Especialistas Seniores em Covid-19 com atuação no Brasil

Luiz Carlos Junior Alcantara

Pesquisador Titular da Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ). Pesquisador Visitante do Depto. de Genética da Universidade Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG). Possui graduação em Farmácia pela Universidade Federal de Ouro Preto (1992), mestrado em Bioquímica pela Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (1994) e doutorado em Biologia Celular e Molecular pela Fundação Oswaldo Cruz (2002). Possui também 2 pós-doutorados, sendo o último realizado no Instituto Nacional do Cancer, no Instituto Nacional de Saúde dos EUA. Tem experiência na área de Bioquímica, Biologia Molecular e Bioinformática dos Retrovírus Humanos (HIV e HTLV) e Arbovírus Humanos (Chikungunya, Zika, Dengue, Febre Amarela etc), atuando principalmente nos seguintes temas: Vigilância genômica, epidemiologia molecular e evolução dos vírus humanos, Polimorfismos nos genes dos hospedeiros de vírus humanos, Correlações clínico-epidemiológicas nas viroses humanas, Desenvolvimento de novas ferramentas de bioinformática para estudo dos genes dos vírus humanos/hospedeiros. Atua também como orientador/professor permanente do curso de Pós Graduação em Genética da UFMG, bem como na UFRJ; orientador/professor permanente do curso de Pós graduação em Bioinformática (área de Virologia) da UFMG; orientador/professor colaborador do curso de Pós Graduação em Saúde Coletiva da Universidade Estadual de Feira de Santana (UEFS) e também como orientador/professor colaborador do curso de Pós Graduação em Vigilância Sanitária do INCQS/FIOCRUZ. Atua também como professor de bioinformática, desde 2004, no International Bioinformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology (VEME), e como membro das redes RENEZIKA do Ministério da Saúde e RELDA e VIGENDA da Organização Pan-Americana de Saúde. Além de bolsista em produtividade nível 1 do CNPq, é bolsista em produtividade Cientista do Nosso Estado, da FAPERJ. (Texto informado pelo autor)

  • https://lattes.cnpq.br/7428560072021675 (22/10/2021)
  • Rótulo/Grupo:
  • Bolsa CNPq: Nível 1D
  • Período de análise:
  • Endereço: Instituto Oswaldo Cruz Fundação Oswaldo Cruz, Laboratório de Flavivírus. Avenida Brasil, 4365 Manguinhos 21040360 - Rio de Janeiro, RJ - Brasil Telefone: (21) 25621707 Fax: (21) 25621779 URL da Homepage: www.fiocruz.br/ioc/
  • Grande área: Ciências da Saúde
  • Área: Saúde Coletiva
  • Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

Prêmios e títulos

Participação em eventos

Organização de eventos

Lista de colaborações

Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

  • Total de projetos de pesquisa (30)
    1. 2020-Atual. United World Antiviral Research Network: UWARN
      Descrição: It is a project to perform surveillance for Arboviruses and other emerging pandemic viruses, like SARS-CoV-2, research on diagnostics, therapeutics, and viral immune responses in USA and Partner countries, funding for 10 years by NIAID-NIH. AIM 1: Laboratory capacity and clinical cohorts in South America (Brazil), West and South African continent (Senegal and South Africa), and South and East Asia (Pakistan and Taiwan) AIM 2: Develop specific human neutralizing monoclonal antibodies (Hu-nMabs) for arboviruses and Coronaviruses. AIM 3: Develop de novo Latching Orthogonal Cage?Key pRotein (LOCKR) switches for point-of-care (PoC) assays. AIM 4: Molecular basis of arbovirus and coronavirus innate immunity antagonism, identifying genes and gene networks.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Especialização: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (12) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador. Financiador(es): National Institutes of Health - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    2. 2020-Atual. FORTALECIMENTO E INOVACAO DA REDE DE VIGILANCIA PARA O ENFRENTAMENTO DA COVID-19: Implantacao de uma plataforma de sequenciamento genetico baseada em nanoporos
      Descrição: Projeto aprovado no edital INOVA-Equipamentos da FIOCRUZ: Aquisição do equipamento GRIDION da Oxford Nanopore para instalação numa plataforma de sequenciamento baseada em nanoporos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador. Financiador(es): Fundação Oswaldo Cruz - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    3. 2020-Atual. Chamada CNPq/AWS No 032/2019 - Acesso as Plataformas de Computacao em Nuvem da AWS: Monitoramento genomico dos virus Zika, Chikungunya, Dengue e Febre Amarela e deteccao precoce de potenciais virus emergentes no Brasil
      Descrição: Este é um projeto aprovado pelo CNPq destinado a utilização de servidor na nuvem para armazenamento e processamento dos dados gerados nos nosso projetos de pesquisas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (10) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    4. 2020-Atual. ViGeCoV2: Nucleo de vigilancia genomica em tempo real do SARS-CoV-2 no Brasil
      Descrição: A partir da implementação de um núcleo de vigilância genômica em tempo real do SARS-CoV-2 no Brasil, esse projeto tem por objetivo investigar a dinâmica de dispersão do SARSCoV- 2 nos estados Minas Gerais (na região Sudeste), Mato Grosso (na região Centro-Oeste), Pernambuco e Bahia (na região Nordeste). Para isso, será conduzido um estudo descritivo, analisando 250 amostras de conveniência de casos confirmados de COVID-19 provenientes dos Laboratórios de Saúde Pública (LACENs) provenientes dos estados de Minas Gerais, Mato Grosso, Pernambuco e Bahia, totalizando 1000 amostras. g. OBJETIVOS: GERAL: Investigar a dinâmica de dispersão em tempo real do SARS-CoV-2 nos estados de Minas Gerais (SUDESTE), Mato Grosso (CENTRO-OESTE), Pernambuco e Bahia (NORDESTE). ESPECÍFICOS ? Realizar o sequenciamento por nanoporos e análise em tempo real para rápida obtenção de genomas completos do SARS-CoV-2 (em menos de 24h); ? Caracterizar os genomas completos gerados para identificar possíveis marcadores de gravidade; ? Correlacionar as informações genômicas geradas e o perfil clínico dos pacientes; ? Fortalecer e capacitar as plataformas de sequenciamento genômico em tempo real dos Laboratório de Saúde Publica nos estados de Minas Gerais, Mato Grosso, Pernambuco e Bahia; ? Identificar a existência de possíveis clados monofiléticos representativos das cadeias de transmissão local; ? Caracterizar a história evolutiva e a disseminação geográfica e temporal do vírus isolado nas diferentes regiões ao longo do tempo auxiliando no controle dessa pandemia; ? Avaliar e comparar a contribuição de fatores sócio-demográficos e ecológicos na dispersão do SARS-CoV-2; ? Utilizar algoritmos de inteligência artificial (Machine Learning) para rastrear possíveis associações entre polimorfismos genéticos virais com diferentes desfechos clínicos; ? Realizar Docking Molecular com proteínas SARS-CoV-2 mutadas/projetadas com o receptor hospedeiro para avaliar as estruturas cristalinas disponíveis e entender melhor como isso influencia a invasão celular; ? Investigar se a pandemia de SARS-CoV-2 nos diferentes estados do Brasil é resultado da transmissão comunitária e/ou de múltiplas introduções independentes, a partir de outros estados/países; ? Implantar um banco de dados público de forma a facilitar o compartilhamento de dados para tomada de decisões em saúde pública. ? Analisar a legislação internacional e nacional, evidenciando a proteção legal dada à saúde e ao acesso ao medicamento, para entender qual será o caminho legal que possibilitará o acesso de todos os cidadãos à vacina, contra a Covid-19.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (5) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Gilson Carlos Soares - Integrante / Marta Giovanetti - Integrante / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / Dario Brock - Integrante / Virginia Antunes de Andrade Zambelli - Integrante / ABURJAILE, FLÁVIA FIGUEIRA - Integrante.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    5. 2019-Atual. Vigilancia Metagenomica Em Tempo Real Dos Arbovirus e Virus Respiratorios Circulantes No Brasil
      Descrição: Este é um projeto para dá suporte aos LACENs do Brasil na identificação dos patógenos virais que possam estar associados aos agravos com diagnóstico clinico de doença arboviral ou Covid-19, e cujo diagnóstico laboratorial foi negativo. è Financiado pela OPAS-OMS na forma de uma Carta Acordo. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (10) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador. Financiador(es): Organizacão Pan-Americana da Saude/Organizacão Mundial da Saude - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    6. 2019-Atual. Cientista do Nosso Estado: Monitoramento genomico dos virus Zika, Chikungunya, Dengue e Febre Amarela e deteccao precoce de potenciais virus emergentes no Brasil
      Descrição: As doenças causadas pelos arbovírus estão associadas à grandes epidemias e à um consequente aumento dos custos financeiros relacionados ao diagnóstico e ao tratamento para o sistema de saúde pública. O diagnóstico clínico é considerado complexo devido à semelhança de sintomas com outras doenças, às reações sorológicas cruzadas, à presença de doença clinicamente assintomática ou oligossintomática, e à dificuldade de acesso aos laboratórios de referência que podem realizar um diagnóstico molecular e/ou sorológico diferencial. As emergências recentes do CHIKV e ZIKV ilustram também a necessidade do preparo para a identificação rápida de novos vírus emergentes, para que contramedidas possam ser prontamente organizadas. Uma forma de realizar a detecção e identificação de patógenos emergentes em potencial é a aplicação da abordagem metagenômica no monitoramento de indivíduos sindrômicos com etiologia indeterminada em grandes centros urbanos, que funcionariam como regiões sentinelas. Diante desse panorama, visando a melhoria da qualidade dos serviços de atenção à saúde pública no Brasil, o presente estudo tem como objetivos entender a dinâmica da disseminação espaço-temporal dos vírus Zika, Chikungunya, Dengue e Febre Amarela (ZIKV, CHIKV, DENV, YFV) circulantes e co-circulantes no Brasil; definir os possíveis determinantes envolvidos em sua dispersão e/ou desfechos clínicos; e identificar vírus emergentes em potencial por metagenômica. Os dados genômicos gerados neste projeto permitirão ao Ministério da Saúde e às Secretárias de Vigilância Epidemiológica ampliar a compreensão da disseminação geográfica e temporal dos arbovírus circulantes no país. Dessa forma, será possível adotar medidas adequadas para controlar epidemias, monitorar a dinâmica e a disseminação de novas estirpes virais.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (10) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador. Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    7. 2019-Atual. Monitoramento genomico dos virus Zika, Chikungunya, Dengue e Febre Amarela e deteccao precoce de potenciais virus emergentes no Brasil
      Descrição: o presente estudo tem como objetivos entender a dinâmica da disseminação espaço-temporal dos vírus Zika, Chikungunya, Dengue e Febre Amarela (ZIKV, CHIKV, DENV, YFV) circulantes e co-circulantes no Brasil; definir os possíveis determinantes envolvidos em sua dispersão e/ou desfechos clínicos; e identificar vírus emergentes em potencial por metagenômica. Os dados genômicos gerados neste projeto permitirão ao Ministério da Saúde e às Secretárias de Vigilância Epidemiológica ampliar a compreensão da disseminação geográfica e temporal dos arbovírus circulantes no país. Dessa forma, será possível adotar medidas adequadas para controlar epidemias, monitorar a dinâmica e a disseminação de novas estirpes virais.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (3) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Marta Giovanetti - Integrante / Vagner Fonseca - Integrante / Joilson Xavier dos Santos Junior - Integrante / ANA BISPO DE FILIPPIS - Integrante / FABRI, ALLISON - Integrante / FRAGA DE OLIVEIRA TOSTA, STEPHANE - Integrante / Flavia levi - Integrante. Financiador(es): Organizacão Pan-Americana da Saude/Organizacão Mundial da Saude - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    8. 2019-Atual. Diagnostico das arboviroses humanas baseado no sequenciamento diferencial de terceira geracao
      Descrição: Desenvolver um diagnóstico molecular de arboviroses baseado no sequenciamento diferencial, utilizando a tecnologia de sequenciamento de terceira geração do minION, para ser utilizado nos laboratórios de referências para arboviroses da Secretaria de Vigilância em Saúde do Ministério da Saúde (SVS/MS). Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (3) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Marta Giovanetti - Integrante / Joilson Xavier dos Santos Junior - Integrante / ANA BISPO DE FILIPPIS - Integrante / FABRI, ALLISON - Integrante / Flavia levi - Integrante. Financiador(es): Fundação Oswaldo Cruz - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    9. 2018-Atual. FERRAMENTAS COMPUTACIONAIS DE GENOTIPAGEM PARA ARBOVIRUS ASSOCIADAS AO SOFTWARE GENOME DETECTIVE DANDO SUPORTE A VIGILANCIA DAS ARBOVIROSES NO BRASIL
      Descrição: O Genome Detective é um pipeline baseado na web, e de livre acesso, que permite que dados NGS brutos sejam montados em genomas virais completos de novo de maneira rápida e precisa. Assim, torna-se necessário darmos amplitude ao software Genome Detective, permitindo ao mesmo identificar dados brutos (input) provenientes da mais nova tecnologia de sequenciamento baseada em nanoporos, denominada minION, cujo pipeline ainda é muito complicado para o usuário, fornecendo a este não só os datasets das sequências geradas e montadas no formato fasta, mas também os datasets das sequências dos reads, com cobertura ampla ou parcial, além de todos os resultados, tipagem, genotipagem, total de reads, porcentagem de cobertura, etc. Torna-se também necessária ampliarmos as ferramentas de genotipagem para arbovírus. Pois até o momento só existem quatro. E para ampliarmos esta genotipagem, será necessário gerarmos mais genomas completos de outros arbovírus circulates no nosso país e nos nossos países vizinhos, bem como nos países vizinhos destes nossos países vizinhos. Isto faz com este processo seja de extrema importância para a vigilância das arboviroses nos Brasil, pois contribuiremos com o MS e OMS na vigilância de arbovírus que estão silenciosos e possam ser possíveis agentes de surtos futuros. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (4) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Vagner Fonseca - Integrante / DE OLIVEIRA, TULIO - Integrante / FABRI, ALLISON - Integrante / Flavia levi - Integrante / Alvaro Salgado - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    10. 2016-Atual. ZIKAlliance - A Global Alliance for Zika Virus Control and Prevention
      Descrição: Major tasks are ahead of the scientific and public health community and need urgent resolution, in particular: ? the assessment of the scale of the problem ? absolute and relative risk of fetal damage in relation to time of infection during pregnancy, and postnatally; ? understanding the natural history of the infection at different scales ? from cellular mechanisms to human infection and circulation of the virus in the environment. These are essential prerequisites to the development of modes of prevention or treatment, to the assessment of the socioeconomic and disability burden of the disease, and to the implementation of informed public health decisions to reduce disease burden and the risk of further spread of the pandemic. The three?year multidisciplinary ZIKAlliance project will link large observational multicentre cohort studies with basic scientific research to address the above questions, (i) with longstanding shared work experience on arboviral diseases in basic, clinical and applied sciences; (ii) with an established network of clinical cohorts currently studying Dengue Fever in Latin America & the Caribbean; (iii) guided by the principles of One Health approach to respond to the challenges of vector?borne epidemics.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (3) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / BARRETO, FERNANDA K - Integrante / AMARANTE, MARIA F C - Integrante / GIOVANETTI, MARTA - Integrante / MAIA DE LIMA, MARICÉLIA - Integrante / AMOUSSA, ADJILE EDJIDE ROUKIYATH - Integrante / DE JESUS, JAQUELINE GOES - Integrante / Isadora Cristina de Siqueira - Integrante / Joilson Xavier dos Santos Junior - Integrante.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    11. 2016-Atual. ZIBRA 2: Analise em Tempo Real, no Brasil, do Virus ZIKA: Segunda etapa
      Descrição: No grupo das doenças infecciosas emergentes e re-emergentes, os arbovírus transmitidos por mosquitos, como Dengue (DENV), Chikungunya (CHIKV) e Zika (ZIKV), são considerados importantes desafios para a saúde pública. Além do cenário causado pelo DENV, endêmico em quase todo o país e responsável por epidemias há décadas, a introdução do CHIKV e principalmente do ZIKV no Brasil traz preocupação quanto aos desafios em saúde pública. Os arbovírus são transmitidos por mosquitos do gênero Aedes, particularmente Ae. Aegypti. As doenças causadas pelos arbovírus estão associadas a grandes epidemias e um consequente aumento dos custos financeiros relacionados ao diagnóstico e ao tratamento. O diagnóstico clínico é considerado complexo devido a semelhança clínica com outras doenças, a presença de doença clinicamente assintomática ou oligossintomática, dificuldade de acesso aos laboratórios de referência que podem realizar um diagnóstico molecular e/ou sorológico diferencial e reações sorológicas cruzadas, especialmente em regiões endêmicas. Uma grande epidemia do ZIKV está em curso na América Latina, e há evidências de uma associação entre esta infecção e microcefalia em recém-nascidos e síndrome de Guillain-Barré em adultos. Devido a escassez de sequências genômicas completas deste vírus, recentemente realizamos o sequenciamento em tempo real de 156 isolados do ZIKV provenientes de um projeto piloto, financiado pela Medical Research Council (MRC-Inglaterra), para dar suporte a quatro LACENs do Nordeste do Brasil no diagnóstico molecular desta infecção. Neste novo projeto, propomos estender o suporte ao diagnóstico a 23 LACENs do país, resultando na caracterização genética e evolutiva das cepas circulantes desse flavivírus nas diferentes regiões geográficas do Brasil, buscando o melhor entendimento das cadeias de transmissão e suas características, traçando a origem e a disseminação dessas infecções no Brasil. Assim, a identificação e a caracterização das cepas circulantes permitirão a procura de associação entre o perfil genético das cepas, o perfil clínico e epidemiológico dos indivíduos infectados e a história epidemiológica da infecção; além de ser muito importante para o desenvolvimento de novas técnicas diagnósticas e modelos vacinais. Os resultados deste projeto trarão novos conhecimentos sobre a patogênese molecular deste vírus e permitirão a identificação de marcadores moleculares e possíveis alvos terapêuticos, com a perspectiva de novas abordagens imunoterapêuticas diferenciais. Além disso, o estudo combinado dos dados epidemiológicos com os dados de genômica evolutiva e estrutural nos possibilitará investigar melhor a interação microrganismo-hospedeiro humano e microrganismo-vetor para estabelecer uma base de dados sobre a infecção aguda e suas consequências.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (5) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / CUNHA, JOANA P M - Integrante / Maria Fernanda de Castro-Amarante - Integrante / GIOVANETTI, MARTA - Integrante / MAIA DE LIMA, MARICÉLIA - Integrante / DO ROSÁRIO, MATEUS SANTANA - Integrante / Maria Inés Restovic - Integrante / Vagner Fonseca - Integrante / Murilo Freire - Integrante / DE OLIVEIRA, TULIO - Integrante / AMOUSSA, ADJILE EDJIDE ROUKIYATH - Integrante / ARAUJO, THESSIKA HIALLA A - Integrante / DE JESUS, JAQUELINE GOES - Integrante / Ana Rita Queiroz Ferraz - Integrante / Jéssica Costa da Silva Sena - Integrante / Joilson Xavier dos Santos Junior - Integrante / Paloma Viana da Silva - Integrante / Melina Mosquera Navarro Borba - Integrante / Daiana Carlos dos Santos - Integrante / Carlos Letacio S. L. da Silva - Integrante / Eddy Oliveira - Integrante / Antônio Carlos dos Santos - Integrante / Siane Campos de Souza - Integrante.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    12. 2016-Atual. Estudo da interacao microrganismo-hospedeiro: Diversidade Genetica e Patogenicidade do ZIKV x Hospedeiro
      Descrição: A disseminação rápida do vírus Zika (ZIKV) em um país tropical como o Brasil, onde o vírus da Dengue já se tornou endêmico, exige uma resposta urgente, dada a emergência em saúde pública que se instalou nos últimos meses. Sendo um patógeno emergente e ainda pouco conhecido, fatores relacionados à interação microrganismo-hospedeiro não são completamente conhecidos. Estudos prévios sugerem a possível associação do ZIKV com efeitos deletérios potenciais sobre o feto em mulheres grávidas e, portanto, a identificação rápida da espécie e genótipo do vírus replicante, assim como a compreensão dos mecanismos infecciosos e patogênicos do ZIKV são fundamentais para o esclarecimento da relação entre o vírus e o hospedeiro. Atualmente há uma escassez de sequências genômicas completas do ZIKV, impedindo tentativas para determinar as suas origens, epidemiologia e base genômica para a microcefalia e outras doenças relacionadas. Portanto, o sequenciamento do genoma completo viral permitirá o monitoramento da diversidade viral e o entendimento do surgimento e espalhamento desta epidemia. Além disso, com esses resultados será possível identificar cepas com maior potencial epidêmico e avaliar genótipos que possuam maior poder de cobertura pelas vacinas potenciais. Faz-se necessário também avaliar os mecanismos de infecção viral. Aqui propomos, através de ensaios in vitro, identificar a taxa de infecção do ZIKV, a localização das proteínas virais e a possível co-localização de proteínas do ZIKV com proteínas motoras. Visando melhor entendimento do comportamento viral, torna-se de extrema importância além da avaliação das características genéticas e patogênicas avaliar fatores relacionados ao hospedeiro, uma vez que estes podem auxiliar no estabelecimento de uma associação definitiva entre o ZIKV e as pressupostas consequências clínicas. Sabe-se que apesar de haver evidências de uma possível associação causal da exposição ao ZIKV com a Síndrome de Guillain-Barré e com defeitos congênitos, ainda não há evidências definitivas referentes a estas associações. Assim, propomos a investigação clínica e genética dos pacientes com diagnóstico confirmado ou com história sugestiva de infecção pelo ZIKV, com ênfase para o envolvimento neurológico, como a Síndrome de Guillain-Barré e a microcefalia.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Especialização: (3) / Mestrado acadêmico: (9) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Espreafico, E. M. - Integrante / Oliveira, Antonio Marcos - Integrante / Acosta, Angelina Xavier - Integrante / Marcio Roberto T Nunes - Integrante / AMARANTE, MARIA F C - Integrante / Elisângela Vitória Adorno - Integrante / BARRETO, FERNANDA KHOURI - Integrante / ZANETTE, DALILA LUCIOLA - Integrante / DE SOUZA GONÇALVES, MARILDA - Integrante / ARAÚJO, THESSIKA HIALLA ALMEIDA - Integrante / GIOVANETTI, MARTA - Integrante / Erenilde Marques de Cerqueira - Integrante / MAIA DE LIMA, MARICÉLIA - Integrante / DO ROSÁRIO, MATEUS SANTANA - Integrante / Maria Inés Restovic - Integrante / Vagner Fonseca - Integrante / Murilo Freire - Integrante / MAFFILI, VITOR V. - Integrante / DE OLIVEIRA, TULIO - Integrante / AMOUSSA, ADJILE EDJIDE ROUKIYATH - Integrante / DE JESUS, JAQUELINE GOES - Integrante / Isadora Cristina de Siqueira - Integrante / Luiz Antônio Rodrigues de Freitas - Integrante / Cristina Borges Goes - Integrante / Ana Rita Queiroz Ferraz - Integrante / Joilson Xavier dos Santos Junior - Integrante / Paloma Viana da Silva - Integrante / Melina Mosquera Navarro Borba - Integrante / Daiana Carlos dos Santos - Integrante / Carlos Letacio S. L. da Silva - Integrante / Marcela Câmara Machado Costa - Integrante / Fernanda Washington de Mendonça Lima - Integrante / Cynara Gomes Barbosa - Integrante / Fabiana Porto - Integrante / Tacyane Cardoso Santos da Silva Paim - Integrante / Célia Maria Stolze Silvany - Integrante / Antonio Marcos dos Santos - Integrante / Daniele de Araújo Freitas - Integrante / Helen Regina Silva Sodre - Integrante / Karoline Brito Caetano Andrade Coelho - Integrante / Julia Gonçalves Carvalho Montenegro - Integrante.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    13. 2016-Atual. Structural Transformation to Attain Responsible BIOSciences (STARBIOS2)
      Descrição: The mean aim of this project is to set up a Protocol for a Horizon 2020 Funded European Multicenter Project to Promote Responsible Research and Innovation in different countries of Europe and also Brazil, EUA, and South Africa.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (12) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador. Financiador(es): European Commission - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    14. 2015-Atual. Caracterizacao Genomica do HTLV-1 e Transcriptomica de Pacientes Infectados
      Descrição: O HTLV-1 é conhecido por ser o agente etiológico da paraparesia espástica tropical/mielopatia associada ao HTLV (HAM/TSP). Esta doença é caracterizada como uma doença neurológica crônico-degenerativa que atinge o sistema nervoso central. Porém, muitos pacientes permanecem assintomáticos para HAM/TSP e ainda não se sabe o que determina a manifestação de doença em alguns indivíduos. Vale ressaltar que ainda não existe um tratamento específico e eficaz contra essa infecção. Assim, o entendimento dos fatores virais e do hospedeiro que levam à permanência no estado assintomático ou ao desenvolvimento da doença neurológica torna-se importante para o desenvolvimento de vacinas e terapias necessárias. O presente projeto tem como objetivo realizar uma análise de interatoma, ou seja, avaliar todas as interações moleculares (genes e proteínas) na célula. Inicialmente, serão caracterizados os genomas completos do HTLV-1 oriundos de indivíduos da Bahia, com diferentes formas clínicas, além de informações epidemiológicas e da carga proviral destes indivíduos. Em seguida, será realizada a análise de expressão gênica (transcriptoma) do hospedeiro. Para alcançarmos este objetivo, utilizaremos análises dos SNPs nas distintas regiões gênicas das diferentes populações obtidas nas análises de pirosequenciamento e, junto com os resultados das análises de microarranjo, utilizaremos ferramentas de bioinformática para data mining, data management e análises de redes neurais. Os estudos que associam as análises genômicas e transcriptômicas, sendo a primeira relacionada ao vírus e a segunda mais especificamente ao hospedeiro, poderão favorecer na construção do conhecimento a cerca da patogenicidade viral, identificando uma assinatura gênica que determine o desenvolvimento ou não da doença.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Luciane Amorim Santos - Integrante / AMARANTE, MARIA F C - Integrante / BARRETO, FERNANDA KHOURI - Integrante / GIOVANETTI, MARTA - Integrante / Vagner Fonseca - Integrante / ARAUJO, THESSIKA HIALLA A - Integrante / DE JESUS, JAQUELINE GOES - Integrante / ALINE DÓREA LUZ MENEZES - Integrante / ANTONIO DE SOUZA ANDRADE FILHO - Integrante / BARBARA SOUZA DE ARAÚJO - Integrante / MARCIA WEBER CARNEIRO - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    15. 2015-Atual. Estudo da Diversidade Genetica e Historia Evolutiva do virus Chikungunya, bem como co-evolucao com outros arbovirus humanos no semiarido baiano e na regiao metropolitana de Salvador, e caracterizacao clinica/epidemiologica/hematologica dos individuos infe
      Descrição: Neste projeto inicialmente pretendemos implantar a técnica de PCR em tempo real, diferencial entre o CHIKV, DENGUE e ZIKA, para dar como suporte ao diagnóstico mais preciso desta infecção pelo CHIKV. Seguiremos com a caracterização genética e evolutiva das cepas circulantes, para assim, através de programas de bioinformática, traçarmos a origem e a disseminação desta infecção no Brasil e testarmos a hipótese do relógio molecular durante a distribuição geográfica da epidemia do CHIKV, durante a onda de epidemias. Pretendemos também conhecer melhor o perfil genético da população infectada com maior agrave da doença. Avaliaremos as alterações no perfil hematológico, bioquímico, imunológico e inflamatório destes pacientes triados para anemia falciforme e infectados pelo CHIKV, associando ao perfil fenotípico, histórico clínico, marcadores clássicos de prognóstico na anemia falciforme e o genótipo do vírus envolvido. Os processos infecciosos (como pelo CHIKV) emergem como fatores de risco para pacientes com anemia falciforme pela modulação de citocinas, aumento do estresse oxidativo e predisposição a eventos oclusivos. O curso clínico de pacientes com infecções virais podem cursar com eventos de dor, síndrome torácica aguda, alterações ósseas e úlcera de perna (Neto et al., 2011; George et al., 2011). No mais, finalizaremos este projeto, com a mineração e organização dos dados obtidos, provenientes do vírus e do hospedeiro, para desenvolvimento de um banco de dados e de um software (CHIKV Genotyping Tool) de livre acesso para genotipagem do CHIKV, como os que já desenvolvemos anteriormente para vários vírus, como o HIV-1, o HTLV-1, o HCV, o HBV, o HHV8 e o HPV [Alcantara et al., 2009; Araujo et al, 2012], que estará hospedado no servidor do CPqGM e da UEFS e disponibilizado com livre acesso na WEB. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Integrante / Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Marcio Roberto T Nunes - Integrante / Marta Giovanetti - Integrante / Elinalva Maciel Paulo - Integrante / Erenilde Marques de Cerqueira - Integrante / Maricélia Maia de Lima - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    16. 2014-2014. 2o Workshop Internacional de Bioinformatica sobre Evolucao Viral e Epidemiologia Molecular 2014
      Descrição: A Filogenia molecular e genética populacional são técnicas estabelecidas com importância para a compreensão de epidemias e dinâmicas virais. Por exemplo, a análise filogenética tem sido utilizada até o momento para explicar a origem do HIV-1 e HIV-2 e suas epidemias em humanos, para estudar a epidemiologia molecular da gripe em aves selvagens e suas conexões com pandemias humanas, assim como estudar a epidemiologia molecular de muitos outros vírus. Muitos dos trabalhos envolvendo estas técnicas estão sendo publicados em revistas internacionais de alto impacto. Novos métodos de mineração de dados estão se tornando cada vez mais importantes para organizar e explorar a enorme quantidade de dados de sequências de vírus que foi gerado nos últimos anos. Por exemplo, a mineração de dados é extremamente importante para o estudo das respostas às terapias antivirais. Além disso, a combinação da mineração de dados com análises filogenéticas permitem uma melhor compreensão do comportamento dos diversos vírus. A utilização destes métodos já foi aplicada ao estudo de mutações de resistência às drogas e tais técnicas podem ser aplicadas a muitos outros campos de pesquisa de vírus. 2. Detalhes sobre o Workshop O Workshop Internacional sobre a utilização da Bioinformática para estudos de Evolução e Epidemiologia Molecular dos vírus foi organizado nos últimos 17 anos pela Profa. Anne-Mieke Vandamme, do Laboratório de Virologia Clínica e Epidemiologia da Katholieke Universiteit Leuven (Rega Institut), Bélgica, e desde 2003 viaja ao redor do globo (https://regaweb.med.kuleuven.be/workshop). Este workshop está dividido em três módulos: Básico, análises filogenéticas avançadas e Mineração de Dados. Os módulos serão realizados simultaneamente e os alunos (máximo de 20 por módulo) só poderão candidatar-se a um dos módulos. Todos os módulos conterão aulas teóricas e práticas (cerca de 50/50). Haverá também tempo reservado para os alunos apresentarem seus trabalhos em uma sessão de pôster, pa. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / AnneMieke Vandamme - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    17. 2014-Atual. Desenvolvimento de ferramenta didatica para avaliacao de fatores de risco e prevencao de agentes causadores de doencas sexualmente transmissiveis (HIV-1/HTLV-1)
      Descrição: EDITAL PPSUS: Este estudo objetiva desenvolver uma ferramenta web para avaliar a evolução do conhecimento de jovens e adolescentes residentes em áreas de risco para as infecções causadas pelo HIV-1 e HTLV-1 na cidade. O estudo caracterizar-se-á por ser uma coorte de intervenção prospectiva, composta por 25 educadores, que irão participar das etapas de identificação dos fatores de risco e avaliação do nível de conhecimento acerca da infecção pelo HIV/HTLV. A execução do mesmo se dará no Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz (CPqGM) da Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) e na sedes do projeto parceiro Adolescente Aprendiz, situadas nos bairros do Pau Miúdo e Rio Vermelho. Este estudo trará como contribuição no desenvolvimento de um banco de dados e de um algoritmo capaz de contabilizar o número de acessos ao conteúdo disponibilizado pela ferramenta; e a organização estatística das informações provenientes do mesmo. Além disso, prevê-se a elaboração de material lúdico/didático (impressos e audiovisuais) a ser disponibilizado para ações de promoção da saúde do Serviço Único de Saúde (SUS) e caracterização do nível de conhecimento acerca da infecção por retrovírus humanos em áreas de risco. Espera-se também, propor novas medidas de promoção da saúde mais específicas para jovens e adolescentes residentes nessas áreas. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Carlos Brites - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Marilda Souza Gonçalves - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    18. 2014-Atual. INTERACAO ENTRE OS PRODUTOS DAS ORFs I E IV DO HTLV-1 COM AS PROTEINAS DO CITOESQUELETO MIOSINA Va E PAXILINA RESPECTIVAMENTE
      Descrição: Pela análise das estruturas primarias de p12I/p8I e da Paxilina, hipotetiza-se que não há interação física entre elas, entretanto a presença de regiões ricas em prolina em ambas as proteínas, e pelo fato da Paxilina ser um dos componentes das adesões focais, sugere que elas participem do complexo de polarização do citoesqueleto no momento do contato e transmissão do HTLV-1 célula-célula. Como a Paxilina está mais expressa em indivíduos TSP/HAM, é possível que a expressão da proteína Tax, transativador viral, interfira na expressão de Paxilina. Assim o estudo inicial da possível interação entre essas proteínas é importante para melhor compreensão da significância do aumento de expressão da Paxilina em indivíduos com TSP/HAM. Por outro lado, acredita-se que a miosina Va esteja envolvida no tráfego de p8I partindo de Golgi até a membrana plasmática. Considerando que p8I exerce importante função na transmissibilidade viral, participando ativamente da sinapse virológica e da formação dos conduítes celulares, o estudo das interações proteicas que contemplam o mecanismo de transporte desta proteína, desde sua formação até seu sítio de atuação, pode estabelecer um ponto inicial para a elucidação desta via, além de sugerir possíveis alvos terapêuticos para redução da infectividade, e transmissibilidade viral, e consequentemente, um controle da disseminação do vírus nos indivíduos infectados. Assim, pretendemos avaliar a interação entre os produtos das ORFs I e IV do HTLV-1 com as proteínas do citoesqueleto Paxilina e Miosina Va, respectivamente.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Simone Kashima - Integrante / Maria Fernanda Castro-Amarante - Integrante / Jaqueline Goes de Jesus - Integrante / Marilda Souza Gonçalves - Integrante / Maria Enilza Espreafico - Integrante.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    19. 2014-Atual. Desenvolvimento de uma Ferramenta de Filotipagem do Virus da Dengue
      Descrição: Devido à história evolutiva do Vírus da Dengue (DENV), a variabilidade genética entre os sorotipos é grande e incomum, no entanto, a variabilidade genética intra-sorotípica é menor e dá origem aos subtipos ou genótipos, como são denominadas, a partir de um critério arbitrário, as cepas que divergem acima de 6% nas suas sequências nucleotídicas. Estudos recentes demonstram que a diversidade dos DENVs está aumentando, assim como, a virulência diferencial das cepas virais e, como consequência, no futuro nós poderemos estar expostos a vírus com uma gama maior de propriedades patogênicas. Por esse motivo, torna-se importante compreender o processo que gera a variabilidade genética em populações naturais de DENV. A completa caracterização filogenética dos vírus da dengue permitirá o monitoramento da transmissão de genótipos e filotipos virais associados ao aparecimento e/ou aumento de casos graves da doença, bem como contribuirá na identificação de áreas de alta diversidade viral e padrões de fluxo gênico. As ferramentas de bioinformática são fundamentais para acompanhar a evolução da diversidade viral, dando suporte aos estudos de análise de sequências genômicas sendo crucial para a vigilância do polimorfismo viral, no desenvolvimento de novas estratégicas terapêuticas, no desenvolvimento de produtos vacinais ou na escolha adequada destes produtos. O único programa de bioinformática, de livre acesso, utilizados para classificação do perfil genético dos subtipos/genótipos/subgrupos/grupos dos DENVs se baseia no emprego de ferramentas de procura de similaridade (BLAST, por exemplo) para determinar o genótipo de uma nova sequência (https://www.viprbrc.org/brc/viprTutorials.spg?decorator=flavi_dengue). A nova ferramenta proposta para o vírus da Dengue, que será desenvolvida utilizando a mesma metodologia destas sete últimas ferramentas, deixará de ser somente um software para classificação de genótipos/subtipos/subgrupos e permitirá também ao usuário a obtenção do filotipo viral, isto é, uma genotipagem baseada em sequências referências do genoma total ou somente do envelope, contendo informações epidemiológicas e filogeográficas, datas das epidemias observadas nos últimos 20 anos no mundo. Portanto, será um programa contendo um banco de dados de sequências referências representativo. Após o desenvolvimento da ferramenta, pretendemos testar a eficiência da mesma analisando sequências disponíveis no GenBank e liberaremos a utilização para testagem, aos colaboradores neste projeto que possuem novas sequências do vírus da dengue e ainda não publicadas, assim como são especialistas em genotipagem viral.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (3) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Luciane Amorim Santos - Integrante / Jose Pereira Moura Neto - Integrante / DE SOUZA GONÇALVES, MARILDA - Integrante / ARAÚJO, THESSIKA HIALLA ALMEIDA - Integrante / Maria Inés Restovic - Integrante / Vagner Fonseca - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante / Bruna de Sousa Carvalho Reis - Integrante / Bruno Antonio Veloso Cerqueira - Integrante.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    20. 2013-2013. WORKSHOP INTERNACIONAL DE BIOINFORMATICA SOBRE EVOLUCAO VIRAL E EPIDEMIOLOGIA
      Descrição: O workshop está dividido em dois módulos: Análises Básicas de Bioinformática, Análises filogenéticas Avançadas. Os módulos serão realizados simultaneamente e os alunos (máximo de 25 por módulo) só podem candidatar-se a um dos módulos. Todos os módulos contem aulas teóricas e práticas (cerca de 50 alunos num total). Possui também um tempo reservado para os alunos apresentarem seus trabalhos em uma sessão de pôster, para discutir e analisar os seus conjuntos de dados com os professores e discutir possíveis colaborações entre os alunos e professores. O curso terá a duração de cinco dias. Para nosso conhecimento, nenhum outro curso semelhante é organizado mundialmente, contendo teoria e aplicações práticas de técnicas de bioinformática, aplicados aos estudos de evolução viral, e aberto a um fórum internacional de estudantes de mestrado e doutorado, jovens pesquisadores, e até mesmo aos pesquisadores seniores. Salientamos que não haverá custo de inscrição no Workshop, e das 50 vagas, 80% serão destinadas preferencialmente a brasileiros e as vagas restantes para estrangeiros, tendo preferência inscritos da América Latina. Os alunos que participam deste workshop são convidados a submeter um resumo, e apresentam o seus trabalhos na forma de poster. Assim, estes alunos terão a oportunidade de discutir o trabalho de pesquisa que eles apresentaram com os professores e outros alunos. Depois da oficina, e tendo em consideração os comentários e discussões recebidos no workshop sobre o seu trabalho, cada aluno terá o seu resumo publicado na IGE (Infection, Genetics and Evolution, uma revista do grupo Elsevier que tem a Dra. Anne-Mieke Vandamme no Editorial Board) numa edição regular, mas inteiramente dedicado ao Workshop, e também terá um tempo para melhorar a qualidade do seu trabalho, sendo então convidado a submeter um artigo, a esta mesma revista científica, que sempre publicou (dos workshops anteriores) e os trabalhos dos alunos apresentados na forma de poster durante o works. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / AnneMieke Vandamme - Integrante / Tulio de Oliveira - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante / Paula Carvalhal Lage von B. Ristow - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    21. 2013-Atual. The tale of two interlinked epidemics: The origin and clinical relationship of the African and Brazilian HIV-1 and HTLV-1 epidemics
      Descrição: This project will use genomics and bioinformatics to further study the origin of the Brazilian and South African Human Immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) and Human T-cell lymphotropic virus type 1 (HTLV-1). In addition, it will study co-infected individuals, as there is growing evidence that HIV-1 and HTLV-1 co-infection affects the course of the AIDS disease. This project is built on a long-standing collaboration between two Brazilian researchers, Dr. Luiz Carlos Junior Alcantara from F CPqGM/FIOCRUZ Foundation and Dr. Tulio de Oliveira from the Africa Centre for Health and Population Studies, Nelson Mandela School of Medicine. This partnership has already given rise to a number of peer-reviewed publications, the graduation of post-graduate students and training workshops in Brazil. At present, the two researchers are co-supervising a PhD student from Brazil. This project, if funded, will allow this successful collaboration to continue and a Brazilian researcher (Dr. Tulio de Oliveira) living outside the country to continue to contribute to local research and the training of post-graduate students in Brazil. Previous results of this collaboration: One of the reasons why we believe that this exchange project will be successful is due to the previous results that have been produced by this collaboration. The collaborators have been working together since 2001. During this time, Dr. Tulio de Oliveira has been based in Durban and Cape Town, South Africa and in Oxford, the U.K., whereas Dr. Luiz Carlos Alcantara has been based in Salvador, Brazil and in Washington, the U.S.A. They have made many exchange visits. They have also produced many collaborative publications on the study of the origin of the HIV-1 and HTLV-1 epidemics in Brazil, which will be one of the topics to be studied in this project. For example, they have shown that HTLV-1 strains from South Africa (sampled and produced during a visit by Dr. Alcantara to the Dr. de Oliveira group in 2005) are directe. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Tulio de Oliveira - Integrante / Rego, Filipe Ferreira de Almeida - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    22. 2012-2014. Avaliacao da historia epidemiologica da infeccao pelo HIV-1 no estado da Bahia - Brasil
      Descrição: Estudo de coorte transversal com amostragem de conveniência que avaliará amostras sanguíneas de pacientes, no período de 1 de Março de 2012 à 31 de Setembro de 2012. A população do estudo será formado por pacientes com idade igual ou superior à 18 anos, soro-reagentes para HIV-1 sem uso de Terapia Antirretroviral (TARV), que após assinarem termo de consentimento livre, respondam a questionário epidemiológico e permita a coleta de 10 ml de sangue para o estudo. A amostra para o estudo será obtida durante coleta sanguínea, no Laboratório de Retrovírus do Hospital Universitário Prof. Edgard Santos e no Centro Especializado em Diagnóstico, Assistência e Pesquisa, para realização de carga viral do HIV ou estudo das subpopulações linfocitárias. O questionário epidemiológico será preenchido pelo pesquisador e equipe, esse o documento conterá informações sobre identificação, data de nascimento, gênero, data do diagnóstico do HIV-1, uso de TARV, provável forma de aquisição, orientação sexual e discordância sorológico dos parceiros atuais. Será descartado aleatoriamente 1 das amostras de pacientes com concordância sorológica entre parceiros ou transmissão vertical. O projeto e o termo de consentimento livre e esclarecido será submetido, previamente a qualquer fase do estudo, ao Comitê de Ética em Pesquisa da Fundação Gonçalo Muniz, do Hospital Universitário Prof. Edgard Santos e no Centro Especializado em Diagnóstico, Assistência e Pesquisa.A extração do DNA das amostras usará o kit de extração QIAmp Blood Kit (Qiagen Inc., Valencia, CA, USA) segundo protocolo do fabricante. Os genes pol e env serão amplificados através da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR). Os produtos das PCR serão purificados e posteriormente sequenciados. Os objetivos são: Caracterizar a epidemiologia molecular do HIV-1 na Bahia através de estudos evolutivos nos genótipos B, F e formas recombinantes BF, buscando inferir a história evolutiva deste retrovírus na nossa população. Estimar a taxa evolutiv. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Carlos Brites - Integrante / Genoveffa Franchini - Integrante / Erika Andrade - Integrante / Marcio Oliveira Silva - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    23. 2012-2013. Banco de Dados sobre o HTLV-1/paciente infectado
      Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Tulio de Oliveira - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Antonio Eduardo de Albuquerque-Junior - Integrante.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    24. 2012-Atual. ?Implantacao e Consolidacao do Centro Integrado de Biodesenvolvimento da Escola Bahiana de Medicina e Saude Publica no Parque Tecnologico da Bahia
      Descrição: Luiz Alcantara coordena um subprojeto, especificamente ?Utilização do HTLV-2 Pseudotipado como Vetor Vacinal contra a Infecção pelo HTLV-1?. O presente projeto faz parte do esforço da Secretaria de Ciência, Tecnologia e Inovação do Estado da Bahia ? SECTI, através do Parque Tecnológico da Bahia, para implantação dos Laboratórios Compartilhados dos Equipamentos Dinamizadores, que serão consolidados na segunda etapa do Parque. Neste esforço, composto por dez plataformas agregadas que integram parceiros públicos e privados operando em conjunto, tem como objetivo comum o fortalecimento da rede de pesquisa nas áreas de Biotecnologia e Saúde do Estado.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Integrante / Maria Luisa Carvalho Soliani - Coordenador / Luiz Erlon Araujo Rodrigues - Integrante.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    25. 2012-Atual. IMPLANTACAO DE UM LABORATORIO DE BIOINFORMATICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE POS-GRADUACAO EM BIOTECNOLOGIA EM SAUDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM
      Descrição: Bioinformática é a coleção, organização e análise de grandes quantidades de dados biológicos utilizando uma rede de computadores e bancos de dados. Implica na análise de seqüências de genes e seus produtos (proteínas), mas o campo tem sido expandido para a gerência, processamento, análise e visualização de grandes quantidades de dados genômicos, proteômicos, triagem de drogas e química medicinal. Hoje a bioinformática já é considerada uma ciência, que além de ser indispensável ao melhor entendimento da genética, da bioquímica, da imunologia, da biologia celular e molecular e das outras ciências, vem se tornando uma área cada vez mais independente. Procuramos, com a implantação de um laboratório de bioinformática, criar uma infraestrutura que permita ao aluno de mestrado e doutorado, do curso de pós-graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa, ter a possibilidade de conhecer melhor esta ciência, não só na disciplina Bioinformática, mas também nas outras disciplinas, podendo também contar com a estrutura necessária para procurar desenvolver ferramentas de bioinformática que lhes possam auxiliar em responder questões importantes dos seus projetos. Será também possível, ensinando uma bioinformática mais completa a estes estudantes, fornecer recursos e o treinamento em banco de dados e programas relacionados à estrutura macromolecular, permitindo a estes cientistas da área biológica o acesso a esta rica fonte de informações, desenho de tutoriais, etc.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    26. 2012-Atual. Caracterizacao de genomas completos do virus da Leucemia de celulas T do adulto do tipo 1 (HTLV-1) provenientes de pacientes com diferentes perfis clinicos
      Descrição: Embora o HTLV-1 tenha sido convincentemente associado à Leucemia/Linfoma de Células T do Adulto (ATLL), é observado que a grande maioria dos indivíduos infectados permanece assintomática (95-98%). Ainda não se sabe por que isto ocorre, assim como não é conhecido os motivos pelos quais alguns indivíduos desenvolvem algum tipo de doença, seja ela de natureza neoplásica ou inflamatória, bem como os fatores que direcionam o curso clínico ao longo da infecção. Acredita-se que as diversas manifestações clínicas possam ser influenciadas pelo tipo e magnitude da resposta imune do hospedeiro para os antígenos do HTLV-1, bem como pelo local ou órgão no qual a reação inflamatória predominantemente acontece. Fatores relacionados às variantes genéticas do vírus e fatores referentes ao hospedeiro também têm sido sugeridos. Alguns trabalhos ainda apontam que fatores ambientais, como idade, modo de transmissão e características étnicas (Gadelha et al., 2005; Miller et al., 1994; Vine et al., 2002; Sabouri et al., 2005) podem contribuir para a manifestação de doença em indivíduos infectados. A análise de indivíduos, com diferentes status clínicos da doença, porém apresentando níveis semelhantes de carga proviral, demonstrou que células de pacientes assintomáticos produzem menores níveis das citocinas inflamatórias: TNF-? (Fator de necrose tumoral ?) e IFN-? (Interferon ?) (Nishimura et al., 2000), sugerindo que esta baixa produção seria importante para a manutenção do estado assintomático, e que outros fatores, além da carga proviral, também devem influenciar a sintomatologia da infecção (Furukawa et al, 2003). Visto isto, pretendemos estudar a diversidade genética no genoma total do HTLV-1 mais prevalente em cada grupo de indivíduos infectados: 10 com TSP/HAM, ATLL, 10 com dermatite infecciosa, 10 com dermatite infecciosa e TSP/HAM e 10 assintomáticos. Todos os indivíduos com idade superior a 45 anos e mediana da carga proviral de 1.500 copias/106 PBMC.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Marcio Roberto T Nunes - Integrante / Luis Felipe Ivanoff de Menezes - Integrante.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    27. 2012-Atual. Utilizacao do HTLV-2 pseudotipado como vetor vacinal contra a infeccao pelo HTLV-1
      Descrição: O Vírus Linfotrópico de Células T Humanas do tipo 1 (HTLV-1) é conhecido por ser o agente etiológico de doenças de natureza neoplásica, como a Leucemia/Linfoma de Células T do Adulto (ATLL) (Yoshida et al., 1982). Além disso, a infecção pelo HTLV-1 é endêmica em diferentes regiões geográficas do mundo, sendo Salvador a cidade brasileira com a mais alta prevalência entre a população geral, atingindo valores próximos a 1,8% (Dourado et al., 2003). As glicoproteínas do envelope viral são reconhecidas de maneira específica pelos receptores de linfócitos B (anticorpos de membrana), por anticorpos neutralizantes e por receptores de células T (TCR) de linfócitos-T citotóxicos (CTL), o que proporciona posteriormente uma resposta imune protetora. Estas glicoproteínas poderiam representar importantes . Para explorar as propriedades imunológicas em potencial do envelope viral como candidato à vacina, pretendemos utilizar as glicoproteínas gp46 e gp21 do HTLV-1, como um imunógeno. Há três anos firmamos uma colaboração internacional com o grupo de vacinas do Instituto Nacional do Câncer, do Instituto Nacional de Saúde do Governo dos EUA (Vaccine Branch ? NCI/NIH), liderado pela Dra. Genoveffa Franchini, resultando no desenvolvimento de um vetor vacinal anti-HTLV-1. Este vetor foi baseado no HTLV-2 atenuado, sendo desenhado por mim e construído pela GeneArt (USA). Este vetor foi cedido pela Dra Franchini para o CPqGM/FIOCRUZ, para montagem do vetor recombinante, ensaios in vitro e ex-vivo e testes bioquímicos e imunológicos (a serem realizados no CPqGM/FIOCRUZ). Após estes experimentos, os testes em modelo animal, utilizando coelhos serão realizados utilizando coelhos e macacos no NCI-NIH.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Genoveffa Franchini - Integrante / Maria Fernanda Castro-Amarante - Integrante / Fernanda Khouri Barreto - Integrante / Loianna Mascarenhas - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    28. 2011-Atual. Identificacao de SNPs no genoma da Leptospira interrogans sorovar Copenhageni e possivel associados ao desfecho clinico e Sindrome Hemorragica Pulmonar
      Descrição: O estudo molecular de sequências do genoma completo da L. interrogans sorovar Copenhageni possibilita testar a hipótese de que mutações estejam associadas a diferentes desfechos e fenótipos clínicos. Além disso, é possível ainda identificar grupamentos filogenéticos de isolados com características epidemiológicas, como tempo e espaço, que tenham associação com um maior sucesso na transmissão de um determinado clone. Objetivo: Identificar polimorfismos genéticos associados ao desfecho clínicos da leptospirose e ao sucesso de transmissão em determinado tempo e espaço. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Luciane Amorim Santos - Integrante / Albert Ko - Integrante / Mitermayer Galvão dos Reis - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante. Financiador(es): National Institutes of Health - Auxílio financeiro.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    29. 2010-2011. Identificacao in silico de Retrovirus Endogenos Humanos usando a regiao LTR de PTLV-1, PTLV-2 e PTLV-3
      Descrição: O HTLV-1 foi o primeiro retrovírus humano descrito, seguido pelo HTLV-2 e HTLV-3. Acredita-se que HTLV-1, HTLV-2 e HTLV-3 se originaram independentemente e teriam emergido do contato entre humanos e primatas não-humanos infectados com STLV. Durante o ciclo de replicação desses retrovírus pode ocorrer a formação de retroelementos, os elementos com repetições terminais longas. Estima-se que mais de 40% do genoma humano seja composto de retroelementos, sendo 8% de elementos LTR. Sugere-se ainda que os HERVs estão no genoma humano por um período de aproximadamente 30 milhões de anos, e alguns eventos de transposição envolvendo-os podem ter modificado a expressão gênica celular, conferindo ao hospedeiro uma vantagem seletiva. Esse estudo tem como objetivo identificar a presença de isolados de HTLV-1, HTLV-2, HTLV-3, STLV-1, STLV-2 e STLV-3 como retrovírus internos humanos. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Costa, Giselle Calasans Souza - Integrante / Fernanda Khouri Barreto - Integrante / Jaqueline Goes de Jesus - Integrante / Aline Cristina Mota Miranda - Integrante.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.
    30. 2010-2011. ESTUDO DA DIVERSIDADE DO HIV-1 NA BAHIA - BUSCA E ANALISE DE NOVAS FORMAS RECOMBINANTES CIRCULANTES (CRF) DO HIV
      Descrição: Após quase três décadas do início da epidemia de AIDS, inúmeros esforços vêm sendo feitos no combate ao HIV, porém até o momento não se chegou à uma vacina capaz de prevenir a infecção ou medicamentos capazes de eliminar o vírus. A intensa variabilidade genética do HIV-1 reflete-se no surgimento de isolados virais com comportamentos biológicos diversos e esta característica representa o principal obstáculo para a eficiência do funcionamento do sistema imune humano e para o desenvolvimento de vacinas e terapias universais. Estudos anteriores realizados pelo nosso grupo indicaram uma grande diversidade de genótipos de HIV-1 na Bahia e a prevalência de uma forma recombinante ainda não identificada, apresentando o mesmo padrão genético, em cerca de 6% da população infectada. O objetivo deste trabalho é investigar a existência de uma nova forma recombinante circulante (CRF) do HIV-1 na Bahia e a identificação de propriedades moleculares relacionadas com a adaptação e dispersão destas variantes. Para tanto, será realizado o seqüenciamento do genoma total de isolados previamente caracterizados em dois genes virais: gag e env. Estas seqüências de DNA serão então submetidas às análises filogenéticas e de recombinação através de ferramentas de Bioinformática. Este estudo poderá contribuir para o melhor entendimento a respeito das propriedades evolutivas do HIV, para vigilância da epidemia local de AIDS e para a escolha adequada de medidas de controle.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / joana Paixão Monteiro - Integrante / Adriano Fernando Araujo - Integrante.
      Membro: Luiz Carlos Junior Alcantara.

Prêmios e títulos

  • Total de prêmios e títulos (5)
    1. Premio CAPES de Tese de 2019 - Programa de Medicina II - Vigilância Genomica em Tempo Real de Arboívírus Emergentes e Re-emergentes - PGPAT/UFBA-FIOCRUZ - Jaqueline Goes de Jesus, CAPES-MEC - Processo: 23038.001446/2020-81 - publicado no DOU de 15.04.2020, Seção 3, pág. 72.. 2020.
      Membro: Luiz Carlos Júnior Alcantara.
    2. Cientista do Nosso Estado, FAPERJ - Fundação do Amparo da Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro.. 2019.
      Membro: Luiz Carlos Júnior Alcantara.
    3. (Melhor experiência) Projeto Aconchego: compartilhando emoções e experiências, CONASEMS - Conselho Nacional de Secretarias Municipais de Saúde.. 2017.
      Membro: Luiz Carlos Júnior Alcantara.
    4. Reconhecimento pela participação e contribuição como Vice-Coordenador da Pós-Graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa do CPqGM, CPqGM - Fiocruz.. 2016.
      Membro: Luiz Carlos Júnior Alcantara.
    5. Medalha de Mérito Barão de Corutuba, Câmara Municipal de Janaúba.. 2014.
      Membro: Luiz Carlos Júnior Alcantara.

Participação em eventos

  • Total de participação em eventos (32)
    1. International Conference and Exhibition on Genome Science - Genome USA 2018. .. 2018. (Congresso).
    2. 22nd International Bioinformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology (VEME). Sequence alignments and editing: practical computer session / Constructing phylogenetic trees: practice (NJ, ML). 2017. (Congresso).
    3. Curso Internacional de Bioinformática em Epidemiologia Molecular e Evolução Viral.Organização e alinhamento dos genomas. 2017. (Oficina).
    4. First International Asian-Latin American Workshop on Diagnosis, Clinical Management and Dengue Surveillance. Palestrante. 2017. (Congresso).
    5. First International Conference on Zika Virus. An automated method for the identification of Dengue, Zika, Yellow Fever and Chikungunya virus species and genotypes. 2017. (Congresso).
    6. II International Symposium on Biological Sciences.Mobile surveillance of Zika, Yellow Fever and Chikungunya viruses in Brazil using the minION nanopore technology. 2017. (Simpósio).
    7. Reunión Anual de la Red de Laboratorios de Diagnóstico de Arbovirus (RELDA).Nuevas metodologías de diagnóstico y caracterización de arbovirus. 2017. (Seminário).
    8. Reunión de seguimiento del Proyecto VIGENDA.Reunión de seguimiento del Proyecto VIGENDA. 2017. (Encontro).
    9. 2nd Penn in Latin America & Caribbean (PLAC). Responses to emerging viral diseases in Latin America and the Caribbean. 2016. (Congresso).
    10. Seminário Marco Zero - Chamada Pública nº 14/2016 - Prevenção e Combate ao Vírus Zika.ZIBRA 2: Análise em Tempo Real do vírus zika no Brasil: Segunda etapa. 2016. (Seminário).
    11. Taller Regional sobre Vigilancia, Control y Manejo de Zika, Dengue y Chikungunya en la Región Amazónica.Cartografía de la Enfermedad. Estado actual del trabajo de descripción genética del Zika.. 2016. (Oficina).
    12. X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C). An automated method for the identification of Dengue, Zika, Yellow Fever and Chikungunya virus species and genotypes. 2016. (Congresso).
    13. ZIKAlliance - Kick-off Meeting. 2016. (Encontro).
    14. 20th International Bioinformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology (VEME). Constructing phylogenetic trees: practice (NJ, ML). 2015. (Congresso).
    15. Seminário Dengue, Chikungunya, Zika - Situação atual e desafios.Apresentação do Projeto CHIKV submetido à FAPESB. 2015. (Seminário).
    16. VI Semana Científica 2015.Estudo da genética reversa do HTLV como suporte para o desenvolvimento de uma estratégia vacinal anti-HTLV-1. 2015. (Encontro).
    17. 19th International BioInformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology.Professor. 2014. (Outra).
    18. IX Encontro de Virologia do Mercosul.HTLV: codon usage and other molecular insights. 2014. (Encontro).
    19. Oficina Gestão de Projetos de Cooperação Técnica. 2014. (Oficina).
    20. XXV Congresso Brasileiro de Virologia. HTLV: codon usage and other molecular insights. 2014. (Congresso).
    21. 16th International Conference on Human Retrovirology: HTLV and Related Viruses. HTLV in Brazil. 2013. (Congresso).
    22. 18th International BioInformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology.Professor. 2013. (Outra).
    23. 1st Symposium on Big Data and Public Health. 2013. (Simpósio).
    24. 3º Congresso Brasileiro sobre HIV-AIDS e Vírus Relacionados. Diversidade Genética do Vírus HIV-1 na Transmissão Materno-Infantil em Salvador-Bahia. 2013. (Exposição).
    25. I Simpósio de Genômica Funcional e Biologia Sistêmica de Microorgan.Métodos de Análises de Sequências. 2013. (Simpósio).
    26. VIII Simpósio sobre Avanços na Patogenia e Manejo da AIDS. Diversidade Genética do Vírus HIV-1 na Transmissão Materno-Infantil em Salvador-Bahia. 2013. (Exposição).
    27. 2° BIO Reunião " A Bioinformática no Século 21". 2012. (Encontro).
    28. I Workshop Internacional em Bioinformática.Practical use of phylogenetic analysis: free computer time. 2011. (Outra).
    29. Sessões Científicas. O reverso genético do HTLV-1 em pacientes infectados. 2011. (Olimpíada).
    30. 16th International BioInformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology.Phylodynamics analysis of HIV-1 strains in Mother-to-Child. 2010. (Oficina).
    31. I Simpósio Paulista de HTLV. 2010. (Simpósio).
    32. Workshop on Viruses, Genes and Cancer. 2010. (Outra).

Organização de eventos

  • Total de organização de eventos (11)
    1. GOES NETO, A. ; FERNANDES, G. R. ; ALCANTARA, L. C. J. ; AZEVEDO, V.. Curso Internacional de Bioinformática em Epidemiologia Molecular e Evolução Viral. 2017. Outro
    2. CERQUEIRA, E. M. ; LIMA, M. M. ; SANTANA, E. B. ; GOES, C. B. ; ALCANTARA, L. C. J.. Seminário Dengue, Chikungunya, Zika - Situação atual e desafios. 2015. Outro
    3. ALCANTARA, L. C. J.; SANTOS,L.A ; ARAUJO, T.H.A. ; REGO, F. F. A. ; OLIVEIRA, T.. 2º Workshop Internacional de Bioinformática em Evolução e Biologia Molecular Viral. 2014. Outro
    4. OLIVEIRA, T. ; ALCANTARA, LC. Bioinformatics in the Tropics - Uganda 2014. 2014. Outro
    5. ALCANTARA, L. C. J.; RISTOW, P. ; OLIVEIRA, T.. 1º Workshop Internacional de Bioinformática em Evolução e Biologia Molecular Viral. 2013. Outro
    6. OLIVEIRA, T. ; ALCANTARA, LUIZ C J. Bioinformatics in the tropics - South Africa 2013. 2013. Outro
    7. ALCANTARA, L. C. J.. 21ª Reunião Anual de Iniciação Científica. 2013. (Outro).. . 0.
    8. ALCANTARA, L. C. J.. Training for database HIV-Base use.. 2005. (Outro).. . 0.
    9. ALCANTARA, L. C. J.. Second Brazilian Workshop on virus Evolution and Molecular Epidemiology - HIV and HTLV. 2004. (Outro).. . 0.
    10. ALCANTARA, L. C. J.. Course of Genic Therapy. 2004. (Outro).. . 0.
    11. ALCANTARA, L. C. J.. VI Simpósio Internacional sobre HTLV no Brasil. 2000. (Congresso).. . 0.

Lista de colaborações

  • Colaborações endôgenas (23)
    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Vasco Ariston de Carvalho Azevedo (16.0)
      1. XAVIER, JOILSON ; FONSECA, VAGNER ; BEZERRA, JOAO FELIPE ; DO MONTE ALVES, MANOELLA ; MARES-GUIA, MARIA ANGÉLICA ; CLARO, INGRA MORALES ; DE JESUS, RONALDO ; ADELINO, TALITA ; ARAÚJO, EMERSON ; CAVALCANTE, KARINA RIBEIRO LEITE JARDIM ; TOSTA, STEPHANE ; DE SOUZA, THEMIS ROCHA ; MOREIRA DA CRUZ, FLAVIA EMANUELLE ; DE ARAÚJO FABRI, ALLISON ; DE OLIVEIRA, ELAINE CRISTINA ; DE MOURA, NOELY FABIANA OLIVEIRA ; DO CARMO SAID, RODRIGO FABIANO ; DE ALBUQUERQUE, CARLOS FREDERICO CAMPELO ; AZEVEDO, VASCO ; de Oliveira, Tulio ; DE FILIPPIS, ANA MARIA BISPO ; VENÂNCIO DA CUNHA, RIVALDO ; LUZ, KLEBER GIOVANNI ; GIOVANETTI, MARTA ; Alcantara, Luiz Carlos Junior. Chikungunya virus ECSA lineage reintroduction in the northeasternmost region of Brazil. INTERNATIONAL JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES. v. 2021, p. 1010100, issn: 1201-9712, 2021.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. Adelino, TE ; Giovanetti, M ; Fonseca, V ; Xavier, J ; de Abreu, AS ; do Nascimento, VA ; Demarchi, LH ; Oliveira, MA ; da Silva, VL ; de Mello, AL ; Cunha, GM ; Santos, RH ; de Oliveira, EC ; Chamon Junior, JA ; Iani, FC ; de Filippis, AM ; Latin American Genomic Surveillance Arboviral Network ; Holmes, EC ; de Oliveira, T ; Lourenco, J ; Alcantara, LC. Field and classroom initiatives for portable sequence-based monitoring of dengue virus in Brazil. Nature Communications. v. 12, p. 2296, issn: 2041-1723, 2021.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      3. GRÄF, TIAGO ; VAZQUEZ, CYNTHIA ; GIOVANETTI, MARTA ; DE BRUYCKER-NOGUEIRA, FERNANDA ; FONSECA, VAGNER ; CLARO, INGRA MORALES ; DE JESUS, JAQUELINE GOES ; GÓMEZ, ANDREA ; XAVIER, JOILSON ; DE MENDONÇA, MARCOS CESAR LIMA ; VILLALBA, SHIRLEY ; TORALES, JUAN ; GAMARRA, MARIA LIZ ; THÉZÉ, JULIEN ; DE FILIPPIS, ANA MARIA BISPO ; AZEVEDO, VASCO ; de Oliveira, Tulio ; FRANCO, LETICIA ; DE ALBUQUERQUE, CARLOS F. CAMPELO ; IRALA, SANDRA ; HOLMES, EDWARD CHARLES ; MÉNDEZ RICO, JAIRO ANDRÉS ; Alcantara, Luiz Carlos Junior. Epidemiologic History and Genetic Diversity Origins of Chikungunya and Dengue Viruses, Paraguay. EMERGING INFECTIOUS DISEASES. v. 27, p. 1393-1404, issn: 1080-6040, 2021.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      4. LOPES, ELISSON NOGUEIRA ; FONSECA, VAGNER ; FRIAS, DIEGO ; TOSTA, STEPHANE ; SALGADO, ÁLVARO ; ASSUNÇÃO VIALLE, RICARDO ; PAULO EDUARDO, TOSCANO SOARES ; BARRETO, FERNANDA KHOURI ; Ariston de Azevedo, Vasco ; GUARINO, MICHELE ; ANGELETTI, SILVIA ; CICCOZZI, MASSIMO ; JUNIOR ALCANTARA, LUIZ CARLOS ; GIOVANETTI, MARTA. Betacoronaviruses genome analysis reveals evolution toward specific codons usage: Implications for SARS-CoV-2 mitigation strategies. JOURNAL OF MEDICAL VIROLOGY. v. open, p. jmv.27056, issn: 0146-6615, 2021.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      5. GIOVANETTI, MARTA Alcantara, Luiz Carlos Junior DOREA, ALFREDO SOUZA FERREIRA, QESYA RODRIGUES MARQUES, WILLIAN DE ALMEIDA JUNIOR FRANCA DE BARROS, JOSE Adelino, Talita Emile Ribeiro TOSTA, STEPHANE FRITSCH, HEGGER IANI, FELIPE CAMPOS DE MELO MARES-GUIA, MARIA ANGÉLICA Salgado, Alvaro FONSECA, VAGNER XAVIER, JOILSON LOPES, ELISSON NOGUEIRA SOARES, GILSON CARLOS CASTRO AMARANTE, MARIA FERNANDA DE AZEVEDO, VASCO KRUGER, ALÍCIA CORREA MATTA, GUSTAVO PAINEIRAS-DOMINGOS, LAISA LIANE COLONNELLO, CLAUDIA BISPO DE FILIPPIS, ANA MARIA MONTESANO, CARLA COLIZZI, VITTORIO , et al.BARRETO, FERNANDA KHOURI ; Promoting Responsible Research and Innovation (RRI) During Brazilian Activities of Genomic and Epidemiological Surveillance of Arboviruses. Promoting Responsible Research and Innovation (RRI) During Brazilian Activities of Genomic and Epidemiological Surveillance of Arboviruses. FRONTIERS IN PUBLIC HEALTH. v. 9, p. 1-4, issn: 2296-2565, 2021.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      6. XAVIER, JOILSON GIOVANETTI, MARTA ADELINO, TALITA FONSECA, VAGNER BARBOSA DA COSTA, ALANA VITOR RIBEIRO, ADRIANA APARECIDA FELICIO, KATLIN NASCIMENTO DUARTE, CLARA GUERRA FERREIRA SILVA, MARCOS VINICIUS SALGADO, ÁLVARO LIMA, MAURICIO TEIXEIRA DE JESUS, RONALDO FABRI, ALLISON SOARES ZOBOLI, CRISTIANE FRANCO SOUZA SANTOS, THALES GUTEMBERG IANI, FELIPE CICCOZZI, MASSIMO BISPO DE FILIPPIS, ANA MARIA TEIXEIRA DE SIQUEIRA, MARILDA AGUDO MENDONÇA DE ABREU, ANDRÉ LUIZ DE AZEVEDO, VASCO RAMALHO, DARIO BROCK CAMPELO DE ALBUQUERQUE, CARLOS F. The ongoing COVID-19 epidemic in Minas Gerais, Brazil: insights from epidemiological data and SARS-CoV-2 whole genome sequencing. Emerging Microbes & Infections. v. Jul 29, p. 1824-1834, issn: 2222-1751, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      7. RIBEIRO, SÉRVIO PONTES ; CASTRO E SILVA, ALCIDES ; DÁTTILO, WESLEY ; REIS, ALEXANDRE BARBOSA ; GÓES-NETO, ARISTÓTELES ; Alcantara, Luiz Carlos Junior ; GIOVANETTI, MARTA ; COURA-VITAL, WENDEL ; FERNANDES, GERALDO WILSON ; AZEVEDO, VASCO ARISTON C.. Severe airport sanitarian control could slow down the spreading of COVID-19 pandemics in Brazil. PeerJ. v. 8:e944, p. e9446, issn: 2167-8359, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      8. GIOVANETTI, MARTA FARIA, NUNO RODRIGUES LOURENÇO, JOSÉ GOES DE JESUS, JAQUELINE XAVIER, JOILSON CLARO, INGRA MORALES KRAEMER, MORITZ U.G. Genomic and Epidemiological Surveillance of Zika Virus in the Amazon Region. Cell Reports. v. 30, p. 2275-2283.e7, issn: 2211-1247, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      9. SILVA ANDRADE, BRUNO ; GHOSH, PREETAM ; BARH, DEBMALYA ; TIWARI, SANDEEP ; JOSÉ SANTANA SILVA, RANER ; RODRIGUES DE ASSIS SOARES, WAGNER ; SILVA MELO, TARCISIO ; SANTOS FREITAS, ANDRIA ; GONZÁLEZ-GRANDE, PATRÍCIA ; SOUSA PALMEIRA, LUCAS ; CARLOS JUNIOR ALCANTARA, LUIZ ; GIOVANETTI, MARTA ; GÓES-NETO, ARISTÓTELES ; ARISTON DE CARVALHO AZEVEDO, VASCO. Computational screening for potential drug candidates against the SARS-CoV-2 main protease. F1000RESEARCH. v. 9, p. 514, issn: 2046-1402, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      10. BARH, DEBMALYA ; TIWARI, SANDEEP ; SILVA ANDRADE, BRUNO ; GIOVANETTI, MARTA ; ALMEIDA COSTA, EDUARDO ; KUMAVATH, RANJITH ; GHOSH, PREETAM ; GÓES-NETO, ARISTÓTELES ; CARLOS JUNIOR ALCANTARA, LUIZ ; AZEVEDO, VASCO. Potential chimeric peptides to block the SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain. F1000RESEARCH. v. 9, p. 576, issn: 2046-1402, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      11. NAVECA, FELIPE GOMES CLARO, INGRA GIOVANETTI, MARTA DE JESUS, JAQUELINE GOES XAVIER, JOILSON IANI, FELIPE CAMPOS DE MELO DO NASCIMENTO, VALDINETE ALVES DE SOUZA, VICTOR COSTA SILVEIRA, PAOLA PAZ LOURENÇO, JOSÉ SANTILLANA, MAURICIO KRAEMER, MORITZ U. Genomic, epidemiological and digital surveillance of Chikungunya virus in the Brazilian Amazon. PLoS Neglected Tropical Diseases. v. 13, p. e0007065, issn: 1935-2735, 2019.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      12. QUEIROZ, A. ; PINTO, I. F. D. ; LIMA, M. M. ; GIOVANETTI, M. ; JESUS, J. G. ; XAVIER, J. ; BARRETO, F. K. ; CANUTO, G. A. B. ; AMARAL, H. R. ; FILIPPIS, A. M. B. ; MASCARENHAS, D. L. ; FALCAO, M. B. ; FRANCA, N. P. S. ; AZEVEDO, V. A. C. ; YOSHINAGA, M. Y. ; MIYAMOTO, S. ; ALCANTARA, L. C. J.. Lipidomic analysis reveals serum alteration of plasmalogens in patients infected with ZIKA virus. Frontiers in Microbiology. v. 10, p. 1-10, issn: 1664-302X, 2019.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      13. FONSECA, VAGNER ; LIBIN, PIETER J. K. ; THEYS, KRISTOF ; FARIA, NUNO R. ; NUNES, MARCIO R. T. ; RESTOVIC, MARIA I. ; FREIRE, MURILO ; GIOVANETTI, MARTA ; CUYPERS, LIZE ; NOWÉ, ANN ; ABECASIS, ANA ; DEFORCHE, KOEN ; SANTIAGO, GILBERTO A. ; SIQUEIRA, ISADORA C. DE ; SAN, EMMANUEL J. ; MACHADO, KALIANE C. B. ; Azevedo, Vasco ; FILIPPIS, ANA MARIA BISPO-DE ; CUNHA, RIVALDO VENÂNCIO DA ; PYBUS, OLIVER G. ; VANDAMME, ANNE-MIEKE ; ALCANTARA, LUIZ C. J. ; DE OLIVEIRA, TULIO. A computational method for the identification of Dengue, Zika and Chikungunya virus species and genotypes. PLoS Neglected Tropical Diseases. v. 13, p. e0007231, issn: 1935-2735, 2019.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      14. DE OLIVEIRA TOSTA, STEPHANE FRAGA ; PASSOS, MARIANA SANTANA ; KATO, RODRIGO ; SALGADO, ÁLVARO ; XAVIER, JOILSON ; JAISWAL, ARUN KUMAR ; SOARES, SIOMAR C. ; AZEVEDO, VASCO ; GIOVANETTI, MARTA ; TIWARI, SANDEEP ; JUNIOR ALCANTARA, LUIZ CARLOS. Multi-epitope based vaccine against Yellow fever virus applying immunoinformatics approaches. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS. v. 2019, p. 1-28, issn: 0739-1102, 2019.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      15. FARIA, N. R. ; KRAEMER, M. ; HILL, S. ; SACCHETTO, L. ; FIGUEIREDO, P. O. ; REZENDE, I. M. ; SOUZA TRINDADE, GILIANE DE ; DRUMOND, BETÂNIA ; e outros autores. Genomic and epidemiological monitoring of yellow fever virus transmission potential. SCIENCE. v. 361, p. eaat7115-eaat7115, issn: 0036-8075, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      16. Santana, Mariana ; DE OLIVEIRA TOSTA, STEPHANE FRAGA ; JAISWAL, ARUN KUMAR ; de Castro Oliveira, Letícia ; SOARES, SIOMAR C. ; Miyoshi, Anderson ; Alcantara, Luiz Carlos Junior ; AZEVEDO, VASCO ; TIWARI, SANDEEP. In Silico Approaches for Prioritizing Drug Targets in Pathogens. Sustainable Agriculture Reviews. 46ed. Em: Sandeep Tiwari. (Org.). Sustainable Agriculture Reviews. 46ed.Switzerland. : Springer International Publishing. 2020.v. 1, p. 83-108.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Marilda de Souza Gonçalves (5.0)
      1. PITANGA, THASSILA N. ; OLIVEIRA, RICARDO R. ; ZANETTE, DALILA L. ; GUARDA, CAROLINE C. ; SANTIAGO, RAYRA P. ; SANTANA, SANZIO S. ; NASCIMENTO, VALMA M.L. ; LIMA, JONILSON B. ; CARVALHO, GRAZIELE Q. ; MAFFILI, VITOR V. ; CARVALHO, MAGDA O.S. ; ALCÂNTARA, LUIZ C.J. ; BORGES, VALÉRIA M. ; GONCALVES, MARILDA S.. Sickle red cells as danger signals on proinflammatory gene expression, leukotriene B4 and interleukin-1 beta production in peripheral blood mononuclear cell. Cytokine. v. 83, p. 75-84, issn: 1043-4666, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. COSTA, GISELLE CALASANS DE SOUZA ; NUNES, MARCIO ; JESUS, JAQUELINE GOES ; NOVAES, THIAGO ; CARDOSO, JEDSON FERREIRA ; SOUSA, EDIVALDO ; SANTOS, EDSON DE SOUZA ; Galvão-Castro, Bernardo ; ZANETTE, DALILA LUCIOLA ; Gonçalves, Marilda de Sousa ; ALCANTARA, Luiz Carlos. Amino and Carboxyl-terminal CCR5 mutations in Brazilian HIV-1 infected women and homology model of p.L55Q CCR5 mutant. AIDS Research and Human Retroviruses. v. 31, p. 150331070418001-33, issn: 1931-8405, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      3. SANTOS, LUCIANE AMORIM ; GRAY, REBECCA R. ; MONTEIRO-CUNHA, JOANA PAIXÃO ; STRAZZA, EVANDRA ; Kashima, Simone ; SANTOS, EDSON DE SOUZA ; ARAÚJO, THESSIKA HIALLA ALMEIDA ; GONÇALVES, MARILDA DE SOUZA ; SALEMI, MARCO ; Alcantara, Luiz Carlos Junior. Short Communication: Phylodynamics Analysis of the Human Immunodeficiency Virus Type 1 Envelope Gene in Mother and Child Pairs. AIDS Research and Human Retroviruses. v. 31, p. 913-920, issn: 0889-2229, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      4. Rego, Filipe Ferreira de Almeida ; de Oliveira, Tulio ; GIOVANETTI, MARTA ; Galvão-Castro, Bernardo ; Gonçalves, Marilda de Souza ; Alcantara, Luiz Carlos. Deep Sequencing Analysis of Human T Cell Lymphotropic Virus Type 1 Long Terminal Repeat 5- Region from Patients with Tropical Spastic Paraparesis/Human T Cell Lymphotropic Virus Type 1-Associated Myelopathy and Asymptomatic Carriers. AIDS Research and Human Retroviruses. v. 32, p. 279-283, issn: 0889-2229, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      5. COSTA, GISELLE CALASANS DE SOUZA ; JESUS, JAQUELINE GOES ; Rego, Filipe Ferreira de Almeida ; SANTOS, EDSON SOUZA ; Galvão-Castro, Bernardo ; Gonçalves, Marilda de Souza ; ALCANTARA, LUIZ CARLOS JÚNIOR. Genetic characterisation of Langerin gene in human immunodeficiency virus-1-infected women from Bahia, Brazil. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz (Impresso). v. 109, p. 250-255, issn: 0074-0276, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Simone Kashima Haddad (4.0)
      1. Adelino, TE ; Giovanetti, M ; Fonseca, V ; Xavier, J ; de Abreu, AS ; do Nascimento, VA ; Demarchi, LH ; Oliveira, MA ; da Silva, VL ; de Mello, AL ; Cunha, GM ; Santos, RH ; de Oliveira, EC ; Chamon Junior, JA ; Iani, FC ; de Filippis, AM ; Latin American Genomic Surveillance Arboviral Network ; Holmes, EC ; de Oliveira, T ; Lourenco, J ; Alcantara, LC. Field and classroom initiatives for portable sequence-based monitoring of dengue virus in Brazil. Nature Communications. v. 12, p. 2296, issn: 2041-1723, 2021.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. Slavov, Svetoslav N. ; PATANÉ, JOSÉ S. L. ; BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS ; GIOVANETTI, MARTA ; FONSECA, VAGNER ; MARTINS, ANTONIO J. ; VIALA, VINCENT L. ; RODRIGUES, EVANDRA S. ; SANTOS, ELAINE V. ; BARROS, CLAUDIA R. S. ; MARQUEZE, ELAINE C. ; SANTOS, BIBIANA ; ABURJAILE, FLAVIA ; NETO, RAUL M. ; MORETTI, DEBORA B. ; HADDAD, RICARDO ; CALADO, RODRIGO T. ; KITAJIMA, JOÃO P. ; FREITAS, ERIKA ; SCHLESINGER, DAVID ; JUNIOR DE ALCANTARA, LUIZ C. ; ELIAS, MARIA C. ; SAMPAIO, SANDRA C. ; Kashima, Simone ; COVAS, DIMAS T.. Genomic monitoring unveil the early detection of the SARS-CoV-2 B.1.351 (beta) variant (20H/501Y.V2) in Brazil. JOURNAL OF MEDICAL VIROLOGY. v. 93, p. 6782-6787, issn: 0146-6615, 2021.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      3. SANTOS, LUCIANE AMORIM ; GRAY, REBECCA R. ; MONTEIRO-CUNHA, JOANA PAIXÃO ; STRAZZA, EVANDRA ; Kashima, Simone ; SANTOS, EDSON DE SOUZA ; ARAÚJO, THESSIKA HIALLA ALMEIDA ; GONÇALVES, MARILDA DE SOUZA ; SALEMI, MARCO ; Alcantara, Luiz Carlos Junior. Short Communication: Phylodynamics Analysis of the Human Immunodeficiency Virus Type 1 Envelope Gene in Mother and Child Pairs. AIDS Research and Human Retroviruses. v. 31, p. 913-920, issn: 0889-2229, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      4. Costa, G. C. S. ; ALCANTARA, L. C. J. ; AZEVEDO, R. ; Muricy, G. ; Kashima, S. H. ; COVAS, D. T. ; Galvão-Castro, B. ; Gadelha, S. R. ; Kashima, Simone. Frequency distribution of XbaIG > T and HaeIIIT > C GLUT1 polymorphisms among different Brazilian ethnic groups. Molecular Biology Reports. v. 37, p. 75-79, issn: 0301-4851, 2010.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Pedro Fernando da Costa Vasconcelos (3.0)
      1. MELO, CARLOS FREDERICO CAMPELO DE ALBUQUERQUE E ; VASCONCELOS, PEDRO FERNANDO DA COSTA ; Alcantara, Luiz Carlos Júnior ; ARAUJO, WILDO NAVEGANTES DE. The obscurance of the greatest sylvatic yellow fever epidemic and the cooperation of the Pan American Health Organization during the COVID-19 pandemic. SOCIEDADE BRASILEIRA DE MEDICINA TROPICAL. REVISTA. v. 53, p. 1-3, issn: 1678-9849, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. DO ROSARIO, M. S. ; DE JESUS, P. A. P. ; VASILAKIS, N. ; FARIAS, D. S. ; NOVAES, M. A. C. ; RODRIGUES, S. G. ; MARTINS, L. C. ; DA COSTA VASCONCELOS, P. F. ; KO, A. I. ; ALCANTARA, L. C. J. ; SIQUEIRA, I. C.. Guillain-Barre Syndrome After Zika Virus Infection in Brazil. The American Journal of Tropical Medicine and Hygiene. v. 19, p. 1157-1160, issn: 0002-9637, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      3. FARIA, N. Zika virus in the Americas: Early epidemiological and genetic findings. Science (New York, N.Y.). v. March, p. 345-349, issn: 0036-8075, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Carlos Roberto Brites Alves (3.0)
      1. FERRARO, GERALDO A. ; MONTEIRO-CUNHA, JOANA P. ; FERNANDES, FLORA M.C. ; MOTA-MIRANDA, ALINE C.A. ; Brites, Carlos ; ALCANTARA, LUIZ C.J. ; GALVÃO-CASTRO, BERNARDO ; MORGADO, MARIZA G.. Molecular Characterization of Long Terminal Repeat Sequences from Brazilian Human Immunodeficiency Virus Type 1 Isolates. AIDS Research and Human Retroviruses. v. 29, p. 121216132533000, issn: 0889-2229, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. Santos, Luciane Amorim ; Monteiro-Cunha, Joana Paixao ; Araujo, Adriano Fernando ; Brites, Carlos ; Galvao-Castro, Bernardo ; Alcantara, Luiz Carlos Junior. Detection of distinct human immunodeficiency virus Type 1 circulating recombinant forms in Northeast Brazil. Journal of Medical Virology (Print). v. 83, p. 2066-2072, issn: 0146-6615, 2011.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      3. Araujo, Adriano Fernando ; Brites, Carlos ; Monteiro-Cunha, Joana ; Santos, Luciane Amorim ; Galvaoâ¿" ; Alcantara, Luiz Carlos Junior. Lower Prevalence of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Brazilian Subtype B Found in Northeastern Brazil with Slower Progression to AIDS. AIDS Research and Human Retroviruses. v. 26, p. 1249-1254, issn: 0889-2229, 2010.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Gabriel da Luz Wallau (3.0)
      1. GIOVANETTI, MARTA FARIA, NUNO RODRIGUES LOURENÇO, JOSÉ GOES DE JESUS, JAQUELINE XAVIER, JOILSON CLARO, INGRA MORALES KRAEMER, MORITZ U.G. Genomic and Epidemiological Surveillance of Zika Virus in the Amazon Region. Cell Reports. v. 30, p. 2275-2283.e7, issn: 2211-1247, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. GOES DE JESUS, JAQUELINE DA LUZ WALLAU, GABRIEL LIMA MAIA, MARICELIA XAVIER, JOILSON OLIVEIRA LIMA, MARIA APARECIDA FONSECA, V. Persistence of chikungunya ECSA genotype and local outbreak in an upper medium class neighborhood in Northeast Brazil. PLoS One. v. 15, p. e0226098, issn: 1932-6203, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      3. FARIA, N. ; QUICK, J. ; DHALIA, R. ; FRANCA, R. ; MARQUES, E. ; Wallau, G. L. ; HOLMES, E. ; BREDFORD, T. ; NUNES, M. ; SABINO, E. ; ALCANTARA, L. ; LOMAN, N. ; PYBUS, O.. Establishment and cryptic transmission of Zika virus in Brazil and the Americas. NATURE. v. 546, p. online-first, issn: 0028-0836, 2017.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Julio Henrique Rosa Croda (3.0)
      1. GIOVANETTI, MARTA FARIA, NUNO RODRIGUES LOURENÇO, JOSÉ GOES DE JESUS, JAQUELINE XAVIER, JOILSON CLARO, INGRA MORALES KRAEMER, MORITZ U.G. Genomic and Epidemiological Surveillance of Zika Virus in the Amazon Region. Cell Reports. v. 30, p. 2275-2283.e7, issn: 2211-1247, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. PEREIRA GUSMÃO MAIA, ZUINARA ; MOTA PEREIRA, FELICIDADE ; DO CARMO SAID, RODRIGO FABIANO ; FONSECA, VAGNER ; GRÄF, TIAGO ; DE BRUYCKER NOGUEIRA, FERNANDA ; BRANDÃO NARDY, VANESSA ; XAVIER, JOILSON ; LIMA MAIA, MARICELIA ; ABREU, ANDRÉ L. ; CAMPELO DE ALBUQUERQUE, CARLOS F. ; KLEBER OLIVEIRA, WANDERSON ; Croda, Julio ; DE FILIPPIS, ANA MARIA BISPO ; VENANCIO CUNHA, RIVALDO ; LOURENÇO, JOSE ; DE OLIVEIRA, TULIO ; FARIA, NUNO RODRIGUES ; JUNIOR ALCANTARA, LUIZ CARLOS ; GIOVANETTI, MARTA. Return of the founder Chikungunya virus to its place of introduction into Brazil is revealed by genomic characterization of exanthematic disease cases. Emerging Microbes & Infections. v. 9, p. 53-57, issn: 2222-1751, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      3. GOES DE JESUS, JAQUELINE GRÄF, TIAGO GIOVANETTI, MARTA MARES-GUIA, MARIA ANGÉLICA XAVIER, JOILSON LIMA MAIA, MARICELIA FONSECA, VAGNER FABRI, ALLISON DOS SANTOS, ROBERTO FONSECA MOTA PEREIRA, FELICIDADE FERRAZ OLIVEIRA SANTOS, LEANDRO REBOREDO DE OLIVEIRA DA SILVA, LUCIANA PEREIRA GUSMÃO MAIA, ZUINARA GOMES CERQUEIRA, JANANCI XAVIER THÈZE, JULIEN ABADE, LEANDRO CORDEIRO, MIRZA DE CARVALHO SANTANA TORQUATO, SINTIA SACRAMENTO CERQUEIRA SANTANA, ELOISA BAHIA DE JESUS SILVA, NEUZA SANTOS DOURADO, ROSEMARY SARMENTO OITIÇICA ALVES, ADEMILSON BRÁS DO SOCORRO GUEDES, ADEILDE DA SILVA FILHO, PEDRO MACEDO RODRIGUES FARIA, NUNO , et al.DE ALBUQUERQUE, CARLOS F. Yellow fever transmission in non-human primates, Bahia, Northeastern Brazil. PLoS Neglected Tropical Diseases. v. 14, p. e0008405, issn: 1935-2735, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Amilcar Tanuri (2.0)
      1. HILL, SARAH C VASCONCELOS, JOCELYNE NETO, ZORAIMA JANDONDO, DOMINGOS ZÉ-ZÉ, LÍBIA AGUIAR, RENATO SANTANA XAVIER, JOILSON THÉZÉ, JULIEN MIRANDELA, MARINELA MICOLO CÂNDIDO, ANA LUÍSA VAZ, FILIPA SEBASTIÃO, CRUZ DOS SANTOS WU, CHIEH-HSI KRAEMER, MORITZ U G MELO, ADRIANA SCHAMBER-REIS, BRUNO L F DE AZEVEDO, GIRLENE S Tanuri, Amilcar HIGA, LUIZA M CLEMENTE, CARINA DA SILVA, SARA PEREIRA DA SILVA CANDIDO, DARLAN CLARO, INGRA M QUIBUCO, DOMINGOS DOMINGOS, CRISTÓVÃO , et al.POCONGO, BÁRBARA WATTS, ALEXANDER G KHAN, KAMRAN ALCANTARA, LUIZ CARLOS JUNIOR SABINO, ESTER C LACKRITZ, EVE PYBUS, OLIVER G ALVES, MARIA-JOÃO AFONSO, JOANA FARIA, NUNO R ; Emergence of the Asian lineage of Zika virus in Angola: an outbreak investigation. Emergence of the Asian lineage of Zika virus in Angola: an outbreak investigation. LANCET INFECTIOUS DISEASES. v. 19, p. 1138-1147, issn: 1473-3099, 2019.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. FARIA, N. R. ; KRAEMER, M. ; HILL, S. ; SACCHETTO, L. ; FIGUEIREDO, P. O. ; REZENDE, I. M. ; SOUZA TRINDADE, GILIANE DE ; DRUMOND, BETÂNIA ; e outros autores. Genomic and epidemiological monitoring of yellow fever virus transmission potential. SCIENCE. v. 361, p. eaat7115-eaat7115, issn: 0036-8075, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Alexandre Barbosa Reis (2.0)
      1. FONSECA, VAGNER ; DE JESUS, RONALDO ; ADELINO, TALITA ; REIS, ALEXANDRE BARBOSA ; DE SOUZA, BRENO BERNARDES ; RIBEIRO, ADRIANA APARECIDA ; GUIMARÃES, NATÁLIA ROCHA ; LIVORATI, MIRIAM TERESINHA FURLAM PRADO ; NETO, DANIEL FERREIRA DE LIMA ; KATO, RODRIGO BENTES ; PORTELA, LAYSSA MIRANDA DE OLIVEIRA ; DUTRA, LEONARDO HERMES ; FREITAS, CARLA ; DE ABREU, ANDRÉ LUIZ ; FILIZZOLA, EDUARDO REGIS MELO ; DE MEDEIROS, ARNALDO CORREIA ; IANI, FELIPE CAMPOS DE MELO ; CARVALHO, GLAUCO ; LOURENÇO, JOSÉ ; de Oliveira, Tulio ; Alcantara, Luiz Carlos Junior ; GIOVANETTI, MARTA. Genomic evidence of SARS-CoV-2 reinfection case with the emerging B.1.2 variant in Brazil. JOURNAL OF INFECTION. v. 5126, p. 5126, issn: 0163-4453, 2021.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. RIBEIRO, SÉRVIO PONTES ; CASTRO E SILVA, ALCIDES ; DÁTTILO, WESLEY ; REIS, ALEXANDRE BARBOSA ; GÓES-NETO, ARISTÓTELES ; Alcantara, Luiz Carlos Junior ; GIOVANETTI, MARTA ; COURA-VITAL, WENDEL ; FERNANDES, GERALDO WILSON ; AZEVEDO, VASCO ARISTON C.. Severe airport sanitarian control could slow down the spreading of COVID-19 pandemics in Brazil. PeerJ. v. 8:e944, p. e9446, issn: 2167-8359, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Marilda Agudo Mendonça Teixeira de Siqueira (1.0)
      1. XAVIER, JOILSON GIOVANETTI, MARTA ADELINO, TALITA FONSECA, VAGNER BARBOSA DA COSTA, ALANA VITOR RIBEIRO, ADRIANA APARECIDA FELICIO, KATLIN NASCIMENTO DUARTE, CLARA GUERRA FERREIRA SILVA, MARCOS VINICIUS SALGADO, ÁLVARO LIMA, MAURICIO TEIXEIRA DE JESUS, RONALDO FABRI, ALLISON SOARES ZOBOLI, CRISTIANE FRANCO SOUZA SANTOS, THALES GUTEMBERG IANI, FELIPE CICCOZZI, MASSIMO BISPO DE FILIPPIS, ANA MARIA TEIXEIRA DE SIQUEIRA, MARILDA AGUDO MENDONÇA DE ABREU, ANDRÉ LUIZ DE AZEVEDO, VASCO RAMALHO, DARIO BROCK CAMPELO DE ALBUQUERQUE, CARLOS F. The ongoing COVID-19 epidemic in Minas Gerais, Brazil: insights from epidemiological data and SARS-CoV-2 whole genome sequencing. Emerging Microbes & Infections. v. Jul 29, p. 1824-1834, issn: 2222-1751, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Valeria de Matos Borges (1.0)
      1. PITANGA, THASSILA N. ; OLIVEIRA, RICARDO R. ; ZANETTE, DALILA L. ; GUARDA, CAROLINE C. ; SANTIAGO, RAYRA P. ; SANTANA, SANZIO S. ; NASCIMENTO, VALMA M.L. ; LIMA, JONILSON B. ; CARVALHO, GRAZIELE Q. ; MAFFILI, VITOR V. ; CARVALHO, MAGDA O.S. ; ALCÂNTARA, LUIZ C.J. ; BORGES, VALÉRIA M. ; GONCALVES, MARILDA S.. Sickle red cells as danger signals on proinflammatory gene expression, leukotriene B4 and interleukin-1 beta production in peripheral blood mononuclear cell. Cytokine. v. 83, p. 75-84, issn: 1043-4666, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Giliane de Souza Trindade (1.0)
      1. FARIA, N. R. ; KRAEMER, M. ; HILL, S. ; SACCHETTO, L. ; FIGUEIREDO, P. O. ; REZENDE, I. M. ; SOUZA TRINDADE, GILIANE DE ; DRUMOND, BETÂNIA ; e outros autores. Genomic and epidemiological monitoring of yellow fever virus transmission potential. SCIENCE. v. 361, p. eaat7115-eaat7115, issn: 0036-8075, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Mauro Martins Teixeira (1.0)
      1. ROCHA, MARCELE NEVES ; DUARTE, MYRIAN MORATO ; MANSUR, SIMONE BRUTMAN ; SILVA, BIANCA DAOUD MAFRA E ; PEREIRA, THIAGO NUNES ; ADELINO, TALITA ÉMILE RIBEIRO ; GIOVANETTI, MARTA ; Alcantara, Luis Carlos Junior ; SANTOS, FRANCIELE MARTINS ; COSTA, VICTOR RODRIGUES DE MELO ; TEIXEIRA, MAURO MARTINS ; IANI, FELIPE CAMPOS DE MELO ; COSTA, VIVIAN VASCONCELOS ; MOREIRA, LUCIANO ANDRADE. Pluripotency of Wolbachia against Arboviruses: the case of yellow fever. Gates Open Research. v. 3, p. 161-26, issn: 2572-4754, 2019.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Erna Geessien Kroon (1.0)
      1. FARIA, N. R. ; KRAEMER, M. ; HILL, S. ; SACCHETTO, L. ; FIGUEIREDO, P. O. ; REZENDE, I. M. ; SOUZA TRINDADE, GILIANE DE ; DRUMOND, BETÂNIA ; e outros autores. Genomic and epidemiological monitoring of yellow fever virus transmission potential. SCIENCE. v. 361, p. eaat7115-eaat7115, issn: 0036-8075, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Bruno de Bezerril Andrade (1.0)
      1. VINHAES, CAIAN L ; ARRIAGA, MARÍA B ; DE ALMEIDA, BRENO L ; OLIVEIRA, JOÃO V ; SANTOS, CLEITON S ; CALCAGNO, JUAN I ; CARVALHO, TEREZA X ; GIOVANETTI, MARTA ; ALCANTARA, LUIZ CARLOS J ; DE SIQUEIRA, ISADORA C ; ANDRADE, BRUNO B. Newborns with Zika virus-associated microcephaly exhibit marked systemic inflammatory imbalance. JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES. v. 222, p. 670-680, issn: 0022-1899, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Anna Sara Shafferman Levin (1.0)
      1. FARIA, N. ; QUICK, J. ; DHALIA, R. ; FRANCA, R. ; MARQUES, E. ; Wallau, G. L. ; HOLMES, E. ; BREDFORD, T. ; NUNES, M. ; SABINO, E. ; ALCANTARA, L. ; LOMAN, N. ; PYBUS, O.. Establishment and cryptic transmission of Zika virus in Brazil and the Americas. NATURE. v. 546, p. online-first, issn: 0028-0836, 2017.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Guilherme de Sousa Ribeiro (1.0)
      1. COSTA, FEDERICO ; SARNO, MANOEL ; KHOURI, RICARDO ; DE PAULO FREITAS, BRUNO ; SIQUEIRA, ISADORA ; RIBEIRO, GUILHERME S. ; RIBEIRO, HUGO C. ; CAMPOS, GUBIO S. ; ALCÂNTARA, LUIZ C. ; Reis, Mitermayer G. ; WEAVER, SCOTT C. ; VASILAKIS, NIKOS ; KO, ALBERT I. ; ALMEIDA, ANTONIO RAIMUNDO. Emergence of Congenital Zika Syndrome: Viewpoint From the Front Lines. Annals of Internal Medicine. v. online, p. 689-691, issn: 0003-4819, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Servio Pontes Ribeiro (1.0)
      1. RIBEIRO, SÉRVIO PONTES ; CASTRO E SILVA, ALCIDES ; DÁTTILO, WESLEY ; REIS, ALEXANDRE BARBOSA ; GÓES-NETO, ARISTÓTELES ; Alcantara, Luiz Carlos Junior ; GIOVANETTI, MARTA ; COURA-VITAL, WENDEL ; FERNANDES, GERALDO WILSON ; AZEVEDO, VASCO ARISTON C.. Severe airport sanitarian control could slow down the spreading of COVID-19 pandemics in Brazil. PeerJ. v. 8:e944, p. e9446, issn: 2167-8359, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Renan Pedra de Souza (1.0)
      1. Adelino, TE ; Giovanetti, M ; Fonseca, V ; Xavier, J ; de Abreu, AS ; do Nascimento, VA ; Demarchi, LH ; Oliveira, MA ; da Silva, VL ; de Mello, AL ; Cunha, GM ; Santos, RH ; de Oliveira, EC ; Chamon Junior, JA ; Iani, FC ; de Filippis, AM ; Latin American Genomic Surveillance Arboviral Network ; Holmes, EC ; de Oliveira, T ; Lourenco, J ; Alcantara, LC. Field and classroom initiatives for portable sequence-based monitoring of dengue virus in Brazil. Nature Communications. v. 12, p. 2296, issn: 2041-1723, 2021.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Aluisio Augusto Cotrim Segurado (1.0)
      1. FARIA, N. ; QUICK, J. ; DHALIA, R. ; FRANCA, R. ; MARQUES, E. ; Wallau, G. L. ; HOLMES, E. ; BREDFORD, T. ; NUNES, M. ; SABINO, E. ; ALCANTARA, L. ; LOMAN, N. ; PYBUS, O.. Establishment and cryptic transmission of Zika virus in Brazil and the Americas. NATURE. v. 546, p. online-first, issn: 0028-0836, 2017.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Betania Paiva Drumond (1.0)
      1. FARIA, N. R. ; KRAEMER, M. ; HILL, S. ; SACCHETTO, L. ; FIGUEIREDO, P. O. ; REZENDE, I. M. ; SOUZA TRINDADE, GILIANE DE ; DRUMOND, BETÂNIA ; e outros autores. Genomic and epidemiological monitoring of yellow fever virus transmission potential. SCIENCE. v. 361, p. eaat7115-eaat7115, issn: 0036-8075, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Gonzalo José Bello Bentancor (1.0)
      1. FARIA, N. Zika virus in the Americas: Early epidemiological and genetic findings. Science (New York, N.Y.). v. March, p. 345-349, issn: 0036-8075, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Luiz Carlos Júnior Alcantara ⇔ Federico Costa (1.0)
      1. COSTA, FEDERICO ; SARNO, MANOEL ; KHOURI, RICARDO ; DE PAULO FREITAS, BRUNO ; SIQUEIRA, ISADORA ; RIBEIRO, GUILHERME S. ; RIBEIRO, HUGO C. ; CAMPOS, GUBIO S. ; ALCÂNTARA, LUIZ C. ; Reis, Mitermayer G. ; WEAVER, SCOTT C. ; VASILAKIS, NIKOS ; KO, ALBERT I. ; ALMEIDA, ANTONIO RAIMUNDO. Emergence of Congenital Zika Syndrome: Viewpoint From the Front Lines. Annals of Internal Medicine. v. online, p. 689-691, issn: 0003-4819, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]




(*) Relatório criado com produções desde 2010 até 2021
Data de processamento: 06/11/2021 15:22:32