UFABC-professores

John Andrew Sims

I am an assistant professor in Biomedical Engineering at the Federal University of ABC (www.ufabc.edu.br), situated in a region just outside São Paulo, Brazil. My research interests include medical image processing in the area of Cardiology from magnetic resonance and positron emission tomography images and radiomic analysis of tumors. I am an associated member of the FAPESP project "Accurate Mapping of Cardiac Atrial Fibrilation, an experimental contribution", (FAPESP: 2018256062). I previously worked as a Senior Systems Analyst at the Heart Institute (Instituto do Coração, FMUSP), São Paulo Brazil, having completed my doctorate in sciences in Biomedical Engineering (Electronic Systems) in the Electrical Engineering department at the University of São Paulo, Brazil. I have a master of science degree in Sound and Vibration Studies from the Institute of Sound and Vibration Research (ISVR), Southampton University, United Kingdom (1994) and graduated in Pure Physics from the University of Nottingham, United Kingdom (1992). I am formally qualified to teach in the United Kingdom, possessing a Diploma in Teaching in the Lifelong Learning Sector (DTLLS), with a specialisation to teach Numeracy, from the University of Greenwich, United Kingdom (2010) and also hold a Certificate in English Language Teaching to Adults (CELTA) from Universidade of Cambridge ESOL Examinations (2003). I am a native English speaker, fluent in Portuguese, and passed the CELPE-BRAS Portuguese examination with upper intermediate level in 2012. (Texto informado pelo autor)

  • http://lattes.cnpq.br/4191073114324958 (12/04/2024)
  • Rótulo/Grupo: CECS
  • Bolsa CNPq:
  • Período de análise: 2017-HOJE
  • Endereço: Universidade Federal do ABC, Centro de Engenharia, Modelagem e Ciências Sociais Aplicadas. Rua Arcturus (Jd Antares) Anchieta 09606070 - São Bernardo do Campo, SP - Brasil Telefone: (11) 23206380
  • Grande área: [sem-grandeArea]
  • Área: [sem-area]
  • Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

Prêmios e títulos

Participação em eventos

Organização de eventos

Lista de colaborações

Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

  • Total de projetos de pesquisa (1)
    1. 2021-Atual. Mapeamento da atividade fibrilatória cardíaca acurada: uma contribuição experimental
      Descrição: Descrição: A fibrilação atrial (FA) é a arritmia cardíaca sustentada mais frequente na prática clínica, afetando entre 1 a 2 % da população mundial. Esse distúrbio tem alta morbidade e mortalidade, e tornou-se uma epidemia cardiovascular não infecciosa crônica, que representa uma séria ameaça à saúde humana, tornando um importante problema de saúde pública, e consumo de recursos. Nas últimas décadas a pesquisa básica e clínica possibilitou grandes avanços no aprimoramento do diagnóstico e tratamento da FA, tendo seu mecanismo gradualmente elucidado, mas não totalmente esclarecido. Durante a FA, a interpretação dos sinais e mapas disponibilizados pelos sistemas comerciais de mapeamento elétrico em muitos casos é complexo e incerta, dificultando a correta caracterização e localização das fontes arritmogênicas, reduzindo a eficácia do tratamento por ablação. A identificação correta do tipo de mecanismo e sua localização é o atual desafio dos eletrofisiologistas. Devido à complexidade desta arritmia e grande sensitividade a erros pelos atuais sistemas comerciais é importante que validações de propostas sejam feitas de forma cuidadosa sob através de experimentos com condições controladas mimetizando situações clínicas. O objetivo central deste projeto é de propor um modelo experimental in situ de FA induzida com estimulação elétrica e aquisição simultânea da atividade elétrica do epicárdio e de forma não invasiva para customização dos tradicionais mapas investigatórios durante FA. Os experimentos serão conduzidos em corações isolados de coelhos reperfundidos utilizando preparação Langendorff. A indução da FA será por um protocolo de restituição da estimulação por trem de pulsos padrão (S1-S1) no átrio esquerdo. A aquisição dos biopotenciais no epicárdio será realizada simultaneamente por eletrodos unipolares de contato e por um sistema de mapeamento óptico panorâmico. A aquisição da atividade elétrica não invasiva será por 64 eletrodos distribuídos igualmente entre as faces de um tanque hexagonal de acrílico e translúcido, aos que estarão em contato com uma solução de Krebs-Henseleit ou Tyrode aquecida (37oC). Assim, o coração estará submerso no tanque com a solução nutriente em seu interior, de forma a manter sua atividade fisiológica e conduzir seus impulsos elétricos até os eletrodos da face do tanque. A partir dos sinais de não contato serão estimados os do epicárdio pelo método de imagem eletrocardiográfica não invasiva (iECG) através discretização das superfícies 3D do epicárdio e torso em elementos triangulares e a utilização do método de regularização de Tikhonov. As análises dos sinais e geração dos mapas eletrofisiológicos e eletrocardiográficos serão realizadas utilizando o software Matlab Versão 9.7 (R2019) (Mathworks, Inc.). Métricas e mapas no domínio do tempo e frequência serão calculadas a partir dos sinais ópticos e elétricos do epicárdio e não-invasivos. Através de um pipeline de técnicas de pré-processamento e pós-processamento a serem aplicadas nos sinais obtidos pelo mapeamento elétrico, pretende-se gerar mapas durante a FA mais realísticos com a fisiopatologia da FA. O presente projeto de pesquisa, inspirado pelo caráter interdisciplinar entre as áreas da engenharia e da saúde, une vertentes importantes na área de processamento de sinais biológicos, hardware e experimentação animal contemplando desde a validação das técnicas a uma possível implementação em equipamentos médico-hospitalares. O aperfeiçoamento e desenvolvimento de novas técnicas a serem implementadas as atuais tecnologias de saúde representa assim uma inovação a fim de contribuir no diagnóstico e prognóstico médico dentro de ambientes médico-hospitalares.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (6) . Integrantes: John Andrew Sims - Integrante / João Loures Salinet Júnior - Coordenador / Idágene Aparecida Cestari - Integrante / Ilija Uzelac - Integrante / Marcela Sorelli Carneiro Ramos - Integrante / Maria S Guillem - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
      Membro: John Andrew Sims.
      Descrição: A fibrilação atrial (FA) é a arritmia cardíaca sustentada mais frequente na prática clínica, afetando entre 1 a 2 % da população mundial. Esse distúrbio tem alta morbidade e mortalidade, e tornou-se uma epidemia cardiovascular não infecciosa crônica, que representa uma séria ameaça à saúde humana, tornando um importante problema de saúde pública, e consumo de recursos. Nas últimas décadas a pesquisa básica e clínica possibilitou grandes avanços no aprimoramento do diagnóstico e tratamento da FA, tendo seu mecanismo gradualmente elucidado, mas não totalmente esclarecido. Durante a FA, a interpretação dos sinais e mapas disponibilizados pelos sistemas comerciais de mapeamento elétrico em muitos casos é complexo e incerta, dificultando a correta caracterização e localização das fontes arritmogênicas, reduzindo a eficácia do tratamento por ablação. A identificação correta do tipo de mecanismo e sua localização é o atual desafio dos eletrofisiologistas. Devido à complexidade desta arritmia e grande sensitividade a erros pelos atuais sistemas comerciais é importante que validações de propostas sejam feitas de forma cuidadosa sob através de experimentos com condições controladas mimetizando situações clínicas. O objetivo central deste projeto é de propor um modelo experimental in situ de FA induzida com estimulação elétrica e aquisição simultânea da atividade elétrica do epicárdio e de forma não invasiva para customização dos tradicionais mapas investigatórios durante FA. Os experimentos serão conduzidos em corações isolados de coelhos reperfundidos utilizando preparação Langendorff. A indução da FA será por um protocolo de restituição da estimulação por trem de pulsos padrão (S1-S1) no átrio esquerdo. A aquisição dos biopotenciais no epicárdio será realizada simultaneamente por eletrodos unipolares de contato e por um sistema de mapeamento óptico panorâmico. A aquisição da atividade elétrica não invasiva será por 64 eletrodos distribuídos igualmente entre as faces de um tanque hexagonal de acrílico e translúcido, aos que estarão em contato com uma solução de Krebs-Henseleit ou Tyrode aquecida (37oC). Assim, o coração estará submerso no tanque com a solução nutriente em seu interior, de forma a manter sua atividade fisiológica e conduzir seus impulsos elétricos até os eletrodos da face do tanque. A partir dos sinais de não contato serão estimados os do epicárdio pelo método de imagem eletrocardiográfica não invasiva (iECG) através discretização das superfícies 3D do epicárdio e torso em elementos triangulares e a utilização do método de regularização de Tikhonov. As análises dos sinais e geração dos mapas eletrofisiológicos e eletrocardiográficos serão realizadas utilizando o software Matlab Versão 9.7 (R2019) (Mathworks, Inc.). Métricas e mapas no domínio do tempo e frequência serão calculadas a partir dos sinais ópticos e elétricos do epicárdio e não-invasivos. Através de um pipeline de técnicas de pré-processamento e pós-processamento a serem aplicadas nos sinais obtidos pelo mapeamento elétrico, pretende-se gerar mapas durante a FA mais realísticos com a fisiopatologia da FA. O presente projeto de pesquisa, inspirado pelo caráter interdisciplinar entre as áreas da engenharia e da saúde, une vertentes importantes na área de processamento de sinais biológicos, hardware e experimentação animal contemplando desde a validação das técnicas a uma possível implementação em equipamentos médico-hospitalares. O aperfeiçoamento e desenvolvimento de novas técnicas a serem implementadas as atuais tecnologias de saúde representa assim uma inovação a fim de contribuir no diagnóstico e prognóstico médico dentro de ambientes médico-hospitalares.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (1) . Integrantes: João Loures Salinet Júnior - Coordenador / Maria S Guillem - Integrante / Idágene Aparecida Cestari - Integrante / Marcela Sorelli Carneiro Ramos - Integrante / John Sims - Integrante / ILIJA UZELAC - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T & A: 5 / Número de orientações: 1
      Membro: João Loures Salinet Júnior.

Prêmios e títulos

  • Total de prêmios e títulos (0)

    Participação em eventos

    • Total de participação em eventos (0)

      Organização de eventos

      • Total de organização de eventos (0)

        Lista de colaborações

        • Colaborações endôgenas (4)
          • John Andrew Sims ⇔ Anderson Gabriel Santiago (2.0)
            1. SANTIAGO, A. G.; SANTIAGO, A. G. ; MELLO, S. G. ; SIMS, J. A.. Periodic Signal Generation using an Approximation to the Analytical Wave Equation Solution. Em: Ibero-Latin American Congress on Computational Methods in Engineering, 2020.
            2. SIMS, JOHN ; SANTIAGO, ANDERSON ; SANTIAGO, A. G. ; SALINET, JOÃO ; GUTIERREZ, MARCO. Directional Analysis of 2D Cardiac Motion Slices U}sing the Discrete Helmholtz Hodge Decomposition. Em: 46th Computing in Cardiology (CinC) Conference, v. 45, 2019.

          • John Andrew Sims ⇔ Erick Darío León Bueno de Camargo (2.0)
            1. FIDELIS, V. J. ; CAMARGO, E. D. L. B. ; AMATO, M. B. P. ; SIMS, J.A.. Extraction of Pendelluft Features from Electrical Impedance Tomography Images. Em: Teodiano Freire Bastos-Filho; Eliete Maria de Oliveira Caldeira; Anselmo Frizera-Neto. (Org.). Extraction of Pendelluft Features from Electrical Impedance Tomography Images. 1ed.Cham. : Springer International Publishing. 2022.v. 83, p. 1979-1984.
            2. FIDELIS, V. J. ; CAMARGO, E. D. L. B. ; AMATO, M. B. P. ; SIMS, J.A.. Extraction of Pendelluft Features from Electrical Impedance Tomography Images. Em: XXVII Brazilian Congress on Biomedical Engineering, v. 27, 2020.

          • John Andrew Sims ⇔ João Loures Salinet Júnior (2.0)
            1. SANDOVAL, I. ; MARQUES, V. G. ; SIMS, J. ; RODRIGO, M. ; GUILLEM, M. S. ; Salinet, J. L.. Non-invasive Mechanism Classification and Localization in Supraventricular Cardiac Arrhythmias. Em: 48th Computing in Cardiology conference, v. 48, p. 1, 2021.
            2. SIMS, JOHN ; SANTIAGO, ANDERSON ; SANTIAGO, A. G. ; SALINET, JOÃO ; GUTIERREZ, MARCO. Directional Analysis of 2D Cardiac Motion Slices U}sing the Discrete Helmholtz Hodge Decomposition. Em: 46th Computing in Cardiology (CinC) Conference, v. 45, 2019.

          • John Andrew Sims ⇔ Ricardo Suyama (1.0)
            1. FERREIRA, LEONARDO A. ; BERALDO, ROBERTO G. ; Suyama, Ricardo ; Takahata, André K. ; SIMS, JOHN A.. Deep image prior with sparsity constraint for limited-angle computed tomography reconstruction. Applied Mathematics for Modern Challenges. v. 1, p. 105-125, issn: 2994-7669, 2023.




        Data de processamento: 16/11/2024 16:24:34