UFABC-professores

Danilo Trabuco do Amaral

Bacharel em Ciências Biológicas pela Universidade Federal de São Carlos - Sorocaba/ UFSCar (2009) e Bacharel em Sistemas de Informação também pela UFSCar (2017). Doutor em Ciências com ênfase em biologia molecular e bioquímica (2014), pelo programa de genética evolutiva e biologia molecular (PPGGEV) da Universidade Federal de São Carlos (UFSCar); foi pesquisador visitante no Instituto de Tecnologias e Ciências Avançadas (AIST), Tsukuba-JP (2013) e Sapporo-JP (2018), e na Vanderbilt University, Nashville-EUA (2016). Foi Pós-doutorando no Laboratório de Bioquímica e Biotecnologia de Sistemas Bioluminescentes (UFSCar-Sorocaba), pós-doutorando no Instituto Oceanográfico na Universidade de São Paulo (USP) e professor colaborador no Programa de Pós-graduação em Biotecnologia e Monitoramento Ambiental (PPGBMA/ UFSCar-Sorocaba). Atualmente, é Professor Adjunto A junto a Universidade Federal do ABC (UFABC). Apresenta experiência na área de bioinformática, biologia molecular, biotecnologia e bioquímica. E-mail para contato: danilo.trabuco@ufabc.edu.br (Texto informado pelo autor)

http://lattes.cnpq.br/1962677068147121 (28/11/2023)

Rótulo/Grupo: CCNH

Bolsa CNPq:

Período de análise: 2022-HOJE

Endereço: Universidade Federal do ABC, Centro de Ciências Naturais e Humanas. Avenida dos Estados Santa Terezinha 09210580 - Santo André, SP - Brasil Telefone: (11) 33567382

Grande área: Ciências Biológicas

Área: Biotecnologia

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (10)
1. VITOR, LUCAS ; AMARAL, DANILO TRABUCO ; CORRÊA, DANIELE BUSSIOLI ALVES ; FERREIRA-TONIN, MARIANA ; LUCON, EMANUEL TORRES ; APPY, MARIANA PEREIRA ; TOMASETO, ALEX AUGUSTO ; DESTÉFANO, SUZETE APARECIDA LANZA. Streptomyces hilarionis sp. nov. and Streptomyces hayashii sp. nov., two new strains associated with potato scab in Brazil. INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY. v. 73, p. 5916, issn: 1466-5026, 2023.
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2. BONATELLI, I.A.S. ; FRANCO, F. F. ; AMARAL, D.T.. Barren lives: biodiversity and diversification in arid regions. FRONTIERS IN ECOLOGY AND EVOLUTION. v. 11, p. 1-2, issn: 2296-701X, 2023.
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3. FRANCO, RAFAEL A. L. ; BRENNER, GABRIEL ; ZOCCA, VITÓRIA F. B. ; DE PAIVA, GABRIELA B. ; LIMA, RAYANE N. ; RECH, ELIBIO L. ; Amaral, Danilo T. ; LINS, MILCA R. C. R. ; PEDROLLI, DANIELLE B.. Signal Amplification for Cell-Free Biosensors, an Analog-to-Digital Converter. ACS Synthetic Biology. v. 1, p. 1, issn: 2161-5063, 2023.
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4. Amaral, Danilo T.; BONATELLI, ISABEL A. S.. Opsin diversity and evolution in the superfamily: Insights from transcriptome data. INSECT MOLECULAR BIOLOGY. v. 1, p. 1, issn: 0962-1075, 2023.
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5. FRANCISCONI, ANA FLÁVIA ; MARROQUÍN, JONATHAN ANDRE MORALES ; CAUZ-SANTOS, LUIZ AUGUSTO ; VAN DEN BERG, CÁSSIO ; MARTINS, KAUANNE KAROLLINE MORENO ; COSTA, MARCONES FERREIRA ; PICANÇO-RODRIGUES, DORIANE ; DE ALENCAR, LUCIANO DELMODES ; ZANELLO, CESAR AUGUSTO ; COLOMBO, CARLOS AUGUSTO ; HERNÁNDEZ, BRENDA GABRIELA DÍAZ ; AMARAL, DANILO TRABUCO ; LOPES, MARIA TERESA GOMES ; VEASEY, ELIZABETH ANN ; ZUCCHI, MARIA IMACULADA. Complete chloroplast genomes of six neotropical palm species, structural comparison, and evolutionary dynamic patterns. Scientific Reports. v. 13, p. 20635, issn: 2045-2322, 2023.
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6. FRANCO, FERNANDO FARIA ; AMARAL, DANILO TRABUCO ; BONATELLI, ISABEL A. S. ; ROMEIRO-BRITO, MONIQUE ; TELHE, MILENA CARDOSO ; MORAES, EVANDRO MARSOLA. Evolutionary Genetics of Cacti: Research Biases, Advances and Prospects. Genes. v. 13, p. 452, issn: 2073-4425, 2022.
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7. ROMEIRO-BRITO, MONIQUE ; TELHE, MILENA CARDOSO ; AMARAL, DANILO TRABUCO ; FRANCO, FERNANDO FARIA ; MORAES, EVANDRO MARSOLA. A target Capture Probe Set Useful for Deep- and Shallow-Level Phylogenetic Studies in Cactaceae. Genes. v. 13, p. 707, issn: 2073-4425, 2022.
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8. AMARAL, DANILO TRABUCO; BONATELLI, ISABEL A.S. ; ROMEIRO-BRITO, MONIQUE ; MORAES, EVANDRO MARSOLA ; FRANCO, FERNANDO FARIA. Spatial patterns of evolutionary diversity in Cactaceae show low ecological representation within protected areas. BIOLOGICAL CONSERVATION. v. 273, p. 109677, issn: 0006-3207, 2022.
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9. TRABUCO AMARAL, DANILO; MITANI, YASUO ; APARECIDA SILVA BONATELLI, ISABEL ; CERRI, RICARDO ; OHMIYA, YOSHIHIRO ; VIVIANI, VADIM. Genome analysis of Phrixothrix hirtus (Phengodidae) railroad worm shows the expansion of odorant-binding gene families and positive selection on morphogenesis and sex determination genes. GENE. v. x, p. 146917, issn: 0378-1119, 2022.
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10. MOREIRA, A. C. ; AMARAL, D. T. ; Gabriel, G. V. M. ; VIVIANI, V. R.. Cloning and molecular properties of a novel luciferase from the Brazilian Bicellonycha lividipennis (Lampyridae: Photurinae) firefly: comparison with other firefly luciferases. PHOTOCHEMICAL SCIENCES (ONLINE). v. 21, p. 1, issn: 1474-9092, 2022.
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Livros publicados/organizados ou edições (1)
1. AMARAL, D.T.; ROMEIRO-BRITO, MONIQUE ; BONATELLI, I.A.S.. Bioluminescence Methods and Protocols, Volume 2. 4 ed. New York: Springer, 2022. v. XV, p. 427.
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Capítulos de livros publicados (0)
Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (0)
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (0)
Demais tipos de produção bibliográfica (0)

Produção técnica

Programas de computador com registro de patente (0)
Programas de computador sem registro de patente (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (0)

Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (1)
1. João Alfredo Teodoro. Proteínas Antimicrobianas do Mandacaru (Cactacea): Abordagem In Silico para Terapias Inovadoras na Cicatrização de Feridas. Dissertação (Mestrado em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC, . Início: 2023.
  Orientador: Danilo Trabuco do Amaral.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (1)
1. Graziela Sória Virgem. Desenvolvimento de pipeline de screening virtual invertido para identificação de sistemas bioluminescentes. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia) - Universidade Federal do ABC, . Início: 2022.
  Orientador: Danilo Trabuco do Amaral.
Iniciação científica (7)
1. Daniel Kenji Matuo. Desvendando o Mecanismo Molecular da Produção de teia e veneno em Orfelia fultoni (Diptera: Keroplatidae): Uma Abordagem in silico a partir de dados de transcriptoma. Iniciação científica (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, . Início: 2023.
  Orientador: Danilo Trabuco do Amaral.
2. Thais Kaori Enoki Takishita. Iluminando as Profundezas: Desvendando o Potencial das Espécies Bioluminescentes Marinhas na Conservação e Compreensão das Mudanças Climáticas. Iniciação científica (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, . Início: 2023.
  Orientador: Danilo Trabuco do Amaral.
3. Maria Cecilia Oliveira Villela. Bioprospecção Computacional para Identificação de Potenciais Agentes Anticancerígenos da Curcuma.. Iniciação científica (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, . Início: 2023.
  Orientador: Danilo Trabuco do Amaral.
4. Julia de Oliveria. Desvendando o mandacaru (Cactaceae): perspectivas inovadoras para o controle de manchas e oleosidade na pele por meio da bioprospecção in silico.. Iniciação científica (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2023.
  Orientador: Danilo Trabuco do Amaral.
5. Ciro benevides. Explorando o conhecimento popular do mandacaru no tratamento de doenças reumáticas: uma abordagem de prospecção in silico.. Iniciação científica (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, . Início: 2023.
  Orientador: Danilo Trabuco do Amaral.
6. Giulia de Oliveira Machado. Bioprospecção das expressões gênicas e vias metabólicas do Mandacaru (Cactaceae) visando doenças do sistema urinário.. Iniciação científica (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2023.
  Orientador: Danilo Trabuco do Amaral.
7. Maria Izadora Oliveira Cardoso. Avaliação in silico de Moléculas do Mandacaru (Cereus jamacaru: Cereeae) no Tratamento da Obesidade e Doenças Cardiovasculares: Uma Abordagem de Docking Molecular.. Iniciação científica (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2023.
  Orientador: Danilo Trabuco do Amaral.
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (1)
1. Hera Campestre Cruz. CLUSTERS NA LITERATURA CIENTÍFICA: GENÉTICA DA ENDOMETRIOSE. (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do ABC, . 2023.
  Orientador: Danilo Trabuco do Amaral.
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (2)

2023-Atual. Levantamento de organismos bioluminescentes da Estacao Ecologica de Jureia-Itatins: biodiversidade, evolucao molecular e bioindicador ambiental
Descrição: O Brasil é um dos países mais biodiversos no mundo, sendo a Floresta Atlântica refúgio e berço para diversas espécies. A Estação Ecológica de Juréia-Itatins (EEJI) possui um dos poucos remanescentes de continnum florestal desta formação altamente ameaçada no estado de São Paulo. Assim, a EEJI engloba distintos habitats, de costões rochosos, praias e mangues até importantes bacias de rios estaduais, demonstrando claramente sua relevância para conservação. Logo, o levantamento da biodiversidade local, a compreensão das relações evolutivas e ecológicas das espécies que ocorrem na EEJI são fundamentais para a manutenção adequada da Unidade, sua conservação e uso sustentável de suas riquezas naturais. Apesar de ser reconhecido como um dos principais hotspots de biodiversidade em espécies, a Floresta Atlântica ainda foi pouco explorada quanto à bioluminescência entre espécies terrestres, de água doce, salobra e de mangue. A bioluminescência, emissão de luz fria visível emitida por organismos vivos, é um dos fenômenos biológicos mais intrigantes conhecidos. Ela é resultante de processos bioquímicos observados em vários táxons, desde bactérias até vertebrados, e apresenta importantes papéis biológicos para os mesmos, como defesa, atração de presas e comunicação intra- e interespecífica. Assim, esta proposta de foco interdisciplinar, tem como objetivo realizar o levantamento da diversidade de organismos bioluminescentes terrestres e aquáticos dentro dos limites da EEJI, e realizar estudos filogenéticos e análises populacionais em espécies de Diptera e Coleoptera. Para isso, serão realizadas coletas e observações em campo, assim como o uso de técnicas de biologia molecular e de análises filogenéticas e demográficas. Espera-se com esta proposta, auxiliar os planos de conservação e manejo da EEJI, bem como conhecer melhor nossa fauna bioluminescente, e seu potencial uso como bioindicadores ambientais.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Danilo Trabuco do Amaral - Coordenador / ROSA, SP - Integrante / Fernando Faria Franco - Integrante / Anderson Garbuglio de Oliveira - Integrante / BONATELLI, ISABEL A. S. - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Danilo Trabuco do Amaral.
2023-Atual. Bioprospeccao de produtos genicos e vias metabolicas em mandacaru (Cactaceae) com finalidade biotecnologica: explorando o conhecimento popular usando tecnologias omicas
Descrição: A bioprospecção, que envolve a busca de macromoléculas em fontes naturais para uso econômico, ecológico e social, tem se tornado uma área de crescente interesse nas últimas décadas. A descoberta de novos compostos bioativos, como fármacos, enzimas industriais e produtos químicos naturais, tem sido amplamente explorada visando soluções inovadoras e sustentáveis para problemas enfrentados pela sociedade. As plantas são fontes ricas e diversificadas de compostos químicos com potencial para uso em diversos setores, e o conhecimento tradicional associado ao uso de plantas medicinais tem sido uma importante base para a bioprospecção no mercado brasileiro. O potencial biotecnológico das plantas do clima semiárido brasileiro, como o mandacaru (Cereus jamacaru D.C.), um cacto amplamente distribuído na região Nordeste do país, ainda é pouco explorado. Apesar de seu uso tradicional na medicina popular e em outras aplicações, há uma falta de compreensão a respeito das biomoléculas envolvidas nos processos biotecnológicos associados a essas plantas. Neste projeto serão utilizados dados ômicos da espécie C. jamacaru e ferramentas de bioinformática para compreensão de genes, isoformas e vias metabólicas envolvidas nas propriedades medicinais, industriais e ecológicas desta planta. Síntese gênica e expressão heteróloga dos genes também são processos fundamentais para um melhor entendimento de sua aplicação biotecnológica. As informações obtidas serão aplicadas em diferentes áreas da biotecnologia, visando explorar o potencial do mandacaru de forma sustentável e sugerir seu uso em produtos biotecnológicos inovadores. O projeto busca também preencher a lacuna de conhecimento molecular associado às plantas do semiárido brasileiro, com foco nas propriedades e potencialidades biotecnológicas do mandacaru.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Danilo Trabuco do Amaral - Coordenador / BONATELLI, I.A.S. - Integrante / Fernando Faria Franco - Integrante / Marcus Xavier Senra - Integrante / Milca Lins - Integrante / Cristina Fürstenau - Integrante / Tales Costa Silva - Integrante.
Membro: Danilo Trabuco do Amaral.

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (0)

Participação em eventos

Total de participação em eventos (1)

Evolution Meeting 2023. Abiotic Changes and Natural Selection Drive Genomic Differentiation and Rapid Speciation in Cereus fernambucensis subsp. and Cereus insularis (Cereeae). 2023. (Congresso).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (2)

CARREIRA, A. C. ; AREAS, A. P. M. ; FURSTENAU, C. ; AMARAL, D.T. ; REZENDE, J. C. ; BRUMANO, L. ; LINS, MILCA R. C. R. ; MATSUDO, M. ; SENRA, M. X. ; JESUS, S. ; SILVA, T. C.. II Semana de Biotecnologia da UFABC. 2023. Outro
BRUMANO, L. P. ; SENRA, M. V. X. ; FURSTENAU, C. R. ; ARÊAS, A. P. M. ; AMARAL, D. T. ; LINS, M. R. C. R. ; REZENDE, J. C. ; NISHIYAMA, A. C. O. C. ; SILVA, T. A. C. E. ; MATSUDO, M. C. ; SILVA, M. F. L. ; JESUS, S. S.. I Semana de Biotecnologia da UFABC. 2022. Outro

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (1)

Danilo Trabuco do Amaral ⇔ Milca Rachel da Costa Ribeiro Lins (1.0)
FRANCO, RAFAEL A. L. ; BRENNER, GABRIEL ; ZOCCA, VITÓRIA F. B. ; DE PAIVA, GABRIELA B. ; LIMA, RAYANE N. ; RECH, ELIBIO L. ; AMARAL, DANILO T. ; LINS, MILCA R. C. R. ; Pedrolli, Danielle B.. Signal Amplification for Cell-Free Biosensors, an Analog-to-Digital Converter. ACS Synthetic Biology. v. 12, p. 2819-2826, issn: 2161-5063, 2023.
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Data de processamento: 23/12/2023 13:24:06

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