Especialistas Seniores em Covid-19 com atuação no Brasil

Laurent Emmanuel Dardenne

Possui graduação em Física pela Universidade de Brasília (1992), mestrado em Física pela Universidade de Brasília (1995) e doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica) pelo Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho da Universidade Federal do Rio de Janeiro (2000). Atualmente é pesquisador do Laboratório Nacional de Computação Científica. Tem experiência na área de Biofísica, com ênfase em Modelagem Molecular, atuando principalmente nos seguintes temas: desenvolvimento de metodologias de docking e predição ab initio/de novo de estruturas de proteínas, drug design, dinâmica molecular, algorítmos genéticos e cálculos quânticos de estrutura eletrônica. (Texto informado pelo autor)

  • https://lattes.cnpq.br/8344194525615133 (17/09/2021)
  • Rótulo/Grupo:
  • Bolsa CNPq: Nível 2
  • Período de análise:
  • Endereço: Laboratório Nacional de Computação Científica, Pós Graduação, Departamento de Mecânica Computacional. Avenida Getúlio Vargas 333 Quitandinha 25651070 - Petrópolis, RJ - Brasil Telefone: (24) 22336009 Ramal: 6009 Fax: (24) 22336167 URL da Homepage: https://www.gmmsb.lncc.br
  • Grande área: Ciências Biológicas
  • Área: Biofísica
  • Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

Prêmios e títulos

Participação em eventos

Organização de eventos

Lista de colaborações


Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

  • Total de projetos de pesquisa (3)
    1. 2015-Atual. Identificacao de Alvos por Docagem Reversa Aplicada ao Estudo e Otimizacao Estrutural de Compostos Leishmanicidas e Tripanocidas
      Descrição: Projeto financiado pelo INCT-INOFAR (CNPq). Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Laurent Emmanuel Dardenne - Coordenador / Maurício R Sant'Anna - Integrante / Isabella Alvim Guedes - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
      Membro: Laurent Emmanuel Dardenne.
    2. 2015-Atual. Algoritmos e Sistemas Computacionais em Plataforma de Alto Desempenho para Predicao de Estrutura de Proteinas e Desenho Racional de Farmacos
      Descrição: Desenvolvimentos metodológicos e computacionais que auxiliem pesquisas na área de desenho racional de fármacos e engenharia de proteínas têm uma importância estratégica bastante relevante e com o potencial de gerar resultados de grande impacto científico, econômico e tecnológico. Os objetivos científicos deste projeto estão associados ao desenvolvimento de sistemas computacionais disponibilizados na forma de portais web gratuitos construídos utilizando metodologias próprias, para triagem virtual em larga escala de compostos candidatos à fármacos e para predição de estruturas de proteínas utilizando metodologias template free. Estas ferramentas computacionais estarão acopladas à nova plataforma computacional de alto desempenho do LNCC/SINAPAD, recentemente adquirida pelo Brasil, com capacidade de processamento da ordem de petaflops. O desenvolvimento e disponibilização destes portais visam potencializar projetos de pesquisa nas áreas de desenho racional de fármacos e biologia estrutural/engenharia de proteínas desenvolvidos por grupos de pesquisa brasileiros. O desenvolvimento dos portais está também associado com a implementação de novas abordagens metodológicas e algoritmos visando a obtenção de uma maior capacidade preditiva dos programas envolvidos. A equipe envolvida neste projeto possui pesquisadores com excelente histórico de pesquisa multidisciplinar e experiência comprovada nos seguintes aspectos: (i) desenvolvimento de programas e portais para atracamento molecular receptor-ligante e predição de estruturas de proteínas; (ii) desenvolvimento de algoritmos utilizando metaheurísticas e uso de técnicas de aprendizagem de máquina; (iii) paralelização de programas utilizando arquiteturas multicore e placas GPUs (Graphic Processing Units). É também objetivo deste projeto procurar contribuir para a formação de recursos humanos de alto nível na área de desenvolvimento metodológico em modelagem molecular e computação de alto desempenho... Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Laurent Emmanuel Dardenne - Integrante / Hélio José Correa Barbosa - Coordenador / Fábio Lima Custódio - Integrante / Isabella Alvim Guedes - Integrante / Camila Silva de Magalhães - Integrante / Eduardo Krempser - Integrante. Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.
      Membro: Laurent Emmanuel Dardenne.
      Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Helio José Corrêa Barbosa - Integrante / Helio José Correa Barbosa - Coordenador / Fábio L. Custódio - Integrante / Laurent E. Dardenne - Integrante. Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.
      Membro: Helio Jose Correa Barbosa.
    3. 2014-Atual. INCT-INOFAR -Instituto Nacional de Ciencia e Tecnologia de Farmacos e Medicamentos
      Descrição: O Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fármacos e Medicamentos (INCT-INOFAR), coordenado pelo Professor Dr Eliezer J. Barreiro, LASSBio, UFRJ, se enquadra na área da Saúde, atendendo à indução do Edital de concorrência nesta área prioritária e se situa, especificamente, na especialidade de Fármacos e Medicamentos tendo como metas principais articular, organizadamente, as competências nacionais existentes no País e situadas nos diferentes estágios desta intrincada cadeia de inovação, a exemplo do Instituto do Milênio Inovação e Desenvolvimento em Fármacos e Medicamentos (IM-INOFAR, Proc. CNPq 420.015/05-1), projeto inspirador desta proposta e em vias de conclusão no início de 2009, que alcançou expressivos resultados. O INCT-INOFAR pretende dar continuidade aos esforços de pesquisa realizados no IM-INOFAR e avançar na cadeia de inovação em fármacos e medicamentos os expressivos resultados obtidos no IM-INOFAR que lograram a descoberta de novos compostos-protótipos, candidatos a novos fármacos antiinflamatórios e antiasmáticos, completando seus estudos até os ensaios pré-clínicos. No âmbito do INCT-INOFAR também serão estudados outros compostos promissores descobertos nas áreas do sistema cardiovascular (SCV); sistema nervoso central (SNC), da quimioterapia de doenças negligenciadas, da inflamação e da dor, logrando-se a identificação de protótipos cardioativos, antipsicóticos, leishmanicidas, antiinflamatórios e analgésicos não opióides que serão objeto de estudos visando atingir a fase pré-clínica. O INCT-INOFAR conta a participação de empresa farmacêutica associada que é responsável pelas etapas de desenvolvimento farmacotécnico dos eventuais compostos-protótipos que atingirem este estágio da cadeia de inovação. A equipe participante do INCT-INOFAR inclui especialistas, líderes dos grupos de pesquisa associados, que atuam nas diversas fases hierárquicas da cadeia de inovação em fármacos e medicamentos lodados em institutos de pesquisa e instituições de ensino superior em sua ampla maioria. No ambiente da inovação incremental, o INCT-INOFAR estudará formas de síntese de novos fármacos genéricos e de fármacos genéricos novos, i.e. fármacos que representam impacto nas importações, sem produção no País e aqueles com proteção patentária expirada e representem relevantes oportunidades de negócios pela sua valia terapêutica. A equipe participante conta com competências técnico-científicas reconhecidas internacionalmente e portanto, capazes também de atuarem no desenvolvimento de biofármacos genéricos. Os temas de trabalho do INCT-INOFAR compreendem projetos que permitem a descoberta e desenvolvimento de candidatos a fármacos anticâncer e antiinflamatórios inovadores, atuando através de mecanismos de ação pautados em alvos-terapêuticos novos, racionalmente selecionados. Conta ainda com parcerias internacionais, através de contatos de seus participantes e envolvimento em outros projetos e.g. COFECUB-CAPES, Procad (CAPES), Prosul (CNPq), Pronex (CNPq-FAPERJ), o que assegura a integração com colaboradores, eventuais, de todas as especialidades necessárias à atividade na cadeia de inovação em fármacos e medicamentos. No aspecto da divulgação e popularização da ciência cabe especial menção o projeto ?Portal de Fármacos? da FAPERJ, sob responsabilidade do Coordenador do INCT-INOFAR, que representa autêntico observatório virtual para transparenciar seus resultados, adotando perfil distinto do seu portal específico ? em construção www.inct-inofar.ccs.ufrj.br - que, a exemplo do IM-INOFAR, será tribuna e fórum de contato contínuo e intercâmbio de seus pesquisadores, assegurando, inclusive, em área de acesso restrito aos líderes de equipe, o nível de confidencialidade e sigilo que suas informações exigem. Representará o fórum de divulgação das decisões do Comitê de Governança e Acompanhamento (CGA) do INCT-INOFAR que o administrará co. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Laurent Emmanuel Dardenne - Integrante / EliezerJ Barreiro - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
      Membro: Laurent Emmanuel Dardenne.

Prêmios e títulos

  • Total de prêmios e títulos (5)
    1. Autor de um dos quatro artigos mais citados da revista JCIM publicados no ano de 2020, JCIM.. 2021.
      Membro: Laurent Emmanuel Dardenne.
    2. Trabalho "Design, synthesis and evaluation of novel thalidomide-donepezil hybrids as new inhibitors of AChE for the treatment of Alzheimer?s disease" premiado no 9th BRAZMEDCHEM 2019, BRAZMEDCHEM.. 2019.
      Membro: Laurent Emmanuel Dardenne.
    3. 14 Prêmio Destaque na Iniciação Científica e Tecnológica do CNPq, na área de Ciências da Vida, CNPq.. 2017.
      Membro: Laurent Emmanuel Dardenne.
    4. Capa do periódico Journal of the Brazillian Chemical Society, associado ao artigo em 2017, 28 (11), 2218-2228, JBCS.. 2017.
      Membro: Laurent Emmanuel Dardenne.
    5. Best Paper Award, CIBCB 2015 IEEE Computational Inteligence Society.. 2015.
      Membro: Laurent Emmanuel Dardenne.

Participação em eventos

  • Total de participação em eventos (25)
    1. 9 BrazMedChem. Protein-Ligand Docking: Pose and Binding Affinity Prediction. 2019. (Congresso).
    2. SancaMedChem. Protein-Ligand Docking using DockThor: Pose and Binding Affinity Prediction. 2019. (Congresso).
    3. 13 CASP. GAPF_LNCC: an automated method for protein structure prediction with a multiple minima genetic algorithm. 2018. (Congresso).
    4. Workshop Physics and Biology of Proteins.Strategies for Template-Free Protein Structure Prediction. 2017. (Simpósio).
    5. 12 CASP. GAPF_LNCC_SERVER: a fully automated server for template-free protein structure prediction with a multiple minima genetic algorithm. 2016. (Congresso).
    6. Brazilian Symposium in Medicinal Chemistry.Approaches to Evaluation and Improvement Empirical Affinity Prediction Functions for Virtual Screening. 2016. (Simpósio).
    7. XLVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq). Development of Empirical Scoring Functions for Predicting Protein-Ligand Binding Affinity. 2016. (Congresso).
    8. XVIII Simpósio Brasileiro de Química Teórica.DockThor: A Brazilian Receptor-Ligand Docking Program. 2015. (Simpósio).
    9. 43 SBBq.Ab Initio Protein Structure Prediction: Assessing Components for the Energy Function. 2014. (Simpósio).
    10. III Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática.Avaliação de diversos protocolos automáticos de preparação da proteína e do ligante em experimentos de docking molecular. 2014. (Simpósio).
    11. XXIII International Symposium on Medicinal Chemistry (EFMC-ISMC 2014).DockThor: A Free Protein-Ligand Docking Web Server. 2014. (Simpósio).
    12. 65 Reunião Anual da SBPC. Projeto Dockthor: Um Programa Brasileiro para o Desenho Racional de Fármacos. 2013. (Congresso).
    13. II Escola Brasileira de Modelagem Molecular.Strategies for Ab Initio Protein Structure Prediction. 2013. (Simpósio).
    14. XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular ? SBBq. The DockThor Portal: a Free Protein-Ligand Docking Server. 2013. (Congresso).
    15. Critical Assessment of Protein Structure Prediction - CASP10. none. 2012. (Congresso).
    16. II Latin American Federation of Biophysical Societies Congress/XXXVII Brazilian Biophysical Society Congress. Development and Validation of a New Multi-Solution Receptor-Ligand Docking Program. 2012. (Congresso).
    17. VI Workshop de Avaliação e Acompanhamento do Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fármacos e Medicamentos.Structural and Ligand Binding Properties Studies of the IKK2 Molecular Target. 2012. (Simpósio).
    18. XLI Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (SBBq). Dockthor: Development and Validation of a New Docking Program. 2012. (Congresso).
    19. XXII International Symposium on Medicinal Chemsitry EFMC/ISMC. MOLECULAR MODELING OF IKK2 TARGET: STRUCTURAL AND LIGAND BINDING PROPERTIES STUDIES. 2012. (Congresso).
    20. Encontro de Física - Integração da Física na América Latina - SBF. Ab Iniito Protein Structure Prediction using All-Atom and Coarse Grained Models. 2011. (Congresso).
    21. I Escola Brasileira de Modelagem Molecular.Metodologias de Docking Receptor-Ligante. 2011. (Outra).
    22. II Reunião Anual de Avaliação do Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Fármacos e Medicamentos.Virtual Screening utilizando o programa Dockthor. 2011. (Outra).
    23. Simpósio Interdisciplinar Física+Bioinformática 2011. Dockthor: Development and Validation of a Ligand-Receptor Docking Program. 2011. (Congresso).
    24. XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica. Dockthor: Development and Validation of a Ligand-Receptor Docking Program using a Diverse Set of Ligands. 2011. (Congresso).
    25. V BrazMedChem. DockThor: Software for Ligand Flexible Docking Using a Genetic Algorithm and the MMFF94 Force Field. 2010. (Congresso).

Organização de eventos

  • Total de organização de eventos (6)
    1. EMMANUEL DARDENNE, LAURENT; CAFFARENA, Ernesto Raul ; PASCUTTI, Pedro Geraldo ; CAPRILES, Priscila Vanessa da Silva Zabala ; Guedes, I.A. ; CUSTÓDIO, Fábio Lima ; MAGALHÃES, Camila Silva de ; FIGUEIREDO, P. ; FERNANDES, T. ; LEAL, M. ; Batista, PR. X ESCOLA DE MODELAGEM MOLECULAR EM SISTEMAS BIOLÓGICOS. 2021. Congresso
    2. DARDENNE, LAURENT E.; CAFFARENA, Ernesto Raul ; PASCUTTI, Pedro Geraldo ; Guedes, I.A. ; DE MAGALHAES, C S ; CAPRILES, Priscila Vanessa da Silva Zabala ; GOMES, Diego Henry Barreto ; Batista, PR ; CUSTÓDIO, Fábio Lima. IX ESCOLA DE MODELAGEM MOLECULAR EM SISTEMAS BIOLÓGICOS. 2018. Congresso
    3. DARDENNE, L. E.; PASCUTTI, Pedro Geraldo ; CAFFARENA, Ernesto Raul. VIII ESCOLA DE MODELAGEM MOLECULAR EM SISTEMAS BIOLÓGICOS. 2016. Congresso
    4. DARDENNE, L. E.; CAFFARENA, Ernesto Raul ; PASCUTTI, Pedro Geraldo. VII ESCOLA DE MODELAGEM MOLECULAR EM SISTEMAS BIOLÓGICOS. 2014. Congresso
    5. DARDENNE, L. E.; CAFFARENA, Ernesto Raul ; PASCUTTI, Pedro Geraldo. VI ESCOLA DE MODELAGEM MOLECULAR EM SISTEMAS BIOLÓGICOS. 2012. Congresso
    6. DARDENNE, L. E.; CAFFARENA, Ernesto Raul ; PASCUTTI, Pedro Geraldo. V ESCOLA DE MODELAGEM MOLECULAR EM SISTEMAS BIOLOGICOS. 2010. Congresso

Lista de colaborações

  • Colaborações endôgenas (12)
    • Laurent Emmanuel Dardenne ⇔ Helio José Corrêa Barbosa (9.0)
      1. GUEDES, ISABELLA A. ; COSTA, LEON S. C. ; DOS SANTOS, KARINA B. ; KARL, ANA L. M. ; ROCHA, GREGÓRIO K. ; TEIXEIRA, IURY M. ; GALHEIGO, MARCELO M. ; MEDEIROS, VIVIAN ; KREMPSER, EDUARDO ; CUSTÓDIO, FÁBIO L. ; BARBOSA, HELIO J. C. ; NICOLÁS, MARISA F. ; DARDENNE, LAURENT E.. Drug design and repurposing with DockThor-VS web server focusing on SARS-CoV-2 therapeutic targets and their non-synonym variants. Scientific Reports. v. 11, p. 5543-20, issn: 2045-2322, 2021.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. CUSTÓDIO, Fábio Lima ; BARBOSA, HELIO J.C. ; Dardenne, Laurent Emmanuel. A multiple minima genetic algorithm for protein structure prediction. Applied Soft Computing (Print). v. 15, p. 88-99, issn: 1568-4946, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      3. DE MAGALHÃES, CAMILA SILVA ; ALMEIDA, DIOGO MARINHO ; BARBOSA, HELIO JOSÉ CORREA ; Dardenne, Laurent Emmanuel. A dynamic niching genetic algorithm strategy for docking highly flexible ligands. Information Sciences. v. 289, p. 206-224, issn: 0020-0255, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      4. ROCHA, GREGORIO K. ; DOS SANTOS, KARINA B. ; ANGELO, JAQUELINE S. ; CUSTODIO, FABIO L. ; BARBOSA, HELIO J.C. ; DARDENNE, LAURENT E.. Inserting Co-Evolution Information from Contact Maps into a Multiobjective Genetic Algorithm for Protein Structure Prediction. Em: 2018 IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC), v. 1, p. 1-8, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      5. ROCHA, GREGORIO K. ; ANGELO, JAQUELINE S. ; SANTOS, KARINA B. ; CUSTODIO, FABIO L. ; DARDENNE, LAURENT E. ; BARBOSA, HELIO J.C.. Using an aggregation tree to arrange energy function terms for protein structure prediction. Em: 2017 IEEE Conference on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology (CIBCB), p. 1, 2017.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      6. SANTOS, KARINA B. ; ROCHA, GREGORIO K. ; CUSTODIO, FABIO L. ; BARBOSA, HELIO J. C. ; DARDENNE, LAURENT E.. Improving de novo protein structure prediction using contact maps information. Em: 2017 IEEE Conference on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology (CIBCB), p. 1, 2017.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      7. ROCHA, GREGÓRIO KAPPAUN ; CUSTÓDIO, Fábio Lima ; BARBOSA, HELIO J.C. ; Dardenne, Laurent Emmanuel. Using Crowding-Distance in a Multiobjective Genetic Algorithm for Protein Structure Prediction. Em: the 2016, p. 1285, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      8. SANTOS, KARINA B. ; CUSTODIO, FABIO L. ; BARBOSA, HELIO J. C. ; DARDENNE, LAURENT E.. Genetic operators based on backbone constraint angles for protein structure prediction. Em: 2015 IEEE Conference on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology (CIBCB), p. 1, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      9. CUSTÓDIO, Fábio Lima ; BARBOSA, Hélio José Correa ; DARDENNE, L. E.. Full-Atom Ab Initio Protein Structure Prediction with a Genetic Algorithm using a Similarity-based Surrogate Model. Em: IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC), p. 1-8, 2010.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Laurent Emmanuel Dardenne ⇔ Priscila Vanessa Zabala Capriles Goliatt (9.0)
      1. ROSSI, ARTUR DUQUE ; OLIVEIRA, PEDRO HENRIQUE EVELING ; SIQUEIRA, DIMITRI GUGLINSKI ; REIS, VICTOR CRISÓSTOMO CRUZ ; Dardenne, Laurent Emmanuel ; GOLIATT, PRISCILA VANESSA ZABALA CAPRILES. MHOLline 2.0: Workflow for automatic large-scale modeling and analysis of proteins. REVISTA MUNDI ENGENHARIA, TECNOLOGIA E GESTÃO. v. 5, p. 1-14, issn: 2525-4782, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. CAPRILES, Priscila Vanessa da Silva Zabala ; BAPTISTA, L. P. ; Guedes, I.A. ; GUIMARAES, A. C. ; CUSTÓDIO, Fábio Lima ; Marcelo Alves-Ferreira ; Dardenne, L.E.. Structural modeling and docking studies of ribose 5-phosphate isomerase from Leishmania major and Homo sapiens: A comparative analysis for Leishmaniasis treatment. JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING. v. 55, p. 134-147, issn: 1093-3263, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      3. CAPRILES, Priscila Vanessa da Silva Zabala; BELARMINO, L. C. ; Crovella, S. ; DARDENNE, L. E. ; Benko-Iseppon, A. M.. EST-Database Search of Plant Defensins - An Example using Sugarcane, a Large and Complex Genome.. Current Protein and Peptide Science. v. 11, p. 248-254, issn: 1389-2037, 2010.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      4. CAPRILES, Priscila Vanessa da Silva Zabala; GUIMARÃES, A. C. R. ; OTTO, T. D. ; MIRANDA, A. B. ; DARDENNE, L. E. ; DEGRAVE, W.. Structural modelling and comparative analysis of homologous, analogous and specific proteins from Trypanosoma cruzi versus Homo sapiens: putative drug targets for chagas' disease treatment. BMC Genomics. v. 11, p. 610-619, issn: 1471-2164, 2010.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      5. CAPRILES, Priscila Vanessa da Silva Zabala ; Trevizani R ; ROCHA, G. K. ; DARDENNE, L. E. ; CUSTÓDIO, Fábio Lima. Modelos tridimensionais. Em: Hugo Verli. (Org.). Bioinformática: da Biologia à Flexibilidade Molecular. 1ed.São Paulo. : Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. 2014.v. 1, p. 147-171.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      6. CAPRILES, Priscila Vanessa da Silva Zabala ; CUSTÓDIO, Fábio Lima ; DARDENNE, L. E.. Ab initio Protein Structure Prediction via Genetic Algorithms using a Coarse-grained Model for Side Chains. Em: Brazilian Symposium on Bioinformatics (BSB2010), 2010, Búzios - RJ. Anais do Brazilian Symposium on Bioinformatics (BSB2010), v. CD-ROM, p. 23-27, 2010.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      7. GOMES, L. S. A. ; LIFSCHITZ, S. ; CAPRILES, Priscila Vanessa da Silva Zabala ; DARDENNE, L. E.. A Provenance Model for Bioinformatics Workflows. Em: Brazilian Symposium on Bioinformatics (BSB2010), 2010, Búzios - RJ. Anais do Brazilian Symposium on Bioinformatics (BSB2010), v. CD-ROM, p. 19-22, 2010.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      8. GUEDES, I. A. ; CAPRILES, Priscila Vanessa da Silva Zabala ; DARDENNE, L. E.. Comparative modeling of 2,4dienoyl CoA reductase from Trypanosoma cruzi and Homo sapiens: Insights for ligand docking studies. Em: : 5th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, 2010, Ouro Preto - MG. Anais do : 5th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, p. 155, 2010.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      9. BAPTISTA, L. P. R. ; CAPRILES, Priscila Vanessa da Silva Zabala ; CUSTÓDIO, Fábio Lima ; DARDENNE, L. E.. Structure prediction and substrate docking of Leishmania major and Homo sapiens Ribose5phosphate isomerase. Em: 5th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, 2010, Ouro Preto - 2010. Anais do 5th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, p. 175, 2010.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Laurent Emmanuel Dardenne ⇔ Marisa Fabiana Nicolás (3.0)
      1. GUEDES, ISABELLA A. ; COSTA, LEON S. C. ; DOS SANTOS, KARINA B. ; KARL, ANA L. M. ; ROCHA, GREGÓRIO K. ; TEIXEIRA, IURY M. ; GALHEIGO, MARCELO M. ; MEDEIROS, VIVIAN ; KREMPSER, EDUARDO ; CUSTÓDIO, FÁBIO L. ; BARBOSA, HELIO J. C. ; NICOLÁS, MARISA F. ; DARDENNE, LAURENT E.. Drug design and repurposing with DockThor-VS web server focusing on SARS-CoV-2 therapeutic targets and their non-synonym variants. Scientific Reports. v. 11, p. 5543-20, issn: 2045-2322, 2021.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. RAMUNDO, MARIANA SEVERO ; BELTRAME, CRISTIANA OSSAILLE ; BOTELHO, ANA MARIA NUNES ; COELHO, LEONARDO ROCCHETTO ; SILVA-CARVALHO, MARIA CICERA ; FERREIRA-CARVALHO, BERNADETE TEIXEIRA ; NICOLÁS, MARISA FABIANA ; GUEDES, ISABELLA ALVIM ; Dardenne, Laurent Emmanuel ; O?GARA, JAMES ; FIGUEIREDO, AGNES MARIE SÁ. A unique SaeS allele overrides cell-density dependent expression of saeR and lukSF-PV in the ST30-SCCmecIV lineage of CA-MRSA. International Journal of Medical Microbiology (Print). v. 51047, p. 367-380, issn: 1438-4221, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      3. Guedes, I.A. ; COSTA, L. S. C. ; SANTOS, K. B. ; KARL, ANA LUIZA MARTINS ; ROCHA, G. K. ; TEIXEIRA, I. M. ; GALHEIGO, M. M. ; MEDEIROS, V. ; KREMPSER, E. ; CUSTÓDIO, Fábio Lima ; BARBOSA, Hélio José Correa ; NICOLAS, M. F. ; DARDENNE, LAURENT. Drug Design and Repurposing with DockThor-VS Web Server: Virtual Screening focusing on SARS-CoV-2 Therapeutic Targets and their Non-Synonym Variants. Research Square Doi: 10.21203/rs.3.rs-96789/v1. 2020. Resarch article preprint
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Laurent Emmanuel Dardenne ⇔ Carlos Alberto Saraiva Gonçalves (2.0)
      1. LOPES, JOÃO ; DA COSTA, JESSIE ; CESCHI, MARCO ; GONÇALVES, CARLOS ; KONRATH, EDUARDO ; KARL, ANA ; GUEDES, ISABELLA ; DARDENNE, LAURENT. Chiral Bistacrine Analogues: Synthesis, Cholinesterase Inhibitory Activity and a Molecular Modeling Approach. JOURNAL OF THE BRAZILIAN CHEMICAL SOCIETY. v. 28, p. 2218-2228, issn: 0103-5053, 2017.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. CESCHI, MARCO ANTONIO ; DA COSTA, JESSIE SOBIESKI ; LOPES, JOÃO PAULO BIZARRO ; CÂMARA, VIKTOR SARAIVA ; CAMPO, LEANDRA FRANCISCATO ; BORGES, ANTONIO CÉSAR DE AMORIM ; GONÇALVES, CARLOS ALBERTO SARAIVA ; DE SOUZA, DANIELA FRAGA ; KONRATH, EDUARDO LUIS ; KARL, ANA LUIZA MARTINS ; GUEDES, ISABELLA ALVIM ; Dardenne, Laurent Emmanuel. Novel series of tacrine-tianeptine hybrids: Synthesis, cholinesterase inhibitory activity, S100B secretion and a molecular modeling approach. European Journal of Medicinal Chemistry. v. 121, p. 758-772, issn: 0223-5234, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Laurent Emmanuel Dardenne ⇔ Floriano Paes Silva Junior (2.0)
      1. LOPES, JOÃO PAULO BIZARRO ; SILVA, LUANA ; CESCHI, MARCO ANTONIO ; LÜDTKE, DIOGO SEIBERT ; ZIMMER, ALINE RIGON ; RUARO, THAIS CARINE ; DANTAS, RAFAEL FERREIRA ; DE SALLES, CRISTIANE MARTINS CARDOSO ; SILVA-JR, FLORIANO PAES ; SENGER, MARIO ROBERTO ; BARBOSA, GISELE ; LIMA, LÍDIA MOREIRA ; GUEDES, ISABELLA ALVIM ; DARDENNE, Laurent Emmanuel. Synthesis of new lophine-carbohydrate hybrids as cholinesterase inhibitors: cytotoxicity evaluation and molecular modeling. MedChemComm. v. 10, p. 2089-2101, issn: 2040-2503, 2019.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. LOPES, JOÃO PAULO BIZARRO ; SILVA, LUANA ; DA COSTA FRANARIN, GABRIELA ; ANTONIO CESCHI, MARCO ; SEIBERT LÜDTKE, DIOGO ; FERREIRA DANTAS, RAFAEL ; DE SALLES, CRISTIANE MARTINS CARDOSO ; PAES SILVA-JR, FLORIANO ; ROBERTO SENGER, MARIO ; ALVIM GUEDES, ISABELLA ; EMMANUEL DARDENNE, LAURENT. Design, synthesis, cholinesterase inhibition and molecular modelling study of novel tacrine hybrids with carbohydrate derivatives. BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY. v. 1, p. 1-10, issn: 0968-0896, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Laurent Emmanuel Dardenne ⇔ Lidia Moreira Lima (2.0)
      1. LOPES, JOÃO PAULO BIZARRO ; SILVA, LUANA ; CESCHI, MARCO ANTONIO ; LÜDTKE, DIOGO SEIBERT ; ZIMMER, ALINE RIGON ; RUARO, THAIS CARINE ; DANTAS, RAFAEL FERREIRA ; DE SALLES, CRISTIANE MARTINS CARDOSO ; SILVA-JR, FLORIANO PAES ; SENGER, MARIO ROBERTO ; BARBOSA, GISELE ; LIMA, LÍDIA MOREIRA ; GUEDES, ISABELLA ALVIM ; DARDENNE, Laurent Emmanuel. Synthesis of new lophine-carbohydrate hybrids as cholinesterase inhibitors: cytotoxicity evaluation and molecular modeling. MedChemComm. v. 10, p. 2089-2101, issn: 2040-2503, 2019.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. FREITAS, ROSANA H. C. N. ; CORDEIRO, NATÁLIA M. ; CARVALHO, PATRÍCIA R. ; Alves, Marina A. ; GUEDES, ISABELLA A. ; VALERIO, TAYNA S. ; DARDENNE, LAURENT E. ; Lima, Lídia M. ; Barreiro, Eliezer J. ; FERNANDES, PATRÍCIA D. ; FRAGA, CARLOS A. M.. Discovery of naphthyl- N -acylhydrazone p38? MAPK inhibitors with in vivo anti-inflammatory and anti-TNF-? activity. Chemical Biology & Drug Design. v. June, p. 391-397, issn: 1747-0277, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Laurent Emmanuel Dardenne ⇔ Marcelo Alves Soares (1.0)
      1. Soares, Rosemberg O.; Batista, Paulo R. ; Costa, Mauricio G.S. ; Dardenne, Laurent E. ; Pascutti, Pedro G. ; Soares, Marcelo A.. Understanding the HIV-1 protease nelfinavir resistance mutation D30N in subtypes B and C through molecular dynamics simulations. Journal of Molecular Graphics & Modelling. v. 28, p. 137-147, issn: 1093-3263, 2010.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Laurent Emmanuel Dardenne ⇔ Eliezer Jesus de Lacerda Barreiro (1.0)
      1. FREITAS, ROSANA H. C. N. ; CORDEIRO, NATÁLIA M. ; CARVALHO, PATRÍCIA R. ; Alves, Marina A. ; GUEDES, ISABELLA A. ; VALERIO, TAYNA S. ; DARDENNE, LAURENT E. ; Lima, Lídia M. ; Barreiro, Eliezer J. ; FERNANDES, PATRÍCIA D. ; FRAGA, CARLOS A. M.. Discovery of naphthyl- N -acylhydrazone p38? MAPK inhibitors with in vivo anti-inflammatory and anti-TNF-? activity. Chemical Biology & Drug Design. v. June, p. 391-397, issn: 1747-0277, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Laurent Emmanuel Dardenne ⇔ Ana Maria Benko Iseppon (1.0)
      1. CAPRILES, Priscila Vanessa da Silva Zabala; BELARMINO, L. C. ; Crovella, S. ; DARDENNE, L. E. ; Benko-Iseppon, A. M.. EST-Database Search of Plant Defensins - An Example using Sugarcane, a Large and Complex Genome.. Current Protein and Peptide Science. v. 11, p. 248-254, issn: 1389-2037, 2010.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Laurent Emmanuel Dardenne ⇔ Paulo Augusto Netz (1.0)
      1. THOMPSON, HELEN NATHALIA ; THOMPSON, CLAUDIA ELIZABETH ; ANDRADE CACERES, RAFAEL ; Dardenne, Laurent Emmanuel ; NETZ, PAULO AUGUSTO ; STASSEN, HUBERT. Prion protein conversion triggered by acidic condition: a molecular dynamics study through different force fields. JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY. v. 39, p. 2000-2011, issn: 0192-8651, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Laurent Emmanuel Dardenne ⇔ Ihosvany Camps Rodríguez (1.0)
      1. DIAS VIEGAS, FLÁVIA PEREIRA DE FREITAS SILVA, MATHEUS DIVINO DA ROCHA, MIGUEL CASTELLI, MAÍSA ROSA RIQUIEL, MARIANA MÁXIMO MACHADO, RAFAEL PEREIRA VAZ, SARAH MACEDO SIMÕES DE LIMA, LAÍS MEDEIROS MANCINI, KARLA CRISTINE MARQUES DE OLIVEIRA, PATRÍCIA CRUZ MORAIS, ÉLIDA PARREIRA Gontijo, Vanessa Silva DA SILVA, FERNANDA MOTTA R. Design, synthesis and pharmacological evaluation of N -benzyl-piperidinyl-aryl-acylhydrazone derivatives as donepezil hybrids: Discovery of novel multi-target anti-alzheimer prototype drug candidates. EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY. v. 147, p. 48-65, issn: 0223-5234, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Laurent Emmanuel Dardenne ⇔ Sergio Crovella (1.0)
      1. CAPRILES, Priscila Vanessa da Silva Zabala; BELARMINO, L. C. ; Crovella, S. ; DARDENNE, L. E. ; Benko-Iseppon, A. M.. EST-Database Search of Plant Defensins - An Example using Sugarcane, a Large and Complex Genome.. Current Protein and Peptide Science. v. 11, p. 248-254, issn: 1389-2037, 2010.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]




(*) Relatório criado com produções desde 2010 até 2021
Data de processamento: 06/11/2021 15:23:24