antimony Complexes with Mesoionic 1, 3-Thiazolium-5-thiolate. Em: Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2015, Pirenópolis, GO. Anais do Simpósio Brasileiro de Química Teórica, v. 1, 2015.
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25. LIMA, G.B.V. ; Martins, Evandro P. S. ; SÁ, G. F. ; TEOTONIO, E. E. S. ; VALE, J. A. ; Rocha, Gerd Bruno ; FAUSTINO, Wagner M. Unexpected cleavage selective of N-acetylbenzamide promoted by lanthanide ions: a mechanistic proposal from experimental facts and DFT calculations. Em: 9th international conference on f-elements (ICfE), 2015, Oxford. Annals of 9th international conference on f-elements (ICfE), v. 1, p. 1, 2015.
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26. Martins, Evandro P. S. ; SOUZA, H. D. S. ; ESPÍNOLA, José Geraldo de Paiva ; ATHAYDE FILHO, Petrônio F de ; ROCHA, G. B.. Síntese e modelagem molecular de complexos de Sb(III) e Bi(III) com mesoiônicos 1,3-tiazólio-5-5tiolato. Em: 37a Reunião anual da SBQ, 2014, Natal. Anais da 37a reunião anual da SBQ, v. 1, 2014.
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28. CARVALHO, G. A. U. ; Rocha, Gerd Bruno ; DUARTE, Wallace Fragoso. Assessment of Semiempirical Enthalpy of Formation as Scoring Function to Discriminate Native Structures in Protein Decoy Sets. Em: 10th Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists, 2014, Santiago. 10th Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists, v. 1, 2014.
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29. MAIA, J. D. C. ; CABRAL, L. A. F. ; Rocha, Gerd Bruno. Accelerating Semiempirical Quantum Chemical Calculation by Using Multi-GPU Platforms: Implementations and Benchmarks. Em: 10th Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists, 2014, Santiago. 10th Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists, v. 1, 2014.
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30. ANJOS, Italo Curvelo dos ; Rocha, Gerd Bruno. A DFT assessment of the Noncovalent interactions in Mesoionic Dimers. Em: 10th Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists, 2014, Santiago. 10th Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists, v. 1, 2014.
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31. ANJOS, Italo Curvelo dos ; ROCHA, G. B.. A QTAIM/ELF Investigation of the Electronic Structure of Mesoionic Compounds. Em: Symposium Advances in Quantum Chemical Topology, 2013, Mexico City - Mexico. Symposium Anais, 2013.
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32. CAVALCANTI, Higo Bezerra ; Rocha, Gerd Bruno. Performance Assessment of PM6 and PM7 Semiempirical Methods in the Structural Prediction of Some High Spin Manganese Porphyrins. Em: XXXVIII Congress of Theoretical Chemists of Latin Expression, 2012, Natal RN. Anais do QUITEL 2013, 2012.
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33. CAVALCANTI, Higo Bezerra ; ROCHA, G. B.. Electronic Structure Study of Some High Spin Mn(II/III)-N-Alkylpyridylporphyrins: Evaluation of the effect of Increasing Positive Charge Around the Metal center. Em: XXXVIII Congress of Theoretical Chemists of Latin Expression, 2012, Natal, RN. Anais do Quitel 2012, 2012.
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34. Martins, Evandro P. S. ; ROCHA, G. B.. Evaluation of the Semiempiricsl Methods: AM1, PM3 and PM6 in structural predicting Sb(III) and Bi(III) complexes. Em: XXXVIII Congress of Theoretical Chemists of Latin Expression, 2012, Natal, RN. Anais do QUITEL 2012, 2012.
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35. CAVALCANTI, Higo de Lima Bezerra ; ROCHA, G. B. ; Rebouças, J. S.. An Electronic Structure Study on Some High-Spin Mn(II) Porphyrin: Effects of Increasing Positive Charges Around the Metal Center. Em: XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2011, Ouro Preto. Anais do XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica, p. 399, 2011.
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36. ANJOS, Italo Curvelo dos ; ROCHA, G. B.. An Investigation on the electronic structure of mesoionic compounds. Em: XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2011, Ouro Preto. Anais do XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica, p. 171, 2011.
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37. FIGUEREDO, F. N. S. ; ROCHA, G. B.. Estudos de Dinâmica Molecular das Interações Proteína-Ligantes da Enzima dUTPase de Plasmodium falciparum. Em: XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2011, Ouro Preto. Anais do XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica, p. 408, 2011.
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38. RODRIGUES, D. A. ; COSTA JR, Nivan Bezerra da ; ROCHA, G. B. ; SIMAS, A. M. ; FREIRE, Ricardo O.. Parameterization of Europium Atom with the Explicit Inclusion of Orbitals of Type s, p and d for RM1 and AM1 methods. Em: XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2011, Ouro Preto. Anais do XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica, p. 394, 2011.
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39. MANGUEIRA, C. P. ; MAIA, J. D. C. ; CABRAL, L. A. F. ; ROCHA, G. B.. Accelerating semiempirical quantum chemistry calculations using sparse linear algebra GPU libraries for large systems. Em: XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2011, Ouro Preto. Anais do XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica, p. 429, 2011.
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40. CARVALHO, G. A. U. ; VASCONCELLOS, M. L. A. A. ; ROCHA, G. B.. Estudo MM-PBSA da Afinidade de Adutos de Morita-Baylis-Hillman na Enzima Farnesil Pirofosfato Sintade de Leishmania chagasi (LcFPPS). Em: III Simpósio de Estrutura Eletrônica e Dinâmica Molecular, 2010, 2010.
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41. CAVALCANTI, Higo de Lima Bezerra ; ROCHA, G. B.. Avaliação do Método PM6 com Respeito à Planaridade do Anel Porfirínico em Complexos contendo Mn(II) e Mn(III). Em: III Simpósio de Estrutura Eletrônica e Dinâmica Molecular, 2010, Brasília. Anais do III Simpósio de Estrutura Eletrônica e Dinâmica Molecular, 2010.
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42. ANJOS, Italo Curvelo dos ; ROCHA, G. B.. Efeitos de Substituintes na Estrutura Eletrônica de Compostos Mesoiônicos por Análise de NBO (Natural Bond Orbitals). Em: III Simpósio de Estrutura Eletrônica e Dinâmica Molecular, 2010, Brasília. Anais do III Simpósio de Estrutura Eletrônica e Dinâmica Molecular, 2010.
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43. FIGUEREDO, F. N. S. ; ROCHA, G. B.. Modelagem por homologia e cálculos de dinâmica molecular da enzima Desoxiuridina trifosfato nucleotidohidrolase (dUTPase) de Plasmodium falciparum. Em: III Simpósio de Estrutura Eletrônica e Dinâmica Molecular, 2010, Brasília. Anais do III Simpósio de Estrutura Eletrônica e Dinâmica Molecular, 2010.
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44. Medeiros, W.R. ; ROCHA, G. B.. Estudo do Complexo do Receptor Nuclear TR-Beta1 com o Ligante ácido 3,5-dicloro-4-(4-hidroxi-3-isopropilfenoxi)fenilacético por Dinâmica Molecular. Em: Congresso Químico do Brasil, 2010, João Pessoa. Anais do Congresso Químico do Brasil, 2010.
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45. NOBREGA, J. A. ; ROCHA, G. B.. Localização dos Orbitais de Fronteira do Heterodímero LdTop1LS por Dinâmica Molecular e Métodos Semi-empíricos/MOZYME. Em: III Simpósio de Estrutura Eletrônica e Dinâmica Molecular, 2010, Brasília. Anais do III Simpósio de Estrutura Eletrônica e Dinâmica Molecular, 2010.
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46. NOBREGA, J. A. ; ROCHA, G. B.. Estudo de Novos Alvos e Proposta Teórica de Novos Fármacos Contra Leishmaniose. Em: XVIII Encontro de Iniciação Científica da UFPB, 2010, João Pessoa. Anais do XVIII Encontro de Iniciação Científica da UFPB, 2010.
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47. Medeiros, W.R. ; Rocha, Gerd B.. Cálculo das Afinindades (DeltaG bind) de Agonistas do Receptor Tireoidiano TR-b1 pela Metodologia MM-PBSA. Em: III Simpósio de Estrutura Eletrônica e Dinâmica Molecular, 2010, Brasília. Anais do III Simpósio de Estrutura Eletrônica e Dinâmica Molecular, 2010.
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Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (16)
1. Rocha, G.B. Avaliando candidatos à inibidores da proteína RTA da ricina através de dinâmica molecular/SMD e cálculos quânticos semiempíricos. 2019. Apresentação de Trabalho/Simpósio
2. Rocha, G.B. Acelerando Simulações Moleculares pelo uso de Arquiteturas de Alta Performance Híbridas Multi-CPU/Multi-GPU. 2019. Apresentação de Trabalho/Outra
3. Rocha, G.B. Ferramentas de Química Quântica Aplicadas no Estudo de Biomoléculas e seus Processos. 2019. Apresentação de Trabalho/Outra
4. Rocha, G.B. Desenvolvimento de ferramentas para modelagem molecular de biomoléculas por métodos de química quântica. 2019. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
5. Rocha, Gerd Bruno. Avanços no Cálculo da Estrutura Eletrônica de Biomoléculas. 2017. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
6. ROCHA, G. B. Modelagem Molecular: Aplicações recentes e impactos na sociedade moderna. 2016. Apresentação de Trabalho/Seminário
7. ROCHA, G. B. Métodos Quânticos e parametrizações Semiempíricas. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
8. ROCHA, G. B. Métodos de Química Quântica Aplicados na Modelagem de Sistemas Moleculares Complexos. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
9. ROCHA, G. B. O papel da Química Computacional no Desenvolvimento da Sociedade Moderna. 2015. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
10. Rocha, Gerd B. Métodos Quânticos e Parametrizações Semi-empíricas. 2014. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
11. Rocha, Gerd Bruno. Semiempirical Molecular Orbital Calculations on GPUs. 2014. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
12. Rocha, Gerd Bruno. Métodos de Química Quântica Aplicados na Modelagem de Sistemas Moleculares Complexos. 2014. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
13. ROCHA, G. B. Métodos de química Quântica Aplicados na Modelagem de Sistemas Moleculares Complexos. 2013. Apresentação de Trabalho/Seminário
14. Rocha, Gerd B. Quantum chemistry methods applied to model biomolecules: computational strategies. 2013. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
15. ROCHA, G. B. Development of Semi-empirical Methods and Aplications. 2012. Apresentação de Trabalho/Seminário
16. ROCHA, G. B. Parallel Computing In Semiempirical Quantum Chemistry Calculations Using Graphical Processing Units (GPUs). 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
Demais tipos de produção bibliográfica (0)

Produção técnica

Programas de computador com registro de patente (0)
Programas de computador sem registro de patente (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (1)
1. ROCHA, G. B. Research Group on Quantum Chemistry Applied to Biological Systems. 2013; Tema: Homepage de Grupo de. 2013.Site
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Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (2)
1. ROCHA, G. B. Cálculos Quânticos de Estrutura Eletrônica Semiempíricos. 2016. Curso de curta duração ministrado/Outra
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2. ROCHA, G. B. Cálculos de Estrutura Eletrônica em Biomoléculas. 2012. Curso de curta duração ministrado/Outra
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Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (5)
1. José Gutembergue de Mendonça. Prospecção de inibidores de proteínas associadas ao vírus SARS-Cov-2 por meio do uso conjunto de ferramentas de bioinformática, simulação molecular e química quântica. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2020.
  Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
2. IGOR BARDEN GRILLO. Análise da densidade eletrônica de biomoléculas em eventos biológicos por meio de descritores de reatividade. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2019.
  Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
3. Acassio Rocha Santos. Elaboração de uma interface entre os programas Dockthor e MOPAC, para o refinamento de estruturas de Docking de proteínas e fármacos, através de métodos híbridos semiempíricos e de mecânica molecular. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2017.
  Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
4. José Cícero Alves da Silva. Estudo da Estrutura Eletrônica de Proteínas com Nós Geométricos. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, . Início: 2017.
  Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
5. IRAN FERREIRA DA SILVA. Estudo teórico-experimental das propriedades fotofísicas de compostos de coordenação de íons lantanídeos. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).. Início: 2015.
  Supervisor: Gerd Bruno da Rocha.
Dissertação de mestrado (4)
1. Rafaela Souza Morais. Otimização de parâmetros atômicos para métodos semiempíricos de química quântica.. Dissertação (Mestrado em Modelagem Matemática e Computacional) - Universidade Federal da Paraíba, . Início: 2020.
  Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
2. Josuel Feitosa Rodrigues. Implementação paralela (GPU e shared memory) do método de escalonamento linear DC no programa de Química Quântica Quantum Scenery. Dissertação (Mestrado em Modelagem Matemática e Computacional) - Universidade Federal da Paraíba, . Início: 2020.
  Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
3. Wenison Marrone Souza Farias. Design de enzimas por métodos de química quântica. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2020.
  Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
4. Luiz Eduardo Gomes da Cruz. Estudo teórico de novos líquidos iônicos. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2019.
  Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (5)
1. RONDYNELLY LUCAS DINIZ CORREIA DOS SANTOS. AVALIAÇÃO DA EFICIÊNCIA COMPUTACIONAL DE REPRESENTAÇÕES POLINOMIAIS DE FUNÇÕES GAUSSIANAS NO CÁLCULO DA DENSIDADE ELETRÔNICA TOTAL E DOS ORBITAIS MOLECULARES DE FRONTEIRA. Iniciação científica (Graduando em Química) - Universidade Federal da Paraíba, . Início: 2021.
  Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
2. BIANCA RAFAELA AMARAL RAMOS. Avaliação da performance de ferramentas de Aprendizado de Máquina na predição de propriedades moleculares de di-peptídeos com cadeias laterais ácidas.. Iniciação científica (Graduando em Engenharia Química) - Universidade Federal da Paraíba, . Início: 2021.
  Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
3. RAYSSA THAYANNE NOBREGA ERNESTO. Avaliação da performance de ferramentas de Aprendizado de Máquina na predição de propriedades moleculares de di-peptídeos com cadeias laterais básicas. Iniciação científica (Graduando em Matemática Computacional) - Universidade Federal da Paraíba, . Início: 2021.
  Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
4. KASSIA CRISTINA DE BARROS. Emprego de descritores de Química Quântica na técnica de mutagênese por varredura de alanina (ASM) para avaliar o efeito de resíduos nas interações ligante-proteína. Iniciação científica (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2020.
  Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
5. ITALO NICACIO DOS SANTOS GOMES DE FIGUEIREDO. Implementando bibliotecas de álgebra linear baseadas em GPUs no programa Quantum Scenery. Iniciação científica (Graduando em Matemática Computacional) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2020.
  Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (2)
1. Gabriel Aires Urquiza de Carvalho. . Universidade Federal da Paraíba, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2019.
  Supervisor: Gerd Bruno da Rocha.
2. Sidney Ramos de Santana. . Universidade Federal da Paraíba, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2013.
  Supervisor: Gerd Bruno da Rocha.
Tese de doutorado (6)

ELTON JOSÉ FERREIRA CHAVES. Obtenção de Inibidores da Subunidade Catalítica da Ricina, RTA, Usando Métodos de Modelagem Molecular. Tese (Doutorado em Rede Nordeste de Biotecnologia) - Universidade Federal da Paraíba, . 2021.
Supervisor: Gerd Bruno da Rocha.
MARIA WERUSKA PEREIRA DE OLIVEIRA. Explorando metodologias teóricas clássicas e quânticas para modelagem e simulação molecular de compostos empregados como agentes de contrastes em MRI. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2020.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Higo de Lima Bezerra Cavalcanti. INVESTIGAÇÕES TEÓRICAS EM COMPOSTOS DE COORDENAÇÃO CONTENDO METAIS DE TRANSIÇÃO E ÍONS LANTANÍDEOS: ELABORAÇÃO DE MÉTODOS E APLICAÇÕES EM BIOINORGÂNICA. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2017.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Gabriel Aires Urquiza de Carvalho. Estudo da aplicação de descritores de densidades eletrônicas de proteínas no estudo de suas características químicas e biológicas. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2017.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Italo Curvelo dos Anjos. AVALIAÇÃO TOPOLÓGICA DA ESTRUTURA ELETRÔNICA DE COMPOSTOS MESOIÔNICOS. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2016.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Evandro Paulo Soares Martins. Síntese, Modelagem Molecular e Atividade Antimicrobiana de Complexos de Sb(III) e Bi(III) com Derivados da 1,3,5-Triazina e Mesoiônicos do Núcleo 1,3-Tiazólio-Tiolato. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2015.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Dissertação de mestrado (12)

Larissa da Silva Pereira. Estudo teórico do mecanismo de ação da enzima RTA da Ricina com um ligante análogo ao substrato natural rRNA 28S. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2020.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Rodrigo Nóbrega Rocha Xavier. PYCRYSTALSCD: UM SOFTWARE PARA OBTENÇÃO DA DEMARCAÇÃO DO CLUSTER SUPRAMOLECULAR EM CRISTAIS ORGÂNICOS. Dissertação (Mestrado em Modelagem Matemática e Computacional) - Universidade Federal da Paraíba, . 2020.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
EMERSON GONCALVES MOREIRA. CÁLCULO DE PROPRIEDADES TERMODINÂMICAS, CINÉTICAS E ESPECTROSCÓPICAS DE COMPOSTOS MESOIÔNICOS EM SOLUÇÃO. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2019.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
IGOR BARDEN GRILLO. Estudo da Computação de Descritores de Reatividade de um Sistema Polipeptídico Usando Hamiltonianos Semi-empíricos. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2019.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Júlio Daniel de Carvalho Maia. Quantum Scenery: Um Novo Software de Química Quântica Semiempírico Para Sistemas de Memória Distribuída. Dissertação (Mestrado em Informática) - Universidade Federal da Paraíba, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2018.
Supervisor: Gerd Bruno da Rocha.
ELTON JOSÉ FERREIRA CHAVES. SIMULAÇÃO MOLECULAR DE INIBIDORES DA SUBUNIDADE DA RICINA, RTA. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal da Paraíba, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2017.
Supervisor: Gerd Bruno da Rocha.
Moisés Viana Felipe de Oliveira. O Método de Multipolos Rápidos Aplicados ao Método das Soluções Fundamentais. Dissertação (Mestrado em Modelagem Matemática e Computacional) - Universidade Federal da Paraíba, . 2016.
Supervisor: Gerd Bruno da Rocha.
Carlos Peixoto Mangueira Júnior. Paralelizando o MOPAC usando CUDA e bibliotecas de Matrizes Esparsas.. Dissertação (Mestrado em Informática) - Universidade Federal da Paraíba, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2012.
Supervisor: Gerd Bruno da Rocha.
Gabriel Aires Urquiza de Carvalho. Avaliação de Uso de Técnicas de MMGBSA na Varredura Virtual de Bibliotecas de Ligantes para o Desenvolvimento de Fármacos contra Leishmania amazonensis e Leishmania chagasi. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2011.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Ítalo Curvelo dos Anjos. Estudo da Estrutura Eletrônica de Compostos Mesoiônicos. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2011.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Higo de Lima Bezerra Cavalcanti. Um Estudo da Estrutura Eletrônica de Algumas Mn(II/III)-N-Alquilpiridilporfirinas de Alto Spin: Avaliação do Efeito de Crescente Carga Positiva ao Redor do Centro Metálico. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2011.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Evandro Paulo Soares Martins. Síntese e Estudo Termodinâmico em Adutos de Trihaletos de Antimônio e Bismuto com 2,2?-Bipiridina e 1,10-Fenantrolina. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2010.
Supervisor: Gerd Bruno da Rocha.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (25)

KASSIA CRISTINA DE BARROS. Usando o software ProtDCal para o cálculo de descritores topológicos e termodinâmicos de conformações de proteínas selecionadas do banco de dados I-Tasser.. (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2020.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
RAYSSA THAYANNE NOBREGA ERNESTO. Viabilizando o uso prático do programa Quantum Scenery através da confecção de manual e tutoriais para sua divulgação. (Graduando em Matemática Computacional) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2020.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Luiz Eduardo Gomes da Cruz. Refinamento de estruturas de docking molecular usando abordagem QM/MM. (Graduando em Bacharelado Em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2019.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Luiz Eduardo Gomes da Cruz. Busca de Isômeros Conformacionais de Complexos de Gadolínio Di- e Tri-Nucleares Através do Uso da Técnica QMDFF. (Graduando em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2017.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Amanara Souza de Freitas. Cálculo das afinidades de novos inibidores da proteína RTA da Ricina através dos métodos MM-GBSA e MM-PBSA. (Graduando em Engenharia Química) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2017.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
LARISSA DA SILVA PEREIRA. USANDO A ENTALPIA DE FORMAÇÃO EM SOLUÇÃO AQUOSA COMO FUNÇÃO ESCORE PARA DETECTAR O ARRANJO PREFERENCIAL EM COMPLEXOS PROTEÍNA-PROTEÍNA. (Graduando em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2017.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Luiz Eduardo Gomes da Cruz. ANÁLISE DA ESTRUTURA ELETRÔNICA DE CONFORMAÇÕES DE PROTEÍNAS NO PROCESSO DE ENOVELAMENTO. (Graduando em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2017.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
AMANARA SOUZA DE FREITAS. CÁLCULOS DE QUÍMICA QUÂNTICA PARA A PREVISÃO DA ENTALPIA DE LIGAÇÃO DE INIBIDORES DA RICINA. (Graduando em Engenharia Química) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2016.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
LUIZ EDUARDO GOMES DA CRUZ. USO DA TÉCNICA QMDFF NA BUSCA DE ISÔMEROS CONFORMACIONAIS DE COMPLEXOS DE LANTANÍDEOS COM LIGANTES MACROCÍCLICOS. (Graduando em Química) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2016.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
José Lauciano Ferreira de Almeida. Proposta de um algoritmo paralelo (CPU-GPU) para a montagem da Matriz de Fock de cálculos semiempíricos de moléculas com muitos átomos. (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2015.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
JÚLIO DANIEL DE CARVALHO MAIA. IMPLEMENTAÇÃO DA BIBLIOTECA PARALELA SCALAPACK NO PROGRAMA MOPAC PARA PERMITIR SUA EXECUÇÃO EM SISTEMAS COMPUTACIONAIS COM MEMÓRIA DISTRIBUÍDA. (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2015.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Júlio Daniel de Carvalho Maia. Implementação do algoritmo de purificação da matriz densidade em substituição a diagonalização de matrizes esparsas no cálculo químico-quântico de biomoléculas. (Graduando em Computação e Informática) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2014.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
José Lauciano Ferreira de Almeida. Paralelização de sub-rotinas do cálculo de integrais atômicas semi-empíricas em arquiteturas híbridas CPU/GPU. (Graduando em Computação e Informática) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2014.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Júlio Daniel de Carvalho Maia. Paralelização de sub-rotinas de cálculo de gradientes de um código semi-empírico baseado no programa MOPAC utilizando a plataforma NVIDIA/CUDA.. (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2013.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Júlio Daniel de Carvalho Maia. Paralelização de Sub-rotinas do Programa Mopac Utilizando a Plataforma Nvidia/CUDA. (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2012.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Felipe Nobrega Sousa de Figueiredo. Dinâmica da Saída de Ligantes da Enzima Desoxiuridina Trifosfato Nucleotidohidrolase para o Projeto de Novos Fármacos no Combate à Malária. (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2012.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Waldene Alexandre Vieira de Farias. Busca de Isômeros Conformacionais de Complexos de Lantanídeos por Dinâmica Molecular. (Graduando em Engenharia Química) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2012.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Felipe Nobrega Sousa de Figueiredo. Cálculo das afinidades de novos bloqueadores da enzima Desoxiuridina trifosfato nucleotidohidrolase de Plasmodium falciparum através dos métodos Docking Molecular, MM-PBSA e MM-GBSA. (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2012.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Waldene Alexandre Vieira de Farias. Paralelização de Sub-rotinas do Programa Mopac Utilizando a Plataforma Nvidia/CUDA. (Graduando em Engenharia Química) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2012.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Felipe Nóbrega Sousa de Figueirêdo. Cálculos das interações ligante-receptor de novos fármacos para malária usando de dinâmica molecular e potenciais híbridos QM/MM. (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2011.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Vanessa Morais Muniz. Cálculo das afinidades de novos agonistas do receptores TR-?1 através dos métodos MM-PBSA e MM-GBSA. (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2011.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Jessé da Nóbrega Batista Azevêdo. Estudo teórico de alvos moleculares em Leishmania. (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2010.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Vinícius Filgueiras de Oliveira. Uso da biblioteca paralela DGEMM/CUBLAS para acelerar o cálculo de otimização de geometria do código do programa MOPAC.. (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2010.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Felipe Nóbrega Sousa de Figueiredo. Estudo de novos alvos e proposta teórica de novos fármacos contra leishmaniose. (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2010.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Jessé da Nóbrega Batista Azevêdo. Cálculo das afinidades de novos agonistas do receptores TR-?1 através dos métodos MM-PBSA e MM-GBSA. (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2010.
Orientador: Gerd Bruno da Rocha.
Orientações de outra natureza (0)

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (5)

2014-Atual. Novos Metodos em Quimica Teorica: Design e Sintese de Prototipos Moleculares Luminescentes
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (3) . Integrantes: Gerd Bruno da Rocha - Integrante / Alfredo Mayall Simas - Coordenador / Francisco Cribari Neto - Integrante / Simone M. C. Gonçalves - Integrante.
Membro: Gerd Bruno da Rocha.
2014-Atual. Modelagem Molecular de Sistemas Complexos: Desenvolvimentos Teoricos, Computacionais e Aplicacoes
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Gerd Bruno da Rocha - Coordenador.
Membro: Gerd Bruno da Rocha.
2013-Atual. Bioinformatica Estrutural de Proteinas: modelos, algoritmos e aplicacoes biotecnologicas
Descrição: Motivação: Este projeto propõe-se enfrentar dois desafios biotecnológicos de grande relevância nacional. O primeiro envolve a ricina, uma potente fitotoxina encontrada na mamoneira. Coprodutos da produção do ´óleo de mamona podem conter quantidades letais de ricina. Além do risco de intoxicação animal e humana do bagaço, isso tem dificultado sua reutilização e reciclagem, em especial no semiárido nordestino. A ricina preocupa também pelo seu potencial uso como arma química. Portanto, ha´ forte apelo para se encontrar meios efetivos de neutralizar, inibir e/ou detectar a ricina. O segundo envolve a modelagem de celulases multifuncionais, capazes de degradar eficientemente a lignocelulose, composto base para a produção de biocombustíveis de segunda geração, os quais têm por princípio a utilização de subprodutos de plantas que não podem ser usados na alimentação humana. Ambos desafios exigem uma abordagem multidisciplinar sinérgica entre a modelagem teórica in silico e experimental in vitro. Objetivos: 1) Prever in silico e validar in vitro ligantes de ricina 2) Simular in silico e caracterizar in vitro efeitos causados por intervenções estratégicas em ?-glicosidases modificadas. 3) Projetar, implementar e validar modelos, algoritmos e ferramentas de Quimioinformática e Bioinformática Estrutural de Proteínas que permitam dar suporte aos objetivos biotecnológicos previamente descritos. Resultados Esperados: Espera-se que este projeto possa revelar novas plataformas químicas para o desenvolvimento de inibidores, kits de detecção, biossensores, neutralizadores (substratos suicidas) e outros produtos de inovação biotecnológica baseados na ricina, com potencial para alavancar o agronegócio da mamona e a indústria nacional de fármacos. Espera-se também a modelagem de celulases multifuncionais, capazes especialmente de orientar a manipulação genética de algas produtoras de ?-glicosidases, com características catalíticas eficientes e de tolerância à inibição por glicose e celobiose, permitindo seu uso industrial na produção de etanol de segunda geração. Espera-se, enfim, que esses desafios possam inspirar novas metodologias matemáticas, computacionais, químicas e bioquímicas integradas, de modo a gerar artefatos biotecnológicos inovadores, bem como contribuir para a formação de profissionais com perfil multidisciplinar altamente qualificados.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Gerd Bruno da Rocha - Integrante / Demétrio A da Silva Filho - Integrante / Gabriel Aires Urquiza de Carvalho - Integrante / Julio Daniel Carvalho Maia - Integrante / Adriano Velasque Werhli - Integrante / Raquel C. de Melo-Minardi - Coordenador / Wagner Meira Jr. - Integrante / Carlos Henrique da Silveira - Integrante / Amanara Souza de Freitas - Integrante / Igor Barden Grillo - Integrante / Acassio Rocha Santos - Integrante.
Membro: Gerd Bruno da Rocha.
2012-2015. Estudo teorico de metaloporfirinas
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Gerd Bruno da Rocha - Coordenador / Silmar Andrade do Monte - Integrante / Otávio Luis de Santana - Integrante / Sidney Ramos de Santana - Integrante / Elizete Ventura - Integrante / Weber, Karen C. - Integrante / Júlio Santos Rebouças - Integrante.
Membro: Gerd Bruno da Rocha.
2010-2014. Implementacao De Algoritmos De Escalonamento Linear Em Codigos Baseados No Programa Mopac Usando Programacao Paralela
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (3) . Integrantes: Gerd Bruno da Rocha - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Gerd Bruno da Rocha.

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (8)

Menção honrosa no XX Simpósio Brasileiro de Química Teórica, Simpósio Brasileiro de Química Teórica.. 2019.
Membro: Gerd Bruno da Rocha.
2o Lugar de melhor poster apresentado no XX Simpósio Brasileiro de Química Teórica, Simpósio Brasileiro de Química Teórica.. 2019.
Membro: Gerd Bruno da Rocha.
Menção Honrosa na VIII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, MCT/LNCC.. 2016.
Membro: Gerd Bruno da Rocha.
Menção Honrosa na VIII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, MCT/LNCC.. 2016.
Membro: Gerd Bruno da Rocha.
Prêmio Jovem Pesquisador, Universidade Federal da Paraíba/CNPq.. 2015.
Membro: Gerd Bruno da Rocha.
Menção honrosa no 12o Prêmio Destaque na Iniciação Científica e Tecnológica do CNPq, CNPq.. 2015.
Membro: Gerd Bruno da Rocha.
Best Poster, Quitel - XXXVIII Congress of Theoretical Chemists of Latin Expression.. 2012.
Membro: Gerd Bruno da Rocha.
Melhor Painel do XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica (Seção Desenvolvimento de Softwares), Simpósio Brasileiro de Química Teórica.. 2011.
Membro: Gerd Bruno da Rocha.

Participação em eventos

Total de participação em eventos (9)

10ª ESCOLA DE MODELAGEM MOLECULAR EM SISTEMAS BIOLÓGICOS. Modelagem Molecular de Biomoléculas com uso de Métodos de Química Quântica. 2021. (Congresso).
3a Escola Gaucha de Bioinformática.Acelerando Simulações Moleculares pelo uso de Arquiteturas de Alta Performance Híbridas Multi-CPU/Multi-GPU. 2019. (Outra).
XX Simpósio Brasileiro de Química Teórica.Avaliando candidatos à inibidores da proteína RTA da ricina através de dinâmica molecular/SMD e cálculo quânticos semiempíricos. 2019. (Simpósio).
IX Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos.Métodos Semiempíricos deQuímica Quântica. 2018. (Outra).
XIX Simpósio Brasileiro de Química Teórica.Aplicação do método RM1 em complexos de Eu3+, Gd3+ e Tb3+ contendo ligantes com anéis Porfirina. 2017. (Simpósio).
VIII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. Métodos Quânticos e Parametrizações Semiempíricas. 2016. (Congresso).
10th Triennial Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists. Accelerating Semiempirical Quantum Chemical Calculation by Using Multi-GPU Platforms: Implementations and Benchmarks. 2014. (Congresso).
VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. Métodos Quânticos e Parametrizações Semi-empíricas. 2014. (Congresso).
XIV Escola Brasieleira de Estrutura Eletrônica. Métodos de Química Quântica Aplicados na Modelagem de Sistemas Complexos. 2014. (Congresso).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (3)

ROCHA, G. B.; FARIA, J. R.. XIX Encontro Nacional de Modelagem Computacional. 2016. Congresso
Seabra G. M. ; ROCHA, G. B.. AMBER Workshop October 2013. 2013. Outro
TEOTONIO, E. E. S. ; ROCHA, G. B. ; BRITO, H. F. ; HOLSA, J. ; VALE, J. A. ; FELINTO, M. C. F. C. ; MALTA, Oscar L ; SALDANHA, T. ; FAUSTINO, Wagner M. 5o Encontro Nacional Sobre Terras Raras. 2012. Congresso

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (1)

Gerd Bruno da Rocha ⇔ Rafaela Salgado Ferreira (1.0)
ROCHA, RAFAEL E. O. ; CHAVES, ELTON J. F. ; FISCHER, PEDRO H. C. ; COSTA, LEON S. C. ; GRILLO, IGOR BARDEN ; DA CRUZ, LUIZ E. G. ; GUEDES, FABIANA C. ; DA SILVEIRA, CARLOS H. ; SCOTTI, MARCUS T. ; CAMARGO, ALEX D. ; MACHADO, KARINA S. ; WERHLI, ADRIANO V. ; Ferreira, Rafaela S. ; ROCHA, GERD B. ; DE LIMA, LEONARDO H. F.. A higher flexibility at the SARS-CoV-2 main protease active site compared to SARS-CoV and its potentialities for new inhibitor virtual screening targeting multi-conformers. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS. v. ., p. 1-21, issn: 0739-1102, 2021.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

(*) Relatório criado com produções desde 2010 até 2021
Data de processamento: 06/11/2021 15:22:35

Relatório gerado por scriptLattes V8.11. Os resultados estão sujeitos a falhas devido a inconsistências no preenchimento dos CVs Lattes. E-mail de contato: henriquimicosp@gmail.com