Especialistas Seniores em Covid-19 com atuação no Brasil

Walter Filgueira de Azevedo Junior

"I am a freethinker influencing science and technology"- see here: https://www.pucrs.br/en/blog/research-database-includes-7-pucrs-professors-among-most-influential-in-the-world/

https://lattes.cnpq.br/4183276948524704 (13/10/2021)

Rótulo/Grupo:

Bolsa CNPq: Nível 1D

Período de análise:

Endereço: Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Escola de Ciências da Saúde. Av. Ipiranga, 6681. Partenon 90619900 - Porto Alegre, RS - Brasil Telefone: (51) 33534529 Fax: (51) 33203629 URL da Homepage: www.azevedolab.net

Grande área: Ciências Biológicas

Área: Bioquímica

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (52)
1. Veit-Acosta, Martina ; de Azevedo Junior, Walter Filgueira. The Impact of CrystallographicData for the Development of Machine Learning Models to Predict Protein-Ligand Binding Affinity. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 28, p. 1-15, issn: 0929-8673, 2021.
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2. de Azevedo Junior, Walter Filgueira; BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; GODOY, JOANA RETZKE ; ADRIANO, HILDA MAYELA ARAN ; DOS SANTOS BEZERRA, WALLYSON ANDRÉ ; DOS SANTOS SOARES, ALEXANDRA MARTINS. Protein-ligand Docking Simulations with AutoDock4 Focused on the Main Protease of SARS-CoV-2. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 28, p. 1-15, issn: 0929-8673, 2021.
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3. PEPINO, REBEKA DE OLIVEIR ; COELHO, FERNANDA ; JANKU, TATIANE APARECIDA BUZANELLO ; ALENCAR, DIANDRA PINHEIRO ; DE AZEVEDO JR, WALTER FIGUEIRA ; CANDURI, Fernanda. Overview of PCTK3/CDK18: A Cyclin-Dependent Kinase Involved in Specific Functions in Post-Mitotic Cells. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 28, p. 1-17, issn: 0929-8673, 2021.
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4. DA SILVEIRA, NELSON JOSÉ FREITAS ; de Azevedo Jr., Walter Filgueira ; GUEDES, RITA CARDOSO ; SANTOS, LEANDRO MARCOS ; MARCELINO, RODOLFO CABRAL ; ANTUNES, PATRÍCIA ; ELIAS, THIAGO CABRAL. Bioinformatics approach on bioisosterism softwares to be used in drug discovery and development. Current Bioinformatics. v. 16, p. 1-15, issn: 1574-8936, 2021.
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5. Veit-Acosta, Martina ; de Azevedo Junior, Walter Filgueira. Computational Prediction of Binding Affinity for CDK2-ligand Complexes. A Protein Target for Cancer Drug Discovery. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 28, p. 1-17, issn: 0929-8673, 2021.
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6. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo Junior, Walter Filgueira. Electrostatic Potential Energy in Protein-Drug Complexes. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 28, p. 1-17, issn: 0929-8673, 2021.
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7. de Azevedo, Walter Filgueira. Meet Our Section Editor. COMBINATORIAL CHEMISTRY & HIGH THROUGHPUT SCREENING. v. 23, p. 1-1, issn: 1386-2073, 2020.
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8. de Azevedo, Walter Filgueira. Meet Our Editorial Board Member. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 27, p. 4753-4753, issn: 0929-8673, 2020.
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9. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; RIZZOTTO, CAMILA ; de Azevedo Junior, Walter Filgueira. Machine Learning-Based Scoring Functions. Development and Applications with SAnDReS.. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 27, p. 1746-1756, issn: 0929-8673, 2020.
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10. DA SILVA, AMAURI DUARTE ; BITENCOURT'FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Taba: A Tool to Analyze the Binding Affinity. JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY. v. 41, p. jcc.26048, issn: 0192-8651, 2019.
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11. RUSSO, SILVANA ; de Azevedo Jr., Walter Filgueira. Computational Analysis of Dipyrone Metabolite 4-Aminoantipyrine as a Cannabinoid Receptor 1 Agonist. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 26, p. 1-10, issn: 0929-8673, 2019.
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12. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; DA SILVA, AMAURI DUARTE ; de Azevedo Jr., Walter Filgueira. Application of Machine Learning Techniques to Predict Binding Affinity for Drug Targets. A Study of Cyclin-Dependent Kinase 2. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 26, p. 1-11, issn: 0929-8673, 2019.
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13. AMARAL, MARIA EDUARDA AZAMBUJA ; NERY, LAURA ROESLER ; LEITE, CARLOS EDUARDO ; de Azevedo Junior, Walter Filgueira ; CAMPOS, MARIA MARTHA. Pre-clinical effects of metformin and aspirin on the cell lines of different breast cancer subtypes. INVESTIGATIONAL NEW DRUGS. v. 36, p. 1-15, issn: 0167-6997, 2018.
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14. LEVIN, NAYARA MARIA BERNHARDT ; PINTRO, VAL OLIVEIRA ; BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; DE MATTOS, BRUNA BOLDRINI ; DE CASTRO SILVÉRIO, ARIADNE ; de Azevedo, Walter Filgueira. Development of CDK-targeted scoring functions for prediction of binding affinity. BIOPHYSICAL CHEMISTRY. v. 235, p. 1-8, issn: 0301-4622, 2018.
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16. FREITAS, POLIANY G. ; ELIAS, THIAGO C. ; PINTO, ICARO A. ; COSTA, LUCIANO T. ; DE CARVALHO, PAULO V.S.D. ; DE Q. OMOTE, DANIEL ; CAMPS, IHOSVANY ; ISHIKAWA, TATI ; ARCURI, HELEN A. ; VINGA, SUSANA ; OLIVEIRA, ARLINDO L. ; JUNIOR, WALTER F.A. ; DA SILVEIRA, NELSON J.F.. Computational Approach to the Discovery of Phytochemical Molecules with Therapeutic Potential Targets to the PKCZ protein. Letters in Drug Design & Discovery. v. 15, p. 488-499, issn: 1570-1808, 2018.
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17. DE ÁVILA, MAURÍCIO BOFF ; BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; AZEVEDO, WALTER. Structural Basis for Inhibition of Enoyl-[Acyl Carrier Protein] Reductase (InhA) from Mycobacterium tuberculosis. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 26, p. 1-13, issn: 0929-8673, 2018.
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18. RUSSO, SILVANA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Advances in the Understanding of the Cannabinoid Receptor 1 - Focusing on the Inverse Agonists Interactions. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 25, p. 1908-1919, issn: 0929-8673, 2018.
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19. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Development of a machine-learning model to predict Gibbs free energy of binding for protein-ligand complexes. BIOPHYSICAL CHEMISTRY. v. 240, p. 63-69, issn: 0301-4622, 2018.
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20. VOLKART, PRISCYLLA ANDRADE ; BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; SOUTO, ANDRE ARIGONY ; de Azevedo, Walter Filgueira. Cyclin-Dependent Kinase 2 in Cellular Senescence and Cancer. A Structural and Functional Review.. CURRENT DRUG TARGETS. v. 20, p. 716-726, issn: 1389-4501, 2018.
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21. LEVIN, N. M. B. ; Pintro VO ; Ávila MB ; de Mattos BB ; DE AZEVEDO, WALTER F.. Understanding the Structural Basis for Inhibition of Cyclin-Dependent Kinases. New Pieces in the Molecular Puzzle. CURRENT DRUG TARGETS. v. 18, p. 1104-1111, issn: 1389-4501, 2017.
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24. DE ÁVILA, MAURÍCIO BOFF ; XAVIER, MARIANA MORRONE ; PINTRO, VAL OLIVEIRA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Supervised machine learning techniques to predict binding affinity. A study for cyclin-dependent kinase 2. BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS. v. 494, p. 305-310, issn: 0006-291X, 2017.
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27. XAVIER, MARIANA ; HECK, GABRIELA ; DE AVILA, MAURÍCIO ; LEVIN, NAYARA ; PINTRO, VAL ; CARVALHO, NATHÁLIA ; AZEVEDO JR., WALTER. SAnDReS a Computational Tool for Statistical Analysis of Docking Results and Development of Scoring Functions. Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening. v. 19, p. 1-1, issn: 1386-2073, 2016.
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28. TELES, CAROLINA BIONI GARCIA ; MOREIRA-DILL, LEANDRO SOARES ; SILVA, ALEXANDRE DE ALMEIDA ; FACUNDO, VALDIR ALVES ; DE AZEVEDO, WALTER F. ; DA SILVA, LUIZ HILDEBRANDO PEREIRA ; MOTTA, MARIA CRISTINA M. ; STÁBELI, RODRIGO GUERINO ; SILVA-JARDIM, IZALTINA. A lupane-triterpene isolated from Combretum leprosum Mart. fruit extracts that interferes with the intracellular development of Leishmania (L.) amazonensis in vitro. BMC Complementary and Alternative Medicine (Online). v. 15, p. 165-174, issn: 1472-6882, 2015.
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30. CORACINI, J. D. ; DE AZEVEDO WF. Shikimate Kinase, a Protein Target for Drug Design. Current Medicinal Chemistry. v. 21, p. 592-604, issn: 0929-8673, 2014.
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31. AVILA, MAURICIO ; JR., WALTER. Data Mining of Docking Results. Application to 3-Dehydroquinate Dehydratase. Current Bioinformatics (Print). v. 9, p. 361-379, issn: 1574-8936, 2014.
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38. AZEVEDO, L. S. ; MORAES, FERNANDA PRETTO ; Xavier MM ; PANTOJA, E. O. ; VILLAVICENCIO, B. ; FINCK, J. A. ; PROENCA, A. M. ; ROCHA, K. B. ; de Azevedo Junior, Walter F.. Recent Progress of Molecular Docking Simulations Applied to Development of Drugs. Current Bioinformatics (Print). v. 7, p. 352-365, issn: 1574-8936, 2012.
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40. DE AZEVEDO WF. Editorial [Hot Topic:Protein targets for development of drugs against Mycobacterium tuberculosis (Guest Editor: Walter Filgueira de Azevedo)]. Current Medicinal Chemistry. v. 18, p. 1255-1257, issn: 0929-8673, 2011.
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41. DE AZEVEDO WF. Molecular Dynamics Simulations of Protein Targets Identified in Mycobacterium tuberculosis. Current Medicinal Chemistry. v. 18, p. 1353-1366, issn: 0929-8673, 2011.
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42. Rocha, Bruno A.M. ; DELATORRE, Plinio ; Oliveira, Taianá M. ; Benevides, Raquel G. ; Pires, Alana F. ; Sousa, Albertina A.S. ; Souza, Luis A.G. ; Assreuy, Ana Maria S. ; Debray, Henri ; Sampaio, Alexandre H. ; CAVADA, Benildo S. ; DE AZEVEDO WF. Structural basis for both pro- and anti-inflammatory response induced by mannose-specific legume lectin from Cymbosema roseum. Biochimie (Paris. Print). v. 93, p. 806-816, issn: 0300-9084, 2011.
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43. Sánchez-Quitian, Zilpa A. ; Timmers, Luís F.S.M. ; Caceres, Rafael A. ; Rehm, Jacqueline G. ; Thompson, Claudia E. ; Basso, Luiz A. ; Santos, Diógenes S. ; DE AZEVEDO WF. Crystal structure determination and dynamic studies of Mycobacterium tuberculosis Cytidine deaminase in complex with products. Archives of Biochemistry and Biophysics (Print). v. 509, p. 108-115, issn: 0003-9861, 2011.
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44. Sá, Matheus S. ; de Menezes, Maria N. ; Krettli, Antoniana U. ; Ribeiro, Ivone M. ; Tomassini, Therezinha C. B. ; Ribeiro dos Santos, Ricardo ; de Azevedo, Walter F ; Soares, Milena B. P. ; DE AZEVEDO WF. Antimalarial Activity of Physalins B, D, F, and G. Journal of Natural Products (Print). v. 74, p. 2269-2272, issn: 0163-3864, 2011.
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45. ARCURI, Helen A ; Zafalon, Geraldo FD ; Marucci, Evandro A ; Bonalumi, Carlos E ; da Silveira, Nelson JF ; Machado, Jose M ; filgueira de azevedo w ; Palma, Mario S. SKPDB: a structural database of shikimate pathway enzymes. BMC Bioinformatics. v. 11, p. 12, issn: 1471-2105, 2010.
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46. Caceres, Rafael Andrade ; Timmers, Luis Fernando Saraiva Macedo ; Pauli, Ivani ; Gava, Lisandra Marques ; Ducati, Rodrigo Gay ; Basso, Luiz Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; de Azevedo Jr., Walter Filgueira. Crystal structure and molecular dynamics studies of human purine nucleoside phosphorylase complexed with 7-deazaguanine. Journal of Structural Biology. v. 169, p. 379-388, issn: 1047-8477, 2010.
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48. Zanchi, Fernando Berton ; Caceres, Rafael Andrade ; Stabeli, Rodrigo Guerino ; Azevedo, Walter Filgueira. Molecular dynamics studies of a hexameric purine nucleoside phosphorylase. Journal of Molecular Modeling. v. 16, p. 543-550, issn: 1610-2940, 2010.
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50. de Azevedo Jr., Walter F. MolDock Applied to Structure-Based Virtual Screening. Current Drug Targets. v. 11, p. 327-334, issn: 1389-4501, 2010.
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51. Hernandes, Marcelo Z. ; Cavalcanti, Suellen Melo T. ; Moreira, Diogo Rodrigo M. ; de Azevedo Junior, Walter Filgueira ; Leite, Ana Cristina Lima. Halogen Atoms in the Modern Medicinal Chemistry: Hints for the Drug Design. Current Drug Targets. v. 11, p. 303-314, issn: 1389-4501, 2010.
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52. Ducati, Rodrigo G. ; Basso, Luiz A. ; Santos, Diógenes S. ; de Azevedo Jr., Walter F.. Crystallographic and docking studies of purine nucleoside phosphorylase from Mycobacterium tuberculosis. Bioorganic & Medicinal Chemistry. v. 18, p. 4769-4774, issn: 0968-0896, 2010.
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Livros publicados/organizados ou edições (1)
1. de Azevedo, Walter Filgueira. Methods in Molecular Biology. 1 ed. New York: Springer New York, 2019. v. 2053, p. 286.
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Capítulos de livros publicados (15)
1. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. How Docking Programs Work. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 35-50.
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2. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. SAnDReS: A Computational Tool for Docking. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 51-65.
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3. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; Veit-Acosta, Martina ; de Azevedo, Walter Filgueira. Electrostatic Energy in Protein¿Ligand Complexes. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 67-77.
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4. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; Veit-Acosta, Martina ; de Azevedo, Walter Filgueira. Van der Waals Potential in Protein Complexes. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.p. 79-91.
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5. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; Veit-Acosta, Martina ; de Azevedo, Walter Filgueira. Hydrogen Bonds in Protein-Ligand Complexes. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 93-107.
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6. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Molecular Dynamics Simulations with NAMD2. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 109-124.
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7. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; PINTRO, VAL OLIVEIRA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Docking with AutoDock4. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 125-148.
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8. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Molegro Virtual Docker for Docking. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 149-167.
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9. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Docking with GemDock. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 169-188.
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10. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Docking with SwissDock. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 189-202.
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11. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Molecular Docking Simulations with ArgusLab. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 203-220.
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12. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Homology Modeling of Protein Targets with MODELLER. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 231-249.
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13. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Machine Learning to Predict Binding Affinity. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 251-273.
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14. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Exploring the Scoring Function Space. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 275-281.
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15. LOMBARDI, F. R. ; ANAZETTI, M. C. ; SANTOS, Giovani Cesar dos ; POLIZELLI, P. P. ; OLIVIERI, Johnny Rizzieri ; de Azevedo, Walter Filgueira ; BONILLA-RODRIGUEZ, G. O.. Oxygen Binding Properties and Tetrameric Stability of Hemoglobins From the Snakes Crotalus Durissus Terrificus and Liophis Miliaris. Em: Ben M. Dunn. (Org.). Oxygen Binding Properties and Tetrameric Stability of Hemoglobins From the Snakes Crotalus Durissus Terrificus and Liophis Miliaris. 1ed. : Bentham. 2014.v. 1, p. 3-30.
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Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (0)
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (3)
1. DE AZEVEDO WF. Biologia de Sistemas Computacional Aplicada ao Desenvolvimento de Fármacos: Um Estudo de Inibidores da Quinase Dependente de Ciclina (CDK). 2018. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
2. DEAZEVEDOJR, W. Astrobiologia. Estamos Sozinhos no Universo?. 2018. Apresentação de Trabalho/Seminário
3. DE AZEVEDO WF. Biologia de Sistemas Computacional Aplicada ao Desenvolvimento de Fármacos. Um Estudo de Inibidores da Protease do HIV-1. 2018. Apresentação de Trabalho/Seminário
Demais tipos de produção bibliográfica (0)

Produção técnica

Programas de computador com registro de patente (0)
Programas de computador sem registro de patente (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (6)
1. AZEVEDO, WALTER; BITENCOURT'FERREIRA, GABRIELA. Tutorials for Docking Simulations. 2021; Tema: Tutorials for Docking Simulations. 2021.
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2. AZEVEDO, WALTER; BITENCOURT'FERREIRA, GABRIELA. SAnDReS. 2021; Tema: Statistical Analysis of Docking Results and Scoring functions. 2021.
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3. AZEVEDO, WALTER; BITENCOURT'FERREIRA, GABRIELA. SFSXplorer. 2021; Tema: Scoring Function Space Explorer. 2021.
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4. BITENCOURT'FERREIRA, GABRIELA ; AZEVEDO, WALTER. Receptor-Ligand Systems Database. 2021; Tema: Receptor-Ligand Systems Database. 2021.
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5. AZEVEDO, WALTER; BITENCOURT'FERREIRA, GABRIELA. azevedolab.net. 2021; Tema: Computational systems biology, computational biology, bioinformatics. 2021.
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6. AZEVEDO, WALTER; BITENCOURT'FERREIRA, GABRIELA. Tool to Analyze the Binding Affinity. 2021; Tema: Tool to Analyze the Binding Affinity. 2021.
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Demais tipos de produção técnica (11)
1. AZEVEDO, WALTER. Curso de Extensão Bioinformática. Uma introdução com a linguagem Python. 2a Edição. 2016. 0. Curso de curta duração ministrado/Extensão
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2. AZEVEDO, WALTER. Curso de Extensão Aprendizado de Máquina. Uma introdução com a linguagem Python. 1a Edição. 2016. 0. Curso de curta duração ministrado/Extensão
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3. AZEVEDO, WALTER. Curso de Extensão Bioinformática. Uma introdução com a linguagem Perl. 3a Edição. 2013. 0. Curso de curta duração ministrado/Extensão
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4. AZEVEDO, WALTER. Curso de Extensão Bioinformática. Uma introdução com a linguagem Perl. 4a Edição. 2013. 0. Curso de curta duração ministrado/Extensão
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5. AZEVEDO, WALTER. Curso de Extensão em Bioinformática. 2013. 0. Curso de curta duração ministrado/Extensão
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6. AZEVEDO, WALTER. Curso de Extensão Bioinformática. Uma introdução com a linguagem Perl. 2a Edição. 2012. 0. Curso de curta duração ministrado/Extensão
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7. AZEVEDO, WALTER. Curso de Extensão Bioinformática. Uma introdução com a linguagem Python. 2012. 0. Curso de curta duração ministrado/Extensão
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8. AZEVEDO, WALTER. Curso de Extensão em Bioinformática. 1a Edição. 2012. 0. Curso de curta duração ministrado/Extensão
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9. AZEVEDO, WALTER. 3SCZ:. 2012. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
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10. AZEVEDO, WALTER. 3IOM: Crystal structure of Purine Nucleoside Phosphorylase from Mycobacterium tuberculosis in complex with 2'-Deoxyguanosine. 2011. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
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11. AZEVEDO, WALTER. 3IJF: Crystal structure of cytidine deaminase from Mycobacterium tuberculosis. 2010. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
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Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (1)
1. Gabriela Bitencourt Ferreira. Estudo das Interações Proteína-Ligante por Abordagens de Aprendizado de Máquina. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2020.
  Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (1)
1. Claudia Elizabeth Thompson. . Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2010.
  Supervisor: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Tese de doutorado (4)

Maurício Boff de Ávila. Modelos Computacionais para previsão de afinidade entre ligantes e proteínas alvos para o desenvolvimento de fármacos. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2020.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Silvana da Cunha Russo. O Receptor Canabinoide 1- Desafios no Desenho de Fármacos com Enfoque nas Ferramentas da Bioinformática.. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2020.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Rafael Andrade Caceres. Estudo estrutural e de dinâmica molecular de enzimas da via metabólica do ácido chiquímico de Mycobacterium tuberculosis: alvos para o desenvolvimento de drogas anti-tuberculose. Tese (Doutorado em Medicina e Ciências da Saúde.) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2012.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Graziela Heberle. Estudo in silico de inibidores de SIRT1. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2011.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Dissertação de mestrado (9)

Rosana da Silva Waszak. Desenvolvimento e Aplicação de Funções Escores Otimizadas para Previsão de Afinidade entre Proteínas e Ligantes. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2020.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Camila Rizzotto. Receptor de Canabinoide 2. Novo Alvo Terapêutico para Tratamento da Osteoporose: Uma Análise da Interação com Ligantes Através da Aplicação de Ferramentas da Bioinformática. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2020.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Maurício Boff de Ávila. Estudo computacional do sistema proteína-ligante. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2015.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Nayara Maria Bernhardt Levin. Estudo computacional da interação de inibidores com quinases dependentes de ciclina. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2015.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Fernanda Pretto Moraes. Computação biologicamente inspirada aplicada ao estudo da interação proteína-ligante. Dissertação (Mestrado em Medicina e Ciências da Saúde.) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2012.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Carolina Pasa Vianna. Identificação de ligantes da chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis por docking molecular. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2011.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Kelen Beiestorf Rocha. Virtual screening e dinâmica molecular para identificação de inibidores da enzima corismato sintase de Mycobacterium tuberculosis. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2011.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Luís Fernando Saraiva Macedo Timmers. Estudo estrutural de alvos para desenho de drogas anti-tuberculose. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2011.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Juliane Dors Coracini. Simulação computacional do sistema proteína-ligante. Dissertação (Mestrado em Medicina e Ciências da Saúde.) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2011.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (7)

Horizontino Souza dos Santos. Pesquisa de Potenciais Inibidores para a Proteína CDK2 a partir de Banco de dados de Produtos Naturais.. (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em Bioinformática) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2020.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Richard Rene Pereira. Avaliação de Possíveis Moléculas Inibidoras da Enzima Chiquimato Quinase de Mycobacterium tuberculosis Utilizando Metodologias de Docking Molecular. (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em Bioinformática) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2018.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Silvana da Cunha Russo.. O Receptor Canabinoide 1. Análise Estrutural com Enfoque no Estudo dos Agonistas Inversos Usando as Ferramentas da Bioinformática.. (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em Bioinformática) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2018.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Taís Silveira Assmann. Investigação dos Genes Alvos da Família hsa-miR-29-3p e sua Possível Participação na Doença Renal do Diabetes. (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em Bioinformática) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2018.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Amauri Duarte da Silva. Taba: A Tool to Analyze the Binding Affinity.. (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em Bioinformática) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2017.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Karim Ebert Pinedo. Leucemia Linfoide Aguda: Um Estudo Computacional sobre Possíveis Inibidores. (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em Bioinformática) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2017.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Moises Zotti. Funções escores e termos de energia em estruturas resolvidas por NMR. (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em Farmacologia e Toxicologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2016.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Trabalho de conclusão de curso de graduação (1)

Tales Ferraz de Paula. Método de Regressão Linear Múltipla Aplicado em Dados Gravimétricos. (Graduação em Física) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2020.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Iniciação científica (7)

Joana Retzke Godoy. Estudo de Alvos para Descoberta de Fármacos Contra a COVID-19. (Graduando em Biomedicina) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2020.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Gabriela Bitencourt Ferreira. Estudo Computacional da Interação Proteína-Ligante. (Graduando em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. 2019.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Bianca Villavicencio. Estudo computacional do sistema proteína-ligante. (Graduando em Biologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. 2011.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Mariana Morrone Xavier. Estudo computacional do sistema proteína-ligante. (Graduando em Medicina) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2011.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Kaluti Rossi de Martini Moraes. Estudo computacional do sistema proteína-ligante. (Graduando em Física Médica) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul. 2011.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Luciele Gonzaga Ribeiro. Estudo da interação proteína-ligante por meio de dinâmica molecular. (Graduando em Biologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2010.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Eduarda Ozório Pantoja. Uso de abordagens in silico para identificação de inibidores da enzima acetilcolina esterase (EC 3.1.1.7). (Graduando em Biologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2010.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Orientações de outra natureza (0)

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (2)

2018-Atual. Taba: A Tool to Analyze the Binding Affinity
Descrição: The basic idea behind the Taba (da Silva et al., 2020) is that we find in the 3D structures of protein-ligand complexes the structural features responsible for ligand-binding affinity. When we consider an ensemble of crystallographic structures, for which ligand-binding information data is available, we have the raw data that the program Taba uses to generate a target-based polynomial scoring function. Taba reads all structures available for a protein system of interest and calculates the average distances for each type of pair of atoms. For instance, consider intermolecular Carbon-Carbon distances, where one Carbon belongs to the protein and the second one is in the ligand. Taba calculates the average intermolecular distance for the Carbon-Carbon pair. Taba considers this length the equilibrium distance for a Carbon-Carbon pair, taking an analogy with a mass-spring system. For a given structure, displacement from this equilibrium distance generates an increase in the system energy. Taba applies supervised machine learning techniques (Bitencourt-Ferreira et al., 2021; Bitencourt-Ferreira and de Azevedo, 2019) available in scikit-learn (Pedregosa et al., 2011) to generate targeted-scoring functions. Additional information: https://azevedolab.net/taba.php References: Bitencourt-Ferreira G, de Azevedo WF Jr. Machine Learning to Predict Binding Affinity. Methods Mol Biol. 2019; 2053: 251?273. Bitencourt-Ferreira G, da Silva AD, de Azevedo WF Jr. Application of Machine Learning Techniques to Predict Binding Affinity for Drug Targets. A Study of Cyclin-Dependent Kinase 2. Curr Med Chem. 2021; 28(2): 253?265. Da Silva AD, Bitencourt-Ferreira G, de Azevedo WF Jr. Taba: A Tool to Analyze the Binding Affinity. J Comput Chem. 2020; 41(1): 69?73. Pedregosa F, Varoquaux G, Gramfort A, Michel V, Thirion B, Grisel O, Blondel M, Prettenhofer P, Weiss R, Dubourg V, Verplas J, Passos A, Cournapeau D, Brucher M, Perrot M, Duchesnay E. Scikit-learn: Machine Learning in Python. J Mach Learn Res. 2011; 12: 2825?2830.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (3) . Integrantes: Walter Filgueira de Azevedo Junior - Coordenador / AVILA, MAURICIO - Integrante / BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA - Integrante / Amauri Duarte da Silva - Integrante / Silvana Cunha Russo - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
2016-Atual. SAnDReS: Statistical Analysis of Docking Results and Scoring functions
Descrição: SAnDReS (Xavier et al., 2016) draws inspiration from several protein-ligand projects that we have been working on in the last decades. These projects began in the 1990s with pioneering studies focused on intermolecular interactions between cyclin-dependent kinase and inhibitors (de Azevedo et al., 1996; 1997). SAnDReS is a free and open-source (GNU General Public License) software developed using Python programming language. SAnDReS is a tool for statistical analysis of docking simulations and machine-learning modeling (Pedregosa et al., 2011). We applied this program to several datasets comprised of crystallographic structures for which there is information for the ligand-binding affinity to generate scoring functions tailored to the protein system of interest (Bitencourt-Ferreira & de Azevedo, 2019; Bitencourt-Ferreira et al., 2021). Additional information here: https://azevedolab.net/sandres.php Bitencourt-Ferreira G, de Azevedo WF Jr. SAnDReS: A Computational Tool for Docking. Methods Mol Biol. 2019; 2053: 51?65. Bitencourt-Ferreira G, Rizzotto C, de Azevedo Junior WF. Machine Learning-Based Scoring Functions. Development and Applications With SAnDReS. Curr Med Chem. 2021; 28(9): 1746?1756. De Azevedo WF Jr, Mueller-Dieckmann HJ, Schulze-Gahmen U, Worland PJ, Sausville E, Kim SH. Structural basis for specificity and potency of a flavonoid inhibitor of human CDK2, a cell cycle kinase. Proc Natl Acad Sci U S A. 1996; 93(7): 2735?2740. De Azevedo WF, Leclerc S, Meijer L, Havlicek L, Strnad M, Kim SH. Inhibition of cyclin-dependent kinases by purine analogues: crystal structure of human cdk2 complexed with roscovitine. Eur J Biochem. 1997; 243(1-2): 518?526. Pedregosa F, Varoquaux G, Gramfort A, Michel V, Thirion B, Grisel O, Blondel M, Prettenhofer P, Weiss R, Dubourg V, Verplas J, Passos A, Cournapeau D, Brucher M, Perrot M, Duchesnay E. Scikit-learn: Machine Learning in Python. J Mach Learn Res. 2011; 12: 2825?2830. Xavier MM, Heck GS, de Avila MB, Levin NM, Pintro VO, Carvalho NL, Azevedo WF Jr. Comb Chem High Throughput Screen. 2016; 19(10): 801-812.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Walter Filgueira de Azevedo Junior - Coordenador / AVILA, MAURICIO - Integrante / BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA - Integrante / Amauri Duarte da Silva - Integrante / Silvana Cunha Russo - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Número de produções C, T & A: 8
Membro: Walter Filgueira de Azevedo Junior.

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (1)

Most influential researchers in the world according to a database created by Journal Plos Biology (https://doi.org/10.1371/journal.pbio.300091, Journal of PLOS Biology.. 2020.
Membro: Walter Filgueira de Azevedo Junior.

Participação em eventos

Total de participação em eventos (0)

Organização de eventos

Total de organização de eventos (1)

DE AZEVEDO, WF.. Curso de Cristalografia de Proteínas-FIOCRUZ/Salvador-BA. 2007. (Outro).. . 0.

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (5)

Walter Filgueira de Azevedo Junior ⇔ Milena Botelho Pereira Soares (2.0)
Soares, Milena B.P.; Silva, Cinara V. ; Bastos, Tanira M. ; Guimarães, Elisalva T. ; Figueira, Claudio P. ; Smirlis, Despina ; Azevedo, Walter F.. Anti-Trypanosoma cruzi activity of nicotinamide. Acta Tropica. v. 122, p. 224-229, issn: 0001-706X, 2012.
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Sá, Matheus S. ; de Menezes, Maria N. ; Krettli, Antoniana U. ; Ribeiro, Ivone M. ; Tomassini, Therezinha C. B. ; Ribeiro dos Santos, Ricardo ; de Azevedo, Walter F ; Soares, Milena B. P. ; DE AZEVEDO WF. Antimalarial Activity of Physalins B, D, F, and G. Journal of Natural Products (Print). v. 74, p. 2269-2272, issn: 0163-3864, 2011.
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Walter Filgueira de Azevedo Junior ⇔ Maria Martha Campos (1.0)
AMARAL, MARIA EDUARDA AZAMBUJA ; NERY, LAURA ROESLER ; LEITE, CARLOS EDUARDO ; de Azevedo Junior, Walter Filgueira ; CAMPOS, MARIA MARTHA. Pre-clinical effects of metformin and aspirin on the cell lines of different breast cancer subtypes. INVESTIGATIONAL NEW DRUGS. v. 36, p. 1-15, issn: 0167-6997, 2018.
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Walter Filgueira de Azevedo Junior ⇔ Rodrigo Guerino Stabeli (1.0)
TELES, CAROLINA BIONI GARCIA ; MOREIRA-DILL, LEANDRO SOARES ; SILVA, ALEXANDRE DE ALMEIDA ; FACUNDO, VALDIR ALVES ; DE AZEVEDO, WALTER F. ; DA SILVA, LUIZ HILDEBRANDO PEREIRA ; MOTTA, MARIA CRISTINA M. ; STÁBELI, RODRIGO GUERINO ; SILVA-JARDIM, IZALTINA. A lupane-triterpene isolated from Combretum leprosum Mart. fruit extracts that interferes with the intracellular development of Leishmania (L.) amazonensis in vitro. BMC Complementary and Alternative Medicine (Online). v. 15, p. 165-174, issn: 1472-6882, 2015.
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Walter Filgueira de Azevedo Junior ⇔ Antonio Egidio Nardi (1.0)
de Azevedo Junior, Walter F. Meet Our Editorial Board Member. CNS & Neurological Disorders. Drug Targets. v. 11, p. 393-393, issn: 1574-8936, 2016.
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Walter Filgueira de Azevedo Junior ⇔ Ihosvany Camps Rodríguez (1.0)
FREITAS, POLIANY G. ; ELIAS, THIAGO C. ; PINTO, ICARO A. ; COSTA, LUCIANO T. ; DE CARVALHO, PAULO V.S.D. ; DE Q. OMOTE, DANIEL ; Camps, Ihosvany ; ISHIKAWA, TATI ; ARCURI, HELEN A. ; VINGA, SUSANA ; OLIVEIRA, ARLINDO L. ; JUNIOR, WALTER F.A. ; DA SILVEIRA, NELSON J.F.. Computational Approach to the Discovery of Phytochemical Molecules with Therapeutic Potential Targets to the PKCZ protein. Letters in Drug Design & Discovery. v. 15, p. 488-499, issn: 1570-1808, 2018.
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(*) Relatório criado com produções desde 2010 até 2021
Data de processamento: 06/11/2021 15:22:34

Relatório gerado por scriptLattes V8.11. Os resultados estão sujeitos a falhas devido a inconsistências no preenchimento dos CVs Lattes. E-mail de contato: henriquimicosp@gmail.com