Especialistas Seniores em Covid-19 com atuação no Brasil

Marisa Fabiana Nicolas

Bióloga (Buenos Aires Argentina, 1991), com mestrado em Genética (Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP 1996), doutorado em Genética (Universidade Federal do Paraná, UFPR 2001) e pós-doutorado (CNPq) na Embrapa soja (2005). Trabalhou como anotador de proteínas no banco de dados UniProt/Swiss-Prot de 2005 a 2007. Desde maio de 2009 é Pesquisador Associado no Laboratório de Bioinformática (Labinfo) no LNCC/MCTIC e Professora Permanente da Pós graduação em Modelagem Computacional nesta instituição (conceito CAPES 6). Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq nível 2 na Área de Genética. Tem experiência na área de Genética, Biologia Molecular, Genômica e Bioinformática. Atua principalmente em Bioinformática aplicada a análise de genomas e transcriptomas (RNAseq e scRNAseq) e redes metabólicas e regulatórias em patógenos de relevância clínicas (Texto informado pelo autor)

https://lattes.cnpq.br/0717161560405537 (29/09/2021)

Rótulo/Grupo:

Bolsa CNPq: Nível 2

Período de análise:

Endereço: Laboratório Nacional de Computação Científica, Laboratório de Bioinformática. Avenida Getúlio Vargas - até 1155 - lado ímpar Quitandinha 25651075 - Petrópolis, RJ - Brasil Telefone: (24) 4981444068 URL da Homepage: https://www.lncc.br

Grande área: Ciências Biológicas

Área: Genética

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (36)
1. GUEDES, ISABELLA A. ; COSTA, LEON S. C. ; DOS SANTOS, KARINA B. ; KARL, ANA L. M. ; ROCHA, GREGÓRIO K. ; TEIXEIRA, IURY M. ; GALHEIGO, MARCELO M. ; MEDEIROS, VIVIAN ; KREMPSER, EDUARDO ; CUSTÓDIO, FÁBIO L. ; BARBOSA, HELIO J. C. ; NICOLÁS, MARISA F. ; DARDENNE, LAURENT E.. Drug design and repurposing with DockThor-VS web server focusing on SARS-CoV-2 therapeutic targets and their non-synonym variants. Scientific Reports. v. 11, p. 5543-20, issn: 2045-2322, 2021.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
2. CORTES, M. F. ; BOTELHO, A. M. N. ; BANDEIRA, P. T. ; MOUTON, W. ; BADIOU, C. ; BES, M. ; Lima C B N ; SOARES, A. E. R. ; ALMEIDA, L. G. P. ; MARTINS-SIMOES, P. ; VASCONCELOS, A. T. R. ; Nicolás, Marisa F ; LAURENT, F. ; PLANET, P. J. ; Figueiredo Agnes M S. Reductive evolution of virulence repertoire to drive the divergence between community- and hospital-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus of the ST1 lineage. Virulence. v. 12, p. 951-967, issn: 2150-5594, 2021.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
3. SERRAL, F. ; CASTELLO, F. A. ; SOSA, E. ; PARDO, A. M. ; PALUMBO, M. C. ; MODENUTTI, C. ; PALOMINO, M. M. ; LAZAROWSKI, A. ; AUZMENDI, J. A. ; Ramos Pereira P I ; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; Turjanski A G ; MARTI, M. A. ; Do Porto, Dario Fernandez. From genome to drugs: New approaches in antimicrobial discovery.. Frontiers in Pharmacology. v. 1, p. 1, issn: 1663-9812, 2021.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
4. MARTINS, YASMMIN CÔRTES ; ZIVIANI, ARTUR ; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; DE VASCONCELOS, ANA TEREZA RIBEIRO. Large-Scale Protein Interactions Prediction by Multiple Evidence Analysis Associated With an In-Silico Curation Strategy. Frontiers in Bioinformatics. v. 1, p. 1-12, issn: 2673-7647, 2021.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
5. MEDEIROS-FILHO, F. ; NASCIMENTO, A. P. B. ; COSTA, M. O. C. E. ; MERIGUETI, T. C. ; MENEZES, M. A. ; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; SANTOS, M. T. ; ASSEF, A. P. D. A. C. ; SILVA, F. A. B.. A systematic strategy to find potential therapeutic targets for Pseudomonas aeruginosa using integrated computational models. FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES. v. 1, p. 1-14, issn: 2296-889X, 2021.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
6. MARTINS, WILLAMES M. B. S. ; NICOLAS, MARISA F. ; YU, YANG ; LI, MEI ; DANTAS, PRISCILA ; SANDS, KIRSTY ; PORTAL, EDWARD ; ALMEIDA, LUIZ G. P. ; VASCONCELOS, ANA TEREZA R. ; Medeiros, Eduardo A. ; TOLEMAN, MARK A. ; WALSH, TIMOTHY R. ; Gales, Ana C. ; ANDREY, DIEGO O.. Clinical and Molecular Description of a High-Copy IncQ1 KPC-2 Plasmid Harbored by the International ST15 Klebsiella pneumoniae Clone. mSphere. v. 5, p. 22-28, issn: 2379-5042, 2020.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
7. BOTELHO, ANA MARIA NUNES ; CERQUEIRA E COSTA, MAIANA OLIVEIRA ; MOUSTAFA, AHMED M. ; BELTRAME, CRISTIANA OSSAILLE ; FERREIRA, FABIENNE ANTUNES ; CÔRTES, MARINA FARREL ; COSTA, BRUNO SOUZA SCRAMIGNON ; SILVA, DEBORAH NASCIMENTO SANTOS ; BANDEIRA, PAULA TERRA ; LIMA, NICHOLAS COSTA BARROSO ; SOUZA, Rangel Celso ; ALMEIDA, LUIZ GONZAGA PAULA DE ; Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro ; NARECHANIA, APURVA ; RYAN, CHANELLE ; O?BRIEN, KELSEY ; KOLOKOTRONIS, SERGIOS-ORESTIS ; PLANET, PAUL J. ; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; FIGUEIREDO, AGNES MARIE SÁ. Local Diversification of Methicillin- Resistant Staphylococcus aureus ST239 in South America After Its Rapid Worldwide Dissemination. Frontiers in Microbiology. v. 10, p. 1-19, issn: 1664-302X, 2019.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
8. BELLINI, REINALDO G. ; CORONADO, MÔNIKA APARECIDA ; PASCHOAL, ALEXANDRE ROSSI ; GAUDENCIO DO RÊGO, THAÍS ; Hungria, Mariangela ; RIBEIRO DE VASCONCELOS, ANA TEREZA ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. Structural analysis of a novel N-carbamoyl-d-amino acid amidohydrolase from a Brazilian Bradyrhizobium japonicum strain: In silico insights by molecular modelling, docking and molecular dynamics. JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING. v. 86, p. 35-42, issn: 1093-3263, 2019.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
9. ANDREY, DIEGO O ; DANTAS, PRISCILA ; MARTINS, WILLAMES B S ; MARQUES DE CARVALHO, FABÍOLA ; GONZAGA, LUIZ A ; SANDS, KIRSTY ; PORTAL, EDWARD ; SAUSER, JULIEN ; CAYÔ, RODRIGO ; NICOLAS, MARISA F ; VASCONCELOS, ANA TEREZA R ; MEDEIROS, EDUARDO A ; WALSH, TIMOTHY R ; GALES, ANA C. An Emerging Clone, KPC-2-Producing Klebsiella pneumoniae ST16, Associated with High Mortality Rates in a CC258 Endemic Setting. CLINICAL INFECTIOUS DISEASES. v. ciz109, p. 1-30, issn: 1058-4838, 2019.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
10. Nicolás, Marisa F. ; RAMOS, PABLO IVAN PEREIRA ; MARQUES DE CARVALHO, FABÍOLA ; CAMARGO, DHIAN R. A. ; DE FÁTIMA MORAIS ALVES, CARLENE ; LOSS DE MORAIS, GUILHERME ; Almeida, Luiz G. P. ; Souza, Rangel C. ; CIAPINA, LUCIANE P. ; VICENTE, ANA C. P. ; COIMBRA, RONEY S. ; RIBEIRO DE VASCONCELOS, ANA T.. Comparative genomic analysis of a clinical isolate of Klebsiella quasipneumoniae subsp. similipneumoniae, a KPC-2 and OKP-B-6 beta-lactamases producer harboring two drug-resistance plasmids from Southeast Brazil. Frontiers in Microbiology. v. 9, p. 1-16, issn: 1664-302X, 2018.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
11. RAMOS, PABLO IVAN PEREIRA ; FERNÁNDEZ DO PORTO, DARÍO ; LANZAROTTI, ESTEBAN ; SOSA, EZEQUIEL J. ; BURGUENER, GERMÁN ; PARDO, AGUSTÍN M. ; KLEIN, CECILIA C. ; Sagot, Marie-France ; DE VASCONCELOS, ANA TEREZA R. ; GALES, ANA CRISTINA ; MARTI, MARCELO ; TURJANSKI, ADRIÁN G. ; Nicolás, Marisa F.. An integrative, multi-omics approach towards the prioritization of Klebsiella pneumoniae drug targets. Scientific Reports. v. 8, p. 10755, issn: 2045-2322, 2018.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
12. Fernanda Alves de Freita Guedes ; ROSSETTO, P. B. ; GUIMARAES, F. ; WILWERTH, M. W. ; PAES, J. E. S. ; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; Reinert F ; PEIXOTO, R. ; ALVES-FERREIRA, M.. Characterization of Laguncularia racemosa transcriptome and molecular response to oil pollution. AQUATIC TOXICOLOGY. v. 205, p. 36-50, issn: 0166-445X, 2018.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
13. CÔRTES, MARINA F. ; BOTELHO, ANA M. N. ; Almeida, Luiz G. P. ; Souza, Rangel C. ; CUNHA, OBERDAN DE LIMA ; Nicolás, Marisa F. ; VASCONCELOS, ANA T. R. ; FIGUEIREDO, AGNES M. S.. Community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus from ST1 lineage harboring a new SCCmec IV subtype (SCCmec IVm) containing the tetK gene. Infection and Drug Resistance. v. Volume 11, p. 2583-2592, issn: 1178-6973, 2018.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
14. CÔRTES, MARINA FARREL ; COSTA, MAIANA OC ; LIMA, NICHOLAS CB ; SOUZA, RANGEL C ; Almeida, Luiz GP ; GUEDES, LUCIANE PRIOLI CIAPINA ; Vasconcelos, Ana TR ; Nicolás, Marisa F ; FIGUEIREDO, AGNES MS. Complete genome sequence of the community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus (strain USA400-0051) a prototype of the USA400 clone. MEMORIAS DO INSTITUTO OSWALDO CRUZ. v. 112, p. 790-792, issn: 0074-0276, 2017.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
15. BOTELHO, ANA M. N. ; COSTA, MAIANA O. C. ; BELTRAME, CRISTIANA O. ; FERREIRA, FABIENNE A. ; CÔRTES, MARINA F. ; BANDEIRA, PAULA T. ; LIMA, NICHOLAS C. B. ; Souza, Rangel C. ; Almeida, Luiz G. P. ; VASCONCELOS, ANA T. R. ; Nicolás, Marisa F. ; FIGUEIREDO, AGNES M. S.. Complete genome sequence of an agr-dysfunctional variant of the ST239 lineage of the methicillin-resistant Staphylococcus aureus strain GV69 from Brazil. Standards in Genomic Sciences. v. 11, p. 34-40, issn: 1944-3277, 2016.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
16. MEDEIROS, JULLIANE DUTRA ; CANTÃO, MAURÍCIO EGÍDIO ; CESAR, DIONÉIA EVANGELISTA ; NICOLÁS, MARISA FABIANA ; Diniz, Cláudio Galuppo ; SILVA, Vânia Lúcia ; VASCONCELOS, ANA TEREZA RIBEIRO DE ; COELHO, CÍNTIA MARQUES. Comparative metagenome of a stream impacted by the urbanization phenomenon. Brazilian Journal of Microbiology (Impresso). v. 119, p. 01-11, issn: 1517-8382, 2016.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
17. RAMUNDO, MARIANA SEVERO ; BELTRAME, CRISTIANA OSSAILLE ; BOTELHO, ANA MARIA NUNES ; COELHO, LEONARDO ROCCHETTO ; SILVA-CARVALHO, MARIA CICERA ; FERREIRA-CARVALHO, BERNADETE TEIXEIRA ; NICOLÁS, MARISA FABIANA ; GUEDES, ISABELLA ALVIM ; Dardenne, Laurent Emmanuel ; O?GARA, JAMES ; FIGUEIREDO, AGNES MARIE SÁ. A unique SaeS allele overrides cell-density dependent expression of saeR and lukSF-PV in the ST30-SCCmecIV lineage of CA-MRSA. International Journal of Medical Microbiology (Print). v. 51047, p. 367-380, issn: 1438-4221, 2016.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
18. Adriana Giannini Nicoletti ; MARCONDES, M. F. M. ; MARTINS, W. B. ; DE PAULA, L. G. ; Nicolas, M. F. ; VASCONCELOS, A. T. R. ; OLIVEIRA, V. ; GALES, A C. Reply to ?Mobilization of blaBKC-1 by ISKpn23??. Antimicrobial Agents and Chemotherapy (Print). v. 60, p. 5102-5104, issn: 0066-4804, 2016.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
19. RAMOS, PABLO IVAN PEREIRA ; CUSTÓDIO, MÁRLON GRÉGORI FLORES ; QUISPE SAJI, GUADALUPE DEL ROSARIO ; CARDOSO, THIAGO ; DA SILVA, GISELE LUCCHETTI ; BRAUN, GRAZIELA ; MARTINS, WILLAMES M. B. S. ; GIRARDELLO, RAQUEL ; DE VASCONCELOS, ANA TEREZA RIBEIRO ; FERNÁNDEZ, ELMER ; GALES, ANA CRISTINA ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. The polymyxin B-induced transcriptomic response of a clinical, multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae involves multiple regulatory elements and intracellular targets. BMC GENOMICS. v. 17, p. 447-462, issn: 1471-2164, 2016.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
20. FREITAS, MICHELE C. R. DE ; RESENDE, JULIANA A. ; FERREIRA-MACHADO, ALESSANDRA B. ; SAJI, GUADALUPE D. R. Q. ; VASCONCELOS, ANA T. R. DE ; SILVA, VÂNIA L. DA ; NICOLÁS, MARISA F. ; Diniz, Cláudio G.. Exploratory investigation of Bacteroides fragilis transcriptional response during in vitro exposure to subinhibitory concentration of metronidazole. Frontiers in Microbiology (Online). v. 7, p. 1465-1477, issn: 1664-302X, 2016.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
21. BOTELHO, ANA M. N. ; COSTA, MAIANA O. C. ; BELTRAME, CRISTIANA O. ; FERREIRA, FABIENNE A. ; LIMA, NICHOLAS C. B. ; COSTA, BRUNO S. S. ; DE MORAIS, GUILHERME L. ; Souza, Rangel C. ; Almeida, Luiz G. P. ; VASCONCELOS, ANA T. R. ; Nicolás, Marisa F. ; FIGUEIREDO, AGNES M. S.. Complete genome sequence of the MRSA isolate HC1335 from ST239 lineage displaying a truncated AgrC histidine kinase receptor. Genome Biology and Evolution. v. 8, p. 3187-3192, issn: 1759-6653, 2016.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
22. FERREIRA-MACHADO, A. B. ; FREITAS, M. C. R. ; Quispe Saji, Guadalupe del Rosario ; REZENDE, A. B. ; ALMEIDA, P. ; CESAR, D. E. ; RESENDE, J. A. ; Nicolas, M. F. ; da Silva V L ; DINIZ, C.. Integrity of prokaryotic mRNA isolated from complex samples for in vivo bacterial transcriptome analysis. Genetics and Molecular Research. v. 14, p. 14752-14759, issn: 1676-5680, 2015.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
23. NICOLETTI, ADRIANA GIANNINI ; MARCONDES, MARCELO F. M. ; MARTINS, WILLAMES B. ; Almeida, Luiz G. P. ; Nicolás, Marisa F. ; VASCONCELOS, ANA T. R. ; OLIVEIRA, VITOR ; GALES, ANA CRISTINA. Characterization of BKC-1 class A carbapenemase from Klebsiella pneumoniae clinical isolates in Brazil. Antimicrobial Agents and Chemotherapy (Print). v. 59, p. AAC.00158-15-30, issn: 0066-4804, 2015.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
24. DEFELIPE, LUCAS A. ; RADUSKY, LEANDRO ; LANZAROTTI, ESTEBAN ; TURJANSKI, ADRIÁN G. ; MARTI, MARCELO A. ; DO PORTO, DARIO FERNÁNDEZ ; SOSA, EZEQUIEL ; PEREIRA RAMOS, PABLO IVAN ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. A Whole genome bioinformatic approach to determine potential latent phase specific targets in Mycobacterium tuberculosis. TUBERCULOSIS. v. 97, p. 181-192, issn: 1472-9792, 2015.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
25. RAMOS, PABLO IVAN ; Picão, Renata C ; ALMEIDA, LUIZ GONZAGA ; LIMA, NICHOLAS COSTA ; Girardello, Raquel ; VIVAN, ANA CAROLINA ; Xavier, Danilo E ; BARCELLOS, FERNANDO G ; PELISSON, Marsileni ; VESPERO, ELIANA C ; MÉDIGUE, CLAUDINE ; VASCONCELOS, ANA TEREZA ; Gales, Ana C ; NICOLÁS, MARISA F. Comparative analysis of the complete genome of KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae Kp13 reveals remarkable genome plasticity and a wide repertoire of virulence and resistance mechanisms. BMC Genomics. v. 15, p. 54, issn: 1471-2164, 2014.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
26. SALGADO, LEONARDO RIPPEL ; KOOP, DANIELA MARTINS ; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ ; RIVALLAN, RONAN ; LE GUEN, VINCENT ; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; DE ALMEIDA, LUIZ GONZAGA ; ROCHA, VIVIANI RIBEIRO ; MAGALHÃES, MILENA ; GERBER, ALEXANDRA LEHMKUHL ; FIGUEIRA, ANTONIO ; CASCARDO, JÚLIO CÉZAR ; DE VASCONCELOS, ANATEREZA RIBEIRO ; SILVA, WILSON ARAÚJO ; COUTINHO, LUIZ LEHMANN ; GARCIA, DOMINIQUE. De novo transcriptome analysis of Hevea brasiliensis tissues by RNA-seq and screening for molecular markers. BMC Genomics. v. 15, p. 236, issn: 1471-2164, 2014.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
27. MARINOTTI, O. The Genome of Anopheles darlingi, the main neotropical malaria vector. Nucleic Acids Research (Online). v. 41, p. 7387-7400, issn: 0305-1048, 2013.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
28. COSTA, M. O. C. ; BELTRAME, C. O. ; FERREIRA, F. A. ; BOTELHO, A. M. N. ; LIMA, N. C. B. ; Souza, R. C. ; DE ALMEIDA, L. G. P. ; VASCONCELOS, A. T. R. ; Nicolas, M. F. ; FIGUEIREDO, A. M. S.. Complete Genome Sequence of a Variant of the Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus ST239 Lineage, Strain BMB9393, Displaying Superior Ability To Accumulate ica-Independent Biofilm. Genome Announcements. v. 1, p. e00576-13-e00576-13, issn: 2169-8287, 2013.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
29. Neto N.E. ; LOUREIRO, M. F. ; Nicolas, M. F. ; MARIANOWSKI, T. ; Torres A.R. ; HUNGRIA, M.. Identification of Discolobium species indigenous to the Brazilian Pantanal ecosystem by microsatellite (SSRs) markers. Semina. Ciências Agrárias (Online). v. 33, p. 3017-3022, issn: 1679-0359, 2012.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
30. Pablo I.P Ramos ; Renata C Picão ; Eliana C Vespero ; Marsileni Pelisson ; ZULETA, L. F. G. ; ALMEIDA, L. G. P. ; Alexandra L. Gerber ; VASCONCELOS, A. T. R. ; GALES, A. C. ; Nicolás, Marisa F. Pyrosequencing-based analysis reveals a novel capsular gene cluster in a KPC-producing Klebsiella pneumoniae clinical isolate identified in Brazil. BMC Microbiology (Online). v. 12, p. 173, issn: 1471-2180, 2012.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
31. Souza, Rangel C ; Quispe Saji, Guadalupe del Rosario ; Costa, Maiana O C ; Netto, Diogo S ; Lima, Nicholas C B ; Klein, Cecília C ; Vasconcelos, Ana T R ; Nicolás, Marisa F. AtlasT4SS: A curated database for type IV secretion systems. BMC Microbiology (Online). v. 12, p. 172, issn: 1471-2180, 2012.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
32. ORMENO-ORRILLO, E. ; MENNA, P. ; ALMEIDA, L. G. P. ; OLLERO, F. J. ; Nicolás, Marisa F. ; RODRIGUES, E. P. ; NAKATANI, A. S. ; BATISTA, J. S. S. ; CHUEIRE, L. M. O. ; SOUZA, Rangel Celso ; VASCONCELOS, A. T. R. ; MEGIAS M. ; HUNGRIA, Mariangela ; MARTINEZ-ROMERO, E.. Genomic basis of broad host range and environmental adaptability of Rhizobium tropici CIAT 899 and Rhizobium sp. PRF 81 which are used in inoculants for common bean (Phaseolus vulgaris L.). BMC Genomics. v. 13, p. 735, issn: 1471-2164, 2012.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
33. Galante, P. Distinct patterns of somatic alterations in a lymphoblastoid and a tumor genome derived from the same individual. Nucleic Acids Research. v. 39, p. 6056-6068, issn: 0305-1048, 2011.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
34. Abreu, Fernanda ; Cantão, Mauricio E ; Nicolás, Marisa F ; Barcellos, Fernando G ; Morillo, Viviana ; Almeida, Luiz GP ; do Nascimento, Fabrícia F ; Lefèvre, Christopher T ; Bazylinski, Dennis A ; R de Vasconcelos, Ana Tereza ; Lins, Ulysses. Common ancestry of iron oxide- and iron-sulfide-based biomineralization in magnetotactic bacteria. The ISME Journal (Print). v. 35, p. 1-10, issn: 1751-7362, 2011.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
35. PEDROSA, F O ; MONTEIRO, R A ; WASSEM, R ; AYUB, R A ; COLAUTO, Nelson Barros ; VALLE, J. S. ; HUNGRIA, M ; BARCELLOS, F.G.. Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a Specialized Diazotrophic Endophyte of Tropical Grasses - GENOPAR. PLOS Genetics (Online). v. 7, p. e1002064-e1002064, issn: 1553-7390, 2011.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
36. Lanzarotti, E. ; Pellizza, L. ; Bercovich, A. ; Foti, M. ; Coria, S. H. ; Vazquez, S. C. ; Ruberto, L. ; Hernandez, E. A. ; Dias, R. L. ; Mac Cormack, W. P. ; Cicero, D. O. ; Smal, C. ; Nicolas, M. F. ; VASCONCELOS, A. T. R. ; Marti, M. A. ; Turjanski, A. G.. Draft Genome Sequence of Bizionia argentinensis, Isolated from Antarctic Surface Water. Journal of Bacteriology (Print). v. 193, p. 6797-6798, issn: 0021-9193, 2011.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
Livros publicados/organizados ou edições (0)
Capítulos de livros publicados (1)
1. NICOLÁS, Marisa Fabiana; de Oliveira Cerqueira e Costa, Maiana ; Ramos, Pablo Ivan P. ; dos Santos, Marcelo Trindade ; Perez-Rueda, Ernesto ; MARTI, MARCELO A. ; Do Porto, Dario Fernandez ; Turjanski, Adrian G.. Integrating Omics Data to Prioritize Target Genes in Pathogenic Bacteria. Em: Fabricio Alves Barbosa da Silva; Nicolas Carels; Marcelo Trindade dos Santos; Francisco José Pereira Lopes. (Org.). Computational Biology. 1ed. : Springer International Publishing. 2020.v. 32, p. 217-276.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (3)
1. ANDREY, D. ; DANTAS, P. ; MARTINS, W. B. ; DE PAULA, L. G. ; SANDS, K. ; PORTA, E. ; SILVA, R. C. ; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; VASCONCELOS, A. T. R. ; MEDEIROS, E. A. S. ; WALSH, T. R. ; GALES, A C. High mortality rates due to the emergence and spread of a hypervirulent Klebsiella pneumoniae ST16 clone producer of KPC-2 and yersiniabactin. Em: 28th ECCMID, 2018.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
2. Lima C B N ; CANTÃO, M ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. SNPs detection in Klebsiella pneumoniae. Em: VI workshop e-Science 2012, 2012.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
3. Ramos Pereira P I ; KLEIN, C ; GALES, A C ; VASCONCELOS, A. T. R. ; Sagot M F ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. Regiões de plasticidade genômica e reconstrução metabólica in silico de um isolado clínico de Klebsiella causador de surto hospitalar. Em: VI workshop e-Science 2012, 2012.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (19)
1. BARBOSA, J. J. S. C. ; Ramos Pereira P I ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. Overcoming challenges in the metabolic reconstruction process: A promising approach to the MDRAB problem. Em: X-meeting 2019 - 15th International Conference of the AB3C, 2019, Campos do Jordão. X-meeting 2019 - 15th International Conference of the AB3C, v. 1, p. 1-2, 2019.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
2. CARDOSO, T. ; MORAES, G. L. ; LUCCHETTI, G. ; QUISPE SAJI, G ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. SNP discovery in the Klebsiella pneumoniae transcriptome after polymyxin B induction in combination with abiotic stresses using RNA-Seq technology. Em: International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C), 2016, Belo Horizonte. Anais of X-Meeting 2016, v. 1, p. 1-1, 2016.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
3. DEFELIPE, L. A. ; PORTO, D. F. ; Ramos Pereira P I ; NICOLÁS, M. F. ; RADUSKY, L. ; SOZA, E. ; Turjanski A G ; Marti, M. A.. IN SILICO DETERMINATION OF POTENTIAL THERAPEUTIC TARGETS FOR LATENT PHASE Mycobacterium tuberculosis. Em: XI CONGRESO ARGENTINO DE MICROBIOLOGÍA GENERAL SAMIGE, 2015, Córdoba. Aanais XI CONGRESO ARGENTINO DE MICROBIOLOGÍA GENERAL, v. 1, p. 335-335, 2015.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
4. CORTES, M. F. ; Nicolás, Marisa F ; DE PAULA, L. G. ; A. T. R. Vasconcelos, ; BANDEIRA, P. T. ; Figueiredo Agnes M S. Comparative genomic of the methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates of the ST1-SCCmec IV lineage associated with community- or hospital-associated infections. Em: 28º Congresso Brasileiro de Microbiologia CBM 2015, 2015, Florianópolis. ANAIS DO 28º CBM 2015, v. 1, p. 875-875, 2015.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
5. BOTELHO, A. M. N. ; COSTA, M. O. C. E. ; Beltrame C O ; Ferreira F A ; CORTES, M. F. ; BANDEIRA, P. T. ; DE PAULA, L. G. ; Lima C B N ; SOUZA, R. C. ; A. T. R. Vasconcelos, ; Nicolas, M. F. ; Figueiredo Agnes M S. COMPARATIVE GENOMICS OF METHICILLIN-RESISTANT Staphylococcus aureus ISOLATES OF ST239 LINEAGE BELONGING TO THE BRAZILIAN EPIDEMIC CLONE. Em: 28º Congresso Brasileiro de Microbiologia CBM 2015, 2015, Florianópolis. Anais 28º Congresso Brasileiro de Microbiologia - 2015, v. 1, p. 918-918, 2015.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
6. RESENDE, J. A. ; FERREIRA-MACHADO, A. B. ; FREITAS, M. C. R. ; PESTANA, D. M. ; FIGUEIREDO, K. L. ; Quispe Saji, Guadalupe del Rosario ; NICOLÁS, M. F. ; da Silva V L ; DINIZ, C.. EXPLORATORY INVESTIGATION OF Bacteroides fragilis TRANSCRIPTOME SELECTED AFTER IN VITRO EXPOSURE TO SUBINHIBITORY CONCENTRATION OF METRONIDAZOLE. Em: 28º Congresso Brasileiro de Microbiologia CBM 2015, 2015, Florianópolis. Anais Anais 28º Congresso Brasileiro de Microbiologia - 2015, v. 1, p. 1299-1299, 2015.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
7. LUCCHETTI, G. ; CARDOSO, T. ; Custódio MGF ; Girardello R ; BRAUN, G. ; Quispe Saji, Guadalupe del Rosario ; MARTINS, W. B. ; A. T. R. Vasconcelos, ; GALES, A C ; Nicolas, M. F.. TRANSCRIPTOME PROFILING ANALYSIS OF KLEBSIELLA PNEUMONIAE PLASMID GENES IN RESPONSE TO POLYMYXIN B. Em: 28º Congresso Brasileiro de Microbiologia CBM 2015, 2015, Florianópolis. Anais 28º Congresso Brasileiro de Microbiologia CBM 2015, v. 1, p. 1843-1843, 2015.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
8. FERRO, M. ; NICOLÁS, M. F. ; MURY, A. R. ; SCHULZE, B. R.. Metodologia para Avaliação de Equipamentos de Computação de Alto Desempenho: Um Estudo de Caso para Bioinformatica. Em: BRESCI - VIII Brazilian e-Science Workshop, 2014, Brasilia. Anaia BRESCI - VIII Brazilian e-Science Workshop, v. 1, p. 2-2, 2014.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
9. Custódio MGF ; GRECCO, M. S. ; Coelho VL ; NICOLÁS, M. F.. Estratégia para análise de dados de RNA-seq bacteriano. Em: BRESCI - VIII Brazilian e-Science Workshop, 2014, Brasilia. Anais BRESCI - VIII Brazilian e-Science Workshop, v. 1, p. 3-3, 2014.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
10. Girardello R ; Custódio MGF ; Coelho VL ; GRECCO, M. S. ; Ramos Pereira P I ; BRAUN, G. ; CARNEIRO, T. B. ; Vasconcelos, Ana T R ; NICOLÁS, M. F. ; GALES, A C. Whole Transcriptome Analysis of Acinetobacter baumannii Responses to Polymyxin B. Em: ICAAC 2014, 2014, Washington DC. Anais ICCAC 2014, v. 1, p. 640-640, 2014.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
11. QUISPE SAJI, G ; CANTÃO, M ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. Identification of coding sequences with conflicting atributes in the complete genome of Klebsiella pneumoniae Kp13 using ProkSCAs Tool. Em: VI workshop e-Science 2012, 2012, Curitiba. XXXII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, 2012.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
12. Medeiros J D ; CANTÃO, M ; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; DINIZ, C. ; da Silva V L ; CESAR, D. ; Coelho C M. Comparative resistome of a polluted and preserved stream. Em: American Society for Microbiology 2012, 2012, Chicago. ASM 2012, 2012.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
13. Ramos Pereira P I ; KLEIN, C ; Cottret L ; VASCONCELOS, A. T. R. ; GALES, A C ; Sagot M F ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. Initial metabolic reconstruction of Klebsiella pneumoniae Kp13, a multidrug resistant pathogen involved in nosocomial outbreaks in Brazil. Em: X-meeting 2011, 2011, Florianópolis. X-meeting 2011, 2011.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
14. COSTA, M. O. C. E. ; Almeida L G P ; VASCONCELOS, A. T. R. ; Ferreira F A ; Beltrame C O ; Figueiredo Agnes M S ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. Pyrosequencing-based analysis of four methicilin-resistant Staphylococcus aureus isolated in Brazil. Em: X-meeting 2011, 2011, Florianópolis. X-meeting 2011, 2011.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
15. COSTA, N ; CANTÃO, M ; DE PAULA, L. G. ; VESPERO, E C ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. Bioinformatics Approach for Detection of Single Nucleotide Polymorphisms in Klebsiella pneumoniae KP13 draft genome sequence. Em: The 1st International Conference on Bioinformatics SoIBio 2010, 2010, Termas de Chillan. The 1st International Conference on Bioinformatics SoIBio 2010, 2010.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
16. Koop M D ; Rocha V R ; Magalhães M ; Gerber A ; Cascardo J C M ; VASCONCELOS, A. T. R. ; DE PAULA, L. G. ; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; Figueira A V O ; Coutinho L L ; da Silva Junior W A ; Garcia D. Pirosequenciamento do transcriptoma da seringueira. Em: II Congresso brasileiro sobre heveicultura, 2010, Ilhéus, Bahia. II Congresso brasileiro sobre heveicultura, 2010.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
17. COSTA, N ; CANTÃO, M ; Almeida L G P ; VESPERO, E C ; VASCONCELOS, A. T. R. ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. SNPS ANALYSIS AND VIRULENCE CORRELATION IN KLEBSIELLA PNEUMONIAE KP13 DRAFT GENOME SEQUENCE. Em: 6th INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2010, Ouro Preto. X meeting 2010 Abstracts Book, v. 1, p. 5-5, 2010.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
18. COSTA, M. O. C. E. ; Souza, R. C. ; NETTO, D. S. ; COSTA, N ; KLEIN, C ; QUISPE SAJI, G ; VASCONCELOS, A. T. R. ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. ATLAST4SS: A HIERARCHICAL DATABASE OF TYPE IV SECRETION. Em: 6th INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2010, Ouro Preto. X meeting 2010 Abstracts Book, v. 1, p. 83-83, 2010.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
19. QUISPE SAJI, G ; CANTÃO, M ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. FINDING CODING SEQUENCES WITH CONFLICTING ATTRIBUTES DURING THE PROCESS OF PROKARYOTIC GENOME ANNOTATION. Em: 6th INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2010, Ouro Preto. X meeting 2010 Abstracts Book, v. 1, p. 191-191, 2010.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (32)
1. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Enfoques bioinformáticos para priorizar blancos para drogas antimicrobianas. 2021. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
2. Nicolás, Marisa F. How to Prioritize Molecular Targets in Pathogens through Bioinformatics. 2020. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
3. NICOLÁS, M. F. Integrating omics data to proritize target genes in pathogenic bacteria. 2019. Apresentação de Trabalho/Simpósio
4. Nicolás, Marisa F. Sequenciamento de Alto Rendimento com Aplicações em Bactérias Patogênicas. 2018. Apresentação de Trabalho/Congresso
5. Nicolás, Marisa F. Use of computational modeling to search for new therapeutic targets. 2018. Apresentação de Trabalho/Simpósio
6. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Primer relato del genoma de una KPC-producing K. quasipneumoniae subsp. similipneumoniae (KPC-Kqps) aislada de infección nosocomial en el sudeste brasileño. 2017. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
7. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Anotación de proteínas utilizando las bases de datos UniProt, Prosite e InterPro. 2017. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
8. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Patogenómica: como estrategia para priorizar blancos contra las bacterias multirresistentes. 2017. Apresentação de Trabalho/Seminário
9. CARDOSO, T. ; MORAES, G. L. ; LUCCHETTI, G. ; QUISPE SAJI, G ; VASCONCELOS, A. T. R. ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. SNP discovery in the Klebsiella pneumoniae transcriptome after polymyxin B induction in combination with abiotic stresses using RNA-Seq technology. 2016. Apresentação de Trabalho/Congresso
10. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Aplicación de las estrategias de RNA-seq para el estudio de transcriptomas bacterianos. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
11. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Estudio de casos de transcriptomas de bacterias patogénicas a través de RNA-seq: K pneumoniae. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
12. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Predicción de interacciones regulatorias transcripcionales bacterianas usando redes neuronales artificiales y datos de expresión de RNA-Seq. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
13. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Bioprospección de blancos moleculares para a busca de nuevos antibióticos para o control de enfermedades causadas por bacterias patogénicas. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
14. Custódio MGF ; Coelho VL ; NICOLÁS, M. F.. Estratégia para análise de dados de RNA-seq bacteriano. 2014. Apresentação de Trabalho/Congresso
15. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Genômica de Patógenos. 2013. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
16. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Genômica aplicada ao estudo de patógenos humanos. 2013. Apresentação de Trabalho/Simpósio
17. COSTA, N ; CANTÃO, M ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. SNPs detection in Klebsiella pneumoniae. 2012. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
18. Ramos Pereira P I ; KLEIN, C ; GALES, A C ; VASCONCELOS, A. T. R. ; Sagot M F ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. Regiões de plasticidade genômica e reconstrução metabólica in silico de um isolado clínico de Klebsiella causador de surto hospitalar. 2012. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
19. QUISPE SAJI, G ; CANTÃO, M ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. Identification of coding sequences with conflicting atributes in the complete genome of Klebsiella pneumoniae Kp13 using ProkSCAs Tool. 2012. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
20. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Genômica comparativa de procariotos: Avanços biotecnológicos. 2012. Apresentação de Trabalho/Simpósio
21. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Desvendando a virulência de um isolado de surto hospitalar de Klebsiella pneumoniae através da análise por pirossequenciamento. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
22. R. C. Picão ; P. I. P. Ramos, ; E. C. Vespero ; M. Pelisson ; L. F. Zuleta ; L. G. P. Almeida ; A. L. Gerber ; C. E. Thompson ; A. T. R. Vasconcelos, ; A. C. Gales ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. Pyrosequencing-based analysis reveals novel capsular gene cluster (cps) from a KPC-producing K. pneumoniae clinical isolate from Brazil. 2011. Apresentação de Trabalho/Congresso
23. COSTA, M. O. C. E. ; Almeida L G P ; VASCONCELOS, A. T. R. ; Ferreira F A ; Beltrame C O ; Figueiredo Agnes M S ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. Pyrosequencing-based analysis of four methicilin-resistant Staphylococcus aureus isolated in Brazil. 2011. Apresentação de Trabalho/Congresso
24. Ramos Pereira P I ; KLEIN, C ; Cottret L ; VASCONCELOS, A. T. R. ; GALES, A C ; Sagot M F ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. Initial metabolic reconstruction of Klebsiella pneumoniae Kp13, a multidrug resistant pathogen involved in nosocomial outbreaks in Brazil. 2011. Apresentação de Trabalho/Congresso
25. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Bioinformática: predição e anotação de genes. Em: Genômica, Evolução e Diversidade Bacteriana. 2011. Apresentação de Trabalho/Seminário
26. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Estudo do genoma de Klebsiella pneumoniae KPC. 2011. Apresentação de Trabalho/Seminário
27. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Desvendando a virulência de Klebsiella pneumoniae Kp13 através da análise genômica. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
28. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Desvendando a virulência de um isolado de surto hospitalar de Klebsiella pneumoniae Carbapenemase (KPC) através da análise por pirossequenciamento. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
29. NICOLÁS, Marisa Fabiana. O mundo dos microorganismos. Fique por dentro do LNCC. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
30. QUISPE SAJI, G ; CANTÃO, M ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. Identificación y análisis de secuencias codificadas con atributos en conflictos en genomas de procariotas. 2010. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
31. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Sequenciamento de alto desempenho na unidade genômica computacional UGC. 2010. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
32. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Técnicas Genômicas. Encontro Brasil-França de Bioinformática. 2010. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
Demais tipos de produção bibliográfica (1)
1. Guedes, I.A. ; COSTA, L. S. C. ; SANTOS, K. B. ; KARL, ANA LUIZA MARTINS ; ROCHA, G. K. ; TEIXEIRA, I. M. ; GALHEIGO, M. M. ; MEDEIROS, V. ; KREMPSER, E. ; CUSTÓDIO, Fábio Lima ; BARBOSA, Hélio José Correa ; NICOLAS, M. F. ; DARDENNE, LAURENT. Drug Design and Repurposing with DockThor-VS Web Server: Virtual Screening focusing on SARS-CoV-2 Therapeutic Targets and their Non-Synonym Variants. Research Square Doi: 10.21203/rs.3.rs-96789/v1. 2020. Resarch article preprint
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

Produção técnica

Programas de computador com registro de patente (0)
Programas de computador sem registro de patente (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (7)
1. Nicolas, M. F. Sequenciamento de alto rendimento com aplicações em bactérias patogênicas. 2018. Curso de curta duração ministrado/Extensão
  [ busca Google | busca Bing ]
2. NICOLÁS, Marisa Fabiana. Anotación de proteínas: PROSITE, INTERPRO, UNIPROTKB. 2017. Curso de curta duração ministrado/Especialização
  [ busca Google | busca Bing ]
3. NICOLÁS, M. F. Uso do banco de dados UniProt/Swiss-Prot na anotação de alta qualidade. Em: Curso CBAB/CABBIO Bioinformática Estrututal e Análises do Proteoma. 2013. Curso de curta duração ministrado/Extensão
  [ busca Google | busca Bing ]
4. NICOLÁS, M. F. Bioinformática: predição e anotação de genes. Em: Genômica, Evolução e Diversidade Bacteriana. 2012. Curso de curta duração ministrado/Outra
  [ busca Google | busca Bing ]
5. Nicolas, M. F.; Figueiredo Agnes M S. Bioinformática: predição e anotação de genes. Em: Genômica, Evolução e Diversidade Bacteriana. 2011. Curso de curta duração ministrado/Outra
  [ busca Google | busca Bing ]
6. NICOLÁS, Marisa Fabiana; Cantão, Mauricio E ; VASCONCELOS, A. T. R.. Curso CBAB 2011: ?FERRAMENTAS DE BIOINFORMÁTICA APLICADAS À ANÁLISE DE SEQUÊNCIAS GENÔMICAS, METAGENÔMICAS E TRANSCRIPTÔMICAS. 2011. Curso de curta duração ministrado/Outra
  [ busca Google | busca Bing ]
7. VASCONCELOS, A. T. R. ; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; CANTÃO, M ; BARCELLOS, F. G. ; Thompson F ; Kruger, R. Curso CBAB: Análise metagenômcia com o uso das plataformas avançadas de segunda geração de sequenciamento de DNA. 2010. Curso de curta duração ministrado/Outra
  [ busca Google | busca Bing ]

Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (2)
1. Stephanny Miranda Alves de Souza. Caracterização Estrutural, Funcional e Desenvolvimento de Nanobiossistemas do Peptídeo Lunasina Aplicados a sua Efetivação Terapêutica Anticâncer. Tese (Doutorado em Nanobiossistemas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).. Início: 2020.
  Supervisor: Marisa Fabiana Nicolás.
2. Cristiano Nascimento Costa. Desenvolvimento e validação de metodologia para avaliação de substâncias ativas nanoestruturadas e não nanoestruturadas administradas via nanoinjeção em Drosophila melanogaster. Tese (Doutorado em Nanobiossistemas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro. (Coorientador)., . Início: 2019.
  Supervisor: Marisa Fabiana Nicolás.
Dissertação de mestrado (1)
1. Leon Sulfierry Corrêa Costa. Avaliação do impacto das mutações não sinônimas na estrutura da proteína Nsp12 de SARS-CoV-2. Dissertação (Mestrado profissional em Modelagem Computacional) - Laboratório Nacional de Computação Científica, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).. Início: 2020.
  Supervisor: Marisa Fabiana Nicolás.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (1)
1. Maiana de Oliveira Cerqueira e Costa. Modelagem de redes biológicas para priorizar alvos em Staphylococcus aureus. Orientação de outra natureza. Laboratório Nacional de Computação Científica. Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, . Início: 2019.
  Orientador: Marisa Fabiana Nicolás.

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (1)
1. Guadalupe del Rosario Quispe Saji. . Laboratório Nacional de Computação Científica, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2018.
  Supervisor: Marisa Fabiana Nicolás.
Tese de doutorado (5)

Maiana Oliveira Cerqueira Costa. Modelo metabólico integrado com as vias regulatórias associadas ao biofilme do isolado Bmb9393 de Staphylococcus aureus pertencente à linhagem ST239-SCCmecIII do Clone Epidêmico Brasileiro (BEC). Tese (Doutorado em Modelagem Computacional) - Laboratório Nacional de Computação Científica, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2018.
Orientador: Marisa Fabiana Nicolás.
Guadalupe del Rosario Quispe Saji. Predição de interações de redes regulatórias transcricionais (TRNs) usando sistemas de aprendizagem automatizado a partir de dados de expressão de RNA-seq-bacteriano.. Tese (Doutorado em Modelagem Computacional) - Laboratório Nacional de Computação Científica, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2016.
Orientador: Marisa Fabiana Nicolás.
Pablo Ivan Pereira Ramos. Transcritoma da resposta de Klebsiella pneumoniae à polimixina B e abordagem computacional para priorização de alvos moleculares. Tese (Doutorado em Modelagem Computacional) - Laboratório Nacional de Computação Científica, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2016.
Orientador: Marisa Fabiana Nicolás.
Fernanda Alves de Freita Guedes. Análise transcriptômica e interatômica de diferentes espécies de Hevea brasiliensis inoculadas com Microcyclus ulei. Tese (Doutorado em Modelagem Computacional) - Laboratório Nacional de Computação Científica, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2015.
Orientador: Marisa Fabiana Nicolás.
Ana Maria Nunes Botelho. Genômica Comparativa de Amostras de Staphylococcus aureus Resistentes à Meticilina Pertencentes à Linhagem ST239-SCCmecIII Com Diferentes Fenótipos de Formação de Biofilme. Tese (Doutorado em Ciências (Microbiologia)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2015.
Supervisor: Marisa Fabiana Nicolás.
Dissertação de mestrado (8)

Juliana Simas Coutinho Barbosa. Genome-scale Reconstruction of the Metabolic Network iJS784 for Acinetobacter baumannii strain ATCC 17978 to Address Drug Target Prioritization. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Laboratório Nacional de Computação Científica, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2020.
Orientador: Marisa Fabiana Nicolás.
Rodrigo Colpo. Um novo algorítimo de gap filling de redes metabólicas aplicando estratégia de expansão de redes. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Laboratório Nacional de Computação Científica, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2016.
Orientador: Marisa Fabiana Nicolás.
Márlon Gregori Flores Custódio. Análise bioinformática do perfil de transcritos de Klebsiella pneumoniae através de dados de RNA-seq. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Laboratório Nacional de Computação Científica, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2015.
Orientador: Marisa Fabiana Nicolás.
Julliane Dutra Medeiros. Análise da diversidade genética e função da comunidade microbiana das águas do Córrego São Pedro, comparando duas regiões com diferentes níveis de urbanização. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2013.
Supervisor: Marisa Fabiana Nicolás.
Maiana de Oliveira Cerqueira e Costa. Genômica comparativa de variantes de Staphylococcus aureus MRSA com diferentes padrões de biolme isolados no Brasil. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Laboratório Nacional de Computação Científica, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2012.
Orientador: Marisa Fabiana Nicolás.
Pablo Ivan Pereira Ramos. Análise Genômica Comparativa e Reconstrução Metabolica de Klebsiella pneumoniae Kp13. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Laboratório Nacional de Computação Científica, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2012.
Orientador: Marisa Fabiana Nicolás.
Nicholas Costa Barroso Lima. Abordagem Computacional para Detecção e Análise de Polimorfismos de Nucleotídeos Únicos (SNPs) em Genomas Bacterianos. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Laboratório Nacional de Computação Científica, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2011.
Orientador: Marisa Fabiana Nicolás.
Guadalupe del Rosario Quispe Saji. Identificação e Análise de Sequências Codificantes com Atributos Conflitantes em Genomas Procariotos. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Laboratório Nacional de Computação Científica, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2010.
Orientador: Marisa Fabiana Nicolás.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (3)

Leonardo Carvalho GaIlharco Morgado (co-orientado). Modelagem do crescimento da bactéria patogênica Staphylococcus aureus N315 com a análise de balanço de fluxo (FBA). Iniciação Científica - Laboratório Nacional de Computação Científica, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2015.
Orientador: Marisa Fabiana Nicolás.
Thiago Cardoso. Bioinformática Aplicada às Análises de sequências transcriptômicas de Klebsiella pneumoniae. Iniciação Científica - Laboratório Nacional de Computação Científica, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2015.
Orientador: Marisa Fabiana Nicolás.
Gisele Luchetti. Análises de sequências transcriptômicas de plasmideos de Klebsiella pneumoniae. Iniciação Científica - Laboratório Nacional de Computação Científica, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2015.
Orientador: Marisa Fabiana Nicolás.
Orientações de outra natureza (1)

Nicholas Costa Barroso Lima. Workflow de detecção de polimorfismos em sequências de genomas bacterianos. Orientação de outra natureza - Laboratório Nacional de Computação Científica, Ministerio da Ciência, Tecnologia e Inovação. 2013.
Orientador: Marisa Fabiana Nicolás.

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (9)

2020-Atual. Estudo das bases moleculares das comorbidades associadas ao desenvolvimento de COVID-19 grave - Uma abordagem de biologia de sistemas
Descrição: Para apoio no tratamento de pacientes graves com COVID-19, é preciso entender a intrincada correlação molecular da infecção pelo SARS-CoV-2 com as comorbidades associadas à gravidade e seus tratamentos. Pretendemos avançar na compreensão destes mecanismos por meio da modelagem computacional, utilizando algoritmos de aprendizado de máquina e análise de redes biológicas, analisando dados transcriptômicos e de proteoma de células humanas infectadas com SARS-CoV-2 para identificar os genes e proteínas associados à infecção. Esta análise fornecerá uma ampla visão geral das moléculas envolvidas em doenças relacionadas à COVID-19 grave e como elas podem estar relacionadas à infecção por SARS-CoV-2. A integração e análise deste complexo conjunto de informações irá gerar uma lista de fármacos (individuais ou combinados), candidatos ao reposicionamento, adequados aos diversos casos clínicos. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marisa Fabiana Nicolás - Coordenador / Maiana de Oliveira C E Costa - Integrante / marcelo trindade dos santos - Integrante / Fabricio Alves Barbosa da Silva - Integrante / Alberto Martín Rivera Dávila - Integrante / CASTRO, MARIA CLICIA S - Integrante / Adriano Barbosa - Integrante / Andrea Henriques Pons - Integrante / Anna Cristina Calçada Carvalho - Integrante / Alba Cristina Magalhaes Alves de Melo - Integrante / Helder Takashi Imoto Nakaya - Integrante. Financiador(es): INOVA Fiocruz - Auxílio financeiro.
Membro: Marisa Fabiana Nicolas.
2019-Atual. Abordagem multi-omica e modelagem de redes biologicas para priorizar alvos em Staphylococcus aureus
Descrição: a presente proposta de projeto tem ênfase na priorização de alvos candidatos para futuras aplicações terapêuticas contra o patógeno humano Staphylococcus aureus pertencente à linhagem ST239-SCCmecIII do Clone Epidêmico Brasileiro (BEC) resistente a meticilina. Especificamente, utilizaremos várias camadas de dados 'ômicos', de redes em escala genômica e dados estruturais/funcionais relacionados a essas espécies para priorizar genes e proteínas com características de potenciais alvos atraentes para o desenvolvimento de novos antimicrobianos (fármacos/biofármacos).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Marisa Fabiana Nicolás - Coordenador / Maiana de Oliveira C E Costa - Integrante / Agnes Marie S Figueiredo - Integrante / Dario Fernandes do Porto - Integrante. Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.
Membro: Marisa Fabiana Nicolas.
2019-Atual. Abordagem integrativa e multi-omica na priorizacao de alvos contra patogenos de importancia clinica combinando tecnicas de bioinformatica e biotecnologia
Descrição: As contribuições científicas, tecnológicas e de inovação a partir deste projeto vão desde a aplicação da bioinformática, modelagem molecular, machine learning, virtual screening, molecular docking, para a identificação e seleção de alvos candidatos, até a biologia e biotecnologia para a avaliação experimental de alvos específicos identificados. Ressalta-se a consolidação da interação entre grupos de pesquisa brasileiros, argentinos e mexicanos com expertises complementares e forte atuação em suas respectivas áreas que vem trabalhando em conjunto há mais de cinco anos, a exemplo do Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC), Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz - Instituto Gonçalo Moniz, BA), UNIFESP, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM) e Universidad de Buenos Aires (UBA).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Marisa Fabiana Nicolás - Coordenador / Luciane Prioli Ciapina - Integrante / Ana Tereza Ribeiro Vasconcelos - Integrante / Ana Cristina Gales - Integrante / Pablo Ivan Pereira Ramos - Integrante / Adrian Gustavo Turjanski - Integrante / Laurent E. Dardenne - Integrante / Dario Fernandes do Porto - Integrante / Ernesto Perez Rueda - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
Membro: Marisa Fabiana Nicolas.
2017-Atual. Reconstrucao de modelos metabolicos integrados com redes regulatorias em genomas bacterianos
Descrição: Este projeto de pesquisa visa selecionar alvos moleculares como resultado da abordagem in silico da reconstrução das redes metabólicas em escala genômica (GENRE), combinadas com a análise de balanço de fluxo (FBA) e as redes regulatórias transcricionais (TRNs).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . Integrantes: Marisa Fabiana Nicolás - Coordenador / Maiana de Oliveira C E Costa - Integrante / Guadalupe del Rosario Quispe Saji - Integrante / Pablo Ivan Pereira Ramos - Integrante / Rodrigo Amarante Colpo - Integrante / Juliana Juliana Simas Coutinho Barbosa - Integrante / Dario Fernandes do Porto - Integrante / Adrián Turjanski - Integrante / Marcelo Marti - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / FAPERJ - Auxílio financeiro.
Membro: Marisa Fabiana Nicolas.
2014-2018. Prospeccao e priorizacao de alvos moleculares para o desenho de novos farmacos contra Klebsiella pneumoniae e Mycobacterium tuberculosis utilizando tecnicas de bioinformatica
Descrição: : O projeto abrange a utilização de métodos de bioinformática, modelagem molecular e transcritômica para a detecção e priorização de desenvolvimento de novos fármacos para o controle de doenças causadas pelas bactérias Klebsiella pneumoniae (infecções hospitalares) e Mycobacterium tuberculosis (tuberculose). O presente projeto possui relevância para as populações de ambos os países partícipes, Brasil e Argentina, uma vez que todos enfrentam, na prática clínica, surtos de infecções hospitalares causados por estirpes de K. pneumoniae além de sermos, também, países onde a tuberculose, causada pelo bacilo Mycobacterium tuberculosis, ainda representa uma ameaça à saúde pública a despeito das políticas públicas de vacinação implementadas. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . Integrantes: Marisa Fabiana Nicolás - Coordenador / Pablo Ivan Pereira Ramos - Integrante / Esteban Omar Lanzarotti - Integrante / Adrian Gustavo Turjanski - Integrante. Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.
Membro: Marisa Fabiana Nicolas.
2014-2016. Identificacao de transcritos relacionados a resistencia da seringueira Hevea brasiliensis ao patogeno Microcyclus ulei utilizando dados de RNA-Seq e mineracao de dados
Descrição: A seringueira (Hevea brasiliensis) é a principal fonte comercial de látex, que serve de matéria-prima a diversos setores da indústria. Entretanto, seu cultivo é bastante afetado pelo fungo Microcyclus ulei, causador do Mal-das-Folhas, que pode provocar a morte da árvore ainda em período produtivo. O presente projeto tem como objetivo ampliar nosso conhecimento sobre os mecanismos de defesa da seringueira e identificar transcritos relacionados à sua resistência ao patógeno M.ulei por meio da utilização de ferramentas de bioinformática e de mineração de dados. Desta forma, sua principal contribuição será auxiliar programas de manejo e melhoramento desta espécie vegetal economicamente importante, na busca de cultivares resistentes.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Marisa Fabiana Nicolás - Integrante / Dominique Garcia - Coordenador / Fernanda Alves de Freita Guedes - Integrante.
Membro: Marisa Fabiana Nicolas.
2013-2018. Bioinformatica aplicada as analises de sequencias transcriptomicas de Klebsiella pneumoniae
Descrição: Esta proposta aplicará métodos de Bioinformática para analisar sequências transcriptômicas do isolado Kp13 de surto hospitalar de Klebsiella pneumoniae, cujo genoma completo foi recentemente sequenciado pelo nosso grupo no LNCC, Petrópolis RJ. Serão realizadas analises de dados gerados do sequenciamento de transcriptos (RNA-seq) obtidos de células de K. pneumoniae Kp13 submetidas a diferentes condições de crescimento in vitro.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . Integrantes: Marisa Fabiana Nicolás - Coordenador / Ana Tereza Ribeiro Vasconcelos - Integrante / Ana Cristina Gales - Integrante / Raquel Girardello - Integrante / Pablo Ivan Pereira Ramos - Integrante / Márlon Grégori Flores Custódio - Integrante. Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro. Número de produções C, T & A: 3
Membro: Marisa Fabiana Nicolas.
2011-2016. Avaliacao do transcriptoma bacteriano e aspectos fisiologicos e da patogenese de Bacteroides fragilis durante infeccao experimental em resposta a concentracoes sub-inibitorias de metronidazole
Descrição: Ao longo das pesquisas sobre susceptibilidade bacteriana aos antimicrobianos, agregando novas metodologias, introduzimos ao estudo da resistência a drogas uma abordagem ecológica, discutindo alguns aspectos das relações droga-bactéria-hospedeiro, em modelos microbianos de interesse microbiológico e clínico. Posteriormente, a oportunidade de aprendizado de novas técnicas e integração a grupo de pesquisa no exterior, EUA, permitiram a aplicação de técnicas de biologia molecular, para o estudo dos genomas funcionais microbianos, que vêm sendo utilizadas, de maneira inédita no Brasil, como ferramenta para elucidação mais abrangente da interferência de agentes ambientais na relação bactéria-hospedeiro, com contribuição significativa para a literatura internacional pertinente a esta área de estudo nos últimos anos. Apesar dos avanços, os mecanismos moleculares e regulatórios envolvidos na resposta bacteriana a alterações ambientais (como à presença de drogas antimicrobianas), diretamente relacionadas com a virulência bacteriana e com reflexo imediato para os seus hospedeiros humanos e animais, não são, ainda, bem compreendidos. Investigações científicas direcionadas ao esclarecimento desses mecanismos deverão contribuir para o desenvolvimento de marcadores para o diagnóstico microbiológico e para o desenvolvimento de estratégias terapêuticas, além de estimular o uso racional de drogas antimicrobianas e o desenvolvimento de novas tecnologias que poderão minimizar o crítico impacto ecológico dos antimicrobianos, um dos temas de maior preocupação, hoje, em todo o mundo. Desta forma, com abordagem multidisciplinar, que possibilita a troca de experiências entre participantes de diferentes áreas e Instituições, este projeto contribui para formação de recursos humanos e formação científica em bacteriologia de futuros profissionais das áreas de Ciências Biológicas e Saúde. Deve-se acrescentar que outros profissionais serão convidados a participar desse estudo, quando pertinente. O projeto deverá, também, contribuir para um melhor conhecimento da ecologia e dinâmica populacional microbiana, principalmente no que se refere aos mecanismos adaptativos bacterianos. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Marisa Fabiana Nicolás - Integrante / Claudio Diniz - Coordenador.
Membro: Marisa Fabiana Nicolas.
2010-2013. Genomica comparativa de variantes de Staphylococcus aureus resistentes a meticilina ST239, importante patogeno de pneumonias hospitalares
Descrição: Este projeto visa o sequenciamento completo de 08 amostras de S. aureus resistentes à meticilina pertencentes à linhagem ST239-Sccmec III, visando um estudo patogenômico sobre o biofilme de S. aureus... Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marisa Fabiana Nicolás - Integrante / Maiana de Oliveira C E Costa - Integrante / Agnes Marie S Figueiredo - Coordenador. Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.
Membro: Marisa Fabiana Nicolas.

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (2)

Honorable Mention Award for the work intitled "Overcoming challenges in the metabolic reconstruction process: A promising approach to the MDRAB problem.", 15th International Conference of the AB3C.. 2019.
Membro: Marisa Fabiana Nicolás.
Orientador do 3o melhor trabalho na XI Jornada de Iniciação Científica e Tecnológica, PIBIC/PIBITI-LNCC.. 2016.
Membro: Marisa Fabiana Nicolás.

Participação em eventos

Total de participação em eventos (13)

1st Congress of Women in Bioinformatics and Data Science LA. How to Prioritize Molecular Targets in Pathogens through Bioinformatics. 2020. (Congresso).
III International Course on Theoretical and Applied Aspects of Systems Biology 019.Integrating omics data to proritize target genes in pathogenic bacteria. 2019. (Simpósio).
SYMPOSIUM ON RESEARCH, DEVELOPMENT AND INNOVATION IN BACTERIAL AND FUNGAL DISEASES? (IV SIMBAF).Use of computational modeling to search for new therapeutic targets. 2018. (Simpósio).
CELFI: Escuela de Análisis de resistencia antimicrobiana y desarrollo de drogas a partir de genomas bacterianos.Primer relato del genoma una KPC-producing K. quasipneumoniae subsp. similipneumoniae (KPC-Kqps) aislada de infección nosocomial en el sudeste brasileño. 2017. (Encontro).
Genômica no Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable.Patogenómica como estratégia para priorizar blancos contra las bacterias multirresistentes. 2017. (Oficina).
CELFI: De la clínica a la genómica de agentes infecciosos bacterianos. Un enfoque interdisciplinario.Estudio de casos de transcriptomas de bacterias patogénicas a través de RNA-seq: K pneumoniae. 2016. (Outra).
Simpósio em Bioinformática: Enfoques computacionais para resolver problemas biológicos.Bioprospección de blancos moleculares para buscar nuevos antibióticos: el problema de las bacterias multirresistentes. 2016. (Simpósio).
28º Congresso Brasileiro de Microbiologia CBM 2015. TRANSCRIPTOME PROFILING ANALYSIS OF KLEBSIELLA PNEUMONIAE PLASMID GENES IN RESPONSE TO POLYMYXIN B. 2015. (Congresso).
XXXII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. trilha de bioinformática no VI e-Science workshop. 2012. (Congresso).
III Seminários Avançados em Tecnologia de Microarrays e Next Generation Sequencing.Desvendando a virulência de um isolado de surto hospitalar de Klebsiella pneumoniae através da análise por pirossequenciamento. 2011. (Seminário).
X-meeting 2011. Initial metabolic reconstruction of Klebsiella pneumoniae Kp13, a multidrug resistant pathogen involved in nosocomial outbreaks in Brazil. 2011. (Congresso).
1st international Conference on Bioinformatics SoiBio. Identificación y análisis de secuencias codificadas con atributos en conflictos en genomas de procariotas. 2010. (Congresso).
EMBO Meeting 2010. 2010. (Congresso).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (24)

Nicolas, M. F.; CANTÃO, M ; FORNANDES, G. R.. 1era Escola Latino-Americana de Bioinformática para as Ciências Ômicas - ELAB. 2019. Outro
NICOLÁS, Marisa Fabiana; CANTÃO, M. Curso CBAB/CABBIO 2017: Ferramentas de Bioinformática para Análise de Dados de RNA-seq. 2017. Outro
NICOLÁS, Marisa Fabiana; CANTÃO, M. Curso CBAB/CABBIO 2016: Ferramentas de Bioinformática Aplicadas às Análises de Sequências de RNA-seq. 2016. Outro
NICOLÁS, Marisa Fabiana; Quispe Saji, Guadalupe del Rosario. Vinda e atividades do pesquisador Dario Fernandez do Porto (Universidad de Buenos Aires UBA). 2015. Outro
Nicolás, Marisa F; Cantão, Mauricio E. Curso CBAB/CABBIO 2015: Ferramentas de Bioinformática Aplicadas às Análises de Sequências de RNA-seq. 2015. Outro
NICOLÁS, Marisa Fabiana. Vinda e atividades do aluno de intercambio Martín Soñora Grecco (Facultad de Ciencias - UDeLaR, Universidad de la Repu?blica, Uruguay). 2014. (Outro).. . 0.
NICOLÁS, Marisa Fabiana; Cantão, Mauricio E. Curso CBAB/CABBIO 2014 "Ferramentas de Bioinformática Aplicadas às Sequências Transcriptômicas". 2014. Outro
NICOLÁS, Marisa Fabiana; Quispe Saji, Guadalupe del Rosario ; Custódio MGF. Vinda e atividades da aluna Natalia Lizeth Acosta Vega (Instituto Nacional de Cancerologia) Colombia. 2014. Outro
Nicolás, Marisa F; Cantão, Mauricio E. Curso CBAB/CABBIO 2013 "Ferramentas de Bioinformática Aplicadas às Análises de Sequências Transcriptômicas". 2013. Outro
E Ogasawara ; E Bezerra ; Porto F ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. VI workshop e-Science 2012. 2012. Congresso
VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; CANTAO, M. E.. Curso CBAB/CABBIO 2012 "Ferramentas de Bioinformática Aplicadas às Análises de Sequências Transcriptômicas e Metagenômicas". 2012. Outro
Porto F ; NICOLÁS, M. F.. V Brazilian E-Science Workshop. 2011. Congresso
VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; CANTAO, M. E.. Curso CBAB/CABBIO 2011 ?Ferramentas de Bioinformática Aplicadas à Análise de Sequências Genômicas, Metagenômicas e Transcriptômicas. 2011. Outro
VASCONCELOS, A. T. R. ; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; CANTÃO, M ; BARCELLOS, F. G.. Curso CBAB/CABBIO 2010 "Análise metagenômica com o uso das plataformas avançadas de segunda geração de sequenciamento de DNA". 2010. Outro
NICOLÁS, Marisa Fabiana. Vinda e atividades do professor visitante Dominique Garcia (CIRAD, França). 2010. (Outro).. . 0.
NICOLÁS, Marisa Fabiana. Vinda e atividades do aluno visitante Esteban Omar Lanzarotti (UBA, Argentina). 2010. (Outro).. . 0.
NICOLÁS, Marisa Fabiana. Vinda e atividades do professor visitante Jorge Teodoro de Souza (Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, Cruz das Almas). 2010. (Outro).. . 0.
NICOLÁS, Marisa Fabiana. Curso para a anotação do genoma de Klebsiella pneumoniae KP13. 2010. (Outro).. . 0.
NICOLÁS, Marisa Fabiana; DE PAULA, L. G. ; CANTÃO, M. Vinda e atividades da professora visitante Ana Cristina Gales (UNIFESP, São Paulo). 2010. Outro
NICOLÁS, Marisa Fabiana. Vinda e atividades da professora visitante Eliana Vespero (UEL, Londrina). 2010. (Outro).. . 0.
NICOLÁS, Marisa Fabiana. Vinda e atividades da aluna Carolina Polano (UEL, Londrina). 2010. (Outro).. . 0.
NICOLÁS, Marisa Fabiana; DE PAULA, L. G. ; CANTÃO, M. Vinda e atividades da professora visitante Renata Picão (UNIFESP, São Paulo). 2010. Outro
NICOLÁS, Marisa Fabiana; DE PAULA, L. G. ; CANTÃO, M. Vinda e atividades do aluno Danilo Elias Xavier (UNIFESP, São Paulo). 2010. Outro
NICOLÁS, Marisa Fabiana. Vinda e atividades do pesquisador Juliano Tomazzoni Boldo (UFRGS, Porto Alegre). 2010. (Outro).. . 0.

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (14)

Marisa Fabiana Nicolás ⇔ Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos (24.0)
MARTINS, YASMMIN CÔRTES ; ZIVIANI, ARTUR ; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; DE VASCONCELOS, ANA TEREZA RIBEIRO. Large-Scale Protein Interactions Prediction by Multiple Evidence Analysis Associated With an In-Silico Curation Strategy. Frontiers in Bioinformatics. v. 1, p. 1-12, issn: 2673-7647, 2021.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
BELLINI, REINALDO G. ; CORONADO, MÔNIKA APARECIDA ; PASCHOAL, ALEXANDRE ROSSI ; GAUDENCIO DO RÊGO, THAÍS ; Hungria, Mariangela ; RIBEIRO DE VASCONCELOS, ANA TEREZA ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. Structural analysis of a novel N-carbamoyl-d-amino acid amidohydrolase from a Brazilian Bradyrhizobium japonicum strain: In silico insights by molecular modelling, docking and molecular dynamics. JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING. v. 86, p. 35-42, issn: 1093-3263, 2019.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
BOTELHO, ANA MARIA NUNES ; CERQUEIRA E COSTA, MAIANA OLIVEIRA ; MOUSTAFA, AHMED M. ; BELTRAME, CRISTIANA OSSAILLE ; FERREIRA, FABIENNE ANTUNES ; CÔRTES, MARINA FARREL ; COSTA, BRUNO SOUZA SCRAMIGNON ; SILVA, DEBORAH NASCIMENTO SANTOS ; BANDEIRA, PAULA TERRA ; LIMA, NICHOLAS COSTA BARROSO ; SOUZA, Rangel Celso ; ALMEIDA, LUIZ GONZAGA PAULA DE ; Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro ; NARECHANIA, APURVA ; RYAN, CHANELLE ; O?BRIEN, KELSEY ; KOLOKOTRONIS, SERGIOS-ORESTIS ; PLANET, PAUL J. ; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; FIGUEIREDO, AGNES MARIE SÁ. Local Diversification of Methicillin- Resistant Staphylococcus aureus ST239 in South America After Its Rapid Worldwide Dissemination. Frontiers in Microbiology. v. 10, p. 1-19, issn: 1664-302X, 2019.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
ANDREY, DIEGO O ; DANTAS, PRISCILA ; MARTINS, WILLAMES B S ; MARQUES DE CARVALHO, FABÍOLA ; GONZAGA, LUIZ A ; SANDS, KIRSTY ; PORTAL, EDWARD ; SAUSER, JULIEN ; CAYÔ, RODRIGO ; NICOLAS, MARISA F ; VASCONCELOS, ANA TEREZA R ; MEDEIROS, EDUARDO A ; WALSH, TIMOTHY R ; GALES, ANA C. An Emerging Clone, KPC-2-Producing Klebsiella pneumoniae ST16, Associated with High Mortality Rates in a CC258 Endemic Setting. CLINICAL INFECTIOUS DISEASES. v. ciz109, p. 1-30, issn: 1058-4838, 2019.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
Nicolás, Marisa F. ; RAMOS, PABLO IVAN PEREIRA ; MARQUES DE CARVALHO, FABÍOLA ; CAMARGO, DHIAN R. A. ; DE FÁTIMA MORAIS ALVES, CARLENE ; LOSS DE MORAIS, GUILHERME ; Almeida, Luiz G. P. ; Souza, Rangel C. ; CIAPINA, LUCIANE P. ; VICENTE, ANA C. P. ; COIMBRA, RONEY S. ; RIBEIRO DE VASCONCELOS, ANA T.. Comparative genomic analysis of a clinical isolate of Klebsiella quasipneumoniae subsp. similipneumoniae, a KPC-2 and OKP-B-6 beta-lactamases producer harboring two drug-resistance plasmids from Southeast Brazil. Frontiers in Microbiology. v. 9, p. 1-16, issn: 1664-302X, 2018.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
RAMOS, PABLO IVAN PEREIRA ; FERNÁNDEZ DO PORTO, DARÍO ; LANZAROTTI, ESTEBAN ; SOSA, EZEQUIEL J. ; BURGUENER, GERMÁN ; PARDO, AGUSTÍN M. ; KLEIN, CECILIA C. ; Sagot, Marie-France ; DE VASCONCELOS, ANA TEREZA R. ; GALES, ANA CRISTINA ; MARTI, MARCELO ; TURJANSKI, ADRIÁN G. ; Nicolás, Marisa F.. An integrative, multi-omics approach towards the prioritization of Klebsiella pneumoniae drug targets. Scientific Reports. v. 8, p. 10755, issn: 2045-2322, 2018.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
CÔRTES, MARINA F. ; BOTELHO, ANA M. N. ; Almeida, Luiz G. P. ; Souza, Rangel C. ; CUNHA, OBERDAN DE LIMA ; Nicolás, Marisa F. ; VASCONCELOS, ANA T. R. ; FIGUEIREDO, AGNES M. S.. Community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus from ST1 lineage harboring a new SCCmec IV subtype (SCCmec IVm) containing the tetK gene. Infection and Drug Resistance. v. Volume 11, p. 2583-2592, issn: 1178-6973, 2018.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
CÔRTES, MARINA FARREL ; COSTA, MAIANA OC ; LIMA, NICHOLAS CB ; SOUZA, RANGEL C ; Almeida, Luiz GP ; GUEDES, LUCIANE PRIOLI CIAPINA ; Vasconcelos, Ana TR ; Nicolás, Marisa F ; FIGUEIREDO, AGNES MS. Complete genome sequence of the community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus (strain USA400-0051) a prototype of the USA400 clone. MEMORIAS DO INSTITUTO OSWALDO CRUZ. v. 112, p. 790-792, issn: 0074-0276, 2017.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
BOTELHO, ANA M. N. ; COSTA, MAIANA O. C. ; BELTRAME, CRISTIANA O. ; FERREIRA, FABIENNE A. ; CÔRTES, MARINA F. ; BANDEIRA, PAULA T. ; LIMA, NICHOLAS C. B. ; Souza, Rangel C. ; Almeida, Luiz G. P. ; VASCONCELOS, ANA T. R. ; Nicolás, Marisa F. ; FIGUEIREDO, AGNES M. S.. Complete genome sequence of an agr-dysfunctional variant of the ST239 lineage of the methicillin-resistant Staphylococcus aureus strain GV69 from Brazil. Standards in Genomic Sciences. v. 11, p. 34-40, issn: 1944-3277, 2016.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
MEDEIROS, JULLIANE DUTRA ; CANTÃO, MAURÍCIO EGÍDIO ; CESAR, DIONÉIA EVANGELISTA ; NICOLÁS, MARISA FABIANA ; Diniz, Cláudio Galuppo ; SILVA, Vânia Lúcia ; VASCONCELOS, ANA TEREZA RIBEIRO DE ; COELHO, CÍNTIA MARQUES. Comparative metagenome of a stream impacted by the urbanization phenomenon. Brazilian Journal of Microbiology (Impresso). v. 119, p. 01-11, issn: 1517-8382, 2016.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
BOTELHO, ANA M. N. ; COSTA, MAIANA O. C. ; BELTRAME, CRISTIANA O. ; FERREIRA, FABIENNE A. ; LIMA, NICHOLAS C. B. ; COSTA, BRUNO S. S. ; DE MORAIS, GUILHERME L. ; Souza, Rangel C. ; Almeida, Luiz G. P. ; VASCONCELOS, ANA T. R. ; Nicolás, Marisa F. ; FIGUEIREDO, AGNES M. S.. Complete genome sequence of the MRSA isolate HC1335 from ST239 lineage displaying a truncated AgrC histidine kinase receptor. Genome Biology and Evolution. v. 8, p. 3187-3192, issn: 1759-6653, 2016.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
FREITAS, MICHELE C. R. DE ; RESENDE, JULIANA A. ; FERREIRA-MACHADO, ALESSANDRA B. ; SAJI, GUADALUPE D. R. Q. ; VASCONCELOS, ANA T. R. DE ; SILVA, VÂNIA L. DA ; NICOLÁS, MARISA F. ; Diniz, Cláudio G.. Exploratory investigation of Bacteroides fragilis transcriptional response during in vitro exposure to subinhibitory concentration of metronidazole. Frontiers in Microbiology (Online). v. 7, p. 1465-1477, issn: 1664-302X, 2016.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
RAMOS, PABLO IVAN PEREIRA ; CUSTÓDIO, MÁRLON GRÉGORI FLORES ; QUISPE SAJI, GUADALUPE DEL ROSARIO ; CARDOSO, THIAGO ; DA SILVA, GISELE LUCCHETTI ; BRAUN, GRAZIELA ; MARTINS, WILLAMES M. B. S. ; GIRARDELLO, RAQUEL ; DE VASCONCELOS, ANA TEREZA RIBEIRO ; FERNÁNDEZ, ELMER ; GALES, ANA CRISTINA ; NICOLÁS, Marisa Fabiana. The polymyxin B-induced transcriptomic response of a clinical, multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae involves multiple regulatory elements and intracellular targets. BMC GENOMICS. v. 17, p. 447-462, issn: 1471-2164, 2016.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
NICOLETTI, ADRIANA GIANNINI ; MARCONDES, MARCELO F. M. ; MARTINS, WILLAMES B. ; Almeida, Luiz G. P. ; Nicolás, Marisa F. ; VASCONCELOS, ANA T. R. ; OLIVEIRA, VITOR ; GALES, ANA CRISTINA. Characterization of BKC-1 class A carbapenemase from Klebsiella pneumoniae clinical isolates in Brazil. Antimicrobial Agents and Chemotherapy (Print). v. 59, p. AAC.00158-15-30, issn: 0066-4804, 2015.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
RAMOS, PABLO IVAN ; Picão, Renata C ; ALMEIDA, LUIZ GONZAGA ; LIMA, NICHOLAS COSTA ; Girardello, Raquel ; VIVAN, ANA CAROLINA ; Xavier, Danilo E ; BARCELLOS, FERNANDO G ; PELISSON, Marsileni ; VESPERO, ELIANA C ; MÉDIGUE, CLAUDINE ; VASCONCELOS, ANA TEREZA ; Gales, Ana C ; NICOLÁS, MARISA F. Comparative analysis of the complete genome of KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae Kp13 reveals remarkable genome plasticity and a wide repertoire of virulence and resistance mechanisms. BMC Genomics. v. 15, p. 54, issn: 1471-2164, 2014.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
SALGADO, LEONARDO RIPPEL ; KOOP, DANIELA MARTINS ; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ ; RIVALLAN, RONAN ; LE GUEN, VINCENT ; NICOLÁS, Marisa Fabiana ; DE ALMEIDA, LUIZ GONZAGA ; ROCHA, VIVIANI RIBEIRO ; MAGALHÃES, MILENA ; GERBER, ALEXANDRA LEHMKUHL ; FIGUEIRA, ANTONIO ; CASCARDO, JÚLIO CÉZAR ; DE VASCONCELOS, ANATEREZA RIBEIRO ; SILVA, WILSON ARAÚJO ; COUTINHO, LUIZ LEHMANN ; GARCIA, DOMINIQUE. De novo transcriptome analysis of Hevea brasiliensis tissues by RNA-seq and screening for molecular markers. BMC Genomics. v. 15, p. 236, issn: 1471-2164, 2014.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
MARINOTTI, O. The Genome of Anopheles darlingi, the main neotropical malaria vector. Nucleic Acids Research (Online). v. 41, p. 7387-7400, issn: 0305-1048, 2013.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
COSTA, M. O. C. ; BELTRAME, C. O. ; FERREIRA, F. A. ; BOTELHO, A. M. N. ; LIMA, N. C. B. ; Souza, R. C. ; DE ALMEIDA, L. G. P. ; VASCONCELOS, A. T. R. ; Nicolas, M. F. ; FIGUEIREDO, A. M. S.. Complete Genome Sequence of a Variant of the Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus ST239 Lineage, Strain BMB9393, Displaying Superior Ability To Accumulate ica-Independent Biofilm. Genome Announcements. v. 1, p. e00576-13-e00576-13, issn: 2169-8287, 2013.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
Souza, Rangel C ; Quispe Saji, Guadalupe del Rosario ; Costa, Maiana O C ; Netto, Diogo S ; Lima, Nicholas C B ; Klein, Cecília C ; Vasconcelos, Ana T R ; Nicolás, Marisa F. AtlasT4SS: A curated database for type IV secretion systems. BMC Microbiology (Online). v. 12, p. 172, issn: 1471-2180, 2012.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
Pablo I.P Ramos ; Renata C Picão ; Eliana C Vespero ; Marsileni Pelisson ; ZULETA, L. F. G. ; ALMEIDA, L. G. P. ; Alexandra L. Gerber ; VASCONCELOS, A. T. R. ; GALES, A. C. ; Nicolás, Marisa F. Pyrosequencing-based analysis reveals a novel capsular gene cluster in a KPC-producing Klebsiella pneumoniae clinical isolate identified in Brazil. BMC Microbiology (Online). v. 12, p. 173, issn: 1471-2180, 2012.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
ORMENO-ORRILLO, E. ; MENNA, P. ; ALMEIDA, L. G. P. ; OLLERO, F. J. ; Nicolás, Marisa F. ; RODRIGUES, E. P. ; NAKATANI, A. S. ; BATISTA, J. S. S. ; CHUEIRE, L. M. O. ; SOUZA, Rangel Celso ; VASCONCELOS, A. T. R. ; MEGIAS M. ; HUNGRIA, Mariangela ; MARTINEZ-ROMERO, E.. Genomic basis of broad host range and environmental adaptability of Rhizobium tropici CIAT 899 and Rhizobium sp. PRF 81 which are used in inoculants for common bean (Phaseolus vulgaris L.). BMC Genomics. v. 13, p. 735, issn: 1471-2164, 2012.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
Galante, P. Distinct patterns of somatic alterations in a lymphoblastoid and a tumor genome derived from the same individual. Nucleic Acids Research. v. 39, p. 6056-6068, issn: 0305-1048, 2011.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
Abreu, Fernanda ; Cantão, Mauricio E ; Nicolás, Marisa F ; Barcellos, Fernando G ; Morillo, Viviana ; Almeida, Luiz GP ; do Nascimento, Fabrícia F ; Lefèvre, Christopher T ; Bazylinski, Dennis A ; R de Vasconcelos, Ana Tereza ; Lins, Ulysses. Common ancestry of iron oxide- and iron-sulfide-based biomineralization in magnetotactic bacteria. The ISME Journal (Print). v. 35, p. 1-10, issn: 1751-7362, 2011.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
Lanzarotti, E. ; Pellizza, L. ; Bercovich, A. ; Foti, M. ; Coria, S. H. ; Vazquez, S. C. ; Ruberto, L. ; Hernandez, E. A. ; Dias, R. L. ; Mac Cormack, W. P. ; Cicero, D. O. ; Smal, C. ; Nicolas, M. F. ; VASCONCELOS, A. T. R. ; Marti, M. A. ; Turjanski, A. G.. Draft Genome Sequence of Bizionia argentinensis, Isolated from Antarctic Surface Water. Journal of Bacteriology (Print). v. 193, p. 6797-6798, issn: 0021-9193, 2011.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

Marisa Fabiana Nicolás ⇔ Laurent Emmanuel Dardenne (3.0)
GUEDES, ISABELLA A. ; COSTA, LEON S. C. ; DOS SANTOS, KARINA B. ; KARL, ANA L. M. ; ROCHA, GREGÓRIO K. ; TEIXEIRA, IURY M. ; GALHEIGO, MARCELO M. ; MEDEIROS, VIVIAN ; KREMPSER, EDUARDO ; CUSTÓDIO, FÁBIO L. ; BARBOSA, HELIO J. C. ; NICOLÁS, MARISA F. ; DARDENNE, LAURENT E.. Drug design and repurposing with DockThor-VS web server focusing on SARS-CoV-2 therapeutic targets and their non-synonym variants. Scientific Reports. v. 11, p. 5543-20, issn: 2045-2322, 2021.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
RAMUNDO, MARIANA SEVERO ; BELTRAME, CRISTIANA OSSAILLE ; BOTELHO, ANA MARIA NUNES ; COELHO, LEONARDO ROCCHETTO ; SILVA-CARVALHO, MARIA CICERA ; FERREIRA-CARVALHO, BERNADETE TEIXEIRA ; NICOLÁS, MARISA FABIANA ; GUEDES, ISABELLA ALVIM ; Dardenne, Laurent Emmanuel ; O?GARA, JAMES ; FIGUEIREDO, AGNES MARIE SÁ. A unique SaeS allele overrides cell-density dependent expression of saeR and lukSF-PV in the ST30-SCCmecIV lineage of CA-MRSA. International Journal of Medical Microbiology (Print). v. 51047, p. 367-380, issn: 1438-4221, 2016.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
Guedes, I.A. ; COSTA, L. S. C. ; SANTOS, K. B. ; KARL, ANA LUIZA MARTINS ; ROCHA, G. K. ; TEIXEIRA, I. M. ; GALHEIGO, M. M. ; MEDEIROS, V. ; KREMPSER, E. ; CUSTÓDIO, Fábio Lima ; BARBOSA, Hélio José Correa ; NICOLAS, M. F. ; DARDENNE, LAURENT. Drug Design and Repurposing with DockThor-VS Web Server: Virtual Screening focusing on SARS-CoV-2 Therapeutic Targets and their Non-Synonym Variants. Research Square Doi: 10.21203/rs.3.rs-96789/v1. 2020. Resarch article preprint
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

Marisa Fabiana Nicolás ⇔ Cláudio Galuppo Diniz (3.0)
MEDEIROS, JULLIANE DUTRA ; CANTÃO, MAURÍCIO EGÍDIO ; CESAR, DIONÉIA EVANGELISTA ; NICOLÁS, MARISA FABIANA ; Diniz, Cláudio Galuppo ; SILVA, Vânia Lúcia ; VASCONCELOS, ANA TEREZA RIBEIRO DE ; COELHO, CÍNTIA MARQUES. Comparative metagenome of a stream impacted by the urbanization phenomenon. Brazilian Journal of Microbiology (Impresso). v. 119, p. 01-11, issn: 1517-8382, 2016.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
FREITAS, MICHELE C. R. DE ; RESENDE, JULIANA A. ; FERREIRA-MACHADO, ALESSANDRA B. ; SAJI, GUADALUPE D. R. Q. ; VASCONCELOS, ANA T. R. DE ; SILVA, VÂNIA L. DA ; NICOLÁS, MARISA F. ; Diniz, Cláudio G.. Exploratory investigation of Bacteroides fragilis transcriptional response during in vitro exposure to subinhibitory concentration of metronidazole. Frontiers in Microbiology (Online). v. 7, p. 1465-1477, issn: 1664-302X, 2016.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
FERREIRA-MACHADO, A. B. ; FREITAS, M. C. R. ; Quispe Saji, Guadalupe del Rosario ; REZENDE, A. B. ; ALMEIDA, P. ; CESAR, D. E. ; RESENDE, J. A. ; Nicolas, M. F. ; da Silva V L ; DINIZ, C.. Integrity of prokaryotic mRNA isolated from complex samples for in vivo bacterial transcriptome analysis. Genetics and Molecular Research. v. 14, p. 14752-14759, issn: 1676-5680, 2015.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

Marisa Fabiana Nicolás ⇔ Eduardo Alexandrino Servolo de Medeiros (2.0)
MARTINS, WILLAMES M. B. S. ; NICOLAS, MARISA F. ; YU, YANG ; LI, MEI ; DANTAS, PRISCILA ; SANDS, KIRSTY ; PORTAL, EDWARD ; ALMEIDA, LUIZ G. P. ; VASCONCELOS, ANA TEREZA R. ; Medeiros, Eduardo A. ; TOLEMAN, MARK A. ; WALSH, TIMOTHY R. ; Gales, Ana C. ; ANDREY, DIEGO O.. Clinical and Molecular Description of a High-Copy IncQ1 KPC-2 Plasmid Harbored by the International ST15 Klebsiella pneumoniae Clone. mSphere. v. 5, p. 22-28, issn: 2379-5042, 2020.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
ANDREY, DIEGO O ; DANTAS, PRISCILA ; MARTINS, WILLAMES B S ; MARQUES DE CARVALHO, FABÍOLA ; GONZAGA, LUIZ A ; SANDS, KIRSTY ; PORTAL, EDWARD ; SAUSER, JULIEN ; CAYÔ, RODRIGO ; NICOLAS, MARISA F ; VASCONCELOS, ANA TEREZA R ; MEDEIROS, EDUARDO A ; WALSH, TIMOTHY R ; GALES, ANA C. An Emerging Clone, KPC-2-Producing Klebsiella pneumoniae ST16, Associated with High Mortality Rates in a CC258 Endemic Setting. CLINICAL INFECTIOUS DISEASES. v. ciz109, p. 1-30, issn: 1058-4838, 2019.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

Marisa Fabiana Nicolás ⇔ Renata Cristina Picão (2.0)
RAMOS, PABLO IVAN ; Picão, Renata C ; ALMEIDA, LUIZ GONZAGA ; LIMA, NICHOLAS COSTA ; Girardello, Raquel ; VIVAN, ANA CAROLINA ; Xavier, Danilo E ; BARCELLOS, FERNANDO G ; PELISSON, Marsileni ; VESPERO, ELIANA C ; MÉDIGUE, CLAUDINE ; VASCONCELOS, ANA TEREZA ; Gales, Ana C ; NICOLÁS, MARISA F. Comparative analysis of the complete genome of KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae Kp13 reveals remarkable genome plasticity and a wide repertoire of virulence and resistance mechanisms. BMC Genomics. v. 15, p. 54, issn: 1471-2164, 2014.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
Pablo I.P Ramos ; Renata C Picão ; Eliana C Vespero ; Marsileni Pelisson ; ZULETA, L. F. G. ; ALMEIDA, L. G. P. ; Alexandra L. Gerber ; VASCONCELOS, A. T. R. ; GALES, A. C. ; Nicolás, Marisa F. Pyrosequencing-based analysis reveals a novel capsular gene cluster in a KPC-producing Klebsiella pneumoniae clinical isolate identified in Brazil. BMC Microbiology (Online). v. 12, p. 173, issn: 1471-2180, 2012.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

Marisa Fabiana Nicolás ⇔ Santuza Maria Ribeiro Teixeira (1.0)
MARINOTTI, O. The Genome of Anopheles darlingi, the main neotropical malaria vector. Nucleic Acids Research (Online). v. 41, p. 7387-7400, issn: 0305-1048, 2013.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

Marisa Fabiana Nicolás ⇔ Emanuel Maltempi de Souza (1.0)
PEDROSA, F O ; MONTEIRO, R A ; WASSEM, R ; AYUB, R A ; COLAUTO, Nelson Barros ; VALLE, J. S. ; HUNGRIA, M ; BARCELLOS, F.G.. Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a Specialized Diazotrophic Endophyte of Tropical Grasses - GENOPAR. PLOS Genetics (Online). v. 7, p. e1002064-e1002064, issn: 1553-7390, 2011.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

Marisa Fabiana Nicolás ⇔ Fabio de Oliveira Pedrosa (1.0)
PEDROSA, F O ; MONTEIRO, R A ; WASSEM, R ; AYUB, R A ; COLAUTO, Nelson Barros ; VALLE, J. S. ; HUNGRIA, M ; BARCELLOS, F.G.. Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a Specialized Diazotrophic Endophyte of Tropical Grasses - GENOPAR. PLOS Genetics (Online). v. 7, p. e1002064-e1002064, issn: 1553-7390, 2011.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

Marisa Fabiana Nicolás ⇔ Anamaria Aranha Camargo (1.0)
Galante, P. Distinct patterns of somatic alterations in a lymphoblastoid and a tumor genome derived from the same individual. Nucleic Acids Research. v. 39, p. 6056-6068, issn: 0305-1048, 2011.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

Marisa Fabiana Nicolás ⇔ Helio José Corrêa Barbosa (1.0)
GUEDES, ISABELLA A. ; COSTA, LEON S. C. ; DOS SANTOS, KARINA B. ; KARL, ANA L. M. ; ROCHA, GREGÓRIO K. ; TEIXEIRA, IURY M. ; GALHEIGO, MARCELO M. ; MEDEIROS, VIVIAN ; KREMPSER, EDUARDO ; CUSTÓDIO, FÁBIO L. ; BARBOSA, HELIO J. C. ; NICOLÁS, MARISA F. ; DARDENNE, LAURENT E.. Drug design and repurposing with DockThor-VS web server focusing on SARS-CoV-2 therapeutic targets and their non-synonym variants. Scientific Reports. v. 11, p. 5543-20, issn: 2045-2322, 2021.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

Marisa Fabiana Nicolás ⇔ Ricardo Tostes Gazzinelli (1.0)
MARINOTTI, O. The Genome of Anopheles darlingi, the main neotropical malaria vector. Nucleic Acids Research (Online). v. 41, p. 7387-7400, issn: 0305-1048, 2013.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

Marisa Fabiana Nicolás ⇔ Maria Angelica Ehara Watanabe (1.0)
PEDROSA, F O ; MONTEIRO, R A ; WASSEM, R ; AYUB, R A ; COLAUTO, Nelson Barros ; VALLE, J. S. ; HUNGRIA, M ; BARCELLOS, F.G.. Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a Specialized Diazotrophic Endophyte of Tropical Grasses - GENOPAR. PLOS Genetics (Online). v. 7, p. e1002064-e1002064, issn: 1553-7390, 2011.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

Marisa Fabiana Nicolás ⇔ Nelson Barros Colauto (1.0)
PEDROSA, F O ; MONTEIRO, R A ; WASSEM, R ; AYUB, R A ; COLAUTO, Nelson Barros ; VALLE, J. S. ; HUNGRIA, M ; BARCELLOS, F.G.. Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a Specialized Diazotrophic Endophyte of Tropical Grasses - GENOPAR. PLOS Genetics (Online). v. 7, p. e1002064-e1002064, issn: 1553-7390, 2011.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

Marisa Fabiana Nicolás ⇔ Juliana Silveira do Valle (1.0)
PEDROSA, F O ; MONTEIRO, R A ; WASSEM, R ; AYUB, R A ; COLAUTO, Nelson Barros ; VALLE, J. S. ; HUNGRIA, M ; BARCELLOS, F.G.. Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a Specialized Diazotrophic Endophyte of Tropical Grasses - GENOPAR. PLOS Genetics (Online). v. 7, p. e1002064-e1002064, issn: 1553-7390, 2011.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

(*) Relatório criado com produções desde 2010 até 2021
Data de processamento: 06/11/2021 15:23:48

Relatório gerado por scriptLattes V8.11. Os resultados estão sujeitos a falhas devido a inconsistências no preenchimento dos CVs Lattes. E-mail de contato: henriquimicosp@gmail.com