Especialistas Seniores em Covid-19 com atuação no Brasil

Rommel Thiago Juca Ramos

Formado em Análise de Sistemas e Engenharia de Computação, com especialização em Redes de Computadores e Engenharia de Software pela Universidade Federal do Pará. Já atuou como Programador, Analista de Sistemas, Administrador de Banco de dados antes de iniciar o mestrado em Genética e Biologia Molecular (Bioinformática) - UFPA, onde também concluiu doutorado (2012). Atualmente é professor Associado I da Faculdade de Biotecnologia (ICB/UFPA) e atual diretor (2020-2021). Orientador nos Programas de Pós-graduação: Bioinformática - UFMG (CAPES 7), Genética e Biologia Molecular - UFPA (CAPES 6), Biotecnologia - UFPA (CAPES 5) e Ciência da Computação - UFPA (CAPES 4). Quanto a pesquisa, realiza análises de dados NGS desde 2009, atualmente com foco em genômica e metagenômica, além de desenvolver ferramentas computacionais para manipulação e integração biológicos. Eleito membro afiliado da Academia Brasileira de Ciências (2018-2022) e Coordenador da Área de Genética de Microrganismos e Bioinformática da Sociedade Brasileira de Microbiologia (SBM) de 2020-2021. Já orientou 14 iniciações científicas, 9 dissertações e 3 teses. var _gaq = _gaq || []; _gaq.push(['_setAccount', 'UA-27691971-1']); _gaq.push(['_trackPageview']); (function() { var ga = document.createElement('script'); ga.type = 'text/javascript'; ga.async = true; ga.src = ('https:' == document.location.protocol ? 'https://ssl' : 'https://www') + '.google-analytics.com/ga.js'; var s = document.getElementsByTagName('script')[0]; s.parentNode.insertBefore(ga, s); })(); (Texto informado pelo autor)

  • https://lattes.cnpq.br/1274395392752454 (18/10/2021)
  • Rótulo/Grupo:
  • Bolsa CNPq: Nível 1D
  • Período de análise:
  • Endereço: Universidade Federal do Pará, Instituto de Ciências Biológicas, Centro de Genômica e Biologia de Sistemas. Rua Augusto Corrêa, 01 Guamá 66075970 - BELEM, PA - Brasil Telefone: (91) 32018426 URL da Homepage: https://www.genoma.ufpa.br
  • Grande área: Ciências Biológicas
  • Área: Genética
  • Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

Prêmios e títulos

Participação em eventos

Organização de eventos

Lista de colaborações


Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

  • Total de projetos de pesquisa (25)
    1. 2020-Atual. Estimativa da qualidade da agua na bacia de Yaque del Norte atraves de uma rede de sensores moveis de baixo custo.
      Descrição: A proposta parte de duas questões fundamentais: qual o impacto das ações antrópicas na qualidade das águas do rio Yaque del Norte? 2) Qual o impacto das mudanças climáticas na disponibilidade e qualidade da água na bacia do rio Yaque del Norte? As respostas a essas perguntas são de extrema importância devido a suas implicações em termos de gestão abrangente dos recursos hídricos, gestão da qualidade ambiental e adaptação às mudanças climáticas na República Dominicana. Para responder a essas perguntas, são propostas estratégias metodológicas e tecnológicas que incluem: 1) monitoramento da qualidade da água com sensores remotos de baixo custo, 2) estimativa do impacto das mudanças climáticas na qualidade da água através dos dados coletados e 3 ) Estabelecimento de uma rede de monitoramento da qualidade da água na bacia. Além disso, a análise dos dados será realizada usando técnicas de aprendizado de máquina para identificar padrões e inter-relações relevantes nos dados, o que reduzirá o impacto das mudanças climáticas e melhorará a qualidade desse importante rio. As informações coletadas integrarão a plataforma web do Observatório de Mudanças Climáticas e Resiliência do INTEC. A disponibilidade de informações para fins de pesquisa, formulação de políticas públicas, tomada de decisão e treinamento da comunidade científica e acadêmica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Coordenador / FRANCO, EDIAN F. - Integrante.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    2. 2020-Atual. Mapeo de resistomas en los rios Yaque del Norte y Yaque del Sur y sus implicaciones para la salud humana.
      Descrição: The study of microbial diversity and its metabolism, as well as its mechanisms for antibiotic resistance, is an emerging frontier of the biological, environmental and biotechnological sciences. New genetic techniques such as New Generation Sequencing and Metagenomics allow investigators access to the microbial genetic patrimony, in addition to evaluation and mapping of the existing microbial diversity in studied habitats. In the city of Santo Domingo, watersheds from the main rivers in the Dominican Republic. These affluent are being used habitually by the neighboring communities. In their trajectories, these rivers exhibit several regions that directly or indirectly contact uncontrolled urban growth and highly industrialized zones. Anthropic action comes from the nearby city and neighborhoods, as well as industries contributing to landfill the main watersheds, which can be translated into serious health problems for marine species, and could bring problematic human pathologies, both of which could possibly be avoided if the right approach is taken. The purpose of this inquiry is the characterization of the microbial diversity present in these zones, identify their resistomes and transference mechanisms for antibiotic resistance between the environment and human populations. The comprehension of the microbial communities will allow the development of effective strategies and methodologies in favor of safekeeping a healthy environment, to which adjoining populace will have access with exposure to a microorganism capable of impairing their quality of life. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / FRANCO, EDIAN F. - Coordenador.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    3. 2018-Atual. Acoes em biotecnologia, omicas e bioinformatica para o fortalecimento do agronegocio na Amazonia
      Descrição: O estado do Pará é o maior produto de palma de óleo do Brasil, esta cadeia produtiva é centrado na palma de óleo africana e do seu hibrido, porém poucos estudos avaliam suas diferenças genéticas que podem levar ao incremento na produção de óleo e utilização na nutrição animal. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (4) . Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Coordenador / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / Jefferson Magalhães de Moraes - Integrante / GÓES-NETO, ARISTÓTELES - Integrante / NELSON CRUZ SAMPAIO NETO - Integrante / Igor Hamoy - Integrante / Bianchi Serique - Integrante.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    4. 2018-Atual. Prospeccao da resistencia a antibioticos y diversidade microbiana nos afluentes circundantes da Cidade de Santo Domingo, atraves de tecnicas de metagenomica y NGS
      Descrição: objetivo desta pesquisa é caracterizar a diversidade microbiana, assim como identificar e caracterizar a resistência e mecanismos de transferência de resistência a antibióticos entre o ambiente e o homem, nos rios que circundam a cidade Santo Domingo na Republica Dominicana. O entendimento das comunidades microbianas permitirá o desenvolvimento de estratégias e metodologias com o objetivo de reduzir o impacto e os riscos que as bactérias resistentes a antibióticos podem causar.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Coordenador / Edian Franklin Franco de los santos - Integrante.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    5. 2018-Atual. Prospeccion de la resistencia a antibioticos y diversidad microbiana en los afluentes circundantes de la ciudad de Santo Domingo, a traves de tecnicas de metagenomica y NGS
      Descrição: O objetivo desta pesquisa é caracterizar a diversidade microbiana, assim como identificar e caracterizar a resistência e mecanismos de transferência de resistência a antibióticos entre o ambiente e o homem, nos rios que circundam a cidade Santo Domingo na Republica Dominicana. O entendimento das comunidades microbianas permitirá o desenvolvimento de estratégias e metodologias com o objetivo de reduzir o impacto e os riscos que as bactérias resistentes a antibióticos podem causar. Assim, criaremos um banco de dados de monitoramento ambiental apresentando as características de cada uma das áreas impactadas. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (3) . Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Coordenador / Artur Luis da Costa da Silva - Integrante / Rafael Baraúna - Integrante / Omar Paíno Perdomo Sánchez - Integrante / Luis Enrique Rodríguez - Integrante / Edian Franklin de Los Santos - Integrante / Rosanna Carreras - Integrante / Víctor V. Calderón SotoEsperanza E. Mendoza Reyes - Integrante. Financiador(es): Instituto Tecnológico de Santo Domingo - Cooperação.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    6. 2018-Atual. Acoes em biotecnologia, omicas e bioinformatica para o fortalecimento do agronegocio na Amazonia
      Descrição: O estado do Pará é o maior produto de palma de óleo do Brasil, esta cadeia produtiva é centrado na palma de óleo africana e do seu hibrido, porém não existem estudos que caracterizem suas diferenças genéticas que podem levar ao incremento na produção de óleo e utilização na nutrição animal.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Vasco - Integrante / Luís Carlos Guimarães - Integrante / Jefferson Magalhães de Moraes - Integrante / NELSON CRUZ SAMPAIO NETO - Integrante / Igor Hamoy - Coordenador / Bianchi Serique - Integrante / Roberto Lisboa Cunha - Integrante / ELISA FERREIRA MOURA CUNHA - Integrante / GISELE BARATA DA SILVA - Integrante / EDNALDO DA SILVA FILHO - Integrante / MARIA DO SOCORRO PADILHA DE OLIVEIRA - Integrante / REGINALDO ALVES FESTUCCI BUSELLI - Integrante / LUCIANA GATTO BRITO - Integrante / PRISCILA DI PAULA BESSA SANTANA - Integrante / RAFAEL BORGES DA SILVA VALADARES - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    7. 2017-Atual. Estudo do Interatoma de Corynebacterium pseudotuberculosis em linhagem celular de Mus musculus
      Descrição: Universal 01/2016 - Faixa B. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (6) / Doutorado: (6) . Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Coordenador / Vasco - Integrante / Pacheco, Luis G. C. - Integrante / Flavia Aburjaile - Integrante / BARAUNA, R. A. - Integrante / Artur Luiz Da Costa da Silva - Integrante / Siomar Castro Soares - Integrante / Adriana R Carneiro - Integrante / Luís Carlos Guimarães - Integrante / Adonney Allan de Oliveira Veras - Integrante / kenny C Pinheiro - Integrante / Yan Pantoja - Integrante / LOPES DE SOUSA, AILTON - Integrante / Jefferson Magalhães de Moraes - Integrante / Amalia Raiana Fonseca Lobato - Integrante / Gabriel Rosa Santos Muge - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    8. 2015-2019. ARTEMan:Transferencia de resistencia a antibioticos entre o Ambiente e o Homem
      Descrição: Projeto de cooperação internacional FCT CAPES Edital CAPES-FCT 039/2014. Universidade de Aveiro Profa. Dra. Isabel da Silva Henriques.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Artur Luis da Costa da Silva - Coordenador / Adriana R Carneiro - Integrante / Isabel da Silva Henriques - Integrante / Baraúna, Rafael Azevedo - Integrante.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    9. 2015-Atual. Identificacao de Proteinas Efetoras do Sistema de Secrecao Tipo VII de Corynebacterium pseudotuberculosis sob condicoes de estresse biologicamente relevantes e avaliacao dos seus papeis nos mecanismos de interacao com o hospedeiro
      Descrição: A linfadenite caseosa é uma enfermidade crônica causada por bactérias Gram-positivas, intracelulares facultativas, da espécie Corynebacterium pseudotuberculosis, que acomete pequenos ruminantes. Essa bactéria pode infectar tanto animais de importância econômica (por ex. caprinos, ovinos, bovinos e equinos) quanto animais silvestres e o homem. A patologia é caracterizada pela presença de granulomas nos linfonodos viscerais e superficiais, ocasionando grandes perdas econômicas decorrente da condenação de carcaças, pele e reprodutividade reduzida. No Brasil, estimativas demonstram que a maior parte dos rebanhos esteja infectada, fato esse que é agravado pela inexistência de métodos profiláticos satisfatórios para o controle da LC. Ainda há um conhecimento restrito sobre os determinantes moleculares de virulência de C. pseudotuberculosis, bem como sobre o controle da sua expressão gênica. Sabe-se que durante o processo infeccioso, essa bactéria é exposta a uma gama de diferentes ambientes, desde o ponto de entrada no hospedeiro, passando pelo sistema linfático, até a replicação intracelular dentro de macrófagos e o estabelecimento de lesões. Dessa forma, a resposta bacteriana aos estresses intracelulares representa um importante fator atuante nesse processo. Muitas proteínas secretadas por agentes patogênicos são liberadas ou "injetadas" às células hospedeiras para modificar a fisiologia celular e promover a colonização com o auxílio de proteínas efetoras e toxinas. Uma maquinaria de secreção específica das bactérias Gram-positivas é o sistema do tipo VII (T7SS), que tem sido amplamente descrito em M. tuberculosis por ser constituído de três proteínas essenciais para a virulência desta bactéria. Há relatos da presença desse sistema nas corinebactérias, mas não tem sido estudado profundamente até o momento. Nesse contexto, o objetivo deste projeto é identificar e avaliar as proteínas efetoras (PEs) do T7SS de C. pseudotuberculosis, levando em consideração as condições do ambiente intracelular. Para isso, iremos submeter a bactéria à condições de estresse e identificar as proteínas diferencialmente expressas. Paralelamente, serão geradas linhagens mutantes para PEs do T7SS para avaliar a viabilidade dos macrófagos infectados com essas linhagens. Finalmente, iremos avaliar a persistência da enfermidade em camundongos após a infecção com as linhagens mutantes, assim como a produção de citocinas. Esperamos que através desse projeto novas PEs importantes para a virulência de C. pseudotuberculosis sejam identificadas sob condições de estresse, e assim possamos avançar nossos estudos na busca por métodos mais eficazes para controlar as doenças causadas por esse patógeno. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Artur Luis da Costa da Silva - Coordenador / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / SEYFFERT, NUBIA - Integrante. Financiador(es): CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social - Auxílio financeiro.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    10. 2014-Atual. Rede de Cooperacao Academica em Genomica Funcional e Biologia De Sistemas de Microrganismos
      Descrição: EDITAL N 071/2013 - PROGRAMA NACIONAL DE COOPERAÇÃO ACADÊMICA - PROCAD.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Artur Luis da Costa da Silva - Coordenador / Vasco - Integrante / Adriana R Carneiro - Integrante / Andrea Kelly Ribeiro dos Santos - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
      Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / Artur Luiz Da Costa da Silva - Coordenador / Adriana R Carneiro - Integrante / Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / ANDREA KELLY RIBEIRO DOS SANTOS - Integrante.
      Membro: Vasco Ariston de Carvalho Azevedo.
    11. 2014-Atual. Estudo do interatoma e exossoma em Corynebacterium pseudotuberculosis para pesquisa de novos alvos terapeuticos
      Descrição: Micro-organismos do gênero Corynebacterium são classificados no grupo CMNR, do qual também fazem parte os gêneros Mycobacterium, Nocardia e Rhodococcus. Este compreende um dos grupos mais importantes do domínio bactéria, pois contém espécies de interesse médico, veterinário e biotecnológico (Khamis et al., 2004; Dorella et al., 2006). Dentre estas espécies podemos destacar o patógeno de animais Corynebacterium pseudotuberculosis, que é o agente etiológico da linfadenite caseosa (CLA caseous lymphadenitis), uma doença que acomete principalmente ovinos e caprinos ao redor de todo o mundo (Dorella et al., 2006). Mundialmente, o Agronegócio vem sofrendo perdas consideráveis em decorrência da infecção provocada pela bactéria patogênica C. pseudotuberculosis em seus diferentes hospedeiros. Esta bactéria foi inicialmente identificada como micro- organismo causador da linfadenite caseosa em caprinos e ovinos, porém também já foi isolada de outras espécies, como camelídeos, bovinos, bubalinos, equinos causando linfangite ulcerativa e até em humanos (Yeruham et al., 2004; Williamson, 2001; Selim, 2001), e ainda não existem soluções para combater eficientemente as doenças provocadas por este micro-organismo. O Brasil tornou-se referência na análise molecular desta espécie, e até junho de 2013, 15 linhagens de C. pseudotuberculosis foram isoladas e tiveram seus genomas sequenciados e analisados, revelando importantes características da espécie e agregando novos conhecimentos a cerca da problemática econômica e biológica da C. pseudotuberculosis (Soares et al., 2013). A linfadenite caseosa, caracteriza-se pela formação de abscessos contendo pus de coloração amarelo esverdeado e consistência viscosa. Pode ocorrer sob duas formas clínicas, uma superficial que acomete os linfonodos palpáveis (LC externa), e outra forma visceral que acomete os linfonodos internos (LC visceral) e órgãos como pulmão, rim, fígado (Dorella et al., 2006). O tratamento é feito principalmente pelo uso de antibióticos, porém apresenta um custo elevado e é pouco eficaz, uma vez que as drogas não penetram na cápsula dos abscessos. Por isso a importância de se desenvolver uma vacina potente, segura e realmente protetora. Algumas vacinas já vêm sendo pesquisadas, inclusive de DNA, mas o resultado ainda não é satisfatório (Dorella et al., 2006; Baird & Fontaine, 2007). O diagnóstico da linfadenite caseosa é principalmente clínico. Observa-se no animal acometido, a formação de grandes caroços, geralmente na cabeça, mandíbula e pescoço. Por ser contagiosa, a doença propaga-se nos rebanhos principalmente pelo contato direto entre animais. Em alguns casos, a infecção produz poucos sintomas evidentes, permanecendo indetectável até que um exame post-mortem seja realizado. Assim, o diagnóstico clínico tardio é um dos principais problemas (Alves & Pinheiro, 2000). Quando se verifica a lesão nodular (o caroço), o animal já pode estar francamente comprometido, com perda de peso e do rendimento da produção de carne e/ou leite. Neste caso a única solução, para evitar a propagação, é o descarte de animais acometidos, inclusive a carcaça, não havendo sequer o aproveitamento do couro (Veschi, 2005). O tamanho e a severidade da lesão dependem do número inicial de microrganismo que penetraram no tecido do hospedeiro, da velocidade de multiplicação do microrganismo e da susceptibilidade do hospedeiro em se defender da bactéria, entretanto isso parece ter pouca relação com a duração da infecção. A patogenia tem início quando bactérias penetram no organismo, se multiplicam e são fagocitadas. A sobrevivência intracelular em fagócitos é o principal fator para a disseminação e a eventual formação dos abscessos, que é mediado pelos fatores de virulência (Jolly, 1966).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (3) . Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Artur Luis da Costa da Silva - Integrante / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / Adriana Ribeiro Carneiro - Coordenador. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
      Descrição: Existe uma dificuldade na eliminação da C. pseudotuberculosis por macrófagos, e desvendar como ocorre a interação entre patógeno e hospedeiro, conhecer a cascata de resposta em nível transcricional, nos dois organismos simultaneamente, bem como elucidar o efeito do exossoma secretado na resposta imune do hospedeiro, abriria um leque de tentativas para busca de soluções eficazes contra este problema enfrentado. Tanto o patógeno quanto o hospedeiro buscam uma resposta rápida, adaptativa, eficaz para a própria sobrevivência. Assim, perceber a alteração no ambiente e transmitir a informação montando uma rede de resposta ideal é o ponto chave para entender todo o processo para manutenção dos organismos no ambiente. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (2) . Integrantes: Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / Adriana R Carneiro - Coordenador / Artur Luiz da Costa da Silva - Integrante / Bruno Walter Santos Sobral - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
      Membro: Vasco Ariston de Carvalho Azevedo.
    12. 2014-Atual. O genoma do bufalo do Marajo
      Descrição: Recentes avanços na biologia molecular tem levado a uma rápida obtenção de genomas completos de animais domésticos. Em relação a genômica aplicada a pecuária foram identificadas regiões gênicas ligadas a produção e qualidade do leite e queijo, a incidência de doenças hereditárias, resistência e susceptibilidade a verminose, maciez e marmoreio da carne, ganho de peso, entre outras. A tendência é um aumento na geração de novas informações sobre regiões gênicas e genes que possam influenciar na produção, saúde e qualidade das populações de animais criadas para alimentação humana. Estas informações tiveram um grande impacto no delineamento de novas opções tecnológicas para os sistemas produtivos, destacando-se as associadas ao melhoramento genético. Os programas de melhoramento genético animal estão baseados na correta identificação de animais superiores, que serão os progenitores das futuras gerações. Técnicas reprodutivas, tais como inseminação artificial e transferência de embriões, vêm sendo utilizadas pelos pesquisadores para aumentar o número de progênies de animais geneticamente superiores. Em 2008 o Governo do Pará implanta sua Rede Genoma consolidando a competência em Genômica e Bioinformática na Região Amazônica. Esta ação governamental visa a oferta de serviços biotecnológicos que atendam à demanda da sociedade paraense e da região. Atividades de pesquisa e ensino desenvolvidas na Rede Genoma Pará permitiram a criação de um núcleo atuante em Genômica e Bioinformática no Brasil, que hoje conta com 51 projetos de sequenciamento de micro-organismos no NCBI, fazendo deste programa de pesquisa o maior colaborador latino americano junto ao NCBI. Um outro feito que merece destaque foi a recente publicação do primeiro genoma de um ameríndio realizado integralmente na UFPA.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Artur Luis da Costa da Silva - Coordenador / Silvanira - Integrante / Adriana R Carneiro - Integrante. Financiador(es): Fundação Amazônia Paraense de Amparo à Pesquisa - Auxílio financeiro.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    13. 2013-2016. CoryDB - um ambiente computacional para integracao de estudos genomicos e transcriptomicos de Corynebacterium pseudotuberculosis
      Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (8) . Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Coordenador / Artur Luis da Costa da Silva - Integrante / Anne Cybelle Pinto - Integrante / Pacheco, Luis G. C. - Integrante / Schneider, Maria P. - Integrante / RIBEIRO CARNEIRO, A. - Integrante / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá - Integrante / Joana Montezano Marques - Integrante.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
      Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / Adriana R Carneiro - Integrante / Anne Cybelle Pinto - Integrante / Rommel Thiago Juca Ramos - Coordenador.
      Membro: Vasco Ariston de Carvalho Azevedo.
    14. 2013-Atual. Analise Pangenomica de Corinebacterias Patogenicas Emergentes
      Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Artur Luis da Costa da Silva - Coordenador / Anne Cybelle Pinto - Integrante / Barauna - Integrante / Thiago Lopes - Integrante / CARNEIRO, ADRIANA - Integrante / GRAÇAS, DIEGO A - Integrante / FILHO, LUCIANO C F - Integrante / Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá - Integrante / Fernanda Alves Dorella - Integrante / Adonney Allan de Oliveira Veras - Integrante.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
      Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / Artur Luiz Da Costa da Silva - Coordenador / Adriana R Carneiro - Integrante / Anne Cybelle Pinto - Integrante / Rommel T J Ramos - Integrante / Siomar de Castro Soares - Integrante / Rafael Baraúna - Integrante.
      Membro: Vasco Ariston de Carvalho Azevedo.
    15. 2013-Atual. Avaliacao do Potencial de Biorremediacao da Amazonia Atlantica pela Industria de Petroleo
      Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Artur Luis da Costa da Silva - Coordenador / Vivian Pellizari - Integrante / Adriana R Carneiro - Integrante.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    16. 2013-Atual. Rede de cooperacao academica para o estudo e desenvolvimento de ferramentas para a genomica estrutural e funcional
      Descrição: CAPES Edital nº 51/2013 BIOLOGIA COMPUTACIONAL. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Artur Luis da Costa da Silva - Integrante / Vasco - Coordenador / CARNEIRO, ADRIANA - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    17. 2013-Atual. Analise do perfil transcricional de Corynebacterium pseudotuberculosis biotipo equi sob condicoes de estresses ambientais
      Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Artur Luis da Costa da Silva - Integrante / Vasco - Integrante / Anne Cybelle Pinto - Integrante / Adriana R Carneiro - Coordenador.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
      Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / Artur Luiz Da Costa da Silva - Integrante / Anne Cybelle Pinto - Integrante / Adriana R Carneiro - Coordenador / Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
      Membro: Vasco Ariston de Carvalho Azevedo.
    18. 2013-Atual. A Vida Microbiana na Criosfera Antartica: Mudancas Climaticas e Bioprospeccao (MICROSFERA)
      Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Artur Luis da Costa da Silva - Coordenador / Vivian Pellizari - Integrante / Adriana R Carneiro - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    19. 2013-Atual. Avaliacao do Potencial de Biorremediacao da Amazonia Atlantica pela Industria de Petroleo
      Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Artur Luis da Costa da Silva - Coordenador / Vivian Pellizari - Integrante / GRAÇAS, DIEGO A - Integrante / Adriana R Carneiro - Integrante.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    20. 2013-Atual. Reconstrucao e Modelagem de Vias Metabolicas em Escala de Genoma da Cianobacteria Microcystis aeruginosa SPC777
      Descrição: O projeto visa Identificar vias metabólicas da Microcystis aeruginosa SPC77 a partir do genoma completo do micro-organismo, desenvolver modelo in silico da Microcystis aeruginosa SPC77 e usar este modelo para identificar produtos de interesse biotecnológico bem como melhorar a sua produtividade.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Artur Luis da Costa da Silva - Integrante / Maria Paula Cruz Schneider - Coordenador.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    21. 2011-2014. Genes Biossinteticos e produtos naturais bioativos de cianobacterias da Amazonia: Fronteiras em biotecnologia
      Descrição: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico-CNPq Convênio CNPq/Rede Bionorte R$ 1.0.13.014,10. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Paula Schnneider - Coordenador.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    22. 2011-2013. Implantacao de tecnologias para producao de proteinas recombinantes no Laboratorio de Engenharia Biologica do PCT-Guama
      Descrição: Fapespa R$ 119.623,00. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Artur Luis da Costa da Silva - Coordenador.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    23. 2011-2013. Genetica aplicada ao monitoramento e conservacao da ictiofauna
      Descrição: Norte Energia AS R$ 1.000.063,10. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Artur Luis da Costa da Silva - Coordenador.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    24. 2011-Atual. Analise da genomica funcional de Corynebacterium pseudotuberculosis biotipos ovis e equi sob diferentes condicoes de estresse biologicamente relevantes
      Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Artur Luis da Costa da Silva - Coordenador / Vasco - Integrante / Anne Cybelle Pinto - Integrante / Wanderson Marques Silva - Integrante / CARNEIRO, ADRIANA - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    25. 2010-Atual. Genoma de aves brasileiras, filogenomica, especiacao, conservacao e redes genicas neurais ligadas ao canto (Beija-flor e sabia) e imitacao da fala (Papagaios) - Sisbioaves
      Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . Integrantes: Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Schneider, Maria Paula C. - Coordenador / Maria Sueli Felipe - Integrante / Claudio Mello - Integrante / Evonnildo Gonçalves - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.

Prêmios e títulos

  • Total de prêmios e títulos (4)
    1. Bolsa de Produtividade CNPq nivel PQ1D, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq).. 2019.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    2. Membro afiliado da Academia Brasileira de Ciências (2018-2022), Academia Brasileira de Ciências.. 2018.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    3. Professor Homenageado ( Redes de Computadores), Faculdade de Castanhal.. 2010.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.
    4. Paraninfo da turma de Redes de Computadores 5SIN1, Faculdade de Castanhal.. 2010.
      Membro: Rommel Thiago Juca Ramos.

Participação em eventos

  • Total de participação em eventos (27)
    1. IV Simpósio Norte Nordeste de Bioinformática.Metagenômica da água: meio ambiente e saúde humana e animal. 2019. (Simpósio).
    2. Gene Time Conference 2018.Da montagem de genomas à integração de dados biológicos. 2018. (Seminário).
    3. II Genética em Foco.Montagem de genomas e integração de dados biológicos, um desafio para a biologia computacional. 2018. (Seminário).
    4. I SEMANA TECNOLÓGICA DE INFORMÁTICA DE PARAGOMINAS.BIOLOGIA COMPUTACIONAL - CONCEITOS E APLICAÇÕES. 2017. (Seminário).
    5. 24nd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology.GapBlaster - A graphical gap filler for prokaryote genomes. 2016. (Encontro).
    6. 23rd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. The Mithocondrial Genome Assembly of Buffalo from the Marajo? island (Brazil). 2015. (Congresso).
    7. Dia do profissional de Informática.Bioinformática: computação aplicada à resolução de problemas biológicos. 2015. (Outra).
    8. 22nd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. B4D - Blast2GO for Dummies. 2014. (Congresso).
    9. International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering. The impact of quality filter for RNA-Seq data over differential expression profile. 2014. (Congresso).
    10. ISCB-Latin American. The impact of quality filter for RNA-Seq based reference over differential gene expression for prokaryotes. 2014. (Congresso).
    11. ISCB-Latin American. 2014. (Congresso).
    12. 59o Congresso Brasileiro de Genética. High Efficiency of a mate-paired library from semiconductor sequencer for microbial de novo genome assmebly. 2013. (Congresso).
    13. II Simpósio de Biotecnologia da UFBA.I Simpósio de Genômica Funcional e Biologia Sistêmica de Microrganismos. 2013. (Simpósio).
    14. Primeiro Simpósio Brasileiro de Ensino, Pesquisa e extensão em Bioinformática.Desafios para analise transcriptomica de procariotos. 2013. (Simpósio).
    15. V Semana Acadêmica de Biotecnologia.Perspectivas em Bioinformática. 2013. (Outra).
    16. X-meeting BSB. 2013. (Congresso).
    17. 28? Reunião de Genética de Microrganismos. 2012. (Outra).
    18. 58? Congresso Brasileiro de Genética. Methanogenesis from genomic perspective - Bioinformatic Challenges. 2012. (Congresso).
    19. Centro Argentino Brasileiro de Biotecnologia (CABBIO).De Los Genes a Las Proteínas: Introducción al Análisis Global de Expresión Génica. 2012. (Simpósio).
    20. Curso de Verão em Bioinformática Estrutural (UFMG). 2012. (Outra).
    21. RNASeq (UFMG). 2012. (Outra).
    22. 26 Congresso Brasileiro de Microbiologia. Genomas procariotos: next gen e bioinformática em parceria com Applied Biosystens. 2011. (Congresso).
    23. Life Technologies - Next Gen Sequencing Experience.De novo assembly tools. 2011. (Encontro).
    24. Workshop de Montagem e Anotação de Genomas Bacterianos.Workshop de Montagem e Anotação de Genomas Bacterianos. 2011. (Outra).
    25. X-meeting. De novo Genome Assembly. 2011. (Congresso).
    26. Centro Brasileiro-Argentino de Biotecnologia. 2010. (Encontro).
    27. Centro Brasileiro-Argentino de Biotecnologia.Plataforma de Sequenciamento de Nova Geração NGS-SOLiD: Sequenciamento, montagem e anotação de um genoma bacteriano. 2010. (Encontro).

Organização de eventos

  • Total de organização de eventos (1)
    1. AZEVEDO, V. ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; Ramos, R. T. J. ; PINTO, A. C. ; SOARES, S. ; CERDEIRA, L. T. ; ALMEIDA, S. S.. Plataforma de Sequenciamento de Nova Geração NGS-SOLiD. 2010. Outro

Lista de colaborações

  • Colaborações endôgenas (14)
    • Rommel Thiago Juca Ramos ⇔ Vasco Ariston de Carvalho Azevedo (97.0)
      1. CARVALHO, RODRIGO ; ABURJAILE, FLAVIA ; CANARIO, MARCUS ; NASCIMENTO, ANDRÉA M. A. ; CHARTONE-SOUZA, EDMAR ; DE JESUS, LUIS ; ZAMYATNIN, ANDREY A. ; BRENIG, BERTRAM ; Barh, Debmalya ; GHOSH, PREETAM ; GOES-NETO, ARISTOTELES ; FIGUEIREDO, HENRIQUE C. P. ; Soares, Siomar ; Ramos, Rommel ; Pinto, Anne ; Azevedo, Vasco. Genomic Characterization of Multidrug-Resistant Escherichia coli BH100 Sub-strains. Frontiers in Microbiology. v. 11, p. 1-13, issn: 1664-302X, 2021.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. FRANCO, EDIAN F. ; RANA, PRATIP ; CRUZ, ALINE ; CALDERÓN, VÍCTOR V. ; Azevedo, Vasco ; Ramos, Rommel T. J. ; GHOSH, PREETAM. Performance Comparison of Deep Learning Autoencoders for Cancer Subtype Detection Using Multi-Omics Data. Cancers. v. 13, p. 2013, issn: 2072-6694, 2021.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      3. RODRIGUES, DIEGO LUCAS NERES ; MORAIS-RODRIGUES, FRANCIELLY ; HURTADO, RAQUEL ; DOS SANTOS, ROSELANE GONÇALVES ; COSTA, DANIELA CAMARGOS ; Barh, Debmalya ; GHOSH, PREETAM ; ALZAHRANI, KHALID J. ; SOARES, SIOMAR CASTRO ; Ramos, Rommel ; GÓES-NETO, ARISTÓTELES ; Azevedo, Vasco ; ABURJAILE, FLÁVIA FIGUEIRA. Pan-Resistome Insights into the Multidrug Resistance of Acinetobacter baumannii. ANTIBIOTICS-BASEL. v. 10, p. 596, issn: 2079-6382, 2021.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      4. NOGUEIRA, WYLERSON G. ; JAISWAL, ARUN KUMAR ; Tiwari, Sandeep ; Ramos, Rommel T.J. ; GHOSH, PREETAM ; Barh, Debmalya ; Azevedo, Vasco ; SOARES, SIOMAR C.. Compctutational identification of putative common genomic drug and vaccine targets in Mycoplasma genitalium. GENOMICS. v. 113, p. 2730-2743, issn: 0888-7543, 2021.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      5. FRANCO, EDIAN F. ; RANA, PRATIP ; QUEIROZ CAVALCANTE, ANA LIDIA ; DA SILVA, ARTUR LUIZ ; CYBELLE PINTO GOMIDE, ANNE ; CARNEIRO FOLADOR, ADRIANA R. ; Azevedo, Vasco ; GHOSH, PREETAM ; T. J. Ramos, Rommel. Co-Expression Networks for Causal Gene Identification Based on RNA-Seq Data of Corynebacterium pseudotuberculosis. Genes. v. 11, p. 794, issn: 2073-4425, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      6. ROCHA, DANILO J.P. ; AZEVEDO, Vasco ; BRENIG, BERTRAM ; Silva, Artur ; BLOM, JOCHEN ; RAMOS, ROMMEL T. ; AGUIAR, ERIC R.G. ; CHAPARTEGUI-GONZÁLEZ, ITZIAR ; FERNÁNDEZ-MARTÍNEZ, MARTA ; MARTÍNEZ-MARTÍNEZ, LUIS ; Pacheco, Luis G.C. ; NAVAS, JESÚS. Whole genome sequencing reveals misidentification of a multidrug-resistant urine clinical isolate as Corynebacterium urealyticum. Journal of Global Antimicrobial Resistance. v. n/a, p. 1010100, issn: 2213-7165, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      7. ARAÚJO, CARLOS LEONARDO ; ALVES, JORIANNE ; NOGUEIRA, WYLERSON ; PEREIRA, LINO CÉSAR ; GOMIDE, ANNE CYBELLE ; Ramos, Rommel ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur ; FOLADOR, ADRIANA. Prediction of new vaccine targets in the core genome of Corynebacterium pseudotuberculosis through omics approaches and reverse vaccinology. GENE. v. 702, p. 36-45, issn: 0378-1119, 2019.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      8. SOUSA, THIAGO DE JESUS ; PARISE, DOGLAS ; PROFETA, RODRIGO ; PARISE, MARIANA TEIXEIRA DORNELLES ; GOMIDE, ANNE CYBELLE PINTO ; KATO, RODRIGO BENTOS ; PEREIRA, FELIPE LUIZ ; FIGUEIREDO, HENRIQUE CESAR PEREIRA ; Ramos, Rommel ; BRENIG, BERTRAM ; COSTA DA SILVA, ARTUR LUIZ DA ; GHOSH, PREETAM ; Barh, Debmalya ; GÓES-NETO, ARISTÓTELES ; Azevedo, Vasco. Re-sequencing and optical mapping reveals misassemblies and real inversions on Corynebacterium pseudotuberculosis genomes. Scientific Reports. v. 9, p. 16387, issn: 2045-2322, 2019.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      9. RANA, PRATIP ; FRANCO, EDIAN F. ; RAO, YUG ; SYED, KHAJAMOINUDDIN ; Barh, Debmalya ; Azevedo, Vasco ; Ramos, Rommel T. J. ; GHOSH, PREETAM. Evaluation of the Common Molecular Basis in Alzheimer?s and Parkinson?s Diseases. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES. v. 20, p. 3730, issn: 1422-0067, 2019.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      10. ESLABÃO, MARCUS REDÜ ; KREMER, FREDERICO SCHMITT ; RAMOS, ROMMEL THIAGO JUCA ; SILVA, ARTUR LUIZ DA COSTA DA ; AZEVEDO, VASCO ARISTON DE CARVALHO ; Pinto, Luciano da Silva ; SILVA, ÉVERTON FAGONDE DA ; Dellagostin, Odir Antônio. Genome of Leptospira borgpetersenii strain 4E, a highly virulent isolate obtained from Mus musculus in southern Brazil. MEMORIAS DO INSTITUTO OSWALDO CRUZ. v. 113, p. 137-141, issn: 0074-0276, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      11. SANTOS, ANDRÉ S. ; RAMOS, ROMMEL T. ; SILVA, ARTUR ; HIRATA, RAPHAEL ; MATTOS-GUARALDI, ANA L. ; MEYER, ROBERTO ; AZEVEDO, VASCO ; Felicori, Liza ; PACHECO, LUIS G. C.. Searching whole genome sequences for biochemical identification features of emerging and reemerging pathogenic Corynebacterium species. FUNCTIONAL & INTEGRATIVE GENOMICS. v. n/a, p. 1010100-1010100, issn: 1438-793X, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      12. FERREIRA, DALILA SOUZA SANTOS ; KATO, RODRIGO BENTES ; MIRANDA, FÁBIO MALCHER ; DA COSTA PINHEIRO, KENNY ; FONSECA, PAULA LUIZE CAMARGOS ; TOMÉ, LUIZ MARCELO RIBEIRO ; VAZ, ALINE BRUNA MARTINS ; BADOTTI, FERNANDA ; Ramos, Rommel Thiago Jucá ; BRENIG, BERTRAM ; DE CARVALHO AZEVEDO, VASCO ARISTON ; BENEVIDES, RAQUEL GUIMARÃES ; GÓES-NETO, ARISTÓTELES. Draft genome sequence of Trametes villosa (Sw.) Kreisel CCMB561, a tropical white-rot Basidiomycota from the semiarid region of Brazil. DATA IN BRIEF. v. 1, p. 1581-1587, issn: 2352-3409, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      13. RAMOS, J. N. ; RODRIGUES, I. S. ; BAIO, P. V. P. ; VERAS, J. F. C. ; Ramos, R. T. J. ; PACHECO, L. G. C. ; AZEVEDO, V. ; Hirata Júnior, Raphael ; MARIN, M. A. ; GARALDI, ANA LUIZA M. ; VIEIRA, VERONICA V.. Genome sequence of a multidrug-resistant Corynebacterium striatum isolated from bloodstream infection from a nosocomial outbreak in Rio de Janeiro, Brazil. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz. v. 113, p. e180051, issn: 1678-8060, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      14. VERAS, ALLAN ; ARAUJO, FABRICIO ; PINHEIRO, KENNY ; Guimarães, Luis ; Azevedo, Vasco ; Soares, Siomar ; DA COSTA DA SILVA, ARTUR ; Ramos, Rommel. Pan4Draft: A Computational Tool to Improve the Accuracy of Pan-Genomic Analysis Using Draft Genomes. Scientific Reports. v. 8, p. 1010100-1010100, issn: 2045-2322, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      15. BARAÚNA, RAFAEL A. ; Ramos, Rommel T. J. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; PINHEIRO, KENNY C. ; BENEVIDES, LEANDRO J. ; VIANA, MARCUS V. C. ; GUIMARÃES, LUÍS C. ; EDMAN, JUDY M. ; SPIER, SHARON J. ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur. Assessing the Genotypic Differences between Strains of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar equi through Comparative Genomics. Plos One. v. 12, p. e0170676-e017676, issn: 1932-6203, 2017.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      16. BARAÚNA, RAFAEL A. ; Ramos, Rommel T. J. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; DE SÁ, PABLO H. C. G. ; GUIMARÃES, LUÍS C. ; DAS GRAÇAS, DIEGO A. ; Carneiro, Adriana R. ; EDMAN, JUDY M. ; SPIER, SHARON J. ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur. Genomic analysis of four strains of Corynebacterium pseudotuberculosis bv. Equi isolated from horses showing distinct signs of infection. Standards in Genomic Sciences. v. 12, p. 10101000-10101000, issn: 1944-3277, 2017.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      17. VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO ; FIGUEIREDO, HENRIQUE ; Ramos, Rommel ; GUIMARÃES, LUIS CARLOS ; PEREIRA, FELIPE LUIZ ; DORELLA, FERNANDA ALVES ; SELIM, SALAH ABDEL KARIM ; SALAHELDEAN, MOHAMMAD ; Silva, Artur ; WATTAM, ALICE R. ; Azevedo, Vasco. Comparative genomic analysis between Corynebacterium pseudotuberculosis strains isolated from buffalo. PLoS One. v. 12, p. e0176347-e0176347, issn: 1932-6203, 2017.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      18. SANTOS, CAROLINA S. ; RAMOS, JULIANA N. ; VIEIRA, VERONICA V. ; PINHEIRO, CARINA S. ; MEYER, ROBERTO ; ALCANTARA-NEVES, NEUZA M. ; RAMOS, ROMMEL T. ; SILVA, ARTUR ; HIRATA, RAPHAEL ; Felicori, Liza ; DE ALEGRÍA PUIG, CARLOS RUIZ ; NAVAS, JESÚS ; AZEVEDO, VASCO ; MATTOS-GUARALDI, ANA L. ; PACHECO, LUIS G.C.. Efficient differentiation of Corynebacterium striatum , Corynebacterium amycolatum and Corynebacterium xerosis clinical isolates by multiplex PCR using novel species-specific primers. JOURNAL OF MICROBIOLOGICAL METHODS. v. 142, p. 1010100, issn: 0167-7012, 2017.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      19. GOMIDE, ANNE CYBELLE PINTO ; DE SÁ, PABLO GOMES ; CAVALCANTE, ANA LIDIA QUEIROZ ; DE JESUS SOUSA, THIAGO ; GOMES, LUCAS GABRIEL RODRIGUES ; RAMOS, ROMMEL THIAGO JUCA ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur ; FOLADOR, ADRIANA RIBEIRO CARNEIRO. Heat shock stress: Profile of differential expression in Corynebacterium pseudotuberculosis biovar Equi. GENE. v. 645, p. 124-130, issn: 0378-1119, 2017.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      20. GUIMARÃES, LUIS CARLOS ; LOPES, Thiago ; Ramos, Rommel Thiago Jucá ; Carneiro, Adriana Ribeiro ; CAVALCANTE, ANA LÍDIA QUEIROZ ; BARRETO, DIEGO ; DE SÁ, PABLO CARACCIOLO GOMES ; VERAS, ADONNEY ALLAN OLIVEIRA ; Rocha, Flávia Souza ; BAGANO, PRISCILLA ; PEREIRA, FELIPE LUIZ ; Dorella, Fernanda Alves ; LEAL, CARLOS AUGUSTO ; CARVALHO, ALEX FIORINI ; BIZET, CHANTAL ; Guiso, Nicole ; BADELL, EDGAR ; FIGUEIREDO, HENRIQUE CÉSAR PEREIRA ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur. Draft Genome Sequences of Two Pathogenic Corynebacterial Species Isolated from Cows. Journal of Genomics. v. 4, p. 7-9, issn: 1839-9940, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      21. MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA ; SOUSA, THIAGO DE JESUS ; PEREIRA, FELIPE LUIZ ; ABURJAILE, FLÁVIA ; Barh, Debmalya ; ROCHA, FLÁVIA ; PINTO, ANNE CYBELLE ; HASSAN, SYED SHAH ; SARAIVA, TESSÁLIA DINIZ LUERCE ; DORELLA, FERNANDA ALVES ; DE CARVALHO, ALEX FIORINI ; LEAL, CARLOS AUGUSTO GOMES ; FIGUEIREDO, HENRIQUE CÉSAR PEREIRA ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel Thiago Jucá ; Azevedo, Vasco Ariston Carvalho. Whole-genome optical mapping reveals a mis-assembly between two rRNA operons of Corynebacterium pseudotuberculosis strain 1002. BMC Genomics. v. 17, p. 10101000-10101000, issn: 1471-2164, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      22. DE SÁ, PABLO H. C. G. ; MIRANDA, FÁBIO ; VERAS, ADONNEY ; DE MELO, DIEGO MAGALHÃES ; Soares, Siomar ; PINHEIRO, KENNY ; Guimarães, Luis ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel T. J.. GapBlaster-A Graphical Gap Filler for Prokaryote Genomes. Plos One. v. 11, p. e0155327, issn: 1932-6203, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      23. DIAS, LARISSA M. ; ALVES, JORIANNE T. C. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; BARAÚNA, RAFAEL A. ; SÁ, PABLO H. C. G. ; SPIER, SHARON ; EDMAN, JUDY M. ; Guimarães, Luis C. ; ROCHA, FLÁVIA S. ; Ramos, Rommel T. J. ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur ; Carneiro, Adriana R.. Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain 226, Isolated from the Abscess of a Goat in California. Genome Announcements. v. 4, p. e00038-16, issn: 2169-8287, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      24. Guimarães, Luis C. ; VIANA, MARCUS V. C. ; BENEVIDES, LEANDRO J. ; MARIANO, DIEGO C. B. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; SÁ, PABLO H. C. ; ROCHA, FLÁVIA S. ; VILAS BOAS, PRISCILLA C. B. ; SOARES, SIOMAR C. ; BARBOSA, MARIA S. ; Guiso, Nicole ; BADELL, EDGAR ; Azevedo, Vasco ; Ramos, Rommel T. J. ; Silva, Artur. Draft Genome Sequence of Toxigenic Strain 03-8664 Isolated from a Human Throat. Genome Announcements. v. 4, p. e00719-16, issn: 2169-8287, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      25. MUGE, GABRIEL R. S. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; DE SÁ, PABLO H. C. G. ; CAVALCANTE, ANA LÍDIA QUEIROZ ; ALVES, JORIANNE THYESKA CASTRO ; MORAIS, EZEQUIEL ; SILVA, ANDRÉ G. M. ; GUIMARÃES, LUÍS C. ; Azevedo, Vasco ; FOLADOR, ADRIANA RIBEIRO CARNEIRO ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel T. J.. Genome Sequence of Strain PA02 Isolated from an Ovine Host in the Amazon. Genome Announcements. v. 4, p. e00838-16, issn: 2169-8287, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      26. MARIANO, DIEGO C. B. ; PEREIRA, FELIPE L. ; AGUIAR, EDGAR L. ; OLIVEIRA, LETÍCIA C. ; BENEVIDES, LEANDRO ; GUIMARÃES, LUÍS C. ; FOLADOR, EDSON L. ; SOUSA, THIAGO J. ; GHOSH, PREETAM ; Barh, Debmalya ; FIGUEIREDO, HENRIQUE C. P. ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel T. J. ; AZEVEDO, VASCO A. C.. SIMBA: a web tool for managing bacterial genome assembly generated by Ion PGM sequencing technology. BMC Bioinformatics. v. 17, p. 65-72, issn: 1471-2105, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      27. DE SÁ, PABLO H.C.G. ; VERAS, ADONNEY A.O. ; Carneiro, Adriana R. ; PINHEIRO, KENNY C. ; Pinto, Anne C. ; Soares, Siomar C. ; SCHNEIDER, MARIA P.C. ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel T.J.. The impact of quality filter for RNA-Seq. Gene (Amsterdam). v. 563, p. 165-171, issn: 0378-1119, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      28. BENEVIDES, LEANDRO DE JESUS ; VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO ; MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA ; ROCHA, FLÁVIA DE SOUZA ; BAGANO, PRISCILLA CAROLINNE ; FOLADOR, EDSON LUIZ ; PEREIRA, FELIPE LUIZ ; Dorella, Fernanda Alves ; LEAL, CARLOS AUGUSTO GOMES ; CARVALHO, ALEX FIORINI ; SOARES, SIOMAR DE CASTRO ; CARNEIRO, ADRIANA ; Ramos, Rommel ; BADELL-OCANDO, EDGAR ; Guiso, Nicole ; Silva, Artur ; FIGUEIREDO, HENRIQUE ; Azevedo, Vasco ; GUIMARÃES, LUIS CARLOS. Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans Strain FRC11. Genome Announcements. v. 3, p. e00112-15, issn: 2169-8287, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      29. NALLURI, JOSEPH J ; KAMAPANTULA, BHANU K ; Barh, Debmalya ; Jain, Neha ; BHATTACHARYA, ANTARIPA ; DE ALMEIDA, SINTIA ; JUCA RAMOS, ROMMEL ; Silva, Artur ; Azevedo, Vasco ; GHOSH, PREETAM. DISMIRA: Prioritization of disease candidates in miRNA-disease associations based on maximum weighted matching inference model and motif-based analysis. BMC Genomics. v. 16, p. S12-S12, issn: 1471-2164, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      30. GUIMARÃES, LUIS ; SOARES, SIOMAR ; Trost, Eva ; BLOM, JOCHEN ; Ramos, Rommel ; Silva, Artur ; Barh, Debmalya ; Azevedo, Vasco. Genome informatics and vaccine targets in Corynebacterium urealyticum using two whole genomes, comparative genomics, and reverse vaccinology. BMC Genomics. v. 16, p. S7-S7, issn: 1471-2164, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      31. MARIANO, DIEGO CB ; PEREIRA, FELIPE L ; GHOSH, PREETAM ; Barh, Debmalya ; FIGUEIREDO, HENRIQUE CP ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel TJ ; Azevedo, Vasco AC. MapRepeat: an approach for effective assembly of repetitive regions in prokaryotic genomes. Bioinformation (Online) (Chennai). v. 11, p. 276-279, issn: 0973-2063, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      32. SOUSA, THIAGO JESUS ; MARIANO, DIEGO ; PARISE, DOGLAS ; PARISE, MARIANA ; VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO ; GUIMARÃES, LUIS CARLOS ; BENEVIDES, LEANDRO JESUS ; ROCHA, FLÁVIA ; BAGANO, PRISCILLA ; Ramos, Rommel ; Silva, Artur ; FIGUEIREDO, HENRIQUE ; Almeida, Sintia ; Azevedo, Vasco. Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain 12C. Genome Announcements. v. 3, p. e00759-15, issn: 2169-8287, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      33. Mattos-Guaraldi, Ana L. ; Guimarães, Luis C. ; SANTOS, CAROLINA S. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; Carneiro, Adriana R. ; Soares, Siomar C. ; RAMOS, JULIANA N. ; SOUZA, CASSIUS ; VIEIRA, VERONICA V. ; Hirata, Raphael ; Azevedo, Vasco ; Pacheco, Luis G. C. ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel T. J.. Draft Genome Sequence of Corynebacterium striatum 1961 BR-RJ/09, a Multidrug-Susceptible Strain Isolated from the Urine of a Hospitalized 37-Year-Old Female Patient. Genome Announcements. v. 3, p. e00869-15, issn: 2169-8287, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      34. SOARES, SIOMAR C. ; GEYIK, HAKAN ; Ramos, Rommel T.J. ; DE SÁ, PABLO H.C.G. ; BARBOSA, EUDES G.V. ; Baumbach, Jan ; FIGUEIREDO, HENRIQUE C.P. ; MIYOSHI, Anderson ; Tauch, Andreas ; Silva, Artur ; Azevedo, Vasco. GIPSy: genomic island prediction software. Journal of Biotechnology. v. 1, p. 1-1, issn: 0168-1656, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      35. Pacheco, Luis G. C. ; Mattos-Guaraldi, Ana L. ; SANTOS, CAROLINA S. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; Guimarães, Luis C. ; ABREU, VINÍCIUS ; PEREIRA, FELIPE L. ; Soares, Siomar C. ; Dorella, Fernanda A. ; CARVALHO, ALEX F. ; LEAL, CARLOS G. ; FIGUEIREDO, HENRIQUE C. P. ; RAMOS, JULIANA N. ; VIEIRA, VERONICA V. ; FARFOUR, ERIC ; Guiso, Nicole ; Hirata, Raphael ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel T. J.. Draft Genome Sequences of Two Species of -Difficult-to-Identify- Human-Pathogenic Corynebacteria: Implications for Better Identification Tests. Journal of Genomics. v. 3, p. 82-84, issn: 1839-9940, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      36. CAVALCANTE, ANA LÍDIA Q. ; DIAS, LARISSA M. ; ALVES, JORIANNE T. C. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; Guimarães, Luis C. ; ROCHA, FLÁVIA S. ; GALA-GARCÍA, ALFONSO ; RETAMAL, PATRICIO ; Ramos, Rommel T. J. ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur ; Carneiro, Adriana R.. Complete Genome Sequence of Strain E19, Isolated from a Horse in Chile. Genome Announcements. v. 3, p. e01385-15, issn: 2169-8287, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      37. DE SÁ, PABLO H.C.G. ; VERAS, ADONNEY A.O. ; Carneiro, Adriana R. ; BARÚNA, RAFAEL A. ; GUIMARÃES, LUÍS C. ; PINHEIRO, KENNY C. ; Pinto, Anne C. ; SOARES, SIOMAR C. ; SCHNEIDER, MARIA P.C. ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel T.J.. Corynebacterium pseudotuberculosis RNA-seq data from abiotic stresses. Data in Brief. v. 5, p. 963-966, issn: 2352-3409, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      38. SILVA, A. D. S. D. S. ; BARAUNA, R. A. ; DE SA, P. C. G. ; DAS GRACAS, D. A. ; Carneiro, A. R. ; THOUVENIN, M. ; Azevedo, V. ; BADELL, E. ; GUISO, N. ; DA SILVA, A. L. D. C. ; Ramos, R. T. J.. Draft Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans FRC58, Isolated from the Bronchitic Aspiration of a Patient in France. Genome Announcements. v. 2, p. e01132-13-e01132-13, issn: 2169-8287, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      39. PINTO, ANNE CYBELLE ; DE SÁ, PABLO HENRIQUE ; RAMOS, ROMMEL T ; BARBOSA, SILVANIRA ; BARBOSA, HIVANA P ; RIBEIRO, ADRIANA CARNEIRO ; SILVA, WANDERSON MARQUES ; ROCHA, FLÁVIA SOUZA ; SANTANA, MARIANA PASSOS ; DE PAULA CASTRO, THIAGO LUIZ ; Miyoshi, Anderson ; SCHNEIDER, MARIA P ; Silva, Artur ; Azevedo, Vasco. Differential transcriptional profile of Corynebacterium pseudotuberculosis in response to abiotic stresses. BMC Genomics. v. 15, p. 14, issn: 1471-2164, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      40. BARBOSA, E. G. V. ; ABURJAILE, F. F. ; Ramos, R. T. J. ; CARNEIRO, A. R. ; Le Loir, Y. ; Baumbach, Jan ; Miyoshi, A. ; Artur Luiz da Costa da Silva ; AZEVEDO, V.. Value of a newly sequenced bacterial genome. World Journal of Biological Chemistry. v. 5, p. 161-168, issn: 1949-8454, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      41. CARVALHO, DAIANE M. ; DE SÁ, PABLO H. ; Castro, Thiago L. P. ; CARVALHO, RODRIGO D. ; PINTO, ANNE ; GIL, DANILO J. P. ; BAGANO, PRISCILLA ; BASTOS, BRUNO ; COSTA, LILIA F. M. ; Meyer, Roberto ; Silva, Artur ; AZEVEDO, Vasco ; Ramos, Rommel T. J. ; Pacheco, Luis G. C.. Reference genes for RT-qPCR studies in Corynebacterium pseudotuberculosis identified through analysis of RNA-seq data. Antonie van Leeuwenhoek (Gedrukt). v. 106, p. 605-614, issn: 0003-6072, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      42. OLIVEIRA, L. Genome Sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis NCDO 2118, a GABA-Producing Strain. Genome Announcements. v. 2, p. e00980-14-e00980-14, issn: 2169-8287, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      43. BARAUNA, R. A. ; Guimaraes, L. C. ; VERAS, A. A. O. ; DE SA, P. H. C. G. ; GRACAS, D. A. ; PINHEIRO, K. C. ; SILVA, A. S. S. ; FOLADOR, E. L. ; BENEVIDES, L. J. ; VIANA, M. V. C. ; Carneiro, A. R. ; Schneider, M. P. C. ; SPIER, S. J. ; EDMAN, J. M. ; Ramos, R. T. J. ; Azevedo, V. ; SILVA, A.. Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis MB20 bv. equi Isolated from a Pectoral Abscess of an Oldenburg Horse in California. Genome Announcements. v. 2, p. e00977-14-e00977-14, issn: 2169-8287, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      44. DALL'AGNOL, HIVANA PMB ; BARAÚNA, RAFAEL A ; DE SÁ, PABLO HCG ; Ramos, Rommel TJ ; NÓBREGA, FELIPE ; NUNES, CATARINA IP ; DAS GRAÇAS, DIEGO A ; Carneiro, Adriana R ; SANTOS, DANIEL M ; Pimenta, Adriano MC ; CAREPO, MARTA SP ; Azevedo, Vasco ; PELLIZARI, VIVIAN H ; Schneider, Maria PC ; Silva, Artur. Omics profiles used to evaluate the gene expression of Exiguobacterium antarcticum B7 during cold adaptation. BMC Genomics. v. 15, p. 986, issn: 1471-2164, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      45. VERAS, A. A. O. ; Gomes de Sa, P. H. C. ; PINHEIRO, K. C. ; DAS GRAÇAS, DIEGO A ; Rafael Baraúna ; Schneider, MPC. ; AZEVEDO, V. ; Ramos, R. T. J. ; Artur Luiz da Costa da Silva. Efficiency of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp31 Genome Assembly with the Hi-Q Enzyme on an Ion Torrent PGM Sequencing Platform. Journal of Proteomics & Bioinformatics. v. 7, p. 374-378, issn: 0974-276X, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      46. Soares, Siomar C. ; Silva, Artur ; Trost, Eva ; BLOM, JOCHEN ; Ramos, Rommel ; CARNEIRO, ADRIANA ; Ali, Amjad ; Santos, Anderson R. ; Pinto, Anne C. ; DINIZ, CARLOS ; BARBOSA, EUDES G. V. ; Dorella, Fernanda A. ; ABURJAILE, FLÁVIA ; ROCHA, FLÁVIA S. ; NASCIMENTO, KARINA K. F. ; GUIMARÃES, LUÍS C. ; ALMEIDA, SINTIA ; Hassan, Syed S. ; Bakhtiar, Syeda M. ; PEREIRA, ULISSES P. ; Abreu, Vinicius A. C. ; Schneider, Maria P. C. ; MIYOSHI, Anderson ; Tauch, Andreas ; Azevedo, Vasco. The Pan-Genome of the Animal Pathogen Corynebacterium pseudotuberculosis Reveals Differences in Genome Plasticity between the Biovar ovis and equi Strains. Plos One. v. 8, p. e53818-e53818, issn: 1932-6203, 2013.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      47. Barh, Debmalya Gupta, Krishnakant Jain, Neha KHATRI, G. Conserved host?pathogen PPIs? Globally conserved inter-species bacterial PPIs based conserved host-pathogen interactome derived novel target in C. pseudotuberculosis, C. diphtheriae, M. tuberculosis, C. ulcerans, Y. pestis, and E. coli targeted by Piper betel compounds. INTEGR BIOL-UK. v. 1, p. 01-15-15, issn: 1757-9694, 2013.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      48. Castro, Thiago L. P. ; Seyffert, Nubia ; Ramos, Rommel T. J. ; Barbosa, Silvanira ; CARVALHO, RODRIGO D. O. ; Pinto, Anne Cybelle ; Carneiro, Adriana Ribeiro ; Silva, Wanderson Marques ; Pacheco, Luis G. C. ; DOWNSON, CHRISTOPHER ; Schneider, Maria P. C. ; MIYOSHI, Anderson ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur. Ion Torrent-based transcriptional assessment of a Corynebacterium pseudotuberculosis equi strain reveals denaturing high-performance liquid chromatography a promising rRNA depletion method. Microbial Biotechnology (Online). v. 6, p. 168-177, issn: 1751-7915, 2013.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      49. LEÃO, SYLVIA CARDOSO ; MATSUMOTO, CRISTIANNE KAYOKO ; CARNEIRO, ADRIANA ; Ramos, Rommel Thiago ; NOGUEIRA, CHRISTIANE LOURENÇO ; JUNIOR, JAMES DALTRO LIMA ; LIMA, KARLA VALÉRIA ; LOPES, MARIA LUIZA ; Schneider, Horacio ; AZEVEDO, VASCO ARISTON ; DA COSTA DA SILVA, ARTUR. The Detection and Sequencing of a Broad-Host-Range Conjugative IncP-1? Plasmid in an Epidemic Strain of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii. Plos One. v. 8, p. e60746-60746, issn: 1932-6203, 2013.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      50. Barh, Debmalya ; BARVE, NEHA ; Gupta, Krishnakant ; Chandra, Sudha ; Jain, Neha ; Tiwari, Sandeep ; LEON-SICAIROS, NIDIA ; CANIZALEZ-ROMAN, ADRIAN ; RODRIGUES DOS SANTOS, ANDERSON ; HASSAN, SYED SHAH ; ALMEIDA, SÍNTIA ; THIAGO JUCÁ RAMOS, ROMMEL ; AUGUSTO CARVALHO DE ABREU, VINICIUS ; RIBEIRO CARNEIRO, ADRIANA ; de Castro Soares, Siomar ; LUIZ DE PAULA CASTRO, THIAGO ; MIYOSHI, Anderson ; Silva, Artur ; Kumar, Anil ; NARAYAN MISRA, AMARENDRA ; BLUM, KENNETH ; BRAVERMAN, ERIC R. ; Azevedo, Vasco. Exoproteome and Secretome Derived Broad Spectrum Novel Drug and Vaccine Candidates in Vibrio cholerae Targeted by Piper betel Derived Compounds. Plos One. v. 8, p. e52773-e52773, issn: 1932-6203, 2013.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      51. ASSIS DAS GRACAS, D. ; THIAGO JUCA RAMOS, R. ; VIEIRA ARAUJO, A. C. ; ZAHLOUTH, R. ; RIBEIRO CARNEIRO, A. ; SOUZA LOPES, T. ; AZEVEDO BARAUNA, R. ; Azevedo, V. ; CRUZ SCHNEIDER, M. P. ; PELLIZARI, V. H. ; SILVA, A.. Complete Genome of a Methanosarcina mazei Strain Isolated from Sediment Samples from an Amazonian Flooded Area. Genome Announcements. v. 1, p. e00271-13-e00271-13, issn: 2169-8287, 2013.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      52. PEREIRA, ULISSES DE PÁDUA ; SANTOS, A. R. ; Hassan, Syed S. ; ABURJAILE, F. F. ; SOARES, S. C. ; RAMOS, R. T. J. ; Carneiro,Adriana R ; GUIMARAES, L. C. ; ALMEIDA, S. S. ; DINIZ, C. ; MATTOS, S. V. M. ; Gomes de Sa, P. H. C. ; ALI, A. ; Bakhtiar, Syeda M. ; Dorella, F. A. ; Zerlotini, Adhemar ; ARAUJO, F. M. G. ; LEITE, L. R. ; Guilherme Correa de Oliveira ; MIYOSHI, A. ; Artur Luiz da Costa da Silva ; AZEVEDO, V. ; FIGUEIREDO, H. C. P.. Complete genome sequence of Streptococcus agalactiae strain SA20-06, a fish pathogen associated to meningoencephalitis outbreaks. Standards in Genomic Sciences. v. 8, p. 188-197, issn: 1944-3277, 2013.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      53. Ramos, Rommel Thiago Jucá ; Carneiro, Adriana Ribeiro ; de Castro Soares, Siomar ; Barbosa, Silvanira ; VARUZZA, LEONARDO ; ORABONA, GUILHERME ; Tauch, Andreas ; Azevedo, Vasco ; SCHNEIDER, MARIA PAULA ; Silva, Artur. High efficiency application of a mate-paired library from Next-Generation Sequencing to PostLight sequencing: Corynebacterium pseudotuberculosis as a case study for microbial de novo genome assembly. JOURNAL OF MICROBIOLOGICAL METHODS. v. 95, p. 1010100-1010100, issn: 0167-7012, 2013.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      54. Ramos, Rommel Thiago Jucá; CARNEIRO, ADRIANA ; SÁ, P. H. C. G. ; Azevedo, Vasco ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; Barh, Debmalya ; SILVA, A.. Graphical contig analyzer for all sequencing platforms (G4ALL): a new stand-alone tool for finishing and draft generation of bacterial genomes. BIOINFORMATION (ONLINE) (CHENNAI). v. 9, p. 599-604, issn: 0973-2063, 2013.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      55. PEREIRA, ULISSES ; SOARES, S. C. ; BLOM, J. ; LEAL, C. ; RAMOS, R. T. J. ; GUIMARAES, L. C. ; Oliveira, L C ; de Almeida, S. S. ; Hassan, Syed S. ; Santos, Anderson R. ; Miyoshi, Anderson ; Artur Luiz da Costa da Silva ; Tauch, Andreas ; Barh, Debmalya ; AZEVEDO, V. ; FIGUEIREDO, H.. In silico prediction of conserved vaccine targets in Streptococcus agalactiae strains isolated from fish, cattle, and human samples. Genetics and Molecular Research. v. 12, p. 2902-2912, issn: 1676-5680, 2013.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      56. VERAS, A. A. O. ; Sá, P. G. ; AZEVEDO, V ; Artur Luiz da Costa da Silva ; RAMOS, R. T. J.. AutoAssemblyD: a graphical user interface system for several genome assemblers. Bioinformation (Online) (Chennai). v. 9, p. 840-841, issn: 0973-8894, 2013.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      57. DORELLA, FERNANDA A ; GALA-GARCIA, ALFONSO ; PINTO, ANNE C ; SARROUH, BOUTROS ; ANTUNES, CAMILA A ; RIBEIRO, DAYANA ; ABURJAILE, FLÁVIA ; FIAUX, KARINA K ; Guimarães, Luis C ; SEYFFERT, NUBIA ; EL-AOUAR, RACHID A ; SILVA, RENATA ; HASSAN, SYED S ; CASTO, THIAGO LP ; MARQUES, WANDERSON S ; Ramos, Rommel ; CARNEIRO, ADRIANA ; SÁ, PABLO DE ; Miyoshi, Anderson ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur. Progression of 'OMICS' methodologies for understanding the pathogenicity of Corynebacterium pseudotuberculosis: the Brazilian experience. Computational and Structural Biotechnology Journal. v. 6, p. 1010100-1010100, issn: 2001-0370, 2013.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      58. LEAO, S. C. ; MATSUMOTO, C. K. ; VIANA-NIERO, C. ; Ramos, R. T. J. ; Carneiro, A. R. ; Barbosa, M. S. ; LIMA, K. V. B. ; LOPES, M. L. ; Azevedo, V. ; SILVA, A.. Draft Genome Sequence of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii INCQS 00594. Genome Announcements. v. 1, p. e00896-13-e00896-13, issn: 2169-8287, 2013.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      59. Soares, Siomar C. ; Abreu, Vinícius A. C. ; Ramos, R. T. J. ; Ramos, Rommel T. J. ; Cerdeira, Louise ; Silva, Artur ; Baumbach, Jan ; Trost, Eva ; Tauch, Andreas ; Hirata, Raphael ; Mattos-Guaraldi, Ana L. ; Miyoshi, Anderson ; AZEVEDO, V.. PIPS: Pathogenicity Island Prediction Software. Plos One. v. 7, p. e30848, issn: 1932-6203, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      60. D'AFONSECA, V. ; SOARES, S. C. ; ALI, A. ; SANTOS, A. R. ; PINTO, A. C. ; MAGALHÃES. A.A.C., MAGALHÃES. A. ; FARIA, C. L. ; BARBOSA, E. G. V. ; GUIMARAES, L. C. ; ESLABAO, M. ; ALMEIDA, S. S. ; ABREU, V. A. C. ; Zerlotini, Adhemar ; CARNEIRO, A. R. ; CERDEIRA, L. T. ; RAMOS, R. T. J. ; HIRATA JR., R. ; MATTOS-GUARALDI, A. L. ; Trost, Eva ; Tauch, Andreas ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, M. P. C. ; AZEVEDO, V. ; MIYOSHI, A.. Reannotation of the Corynebacterium diphtheriae NCTC13129 genome as a new approach to studying gene targets connected to virulence and pathogenicity in diphtheria. Open Access Bioinformatics. v. 2012:4, p. 1-13, issn: 1179-2701, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      61. Lopes, T. Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain Cp267, Isolated from a Llama. Journal of Bacteriology (Print). v. 194, p. 3567-3568, issn: 0021-9193, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      62. Carneiro, Adriana R. ; Ramos, Rommel Thiago Jucá ; Barbosa, Hivana Patricia Melo ; Schneider, Maria Paula C. ; Barh, Debmalya ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur. Quality of prokaryote genomes assembly: Indispensable issues of factors affecting prokaryote genome assembly quality. Gene (Amsterdam). v. 12, p. 1-2, issn: 0378-1119, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      63. Pinto, Anne Cybelle ; Ramos, Rommel T. J. ; Silva, Wanderson Marques ; Rocha, Flávia Souza ; Barbosa, Silvanira ; MIYOSHI, Anderson ; Schneider, Maria P. C. ; Silva, Artur ; Azevedo, Vasco. The core stimulon of Corynebacterium pseudotuberculosis strain 1002 identified using ab initio methodologies. Integrative Biology. v. 4, p. 789-794, issn: 1757-9694, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      64. Pethick, F. Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain 1/06-A, Isolated from a Horse in North America. Journal of Bacteriology (Print). v. 194, p. 4476-4476, issn: 0021-9193, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      65. Pethick Lainson, A. Complete Genome Sequences of Corynebacterium pseudotuberculosis Strains 3/99-5 and 42/02-A, Isolated from Sheep in Scotland and Australia, Respectively. Journal of Bacteriology (Print). v. 194, p. 4736-4737, issn: 0021-9193, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      66. Ali, Amjad ; Soares, Siomar C. ; Santos, Anderson R. ; Guimarães, Luis C. ; Barbosa, Eudes ; Almeida, Sintia S. ; Abreu, Vinícius A.C. ; Carneiro, Adriana R. ; Ramos, Rommel T.J. ; Bakhtiar, Syeda M. ; Hassan, Syed S. ; Ussery, David W. ; On, Stephen ; Silva, Artur ; Schneider, Maria P. ; Lage, Andrey P. ; Miyoshi, Anderson ; Azevedo, Vasco. Campylobacter fetus subspecies: Comparative genomics and prediction of potential virulence targets. Gene (Amsterdam). v. 508, p. 145-156, issn: 0378-1119, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      67. Carneiro,Adriana R RAMOS, R. Genome Sequence of Exiguobacterium antarcticum B7, Isolated from a Biofilm in Ginger Lake, King George Island, Antarctica. Journal of Bacteriology (Print). v. 194, p. 6689-6690, issn: 0021-9193, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      68. RAMOS, R. T. J. ; SILVA, A. ; Carneiro,Adriana R ; PINTO, A. C. ; SOARES, S. C. ; Santos, A. R. ; de Almeida, S. S. ; DE SOUZA FERREIRA L. C. ; ABURJAILE, F. F. ; Barbosa, Eudes ; DORELLA, F ; ROCHA, F. S. ; CERDEIRA, L. ; Barbosa, Silvanira ; TAUCH, A. ; EDMAN, Judy ; SPIER, S. ; MIYOSHI, A ; Schneider, Maria Paula Cruz ; AZEVEDO, V. Genome Sequence of the Corynebacterium pseudotuberculosis Cp316 Strain, Isolated from the Abscess of a Californian Horse. Journal of Bacteriology (Print). v. 194, p. 6620-6621, issn: 0021-9193, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      69. SILVA, A. ; Ramos, R. T. J. ; RIBEIRO CARNEIRO, A. ; CYBELLE PINTO, A. ; de Castro Soares, S. ; RODRIGUES SANTOS, A. ; SILVA ALMEIDA, S. ; Guimaraes, L. C. ; FIGUEIRA ABURJAILE, F. ; VIEIRA BARBOSA, E. G. ; ALVES DORELLA, F. ; SOUZA ROCHA, F. ; SOUZA LOPES, T. ; KAWASAKI, R. ; GOMES SA, P. ; DA ROCHA COIMBRA, N. A. ; TEIXEIRA CERDEIRA, L. ; SILVANIRA BARBOSA, M. ; CRUZ SCHNEIDER, M. P. ; Miyoshi, A. ; SELIM, S. A. K. ; MOAWAD, M. S. ; Azevedo, V.. Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp31, Isolated from an Egyptian Buffalo. Journal of Bacteriology (Print). v. 194, p. 6663-6664, issn: 0021-9193, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      70. Ramos, Rommel; Carneiro, Adriana Ribeiro ; Azevedo, Vasco ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; Barh, D. ; SILVA, A.. Simplifier: the web tool to eliminate redundant NGS contigs. Bioinformation (Online) (Chennai). v. 8, p. 996-999, issn: 0973-2063, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      71. Soares, Siomar C. ; Trost, Eva ; Ramos, Rommel T.J. ; Carneiro, Adriana R. ; Santos, Anderson R. ; Pinto, Anne C. ; Barbosa, Eudes ; ABURJAILE, FLÁVIA ; Ali, Amjad ; DINIZ, CARLOS A.A. ; Hassan, Syed S. ; FIAUX, KARINA ; Guimarães, Luis C. ; Bakhtiar, Syeda M. ; PEREIRA, ULISSES ; Almeida, Sintia S. ; Abreu, Vinícius A.C. ; ROCHA, FLÁVIA S. ; Dorella, Fernanda A. ; Miyoshi, Anderson ; Silva, Artur ; Azevedo, Vasco ; Tauch, Andreas. Genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar equi strain 258 and prediction of antigenic targets to improve biotechnological vaccine production. Journal of Biotechnology. v. 1, p. 1-30, issn: 0168-1656, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      72. Hassan, S. S. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; RAMOS, R. T. J. ; Carneiro, Adriana Ribeiro ; Azevedo, Vasco Ariston Carvalho ; SILVA, A.. Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain Cp162, Isolated from Camel. Journal of Bacteriology (Print). v. 194, p. 5718-5719, issn: 0021-9193, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      73. Santos, Anderson R ; CARNEIRO, ADRIANA ; GALA-GARCÍA, ALFONSO ; PINTO, ANNE ; Barh, Debmalya ; Barbosa, Eudes ; ABURJAILE, FLÁVIA ; Dorella, Fernanda ; ROCHA, FLÁVIA ; GUIMARÃES, LUIS ; Zurita-Turk, Meritxell ; Ramos, Rommel ; ALMEIDA, SINTIA ; SOARES, SIOMAR ; PEREIRA, ULISSES ; ABREU, VINÍCIUS C ; Silva, Artur ; MIYOSHI, Anderson ; Azevedo, Vasco. The Corynebacterium pseudotuberculosis in silico predicted pan-exoproteome. BMC Genomics. v. 13, p. S6-S6, issn: 1471-2164, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      74. HASSAN, SYED SHAH GUIMARÃES, LUIS CARLOS PEREIRA, ULISSES DE PÁDUA ISLAM, ARSHAD Ali, Amjad BAKHTIAR, SYEDA MARRIAM RIBEIRO, DAYANA RODRIGUES DOS SANTOS, ANDERSON SOARES, SIOMAR DE CASTRO Dorella, Fernanda Pinto, Anne Cybelle Schneider, Maria Paula Cruz BARBOSA, MARIA SILVANIRA ALMEIDA, SÍNTIA ABREU, VINÍCIUS ABURJAILE, FLÁVIA Carneiro, Adriana Ribeiro Cerdeira, Louise Teixeira FIAUX, KARINA Barbosa, Eudes DINIZ, CARLOS ROCHA, FLAVIA S. Complete genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar ovis strain P54B96 isolated from antelope in South Africa obtained by rapid next generation sequencing technology. STAND GENOMIC SCI. v. 7, p. 189-199, issn: 1944-3277, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      75. Ramos, Rommel Thiago Jucá ; Carneiro, Adriana Ribeiro ; SOARES, SIOMAR DE CASTRO ; SANTOS, ANDERSON RODRIGUES DOS ; ALMEIDA, SINTIA ; GUIMARÃES, LUIS ; FIGUEIRA, FLÁVIA ; Barbosa, Eudes ; Tauch, Andreas ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur. Tips and tricks for the assembly of a Corynebacterium pseudotuberculosis genome using a semiconductor sequencer. Microbial Biotechnology (Online). v. n/a, p. n/a-n/a, issn: 1751-7915, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      76. RUIZ, J. ; Oliveira, S.C. ; TEIXEIRA, S. M. R. ; FRANCO, G. R. ; OLIVEIRA, G. C. ; Azevedo, V. ; et al. Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains. Plos One. v. 6, p. e18551, issn: 1932-6203, 2011.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      77. Cerdeira, Louise Teixeira ; Carneiro, Adriana Ribeiro ; Ramos, Rommel Thiago Jucá ; de Almeida, Sintia Silva ; D´Afonseca, Vivian ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; Baumbach, Jan ; Tauch, Andreas ; McCulloch, John Anthony ; Azevedo, Vasco Ariston Carvalho ; Silva, Artur. Rapid hybrid de novo assembly of a microbial genome using only short reads: Corynebacterium pseudotuberculosis I19 as a case study. Journal of Microbiological Methods. p. xx-xx, issn: 0167-7012, 2011.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      78. Ramos, Rommel TJ ; Carneiro, Adriana R ; Baumbach, Jan ; Azevedo, Vasco ; Schneider, Maria PC ; Silva, Artur. Analysis of quality raw data of second generation sequencers with Quality Assessment Software. BMC RESEARCH NOTES. v. 4, p. 130-130, issn: 1756-0500, 2011.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      79. CERDEIRA, L. Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain CIP 52.97, Isolated from a Horse in Kenya. Journal of Bacteriology (Print). v. 193, p. 7025-7026, issn: 0021-9193, 2011.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      80. CERDEIRA, L. T. ; PINTO, A. C. ; Schneider, M. P. C. ; de Almeida, S. S. ; dos Santos, A. R. ; Barbosa, E. G. V. ; Ali, A. ; Barbosa, M. S. ; Carneiro, A. R. ; Ramos, R. T. J. ; de Oliveira, R. S. ; Barh, D. ; Barve, N. ; Zambare, V. ; Belchior, S. E. ; Guimaraes, L. C. ; de Castro Soares, S. ; Dorella, F. A. ; Rocha, F. S. ; de Abreu, V. A. C. ; Tauch, A. ; Trost, E. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. ; Silva, A.. Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 Strain Isolated from Sheep in Patagonia, Argentina. Journal of Bacteriology (Print). v. 193, p. 6420-6421, issn: 0021-9193, 2011.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      81. Stynen, A. Complete Genome Sequence of Type Strain Campylobacter fetus subsp. venerealis NCTC 10354T. Journal of Bacteriology (Print). v. 193, p. 5871-5872, issn: 0021-9193, 2011.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      82. Silva, A. ; SCHNEIDER, M. P. C. ; CERDEIRA, L. ; Barbosa, M. S. ; RAMOS, R. T. J. ; CARNEIRO, A. R. ; Santos, R. ; Lima, M. ; D'Afonseca, V. ; ALMEIDA, S. S. ; SANTOS, A. R. ; SOARES, S. C. ; Soares, S. C. ; PINTO, A. C. ; ALI, A. ; DORELLA, F. A. ; Rocha, F. ; de Abreu, V. A. C. ; Shpigel, N. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V.. Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis I-19, strain isolated from Israel Bovine mastitis. Journal of Bacteriology (Print). v. 193, p. 323-324, issn: 0021-9193, 2010.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      83. MARIANO, D. C. B. ; Ramos, Rommel Thiago J ; Azevedo, Vasco. Montagem e finalização de genomas procariotos com mapeamento óptico: Um guia para montagem de genomas de alta precisão. 1 ed. Saarbrücken: Novas Edições Acadêmicas, 2016. v. 1, p. 76.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      84. Gomes de Sa, P. H. C. ; GUIMARÃES, L. C. ; VERAS, ADONNEY ALLAN OLIVEIRA ; BARH, D. ; Azevedo, Vasco ; SILVA, A. ; Thiago Jucá Ramos, Rommel. Next-Generation Sequencing and Data Analysis: Strategies, Tools, Pipelines and Protocols. Next-Generation Sequencing and Data Analysis: Strategies, Tools, Pipelines and Protocols. 1ed.London. Em: Vasco Azevedo;Debmalya Barh. (Org.). Next-Generation Sequencing and Data Analysis: Strategies, Tools, Pipelines and Protocols. 1ed.Chenai. : Elsevier. 2017.v. 1, p. 191-203.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      85. Silva, Artur ; Ramos, Rommel ; CARNEIRO, ADRIANA ; Almeida, Sintia ; De Abreu, Vinicius ; Santos, Anderson ; Soares, Siomar ; Pinto, Anne ; Guimarães, Luis ; Barbosa, Eudes ; Schneider, Paula ; Miyoshi, Anderson. Next-Generation Sequencing and Assembly of Bacterial Genomes. Next-Generation Sequencing and Assembly of Bacterial Genomes. 1ed.Cleveland. Em: Debmalya Barh; Vasudeo Zambare;Vasco Azevedo. (Org.). OMICS Applications in Biomedical, Agricultural. and Environmental Sciences. 1ed.Boca Raton. : CRC PRESS Taylor & Francis Group. 2013.v. 1, p. 367-383.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      86. SOARES, S. C. ; Ramos, Rommel Thiago Jucá ; SILVA, W. M. ; OLIVEIRA, L. C. ; AMORIN, L. G. ; Hirata, Raphael ; MATTOS-GUARALDI, A. ; Miyoshi, A. ; SILVA, A. ; AZEVEDO, V.. Corynebacterium pathogenic species in next-generation genomic era: the use of EDGAR and PIPS software and the importance of pathogenicity islands identification in pan-genomic analyses of pathogenic species. Microbial pathogens and strategies for combating them: science, technology and education?. 1ed.BADAJOZ. Em: . : Formatex Research Center. 2013.v. 3, p. 1584-1599.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      87. SOARES, S. C. ; Aparecida C. Magalhaes, Aryane ; Barbosa, Eudes ; Guimarães, Luís Carlos ; Almeida, S. S. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V ; Artur Luiz da Costa da Silva ; Ramos, Rommel T. J. ; Carneiro,Adriana R ; Cerdeira, Louise Teixeira ; Ali, Amjad ; Santos, Anderson Rodrigues ; Abreu, Vinicius A. C. ; Pinto, Anne C.. Plasticidade genômica e evolução bacteriana. Microbiologia in Foco, p. 31-38, 01 nov. 2011.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      88. Gomes de Sa, P. H. C. ; MIRANDA, FÁBIO ; VERAS, A. A. O. ; PINHEIRO, K. C. ; GUIMARAES, L. C. ; AZEVEDO, VASCO ARISTON ; SILVA, A. ; Ramos, Rommel Thiago J. GapBlaster - A graphical gap filler for prokaryote genomes. Em: X-Meeting 2015 - 11th International Conference of th, 2015, São Paulo. X-Meeting 2015 - 11th International Conference of th AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      89. Gomes de Sa, P. H. C. ; VERAS, A. A. O. ; BARAUNA, R. A. ; ASSIS DAS GRACAS, D. ; Carneiro, A. R. ; AZEVEDO, V ; Artur Luiz da Costa da Silva ; RAMOS, R. T. J.. GO4D - Gene Ontology for Dummies. Em: 23nd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, 2014, Boston. 23nd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      90. MARIANO, Diego. C. B. ; CASTRO, L. O. ; FOLADOR, EDSON LUIZ ; AGUIAR, Edgar. L. ; BENEVIDES, L. ; PEREIRA, F. L. ; RAMOS, R. T. J. ; AZEVEDO, V. Simba: a web tool for complete assembly of bacterial genomes. Em: ISCB- Latin American x-Meeting on Bioinformatics wit BSB E SoiBio, 2014, Belo Horizonte. ISCB- Latin American x-Meeting on Bioinformatics wit BSB E SoiBio, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      91. Gomes de Sa, P. H. C. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; Carneiro,Adriana R ; Pinheiro, Carina S. ; Pinto, A. C. ; SOARES, S. C. ; Schneider, Maria P. C. ; AZEVEDO, V ; Artur Luiz da Costa da Silva ; RAMOS, R. T. J.. The impact of quality filter for RNA-Seq based reference over differential gene expression for prokaryotes. Em: ISCB-Latin American, 2014, Belo Horizonte. ISCB-Latin American, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      92. NALLURI, JOSEPH ; KAMAPANTULA, BHANU ; BARH, D. ; AZEVEDO, V ; DE ALMEIDA, S. S. ; Artur Luiz da Costa da Silva ; RAMOS, R. T. J. ; Jain, N. ; BHATTACHARYA, ANTARIPA ; Ghosh P. Prioritization of disease candidates in miRNA-disease associations based on maximum weighted matching inference model and motif-based analysis. Em: ISCB-Latin American, 2014, Belo Horizonte. ISCB-Latin American, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      93. SANTOS, A. S. ; SANTOS, C. S. ; Hirata Jr, R ; Mattos-Guaraldi, AL ; Abreu, V. ; Ramos, Rommel T. J. ; AZEVEDO, V. ; Silva, Artur ; Pacheco, L.G.C.. A BIOINFORMATICS APPROACH FOR UNDERSTANDING THE HIGH BIOCHEMICAL VARIABILITY BETWEEN ISOLATES OF EMERGING CORYNEBACTERIAL PATHOGENS. Em: The third International Society for Computational Biology Latin America X-Meeting on Bioinformatics, 2014, Belo Horizonte. The Third International Society for Computational Biology Latin America X-Meeting on Bioinformatics, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      94. GUIMARAES, L. C. ; AZEVEDO, V. ; SOARES, S. C. ; Trost, Eva ; BLOM, J. ; Ramos, R. T. J. ; SILVA, A. ; BARH, D.. Genome informatics and vaccine targets in C. urealyticum using two whole genomes, comparative genomics, and reverse vaccinology. Em: ISCB-Latin American, 2014, Belo Horizonte. ISCB-Latin American, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      95. Aburjaile, F. F. ; RAMOS, R. T. J. ; BENEVIDES, L. J. ; VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO ; Artur Luiz da Costa da Silva ; AZEVEDO, V ; LOIR, YVES L. ; Falentin, H. Funcional genomics of Propionibacterium freudereichii. Em: ISCB-Latin American x meeting on Bioinformatics with BSB & Soibio, 2014, Belo Horizonte. ISCB-Latin American, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      96. PINHEIRO, K. C. ; Gomes de Sa, P. H. C. ; VERAS, ADONNEY A.O. ; AZEVEDO, V ; Artur Luiz da Costa da Silva ; RAMOS, R. T. J.. GC bias versus sequencing platforms: hypothesis and ways to evaluate, using Corynebacterium pseudotuberculosis as model. Em: ISCB-Latin American, 2014, Belo Horizonte. ISCB-Latin American, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      97. GUIMARÃES, L. C. ; SILVA, N. F. ; Ramos, Rommel ; SOUZA, B.M. ; MIYOSHI, A. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; ALVES, C. N. ; SILVA, A. ; J. Lameira ; AZEVEDO, V.. Modelagem por Homologia do proteoma predito de três linhagens de Corynebacterium pseudotuberculosis e Dinâmica Molecular da Metaloendopeptidase deste organismo. Em: 26? Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011, Foz do Iguaçu. Modelagem por Homologia do proteoma predito de três linhagens de Corynebacterium pseudotuberculosis e Dinâmica Molecular da Metaloendopeptidase deste organismo, 2011.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Rommel Thiago Juca Ramos ⇔ Luis Gustavo Carvalho Pacheco (12.0)
      1. ROCHA, DANILO J.P. ; AZEVEDO, Vasco ; BRENIG, BERTRAM ; Silva, Artur ; BLOM, JOCHEN ; RAMOS, ROMMEL T. ; AGUIAR, ERIC R.G. ; CHAPARTEGUI-GONZÁLEZ, ITZIAR ; FERNÁNDEZ-MARTÍNEZ, MARTA ; MARTÍNEZ-MARTÍNEZ, LUIS ; Pacheco, Luis G.C. ; NAVAS, JESÚS. Whole genome sequencing reveals misidentification of a multidrug-resistant urine clinical isolate as Corynebacterium urealyticum. Journal of Global Antimicrobial Resistance. v. n/a, p. 1010100, issn: 2213-7165, 2020.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. SANTOS, ANDRÉ S. ; RAMOS, ROMMEL T. ; SILVA, ARTUR ; HIRATA, RAPHAEL ; MATTOS-GUARALDI, ANA L. ; MEYER, ROBERTO ; AZEVEDO, VASCO ; Felicori, Liza ; PACHECO, LUIS G. C.. Searching whole genome sequences for biochemical identification features of emerging and reemerging pathogenic Corynebacterium species. FUNCTIONAL & INTEGRATIVE GENOMICS. v. n/a, p. 1010100-1010100, issn: 1438-793X, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      3. RAMOS, J. N. ; RODRIGUES, I. S. ; BAIO, P. V. P. ; VERAS, J. F. C. ; Ramos, R. T. J. ; PACHECO, L. G. C. ; AZEVEDO, V. ; Hirata Júnior, Raphael ; MARIN, M. A. ; GARALDI, ANA LUIZA M. ; VIEIRA, VERONICA V.. Genome sequence of a multidrug-resistant Corynebacterium striatum isolated from bloodstream infection from a nosocomial outbreak in Rio de Janeiro, Brazil. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz. v. 113, p. e180051, issn: 1678-8060, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      4. SANTOS, CAROLINA S. ; RAMOS, JULIANA N. ; VIEIRA, VERONICA V. ; PINHEIRO, CARINA S. ; MEYER, ROBERTO ; ALCANTARA-NEVES, NEUZA M. ; RAMOS, ROMMEL T. ; SILVA, ARTUR ; HIRATA, RAPHAEL ; Felicori, Liza ; DE ALEGRÍA PUIG, CARLOS RUIZ ; NAVAS, JESÚS ; AZEVEDO, VASCO ; MATTOS-GUARALDI, ANA L. ; PACHECO, LUIS G.C.. Efficient differentiation of Corynebacterium striatum , Corynebacterium amycolatum and Corynebacterium xerosis clinical isolates by multiplex PCR using novel species-specific primers. JOURNAL OF MICROBIOLOGICAL METHODS. v. 142, p. 1010100, issn: 0167-7012, 2017.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      5. SANTOS, LEONARDO N. ; SILVA, EDUARDO S. ; SANTOS, ANDRÉ S. ; DE SÁ, PABLO H. ; RAMOS, ROMMEL T. ; Silva, Artur ; COOPER, PHILIP J. ; BARRETO, MAURÍCIO L. ; LOUREIRO, SEBASTIÃO ; PINHEIRO, CARINA S. ; ALCANTARA-NEVES, NEUZA M. ; PACHECO, LUIS G.C.. De novo assembly and characterization of the Trichuris trichiura adult worm transcriptome using Ion Torrent sequencing. Acta Tropica. v. 159, p. 132-141, issn: 0001-706X, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      6. Mattos-Guaraldi, Ana L. ; Guimarães, Luis C. ; SANTOS, CAROLINA S. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; Carneiro, Adriana R. ; Soares, Siomar C. ; RAMOS, JULIANA N. ; SOUZA, CASSIUS ; VIEIRA, VERONICA V. ; Hirata, Raphael ; Azevedo, Vasco ; Pacheco, Luis G. C. ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel T. J.. Draft Genome Sequence of Corynebacterium striatum 1961 BR-RJ/09, a Multidrug-Susceptible Strain Isolated from the Urine of a Hospitalized 37-Year-Old Female Patient. Genome Announcements. v. 3, p. e00869-15, issn: 2169-8287, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      7. Pacheco, Luis G. C. ; Mattos-Guaraldi, Ana L. ; SANTOS, CAROLINA S. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; Guimarães, Luis C. ; ABREU, VINÍCIUS ; PEREIRA, FELIPE L. ; Soares, Siomar C. ; Dorella, Fernanda A. ; CARVALHO, ALEX F. ; LEAL, CARLOS G. ; FIGUEIREDO, HENRIQUE C. P. ; RAMOS, JULIANA N. ; VIEIRA, VERONICA V. ; FARFOUR, ERIC ; Guiso, Nicole ; Hirata, Raphael ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel T. J.. Draft Genome Sequences of Two Species of -Difficult-to-Identify- Human-Pathogenic Corynebacteria: Implications for Better Identification Tests. Journal of Genomics. v. 3, p. 82-84, issn: 1839-9940, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      8. CARVALHO, DAIANE M. ; DE SÁ, PABLO H. ; Castro, Thiago L. P. ; CARVALHO, RODRIGO D. ; PINTO, ANNE ; GIL, DANILO J. P. ; BAGANO, PRISCILLA ; BASTOS, BRUNO ; COSTA, LILIA F. M. ; Meyer, Roberto ; Silva, Artur ; AZEVEDO, Vasco ; Ramos, Rommel T. J. ; Pacheco, Luis G. C.. Reference genes for RT-qPCR studies in Corynebacterium pseudotuberculosis identified through analysis of RNA-seq data. Antonie van Leeuwenhoek (Gedrukt). v. 106, p. 605-614, issn: 0003-6072, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      9. Castro, Thiago L. P. ; Seyffert, Nubia ; Ramos, Rommel T. J. ; Barbosa, Silvanira ; CARVALHO, RODRIGO D. O. ; Pinto, Anne Cybelle ; Carneiro, Adriana Ribeiro ; Silva, Wanderson Marques ; Pacheco, Luis G. C. ; DOWNSON, CHRISTOPHER ; Schneider, Maria P. C. ; MIYOSHI, Anderson ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur. Ion Torrent-based transcriptional assessment of a Corynebacterium pseudotuberculosis equi strain reveals denaturing high-performance liquid chromatography a promising rRNA depletion method. Microbial Biotechnology (Online). v. 6, p. 168-177, issn: 1751-7915, 2013.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      10. Hassan, S. S. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; RAMOS, R. T. J. ; Carneiro, Adriana Ribeiro ; Azevedo, Vasco Ariston Carvalho ; SILVA, A.. Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain Cp162, Isolated from Camel. Journal of Bacteriology (Print). v. 194, p. 5718-5719, issn: 0021-9193, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      11. RUIZ, J. ; Oliveira, S.C. ; TEIXEIRA, S. M. R. ; FRANCO, G. R. ; OLIVEIRA, G. C. ; Azevedo, V. ; et al. Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains. Plos One. v. 6, p. e18551, issn: 1932-6203, 2011.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      12. SANTOS, A. S. ; SANTOS, C. S. ; Hirata Jr, R ; Mattos-Guaraldi, AL ; Abreu, V. ; Ramos, Rommel T. J. ; AZEVEDO, V. ; Silva, Artur ; Pacheco, L.G.C.. A BIOINFORMATICS APPROACH FOR UNDERSTANDING THE HIGH BIOCHEMICAL VARIABILITY BETWEEN ISOLATES OF EMERGING CORYNEBACTERIAL PATHOGENS. Em: The third International Society for Computational Biology Latin America X-Meeting on Bioinformatics, 2014, Belo Horizonte. The Third International Society for Computational Biology Latin America X-Meeting on Bioinformatics, 2014.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Rommel Thiago Juca Ramos ⇔ Antonio Carlos Rosário Vallinoto (11.0)
      1. BRAGA, MARCUS DE BARROS ; FERNANDES, RAFAEL DA SILVA ; SOUZA, GILBERTO NERINO DE ; ROCHA, JONAS ELIAS CASTRO DA ; DOLÁCIO, CÍCERO JORGE FONSECA ; TAVARES, IVALDO DA SILVA ; PINHEIRO, RAPHAEL RODRIGUES ; NORONHA, FERNANDO NAPOLEÃO ; RODRIGUES, LUANA LORENA SILVA ; Ramos, Rommel Thiago Jucá ; CARNEIRO, ADRIANA RIBEIRO ; BRITO, SILVANA ROSSY DE ; DINIZ, HUGO ALEX CARNEIRO ; BOTELHO, MARCEL DO NASCIMENTO ; VALLINOTO, ANTONIO CARLOS ROSÁRIO. Artificial neural networks for short-term forecasting of cases, deaths, and hospital beds occupancy in the COVID-19 pandemic at the Brazilian Amazon. PLoS One. v. 16, p. e0248161, issn: 1932-6203, 2021.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. ROCHA, Jonas Castro ; SOUZA JR., Gilberto Nerino ; BRITO, S. R ; FERNANDES, R. ; MANESCHY, Carlos ; CARNEIRO, Adriana Ribeiro ; RAMOS, Rommel Thiago Jucá ; VALLINOTO, ANTONIO CARLOS R. ; DINIZ, H. ; RODRIGUES, L. L ; TAVARES, I. ; DOLACIO, C. ; KAMEYAMA, C. ; SOUZA, A. ; POMPEU, H. ; PINHEIRO, R. ; NORONHA, F. ; BRAGA, M. ; BOTELHO, M.. Boletim Covid PA - No 04 (D.O.I. 10.13140/RG.2.2.17078.73283). 2020.
        [ busca Google | busca Bing ]
      3. ROCHA, Jonas Castro ; SOUZA JR., Gilberto Nerino ; BRITO, S. R ; FERNANDES, R. ; VALLINOTO, ANTONIO CARLOS R. ; CARNEIRO, Adriana Ribeiro ; RAMOS, Rommel Thiago Jucá ; DINIZ, H. ; RODRIGUES, L.L.S. ; MANESCHY, Carlos ; TAVARES, I. ; DOLACIO, C. ; NORONHA, F. ; KAMEYAMA, C. ; SOUZA, A. ; POMPEU, H. ; PINHEIRO, R. ; BRAGA, M. ; BOTELHO, M.. Boletim Covid PA - No 05 (D.O.I. 10.13140/RG.2.2.32722.17606). 2020.
        [ busca Google | busca Bing ]
      4. ROCHA, Jonas Castro ; SOUZA JR., Gilberto Nerino ; BRITO, S. R ; FERNANDES, R. ; VALLINOTO, ANTONIO CARLOS R. ; FOLADOR, Adriana Carneiro ; RAMOS, Rommel Thiago Jucá ; DINIZ, H. ; RODRIGUES, L.L.S. ; MANESCHY, Carlos ; TAVARES, I. ; DOLACIO, C. ; NORONHA, F. ; KAMEYAMA, C. ; SOUZA, A. ; POMPEU, H. ; PINHEIRO, R. ; BRAGA, M. ; BOTELHO, M.. Boletim Covid PA - No 06 (DOI: 10.13140/RG.2.2.32043.87847). 2020.
        [ busca Google | busca Bing ]
      5. ROCHA, Jonas Castro ; SOUZA JR., Gilberto Nerino ; BRITO, S. R ; FERNANDES, R. ; RODRIGUES, L.L.S. ; DINIZ, H. ; VALLINOTO, ANTONIO CARLOS R. ; FOLADOR, Adriana Carneiro ; RAMOS, Rommel Thiago Jucá ; TAVARES, I. ; DOLACIO, C. ; NORONHA, F. ; KAMEYAMA, C. ; SOUZA, A. ; POMPEU, H. ; PINHEIRO, R. ; BRAGA, M. ; BOTELHO, M.. Boletim Covid PA - No 07 (DOI: 10.13140/RG.2.2.28896.51205). 2020.
        [ busca Google | busca Bing ]
      6. ROCHA, Jonas Castro ; SOUZA JR., Gilberto Nerino ; BRITO, S. R ; FERNANDES, R. ; MANESCHY, Carlos ; VALLINOTO, ANTONIO CARLOS R. ; FOLADOR, Adriana Carneiro ; RAMOS, Rommel Thiago Jucá ; DINIZ, H. ; RODRIGUES, L.L.S. ; DOLACIO, C. ; TAVARES, I. ; NORONHA, F. ; PINHEIRO, R. ; BRAGA, M. ; BOTELHO, M.. Boletim Covid PA - No 08 (DOI: 10.13140/RG.2.2.21900.54401). 2020.
        [ busca Google | busca Bing ]
      7. ROCHA, Jonas Castro ; SOUZA JR., Gilberto Nerino ; BRITO, S. R ; FERNANDES, R. ; MANESCHY, Carlos ; VALLINOTO, ANTONIO CARLOS R. ; FOLADOR, Adriana Carneiro ; RAMOS, Rommel Thiago Jucá ; DINIZ, H. ; RODRIGUES, L.L.S. ; DOLACIO, C. ; TAVARES, I. ; NORONHA, F. ; PINHEIRO, R. ; BRAGA, M. ; BOTELHO, M.. Boletim Covid PA - No 09 (DOI: 10.13140/RG.2.2.32931.48169). 2020.
        [ busca Google | busca Bing ]
      8. ROCHA, Jonas Castro ; SOUZA JR., Gilberto Nerino ; BRITO, S. R ; FERNANDES, R. ; MANESCHY, Carlos ; VALLINOTO, ANTONIO CARLOS R. ; FOLADOR, Adriana Carneiro ; RAMOS, Rommel Thiago Jucá ; DINIZ, H. ; RODRIGUES, L.L.S. ; DOLACIO, C. ; TAVARES, I. ; NORONHA, F. ; PINHEIRO, R. ; BRAGA, M. ; BOTELHO, M.. Boletim Covid PA - No 10 (DOI: 10.13140/RG.2.2.33865.36967). 2020.
        [ busca Google | busca Bing ]
      9. ROCHA, Jonas Castro ; SOUZA JR., Gilberto Nerino ; BRITO, S. R ; FERNANDES, R. ; MANESCHY, Carlos ; VALLINOTO, ANTONIO C. ; FOLADOR, Adriana Carneiro ; RAMOS, Rommel Thiago Jucá ; DINIZ, H. ; RODRIGUES, L.L.S. ; DOLACIO, C. ; TAVARES, I. ; NORONHA, F. ; PINHEIRO, R. ; BRAGA, M. ; BOTELHO, M.. Boletim Covid PA - No 11 (DOI: 10.13140/RG.2.2.20638.56646). 2020.
        [ busca Google | busca Bing ]
      10. ROCHA, Jonas Castro ; SOUZA JR., Gilberto Nerino ; FERNANDES, R. ; MANESCHY, Carlos ; VALLINOTO, A. C. R. ; FOLADOR, Adriana Carneiro ; RAMOS, Rommel Thiago Jucá ; DINIZ, H. ; RODRIGUES, L.L.S. ; DOLACIO, C. ; TAVARES, I. ; NORONHA, F. ; PINHEIRO, R. ; BRAGA, M. ; BOTELHO, M.. Boletim Covid PA - No 12 (DOI: 10.13140/RG.2.2.33187.89124). 2020.
        [ busca Google | busca Bing ]
      11. ROCHA, Jonas Castro ; SOUZA JR., Gilberto Nerino ; BRITO, S. R ; FERNANDES, R. ; MANESCHY, Carlos ; VALLINOTO, ANTONIO C. ; FOLADOR, Adriana Carneiro ; RAMOS, Rommel Thiago Jucá ; DINIZ, H. ; RODRIGUES, L.L.S. ; DOLACIO, C. ; TAVARES, I. ; NORONHA, F. ; PINHEIRO, R. ; BRAGA, M. ; BOTELHO, M.. Boletim Covid PA - No 13 (DOI: 10.13140/RG.2.2.34731.26406). 2020.
        [ busca Google | busca Bing ]

    • Rommel Thiago Juca Ramos ⇔ Pedro Fernando da Costa Vasconcelos (2.0)
      1. CARNEIRO, Adriana Ribeiro ; CRUZ, A. C. R. ; Vallinoto, M ; Melo, D. V. ; Ramos, R. T. J. ; MEDEIROS, D B A ; SILVA, Eliana V P ; VASCONCELOS, P. F. C.. Molecular characterisation of dengue virus type 1 reveals lineage replacement during circulation in Brazilian territory. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz (Impresso). v. 107, p. 805-812, issn: 0074-0276, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. Casseb, S. M. M. ; Cardoso, J. F. ; Ramos, R. T. J. ; CARNEIRO, Adriana Ribeiro ; MRT, N. ; VASCONCELOS, P. F. C. ; SILVA, A.. Optimization of dengue virus genome assembling using GSFLX 454 pyrosequencing data: evaluation of assembling strategies. Genetics and Molecular Research. v. 11, p. 3688-3695, issn: 1676-5680, 2012.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Rommel Thiago Juca Ramos ⇔ Liza Figueiredo Felicori Vilela (2.0)
      1. SANTOS, ANDRÉ S. ; RAMOS, ROMMEL T. ; SILVA, ARTUR ; HIRATA, RAPHAEL ; MATTOS-GUARALDI, ANA L. ; MEYER, ROBERTO ; AZEVEDO, VASCO ; Felicori, Liza ; PACHECO, LUIS G. C.. Searching whole genome sequences for biochemical identification features of emerging and reemerging pathogenic Corynebacterium species. FUNCTIONAL & INTEGRATIVE GENOMICS. v. n/a, p. 1010100-1010100, issn: 1438-793X, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
      2. SANTOS, CAROLINA S. ; RAMOS, JULIANA N. ; VIEIRA, VERONICA V. ; PINHEIRO, CARINA S. ; MEYER, ROBERTO ; ALCANTARA-NEVES, NEUZA M. ; RAMOS, ROMMEL T. ; SILVA, ARTUR ; HIRATA, RAPHAEL ; Felicori, Liza ; DE ALEGRÍA PUIG, CARLOS RUIZ ; NAVAS, JESÚS ; AZEVEDO, VASCO ; MATTOS-GUARALDI, ANA L. ; PACHECO, LUIS G.C.. Efficient differentiation of Corynebacterium striatum , Corynebacterium amycolatum and Corynebacterium xerosis clinical isolates by multiplex PCR using novel species-specific primers. JOURNAL OF MICROBIOLOGICAL METHODS. v. 142, p. 1010100, issn: 0167-7012, 2017.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Rommel Thiago Juca Ramos ⇔ Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos (1.0)
      1. GOMES DE SÁ, PABLO ; VERAS, ADONNEY ; FONTANA, CARLA SUERTEGARAY ; ALEIXO, ALEXANDRE ; BURLAMAQUI, TIBÉRIO ; MELLO, CLAUDIO VIANNA ; DE VASCONCELOS, ANA TEREZA RIBEIRO ; PROSDOCIMI, FRANCISCO ; Ramos, Rommel ; SCHNEIDER, MARIA ; Silva, Artur. The assembly and annotation of the complete Rufous-bellied thrush mitochondrial genome. Mitochondrial DNA. v. 16, p. 1-2, issn: 1940-1736, 2015.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Rommel Thiago Juca Ramos ⇔ Luiz Ricardo Goulart Filho (1.0)
      1. RUIZ, J. ; Oliveira, S.C. ; TEIXEIRA, S. M. R. ; FRANCO, G. R. ; OLIVEIRA, G. C. ; Azevedo, V. ; et al. Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains. Plos One. v. 6, p. e18551, issn: 1932-6203, 2011.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Rommel Thiago Juca Ramos ⇔ Santuza Maria Ribeiro Teixeira (1.0)
      1. RUIZ, J. ; Oliveira, S.C. ; TEIXEIRA, S. M. R. ; FRANCO, G. R. ; OLIVEIRA, G. C. ; Azevedo, V. ; et al. Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains. Plos One. v. 6, p. e18551, issn: 1932-6203, 2011.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Rommel Thiago Juca Ramos ⇔ Sergio Costa Oliveira (1.0)
      1. RUIZ, J. ; Oliveira, S.C. ; TEIXEIRA, S. M. R. ; FRANCO, G. R. ; OLIVEIRA, G. C. ; Azevedo, V. ; et al. Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains. Plos One. v. 6, p. e18551, issn: 1932-6203, 2011.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Rommel Thiago Juca Ramos ⇔ Odir Antonio Dellagostin (1.0)
      1. ESLABÃO, MARCUS REDÜ ; KREMER, FREDERICO SCHMITT ; RAMOS, ROMMEL THIAGO JUCA ; SILVA, ARTUR LUIZ DA COSTA DA ; AZEVEDO, VASCO ARISTON DE CARVALHO ; Pinto, Luciano da Silva ; SILVA, ÉVERTON FAGONDE DA ; Dellagostin, Odir Antônio. Genome of Leptospira borgpetersenii strain 4E, a highly virulent isolate obtained from Mus musculus in southern Brazil. MEMORIAS DO INSTITUTO OSWALDO CRUZ. v. 113, p. 137-141, issn: 0074-0276, 2018.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Rommel Thiago Juca Ramos ⇔ Mauricio Lima Barreto (1.0)
      1. SANTOS, LEONARDO N. ; SILVA, EDUARDO S. ; SANTOS, ANDRÉ S. ; DE SÁ, PABLO H. ; RAMOS, ROMMEL T. ; Silva, Artur ; COOPER, PHILIP J. ; BARRETO, MAURÍCIO L. ; LOUREIRO, SEBASTIÃO ; PINHEIRO, CARINA S. ; ALCANTARA-NEVES, NEUZA M. ; PACHECO, LUIS G.C.. De novo assembly and characterization of the Trichuris trichiura adult worm transcriptome using Ion Torrent sequencing. Acta Tropica. v. 159, p. 132-141, issn: 0001-706X, 2016.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Rommel Thiago Juca Ramos ⇔ Fabrício Rodrigues dos Santos (1.0)
      1. RUIZ, J. ; Oliveira, S.C. ; TEIXEIRA, S. M. R. ; FRANCO, G. R. ; OLIVEIRA, G. C. ; Azevedo, V. ; et al. Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains. Plos One. v. 6, p. e18551, issn: 1932-6203, 2011.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Rommel Thiago Juca Ramos ⇔ Carlo José Freire de Oliveira (1.0)
      1. FELICE, ANDREI G. ; SANTOS, LEONARDO N. Q. ; KOLOSSOWSKI, IAN ; ZEN, FELIPE L. ; ALVES, LEANDRO G. ; RODRIGUES, THAÍS C. V. ; PRADO, LIGIA C. S. ; JAISWAL, ARUN K. ; TIWARI, SANDEEP ; MIRANDA, FÁBIO M. ; RAMOS, ROMMEL T. J. ; AZEVEDO, VASCO ; OLIVEIRA, CARLO J. F. ; BENEVIDES, LEANDRO J. ; SOARES, SIOMAR C.. Comparative genomics of Bordetella pertussis and prediction of new vaccines and drug targets. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. v. x, p. 1-17, issn: 0739-1102, 2021.
        [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

    • Rommel Thiago Juca Ramos ⇔ Gustavo Fioravanti Vieira (1.0)
      1. Ramos, Rommel. Bioinformática. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra




(*) Relatório criado com produções desde 2010 até 2021
Data de processamento: 06/11/2021 15:22:34