Especialistas Seniores em Covid-19 com atuação no Brasil

Thereza Amelia Soares da Silva

Bacharel em Ciências Biológicas (1994), mestre em Química (1996) e doutor em Química (2001) pela Universidade Federal de Pernambuco com doutorado sanduiche no Scripps Research Institute, EUA sob orientação conjunta dos Professores Ricardo Ferreira e Arthur Olson. Durante o doutorado realizou visitas de 1 ano à University of Houston (1999-2000) (supervisão do Prof. James Briggs) e ao Pacific Northwest National Laboratory (2000) (supervisão do Dr. T.P. Straatsma). Pós-doutoramento no Eidgenössische Technische Hochschule Zürich, Suíça sob a supervisão do Professor Wilfred van Gunsteren (2001-2003) e na École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Suíça sob a direção do Professor Kai Johnson (2005). Em outubro de 2005 tornou-se Senior Research Scientist no Pacific Northwest National Laboratory, USA (2005-2009). Em 2010 tornou-se Professor (tenured) do Departamento de Química Fundamental da UFPE. Em Em 2020 tornou-se Professor Titular da Universidade de São Paulo. Entre 2013 e 2020 atuou como pesquisador convidado na École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Suíça, na Umeå Universitet, Suécia, no National Institute of Infectious Diseases em Tokyo, e no Hylleraas Centre for Quantum Molecular Sciences at Universitet i Oslo, Noruega. Desde 2020 atua como editora associada do Journal of Chemical Information da American Chemical Society. Seu interesse cientifico está centrado na aplicação de métodos e simulações computacionais para a investigação de processos biomoleculares e para a interpretação de observações experimentais à partir de uma perspectiva molecular. A sua principal linha de pesquisa está centrada no desenvolvimento e aplicação de modelos atomísticos para a simulação computacional de matéria macia com enfâse em membranas bacterianas e polímeros moleculares. (https://www.biomatsite.net) (Texto informado pelo autor)

https://lattes.cnpq.br/7252959688681950 (06/09/2020)

Rótulo/Grupo:

Bolsa CNPq: Nível 1D

Período de análise:

Endereço: Universidade Federal de Pernambuco, Centro de Ciências Exatas e da Natureza, Departamento de Química Fundamental. Avenida Professor Luiz Freire S/N Cidade Universitária 50740540 - Recife, PE - Brasil Telefone: (081) 21268440 Fax: (081) 21268440 URL da Homepage: https://dqfnet.ufpe.br/biomat

Grande área: Ciências Exatas e da Terra

Área: Química

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (44)
1. Soares, Thereza A. ; WAHAB, HABIBAH. An Outlook of the Development and Application of Molecular Simulations in Latin America. Journal of Chemical Information and Modeling. v. 60, p. 435-438, issn: 1549-9596, 2020.
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Livros publicados/organizados ou edições (0)
Capítulos de livros publicados (4)
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2. Cunha, R. A. ; SOARES, T. A. ; Pontes, F.J.S. ; Franca, E. ; Lins, R. D.. The molecular structure and conformational dynamics of chitosan polymers: An integrated perspective from experiments and computational simulations. Em: Karunaratn, D. N.. (Org.). The Complex World of Polysaccharides. 1ed.New York. : InTech - Open Access Publisher. 2012.v. 00, p. 229-256.
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Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (2)
1. Pontes, F.J.S. ; Soares, T.A. ; Lins, R. D.. Structural dynamics of Pseudomonas aeruginosa lipid A as a function of the number of acyl chains. Em: 2011 Materials Research Society Spring Meeting, 2011, San Francisco. 2011 Materials Research Society Spring Meeting, 2011.
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2. Nascimento, A. ; SOARES, T. A. ; Lins, R. D.. Influence of ions binding on the dynamics of LPS membranes of Pseudomonas aeruginosa. Em: XVI Brazilian Symposium on Theoretical Chemistry, 2011, Ouro Preto. Annals of the XVI Brazilian Symposium on Theoretical Chemistry, 2011.
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Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (65)
1. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada na University of Oslo - A Molecular Perspective on the Outer Membrane of Gram-Negative Bacteria. 2020. Apresentação de Trabalho/Seminário
2. Soares, Thereza A.. Webinar: A Brief Overview of the Special Issue on Molecular Simulation in LatAm. 2020. Apresentação de Trabalho/Seminário
3. Soares, Thereza A.. Webinar: Simulações Computacionais de Matéria Macia. 2020. Apresentação de Trabalho/Seminário
4. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada National Institute of Infectious Diseases: A Molecular View of the Bacterial Outer Membrane via Computational Simulations. 2019. Apresentação de Trabalho/Seminário
5. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada National Institute of Infectious Diseases: Computational Simulations of Biological Membranes: How to, What for and What we get from. 2019. Apresentação de Trabalho/Seminário
6. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada: Surface Assessment via Grid Evaluation (SuAVE): A Tool to Analyze Curvature-Dependent Properties in Membranes. 2019. Apresentação de Trabalho/Congresso
7. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada na UnB: Mind the Gender Gap. 2019. Apresentação de Trabalho/Seminário
8. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada Universidade de Talca: Membranes Bent Over: Assessment of Curvature-Dependent Properties in Lipopolysaccharide-Containing Systems. 2019. Apresentação de Trabalho/Congresso
9. Soares, T.A. Palestra Convidada V Encontro Anual da Biofísica: Simulações computacionais de peptideos antimicrobianos catiônicos em membranas biológicas: Uma Visão Microscópica do Processo. 2018. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
10. Soares, Thereza A. Palestra Convidada no LNNano-MCTI: Early Stages of Antimicrobial Peptides Binding to Resistant and Susceptible Bacterial Outer Membrane Chemotypes from Atomistic MD simulations. 2018. Apresentação de Trabalho/Seminário
11. Soares, Thereza A.. Plenária no I Workshop on Theoretical Bioinorganic Chemistry (WTBC)/XIX Brazilian Meeting on Inorganic Chemistry/: Cation-induced Polymorphism of Bacterial Outer Membranes via Computational Simulations. 2018. Apresentação de Trabalho/Congresso
12. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada no 7th Workshop Adesão Microbiana e Superfícies: Development of Molecular Brushes Models. 2018. Apresentação de Trabalho/Congresso
13. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada Mulheres na Ciência: Uma visão das barreiras e progressos da mulher em ciência no Brasil. 2018. Apresentação de Trabalho/Seminário
14. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada na IV Escola Brasileira de Modelagem Molecular: Computational Simulations of Polymyxin-B binding to Resistant and Susceptible LPS Chemotypes. 2017. Apresentação de Trabalho/Seminário
15. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada no XLII Meeting of the Brazilian Biophysical Society: An Atomistic View of the Early Stages of Polymyxin-B binding to Resistant and Susceptible Bacterial Outer Membrane Chemotypes. 2017. Apresentação de Trabalho/Congresso
16. SOARES, T. A.. Palestra Convidada na XIX Reunião da Sociedade Brasileira de Química Teórica: Early Stages of Antimicrobial Peptides Binding to Resistant and Susceptible Bacterial Outer Membrane Chemotypes from Atomistic MD simulations. 2017. Apresentação de Trabalho/Congresso
17. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada no CETENE: Por que a ciência é também para as meninas?. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
18. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada na Universidade de Umeå: Molecular Models for Atomistic Simulations of the Interface Bacterial Membranes and Molecular Brushes. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
19. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada na Universidade Nova de Lisboa: Atomistic Simulations of Bacterial Outer Membrane Models. 2016. Apresentação de Trabalho/Seminário
20. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada na Universidade de Umeå: Computational Approaches for Simulations of BioMateriais. 2016. Apresentação de Trabalho/Seminário
21. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada na Universidade de Umeå: Atomistic Simulations of Bacterial Outer Membrane Models. 2016. Apresentação de Trabalho/Simpósio
22. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada na Universidade de Umeå: Computational Simulations of a Pediocin-Plantaricin Hybrid Antimicrobial Peptide. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
23. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada no Umea Center for Microbial Research Day:Simulations of Pmx-B binding to resistant and susceptible LPS chemotypes. 2016. Apresentação de Trabalho/Simpósio
24. SOARES, T. A.. Palestra Convidada na University of Umeå, Suécia: Molecular Models of Lipopolysaccharide Membranes (Invited Speaker). 2015. Apresentação de Trabalho/Seminário
25. SOARES, T. A.. Palestra Convidad na Universidade de Oslo, Noruega: Molecular Models of Lipopolysaccharide Membranes (Invited Speaker). 2015. Apresentação de Trabalho/Seminário
26. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada no Advanced School on Biomolecular Simulation: Molecular Models for Bacterial Membranes and Polymer Brushes (Invited Speaker). 2015. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
27. Soares, Thereza A.. Aula Convidada para o Curso de Biofísica de Membranas (POSLATAM): Computer Simulation of Biological Membranes: Applications (Invited Speaker). 2015. Apresentação de Trabalho/Seminário
28. SOARES, T. A.. Palestra Convidada no Instituto Pasteur Montevideo: Ongoing Research in the Group of Modelling of BioMaterials (BioMat). 2015. Apresentação de Trabalho/Simpósio
29. Pol-Fachini, L. ; SOARES, T. A. ; Roberto D. Lins. Palestra no 44th Annual Meeting of the Brazilian SBBq: Extension and Application of teh GROMOS 53A6Glyc Focrce Field for Aldohexopyranoses, Glycoproteins and Lipopolysaccharides. 2015. Apresentação de Trabalho/Congresso
30. SOARES, T. A.. Palestra Convidada na III Escola Brasileira de Modelagem Molecular: Remodeling and Polymorphism of Lipopolysaccharide Membranes. 2015. Apresentação de Trabalho/Simpósio
31. SOARES, T. A.. Palestra Convidada 4th Workshop Microbial Adhesion and Surfaces: Molecular Models of Lipopolysaccharide Membranes. 2015. Apresentação de Trabalho/Simpósio
32. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada Multi-Scale Simulations of Molecular Brushes. 2015. Apresentação de Trabalho/Seminário
33. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada na UFAL: Estratégias para o Fortalecimento de Pesquisa e PG em Química no Nordeste. 2015. Apresentação de Trabalho/Simpósio
34. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada: Por que a ciência é também para as meninas?. 2015. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
35. Soares, Thereza A.. Palestra Convidada no I Congresso Regional da Sociedade Brasileira de Biofísica Computational Simulations of Metal Organic Frameworks (MOFs) as Carriers for Drug Delivery. 2015. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
36. Rodrigues, C. ; Silva, J. J. ; Soares, T.A.. Interaction of the Mycrocystin with alpha-Toxin Nanopore. 2014. Apresentação de Trabalho/Congresso
37. daHora, G.A.C. ; SOARES, T. A.. Study of the Mechanims of Action of a Hybrid Peptide in POPG:POPC Bilayers. 2014. Apresentação de Trabalho/Congresso
38. Pontes, F. J.S. ; SOARES, T. A. ; LINS, R.D.. Assessing Lipid A Membrane Structure and Phase Transition Dependence as a Function of Acyl Chain Variability and Cation Complexation. 2014. Apresentação de Trabalho/Congresso
39. Dias, R. ; SOARES, T. A.. Palestra Convidada no 43rd Annual Meeting of the Brazilian Insights into Phenomena of Surface on LPS Membranes through MD Simulations. 2014. Apresentação de Trabalho/Congresso
40. Santos, D. E. S. ; SOARES, T. A.. Molecular Dynamics Simulations of Polymyxin B, E and M and its Binding Mechanism to the Outer Membrane of Pseudomona aeruginosa. 2014. Apresentação de Trabalho/Congresso
41. SOARES, T. A.. Palestra Convidada no 248th American Society National Meeting: Modeling the Effects of Water and Solvation in Biological Systems: Developments and Applications. 2014. Apresentação de Trabalho/Congresso
42. SOARES, T. A.. Palestra Convidada no Instituto de Física (USP-São Carlos):Computational Simulations of Bacterial Outer Membranes. 2014. Apresentação de Trabalho/Seminário
43. SOARES, T. A.. Palestra Convidada no Colóquio do Grupo PET-Química, Recife: Nobel em Medicina 1962: A estrutura do DNA e o mecanismo de replicação genética. 2013. Apresentação de Trabalho/Seminário
44. SOARES, T. A.. Palestra Convidade na University of Clemerson, USA: Challenges in Simulations of LPS Membranes. 2013. Apresentação de Trabalho/Seminário
45. Soares, T.A. Palestra Convidada na Queen Mary University of London, UK: A Computational Study of the Effects of Cations, Temperature and Phenotypes on Lipopolysaccharide Membranes. 2013. Apresentação de Trabalho/Seminário
46. Soares, T.A. Palestra Convidada na University of Bern, Suiça: Computational Simulations of LPS Membranes: Phenotypes, Cations and Temperature. 2013. Apresentação de Trabalho/Seminário
47. Soares, Thereza A. ; da Gama, A. S. ; Lins, Roberto D. ; Sa, G. F. ; Malta, O.. Ricardo de Carvalho Ferreira: Scientist, Educator and Humanist. 2013. Apresentação de Trabalho/Simpósio
48. SOARES, T. A.. Palestra Convidada 3rd Workshop Microbial Adhesion and Surfaces: Molecular Models of Lipopolysaccharide Membranes. 2013. Apresentação de Trabalho/Simpósio
49. SOARES, T. A.. Palestra Convidada na École Polytechnique Fédérale de Lausanne, Suiça: Atomistic Simulations of LPS Membranes. 2013. Apresentação de Trabalho/Seminário
50. SOARES, T. A.. Palestra Convidada no Instituto de Física (USP-São Paulo): Simulations of Biological Membranes. 2013. Apresentação de Trabalho/Seminário
51. daHora, G.A.C. ; Itri, R. ; SOARES, T. A.. The effect of cationic antimicrobial peptide on mixed POPC:POPG membrane bilayers. 2012. Apresentação de Trabalho/Simpósio
52. SOARES, T. A. ; da Costa, N. B. ; Sa, G. F. ; Alves Jr., S.. Understanding the Doxorubicin interaction with Zeolite Imidazolate Frameworks (ZIF-8): A theoretical and experimental investigation. 2012. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
53. Nascimento, A. ; SOARES, T. A. ; Lins, R. D.. Palestra Convidada na VI Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos, Petrópolis: The influence of solvation, radius, and charge of ions on the lipopolysaccharide membrane of Pseudomonas aeruginosa. 2012. Apresentação de Trabalho/Simpósio
54. Oliveira, V. ; Soares, T.A.. Investigação da enzima 3-hidroxi-quinurenina transaminase de Anopheles gambiae e Aedes aegypti como alvos moleculares para compostos 1,2,4-oxadiazois. 2012. Apresentação de Trabalho/Simpósio
55. daHora, G.A.C. ; Coutinho-Neto, M. D. ; SOARES, T. A.. A DFT study of the substitution of Cys by SeCYS and TeCYS in the [NiFe]-hydrogenase active site and their oxidized forms. 2012. Apresentação de Trabalho/Seminário
56. Dias, R. ; SOARES, T. A.. Electrostatic Potential Study of Different Chemotypes of the LPS Membrane. 2012. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
57. SOARES, T. A.. Palestra Convidada no II USP Conference on Nanotechnology, São Carlos: Bacterial Outer Membrane: What Can We Learn from Atomistic Simulations? (invited Speaker). 2012. Apresentação de Trabalho/Simpósio
58. SOARES, T. A.. Palestra Convidada 2nd Workshop Microbial Adhesion and Surfaces: Simulations of Biological Membranes in the BioMat Group. 2012. Apresentação de Trabalho/Simpósio
59. Pontes, F.J.S. ; SOARES, T. A. ; Lins, R. D.. Estudo de Dinâmica Molecular da Estrutura e Propriedades Química do Lipídeo A de Pseudomonas aeruginosa. 2011. Apresentação de Trabalho/Simpósio
60. SOARES, T. A. ; Pontes, F.J.S. ; Nascimento, A.. Computer modeling of the LPS Membrane of Pseudomonas aeruginosa. 2011. Apresentação de Trabalho/Simpósio
61. Pontes, F.J.S. ; SOARES, T. A.. Structural Dynamics of Pseudomonas Aeruginosa Lipid A as a Function of the Number of Acyl Chains. 2011. Apresentação de Trabalho/Simpósio
62. Boschek, C.B. ; Apiyo, D. O. ; Baird, C. L. ; SOARES, T. A.. Um Novo Scaffold Molecular Baseado na Proteina Top7 Resistente a Condicoes Extremas de Temperatura e pH. 2011. Apresentação de Trabalho/Congresso
63. SOARES, T. A.. Palestra Convidada 1st Workshop Microbial Adhesion and Surfaces: A novel atomistic force field for simulations of lipopolysaccharide membranes. 2011. Apresentação de Trabalho/Simpósio
64. Soares, T.A. Simulações Atomísticas de Membranas Lipopolissacarídicas e Proteínas de Membrana Externa. 2010. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
65. SOARES, T. A. ; Pontes, F.J.S. ; Nascimento, A.. Computer modeling of the LPS membrane of Pseudomonas aeruginosa. 2010. Apresentação de Trabalho/Simpósio
Demais tipos de produção bibliográfica (8)
1. SANTOS, DENYS E. S. ; LI, DANYANG ; RAMSTEDT, MADELEINE ; GAUTROT, JULIEN E. ; Soares, Thereza A.. Langmuir, v. 35, p. 5037-5049, 2019. 2019. Capa de Períodico com Revisão de Pares
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2. CAPELETTI, LARISSA BRENTANO ; OLIVEIRA, JESSICA FERNANDA AFFONSO ; LOIOLA, LÍVIA MESQUITA DIAS ; GALDINO, FLÁVIA ELISA ; SANTOS, DENYS E. S. ; Soares, Thereza A. ; OLIVEIRA FREITAS, RAUL ; CARDOSO, MATEUS BORBA. Advanced Functional Materials, v. 29, p. 1904216, 2019. Wiley. 2019. Capa de Períodico com Revisão de Pares
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3. BOZKURT, ESRA ; Soares, Thereza A. ; Roethlisberger, U.. Journal of Chemical Theory and Computation, v. 13, p. 6382-6390. . American Chemical Society. 2017. Capa de Períodico com Revisão de Pares
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4. SANTOS, DENYS E. S. ; POL-FACHIN, LAÉRCIO ; LINS, R.D. ; Soares, Thereza A.. Journal of Chemical Information and Modeling, v. 57, p. 2181?2193.. American Chemical Society. 2017. Capa de Períodico com Revisão de Pares
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5. Soares, Thereza A. ; VANNI, STEFANO ; MILANO, GIUSEPPE ; CASCELLA, MICHELE. Journal of Physical Chemistry Letters, v. 8, p. 3586-3594.. American Chemical Society. 2017. Video da American Chemical Society sobre a nossa publicação
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6. DA HORA, G. C. A. ; Coutinho K. ; Itri, R. ; Soares, Thereza A.. Soft Matter, v. 12, p. 8884-8898. . Royal Society of Chemistry. 2016. Capa de Períodico com Revisão de Pares
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7. Pontes, F. J.S. ; AYRES, CONSTÂNCIA F. J. ; SOARES, T. A.. Journal of the Brazilian Chemical Society, v. 27(9), 1602-1615.. Sociedade Brasileira de Química. 2016. Capa de Períodico com Revisão de Pares
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8. DIAS, ROBERTA ; LI, LIN ; Soares, Thereza A. ; ALEXOV, EMIL. Journal of Computational Chemistry, v. 35, p. 1418-1429.. Willey. 2014. Capa de Períodico com Revisão de Pares
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Produção técnica

Programas de computador com registro de patente (0)
Programas de computador sem registro de patente (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (16)
1. Soares, Thereza A.. V Congresso Regional da Sociedade Brasileira de Biofísica. 2019.
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2. SOARES, T. A.. XXXIV Congresso da Sociedade Brasielira de Computação. 2014.
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3. SOARES, T. A.. 43a Reunião da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecula. 2014.
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4. SOARES, T. A.. 42a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. 2013.
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5. Soares, T.A. 35a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química. 2012.
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6. SOARES, T. A.. Swiss Supercomputer Centre. 2012.
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7. SOARES, T. A.. Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Científica (PIBIC-CNPq). 2011.
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8. SOARES, T. A.. Swiss Supercomputer Centre. 2011.
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9. SOARES, T. A.. Materials Research Society - Spring Meeting. 2011.
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10. SOARES, T. A.. XVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química Teórica. 2011.
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11. SOARES, T. A.. Swiss Supercomputer Centre. 2010.
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12. SOARES, T. A.. Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Científica (PIBIC-CNPq). 2010.
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13. Soares, Thereza A ; Santa-Cruz, P. D. ; Pavão, A. C.. #TVPEnoAR,. 2019. (Programa de rádio ou. 2019.
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14. Soares, Thereza A. ; Pavão, A. C. ; Santa-Cruz, P. D.. #TVPEnoAR - Prof. Thereza A. Soares é entrevistada pelo Prof. Antônio Carlos Pavão, Director of Espaço Ciência Interactive Museum. 2019. (Programa de rádio ou. 2019.
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15. Soares, T. A.; Aburjaile F. ; Aquino K.. Mulheres na Ciência. 2018. (Programa de rádio ou TV/Mesa. 2018.
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16. Soares, Thereza A. ; VANNI, STEFANO ; MILANO, GIUSEPPE ; Cascella, M.. ACS video on our Perspective paper on J. Phys. Chem. Lett. 2017, 8, 3586-3594.. 2017; Tema: oward Chemically Resolved Computer Simulations of Dynamics and Remodeling of Biological Membranes. 2017.
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Demais tipos de produção técnica (4)
1. Soares, Thereza A. ; Cotta, M. ; MARQUES, ERNESTO T. A. ; Oliva, G.. ACS Webinar. COVID-19: possibilidades de interação universidade-indústria nas áreas de vacinas, terapêuticos e diagnósticos. 2020. Webinario
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2. Soares, Thereza A ; Cotta, M.. ACS Webinar. COVID-19: O que falta para termos a vacina?. 2020. Webinario
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3. Soares, Thereza A ; OLIVEIRA, OSVALDO N. ; Roberto D. Lins ; Khalil, J.. ACS Webinars. COVID-19: perspectivas sobre vacinas, terapêuticos e diagnósticos. 2020. Webinario
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4. Soares, Thereza A. ; Wahab, H. A.. Molecular Simulation in Latin America. 2019. Editoração/Periódico
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Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (1)
1. Denys Ewerton da Silva Santos. Desenvolvimento de Ferramentas Computacionais para Análise de Propriedades Estruturais e Termodinâmica associadas a Transições de Fase em Membrana Externa de Bactérias. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2017.
  Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Dissertação de mestrado (2)
1. Diane Lima. Desenvolvimento de uma Plataforma Multifuncional para a Liberação Controlada de Agente Químico com Atividade Anti-Formação de Biofilmes Bacterianos e Baixa Indução de Resistência Bacteriana. Dissertação (Mestrado profissional em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. Início: 2019.
  Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
2. Manoela Pascoal. Modelos para o Tratamento de Cations in Membranas Lipopolissacarídicas. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. Início: 2018.
  Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (3)
1. Breno Soares Gazal. Modelos Atomísticos de Escovas Moleculares com Aplicações em Biomedicina. Iniciação científica (Graduando em Engenharia) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2018.
  Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
2. Manuela Nader. Validação de Modelos Atomísticos de Membranas Externas Bacterianas. Iniciação científica (Graduando em Engenharia Química) - Universidade Federal de Pernambuco, . Início: 2018.
  Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
3. Vinicus Firmino. Simulações de Escovas Moleculares para Carreamento de DNA e RNA. Iniciação científica (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Ministério da Educação. Início: 2017.
  Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (8)
1. Gabriel Alverni Costa da Hora. . Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2018.
  Supervisor: Thereza Amélia Soares da Silva.
2. Julio Cosme Santos da Silva. . Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2015.
  Supervisor: Thereza Amélia Soares da Silva.
3. Frederico José Santana Pontes. . Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. 2015.
  Supervisor: Thereza Amélia Soares da Silva.
4. Raquel Milani. Caracterização Molecular de MOFs como carreadores de fármacos. Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2014.
  Supervisor: Thereza Amélia Soares da Silva.
5. Frederico José de Santana Pontes. . Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2014.
  Supervisor: Thereza Amélia Soares da Silva.
6. Frederico José Santana Pontes. . Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2013.
  Supervisor: Thereza Amélia Soares da Silva.
7. Roberta Pereira Dias. Efeitos de Peptídeos Antimicrobianos Catiônicos na Estrutura de Membranas Externas de Diferentes Quimiotipos da Bactéria Gram-Negativa Pseudomonas aeruginosa. Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2012.
  Supervisor: Thereza Amélia Soares da Silva.
8. Roberta Pereira Dias. Simulações computacionais de polímeros moleculares biocompatíveis. Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2011.
  Supervisor: Thereza Amélia Soares da Silva.
Tese de doutorado (8)

Larissa Gonçalves Maciel. A Enzima 3-Hidróxi-Quinurenina Transaminase de Aedes aegypti: como Alvo de Inibidores 1,2,4-Oxadiazois Inibidores Seletivos. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2020.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Amanda Lima Barros. Identificação de Metal-Organic Frameworks com Potencial para o Carreamento de Fármacos: Uma Conexão entre Experimento e Teoria. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2018.
Supervisor: Thereza Amélia Soares da Silva.
Ohana Maria Menezes Madeiro da Costa. Desenvolvimento de Plataformas Lípidicas para o Carreamento de Fármaco: Simulação e Experimento. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Ciências de Materiais) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. 2017.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Gabriel Alverni Costa da HoraU. Simulações Computacionais de Membranas Biológicas e Polímeros Moleculares. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2016.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Rafael Trindade Maia. Simulações computacionais de enzimas glutation S-transferase de Anopheles gambiae: Uma perspectiva estrutural e evolutiva sobre a resistência à inseticidas. Tese (Doutorado em Biologia Animal) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2013.
Supervisor: Thereza Amélia Soares da Silva.
Agrinaldo Jacinto Nascimento. A influência de Íons na Membrana de Lipopolissacarídeos de Pseudomonas aeruginosa PAO1. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. 2013.
Supervisor: Thereza Amélia Soares da Silva.
Janilson José da Silva Júnior. Desenvolvimento de Biosensores Proteícos para Detecção de Toxinas em Meios Aquosos. Tese (Doutorado em Inovação Terapêutica) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2011.
Supervisor: Thereza Amélia Soares da Silva.
Diego Enry Barreto Gomes. Modelos Moleculares de Silica Mesoporosa Funcionalizada para Confinamento de Proteinas. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2010.
Supervisor: Thereza Amélia Soares da Silva.
Dissertação de mestrado (7)

Andesa Messias da Silva. Efeito de Íons Al , Na e Cl em Bicamadas de Lipídio A: Estudo Metodológico e Estrutural por Dinâmica Molecular. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. 2019.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Andresa Messias da Silva. Bases Moleculares da Ação de Adjuvantes Imunogênicos para Vacinas: Agregados de Lipopolissacarídeos e Sais de Alumínio. Dissertação (Mestrado em Quimica) - Universidade Federal de Pernambuco, . 2018.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Yeny Yaneth Pillco Valencia. Simulações em Múltiplas-Escalas do Peptídeo Híbrido Pediocina-Plantaricina em Bicamadas Lípidicas. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Organização dos Estados Americanos. 2017.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Denys Ewerton da Silva Santos. Bases Moleculares da Resistência e Susceptibilidade da Membrana Externa de Bactérias Gram-Negativas à Ação de Peptídeos Antimicrobianos. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. 2017.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
José Adriano da Silva. Emprego de Simulações de Dinâmica Molecular para Estudo de Crescimento de Nanopartículas Anisotrópicas. Dissertação (Mestrado em Química e Biotecnologia) - Universidade Federal de Alagoas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2016.
Supervisor: Thereza Amélia Soares da Silva.
Larissa Gonçalves Maciel. 3-Hidróxi-Quinurenina Transaminase de Aedes aegipty: Clonagem, Expressão, Avaliação Funcional e Síntese de Potenciais Inibidores Seletivos. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2016.
Supervisor: Thereza Amélia Soares da Silva.
Marcos Vinicius da Silva Paula. Metal Organic Frameworks: de novos agentes de remoção à degradação de fármacos. Dissertação (Mestrado em Ciência de Materiais) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2011.
Supervisor: Thereza Amélia Soares da Silva.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (19)

Raquel Eufrásio Medeiros Lins. Dinâmica Molecular de Metal-Organic Frameworks. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2018.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Larissa Dias da Silva. Design de Novos Antagonistas da Enzima 3-Hidróxi-Quinurenina Transaminase de Aedes Aegypti. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. 2018.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Manuela Nader. Desenvolvimento de ferramentas computacionais para análise de propriedades dependentes de curvatura de superfícies. (Graduando em Engenharia) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2018.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Andresa Messias da Silva. Simulações Computacionais de Membranas Bacterianas em Presença do cation Al+3 usado como adjuvante em Vacinas. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2017.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Thomas Lucena Gouveia. Automatizacão de Procedimentos Computacionais para o Estudo de Processos de Adsorcão de Fármacos em Redes Metalo-Orgânicas (MOFs). (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. 2016.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Arthur Monteiro Falcão. Molecular Docking of New Inhibitors to Angiotensin Converting Enzyme. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Ministério da Educação. 2016.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Raquel Eufrásio Medeiros Lins. Simulacões Computacionais de MOFs aplicadas ao Carreamento de Fármacos. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2015.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Vanessa Oliveira. A Enzima 3-Hidroxi-Quinurenina Transaminase como Alvo para Compostos Larvicidas 1,2,4-oxadiazois. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2015.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Denys Ewerton da Silva Santos (Graduando Engenharia Química). Desenvolvimento de Ferramentas Computacionais para Análise de Polimorfismo em Membranas Biológicas. Iniciação Científica - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2015.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Andresa Messias da Silva. Simulações Computacionais de Membranas Bacterianas em Presença do cation Al+3 usado como adjuvante em Vacinas. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2015.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Andresa Messias da Silva. Simulações Computacionais de Membranas Bacterianas em Presença do cation Al+3 usado como adjuvante em Vacinas. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2014.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Raquel Eufreasio Medeiros Lins. Simulacões Computacionais de MOFs aplicadas ao Carreamento de Fármacos. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2014.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Denys Ewerton da Silva Santos. Simulações Computacionais de Polímeros Moleculares. (Graduando em Engenharia Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2014.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Denys Ewerton da Silva Santos. Simulações Computacionais de Peptídeos Antimicrobianos em Membranas Bacterianas. (Graduando em Engenharia Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2013.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Renato Regis Druciak. Validação e Aplicação de Métodos Computacionais para o Estudo de MOFs como Carreadores de Fármacos. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. 2012.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Rogério Batista Moreira da Silva. Avaliação e validação do procedimento de docking molecular como ferramenta para a identificação de fármacos para carreamento em compostos de redes cristalinas. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco. 2012.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Denys Ewerton dos Santos. Simulações Computacionais de Polímeros Moleculares. (Graduando em Engenharia Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2012.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Vanessa Oliveira da Silva. Docking Molecular Aplicado a Investigação de um Novo Alvo Molecular para compostos larvicidas. (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2011.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Cecilia Pimenteira Melo Nascimento (CPF 067.963.824-55). Caracterização de prototipos de drogas 1,2,4-oxadiazóis à enzima 3-hidroxiquinurenina transaminase de A. gambiae e A. aegypti. (Graduando em Biologia) - Universidade Federal da Paraíba, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2010.
Orientador: Thereza Amélia Soares da Silva.
Orientações de outra natureza (0)

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (14)

2020-Atual. Tailoring Antimicrobial Peptide ? Phospholipid Interactions for Fighting Bacteria
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Thereza Amélia Soares da Silva - Integrante / Thereza Amelia Soares da Silva - Coordenador / Madeleine Ramstedt - Integrante / Stefan Salentinig - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Thereza Amelia Soares da Silva.
2020-Atual. Brushing Bacteria: Polymer Brush Coatings for Bacteria Free Drinking Water
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Thereza Amélia Soares da Silva - Integrante / Thereza Amelia Soares da Silva - Coordenador / Madeleine Ramstedt - Integrante / Stefan Salentinig - Integrante.
Membro: Thereza Amelia Soares da Silva.
2015-Atual. Computational Simulations of the Polymer Brushes
Descrição: Our main goal is to understand the physicochemical interactions modulating the attachment processes of infectious bacteria onto model surfaces designed to repel such attachment. We will approach this important problem from a molecular perspective, integrating the experimental characterization of polymer surfaces and computational simulations of bacterial surface onto such polymers. We will create well-defined abiotic model surfaces with a range of different chemistries through surface polymerization techniques. We will perform detailed chemical characterization of the model surfaces and bacterial surfaces. We will perform computational simulations for the interface between bacterial membranes and selected model surfaces exhibiting the desired functionalities.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Thereza Amélia Soares da Silva - Integrante / Thereza Amelia Soares da Silva - Coordenador / Julien Gautrot - Integrante. Financiador(es): The Royal Society - Newton Fund - Auxílio financeiro.
Membro: Thereza Amelia Soares da Silva.
2014-Atual. Bases Moleculares de Doencas Infecciosas: Resistencia em Bacterias Gram-Negativas e Engenharia de Epitopos Imunorreativos
Descrição: O presente projeto propõe a aplicação de metodologias e protocolos computacionais para a elucidação das bases moleculares de doenças infecciosas, e para o desenvolvimento de moléculas com novas funcionalidades imunorreativas ou antibióticas. Esta proposta é parte de 02 projetos de cooperação científica prévios na área de bionanotecnologia e adesão bacteriana envolvendo a Ohio State University, USA e a University of Umeå, Suécia.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Doutorado: (6) . Integrantes: Thereza Amélia Soares da Silva - Integrante / Thereza Amelia Soares da Silva - Coordenador / LINS, R.D. - Integrante / DHALIA, RAFAEL - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro.
Membro: Thereza Amelia Soares da Silva.
2013-2019. Interactions and Binding of Drug Molecules To Metal Organic Frameworks for Controlled Drug Delivery
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (3) . Integrantes: Thereza Amélia Soares da Silva - Integrante / Thereza Amelia Soares da Silva - Coordenador / Ricardo L. Longo - Integrante / Severino Alves Jr. - Integrante / Marcelo Rodrigues - Integrante / Eduardo Falcão - Integrante / Laurent Dardenne - Integrante / Juergen Eckert - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Thereza Amelia Soares da Silva.
2013-Atual. Computational simulations of antimicrobial polymeric surfaces and biological membranes
Descrição: Computational resources for simulations of Antimicrobial Polymeric Surfaces and Biological Membranes. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (3) . Integrantes: Thereza Amélia Soares da Silva - Integrante / Thereza Amelia Soares da Silva - Coordenador / Roberto D. Lins - Integrante / Madeleine Ramstedt - Integrante / Brian H. Lower - Integrante. Financiador(es): Environmental Molecular Sciences Laboratory - Outra.
Membro: Thereza Amelia Soares da Silva.
2013-Atual. Desenvolvimentos e Aplicacoes de Ferramentas Computacionais para Biologia: da Modelagem Molecular a Pesquisa Translacional
Descrição: Este projeto visa integrar competências individuais dos pesquisadores das duas equipes envolvidas (USP/Capital e UFPE), com especialidades em modelagem, simulação e caracterização de sistemas biológicos, em uma rede de Biologia Computacional. As equipes são compostas por docentes das Ciências Exatas e da Terra e Ciências Biológicas e Biomédicas, sendo 5 físicos, 4 químicos, 2 biólogos, 1 farmacêutico e 1 cientista da computação, totalizando 13 docentes (9 da USP e 4 da UFPE). Como o projeto é inerentemente teórico daremos destaque apenas às atividades que serão desenvolvidas pelos pesquisadores teóricos, porém a participação de pesquisadores experimentais é fundamental, tanto em fornecer/colaborar com os dados experimentais como também nas discussões científicas e acadêmicas; e na participação na formação de recursos humanos com uma visão ampliada entre teorias e experimentos. Dentre os 8 docentes teóricos temos um grupo multidisciplinar com 4 físicos (USP), 2 biólogos (UFPE), 1 químico (UFPE) e 1 cientista da computação (USP). Essa composição mostra uma complementaridade de perfil acadêmico entre as duas equipes, pois a equipe da UFPE é voltada às áreas mais biológicas (Biologia e Bioquímica) e da USP voltada às áreas mais exatas (Biofísica e Bioinformática). Esse perfil das equipes envolvidas reflete, em parte, o quadro de docentes teóricos de ambas as instituições, entretanto contribuirá com informações complementares na formação de recursos humanos e com uma visão crítica nas discussões acadêmicas voltadas à integração das Ciências Biológicas às Ciências Exatas e da Terra na área de Biologia Computacional, propiciadas com a formação da rede. Fizemos a opção de montar inicialmente uma equipe pequena para garantir a qualidade e eficiência nas discussões científicas e acadêmicas. Todos esses docentes são bolsistas de produtividade do CNPq (1 no nível 1A, 2 no nível 1C e 5 no nível 2); com uma média de 5 orientandos em nível de pós-graduação (total de 26 doutorandos e 14 mestrandos) e cerca de 3 em outros níveis (12 pós-doutores, 6 graduandos em IC e 2 estudantes do ensino médio em Pré-IC); e uma média de mais de 6 trabalhos publicados/docente-ano nos últimos 5 anos (entre 2008-2013). Esses indicadores mostram a excelência e a grande capacidade de produção de conhecimento científico e formação de recursos humanos do grupo de docentes teóricos envolvidos neste projeto. Adicionalmente, esse projeto irá propiciar uma integração de duas grandes universidades das regiões Nordeste e Sudeste do país e aproximar academicamente duas regiões tão distantes geograficamente.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (10) / Doutorado: (15) . Integrantes: Thereza Amélia Soares da Silva - Integrante / Thereza Amelia Soares da Silva - Integrante / Roberto D. Lins - Coordenador / Ricardo L. Longo - Integrante / Kaline Coutinho - Integrante / Sylvio Canuto - Integrante / André Fujita - Integrante. Financiador(es): Universidade Federal de Pernambuco - Auxílio financeiro.
Membro: Thereza Amelia Soares da Silva.
2013-Atual. Desenvolvimento de uma Quimica Biologica de Fronteira na Regiao Nordeste: Resolucao Estrutural de Macromoleculas e Bio-imagem
Descrição: A aquisição de novos equipamentos multiusuários objetiva a melhoria da capacidade analítica do dQF de maneira a atender as demandas tecnológicas (pesquisa) e educacionais (formação de recursos humanos) de forma integrada às necessidades locais, regionais, bem como de laboratórios de outras regiões do país. Os equipamentos pleiteados visam a inovação regional através do desenvolvimento de uma nova área de pesquisa na região. Salientamos que os equipamentos solicitados serão instalados em locais físicos já existentes do Departamento de Química Fundamental da UFPE. A presente proposta tem como objetivo geral o aperfeiçoamento da infra-estrutura multiusuário do DQF nas suas instalações já existentes. Como objetivos específicos espera-se: 1. Ampliação e diversificação do parque de equipamentos multiusuários da Central Analítica; 2. Inovação regional através do desenvolvimento de uma nova área de pesquisa no Nordeste; 3. Fortalecimento do programa de pós-graduação em Química e programas associados através da diversificação do portfolio de pesquisa e ensino.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Thereza Amélia Soares da Silva - Integrante / Thereza Amelia Soares da Silva - Coordenador / Ricardo L. Longo - Integrante / Gilberto F. de Sá - Integrante / André Galembeck - Integrante / Lins, R.D. - Integrante / Oscar Malta - Integrante / Alfredo Mayall Simas - Integrante / Paulo Henrique Menezes - Integrante / Walter Mendes de Azevedo - Integrante / Marcelo Navarro - Integrante / Petrus D'Amorim Santa-Cruz - Integrante. Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.
Membro: Thereza Amelia Soares da Silva.
2012-2019. Simulacoes computacionais de peptideos antimicrobianos cationicos em membranas polissacaridicas de diferentes quimiotipos de pseudomonas aeruginosa
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (3) . Integrantes: Thereza Amélia Soares da Silva - Integrante / Thereza Amelia Soares da Silva - Coordenador / Madeleine Ramstedt - Integrante / Roberta Dias - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro.
Membro: Thereza Amelia Soares da Silva.
2012-2019. Efeitos de peptideos antimicrobianos cationicos na estrutura de membranas externas de diferentes quimiotipos da bacteria Gram-negativa Pseudomonas aeruginosa
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Thereza Amélia Soares da Silva - Integrante / Thereza Amelia Soares da Silva - Coordenador / Roberta Dias - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Thereza Amelia Soares da Silva.
2012-Atual. Simulacoes computacionais de membranas bacterianas e proteinas associadas
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Thereza Amélia Soares da Silva - Integrante / Thereza Amelia Soares da Silva - Coordenador / Madeleine Ramstedt - Integrante / Roberta Dias - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Thereza Amelia Soares da Silva.
2011-2018. Understanding the biocompatibility of polymeric biomaterial surfaces
Descrição: Medical devices can give rise to difficult infections if they become colonized by bacteria. They can also influence and affect mammalian cells in their surrounding in a variety of ways. Consequently, medical devices need to display very poor adhesion of bacteria whilst being mammalian cell friendly. So understanding how both types of organisms behave on, or in close proximity of surfaces is important. The interactions between cells and a surface will be highly governed by physicochemical properties of both the cell and the substrate surface. Thus a better fundamental understanding of these interactions should allow our society to design better medical surfaces. The proposed project will study the interactions between a range of different well characterized polymeric surfaces with Pseudomonas aeruginosa bacteria and human keratinocytes (epithelial cells). Epithelial cells are relevant to this work as they are very often in contact with medical devices, and epidermal stem cells are an important type of epithelial cells implicated in wound healing, for example. We will study the interactions both experimentally and through molecular dynamics simulations to obtain a detailed understanding of the processes that influence the attachment or repulsion between a cell and an abiotic surface for both bacterial cells and mammalian cells. The results from this project are expected to be of great importance for the biomaterials field and influence the way we design biomaterials surfaces.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Thereza Amélia Soares da Silva - Coordenador / Madeleine Ramstedt - Integrante / Julien Gautrot - Integrante. Financiador(es): The Swedish Foundation for International Cooperation in Research - Auxílio financeiro.
Membro: Thereza Amelia Soares da Silva.
2010-2013. Caracterizacao teorico-experimental de interfaces biomoleculas-nanomateriais com aplicacoes em nanotoxicologia, bioremediacao e bioenergia
Descrição: Nesse projeto, cálculos de dinâmica molecular a nível atomístico em conjunto com dados de ressonância magnética nuclear (RNM) (e.g., NOEs, J-Couplings, RCDs) serão utilizados para estudar as interações que regem a adsorção de biomoléculas na superfície de nanomateriais e superfícies minerais, bem como o empacotamento e a interaçã de polissacarídeos com complexos moleculares. Serão endereçados i) a dinâmica funcional e estabilidade estrutural dos biopolímeros na interface com o nanomaterial, ii) as mudanças conformacionais em função da interação com a nanopartícula ou superfiície mineral, iii) a identificação de sítios de ligação à materiais na superfície dos biopolímeors, e iv) a caracterização do arranjo molecular (assembly) das biomoléculas na superfície do nanomaterial quando adsorvidas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Thereza Amélia Soares da Silva - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro.
Membro: Thereza Amelia Soares da Silva.
2010-2011. Caracterizacao de prototipos de drogas 1,2,4-oxadiazois a enzima 3-hidroxiquinurenina transaminase de A. gambiae e A. aegypti
Descrição: O objetivo deste projeto e investigar a enzima 3-hidroxi-quinurenina transaminase como alvo para compostos 1,2,4-oxadiazois com atividade larvicida visando a elucidação do mecanismo molecular de atividade destes compostos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Thereza Amélia Soares da Silva - Coordenador / Cecília Pimenteira - Integrante / Janaína Versiani dos Anjos - Integrante.
Membro: Thereza Amelia Soares da Silva.

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (15)

Professor Títular da Universidade de São Paulo, Universidade de São Paulo.. 2020.
Membro: Thereza Amélia Soares da Silva.
JSPS Invitational Fellow for Research in Japan, Japan Society for the Promotion of Science (JSPS).. 2019.
Membro: Thereza Amélia Soares da Silva.
1o lugar na Premiação Melhor Poster - V Encontro da Biofísica (por Denys Santos, Thereza A. Soares e colaboradores),, Universidade Federal de Pernambuco.. 2018.
Membro: Thereza Amélia Soares da Silva.
2o lugar na Premiação Melhor Poster - V Encontro da Biofísica (por Larissa Dias, Thereza A. Soares e colaboradores),, Universidade Federal de Pernambuco.. 2018.
Membro: Thereza Amélia Soares da Silva.
Prêmio Ricardo Ferreira ao Talento Jovem Cientista (por Larissa Dias e Thereza A. Soares), FACEPE.. 2018.
Membro: Thereza Amélia Soares da Silva.
1o lugar na Premiação Melhor Poster - IUBMB/IUPAB Advanced School and Workshop (por Yeny Pillco Valencia, Thereza A. Soares e colaboradores),, Intern. Union for Biochemistry Mol. Biology/Intern. Union for Pure and Applied Biophysics.. 2018.
Membro: Thereza Amélia Soares da Silva.
2o lugar Melhor Apresentação de Trabalho de IC PIBIC/CONIC (por Andresa Messias da Silva , Frederico Pontes e Thereza A. Soares), UFPE e CNPq.. 2017.
Membro: Thereza Amélia Soares da Silva.
J. Pys. Chem. Lett. Perspective Video on publication (https://www.youtube.com/watch?v=UjWwMZugCuwlist=PLDEE0898E6A1CE852index=1t=25s), American Chemical Society.. 2017.
Membro: Thereza Amélia Soares da Silva.
Invited Professor, University of Umeå, Sweden.. 2016.
Membro: Thereza Amélia Soares da Silva.
Melhor Poster - VIII Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos (por Andresa da Silva, Frederico Pontes e Thereza A. Soares), Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC).. 2016.
Membro: Thereza Amélia Soares da Silva.
Outstanding reviewer (Journal of Molecular Graphics and Modelling). We recognize those reviewers who are in the top 10th percentil in the last 2 years., Elsevier.. 2015.
Membro: Thereza Amélia Soares da Silva.
Certificate of Recognition from the American Chemical Society for Reviewing Activity, American Chemical Socienty.. 2015.
Membro: Thereza Amélia Soares da Silva.
Terceiro Lugar - Melhor Apresentação de Trabalho de IC PIBIC/CONIC (por Denys Santos e Thereza A. Soares), Universidade Federal de Pernambuco e CNPq.. 2014.
Membro: Thereza Amélia Soares da Silva.
Melhor Poster - VII Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos (por Amanda Lima Barros e Thereza A. Soares),, Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC)... 2014.
Membro: Thereza Amélia Soares da Silva.
Professeur Invité, École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Suiça.. 2013.
Membro: Thereza Amélia Soares da Silva.

Participação em eventos

Total de participação em eventos (40)

7th Workshop Adesão Microbiana e Superfícies (Invited Speaker).Development of Molecular Brushes Models. 2018. (Simpósio).
6th Workshop Adesão Microbiana e Superfícies (Invited Speaker).Simulations of antimicrobial peptide binding to bacterial outer membrane models. 2017. (Simpósio).
FEMEX 2017.Computational Simulations of Polymyxin B in Susceptible and Resistant Outer Membranes. 2017. (Simpósio).
III Advanced School on Biomolecular Simulation (Invited Speaker).The Effect of Cations and Hydration on LPS Chemotype aggregation. 2017. (Simpósio).
IV Escola Brasileira de Modelagem Molecular (Invited Speaker).Looking at Soft-Matter Interfaces via Classical Simulations. 2017. (Simpósio).
UCMR day 2017.Simulations of Pmx-B binding to resistant and susceptible LPS chemotypes. 2017. (Simpósio).
XLII Meeting of the Brazilian Biophysical Society. An Atomistic View of the Early Stages of Polymyxin-B binding to Resistant and Susceptible Bacterial Outer Membrane Chemotypes. 2017. (Congresso).
4th International Workshop on Complex Physical Phenomena in Matrials (in (Invited Speaker).Computational Simulations of Bacterial Membanes. 2016. (Oficina).
UCMR Mini-Symposium on Structural Dynamics of Biological Membranes.Simulations of Pmx-B binding to resistant and susceptible LPS chemotypes. 2016. (Simpósio).
4th Workshop Adesão Microbiana e Superfícies (Invited speaker).Molecular Models of Lipopolysaccharide Membranes. 2015. (Simpósio).
5th Workshop Adesão Microbiana e Superfícies (Invited speaker). Molecular Models for Lipopolysaccharide Membranes and Polymer Brushes. 2015. (Congresso).
Development and Application of Molecular Simulations (Invited Speaker).Ongoing Research in the Group of Modelling of BioMaterials (BioMat). 2015. (Simpósio).
I Advanced School on Biomolecular Simulation (Invited Speaker).Molecular Models for Bacterial Membranes and Polymer Brushes (Invited Speaker). 2015. (Simpósio).
I Congresso Regional da Sociedade Brasileira de Biofísica. Computational Simulations of Metal Organic Frameworks (MOFs) as Carriers for Drug Delivery. 2015. (Congresso).
III Escola Brasileira de Modelagem Molecular (Invited Speaker).Remodeling and Polymorphism of Lipopolysaccharide Membranes. 2015. (Simpósio).
I Simpósio Nordestino de Pós-Graduação em Química e Biotecnologia.Estratégias de fortalecimento de Pesquisa e Pós-Graduação em Química no Nordeste. 2015. (Simpósio).
Programa POSLATAM (Invited Speaker) - Curso de Biofísica de Membranas -. Computer Simulation of Biological Membranes: Applications (Invited Speaker). 2015. (Congresso).
248th American Society National Meeting (Invited speaker). Modeling the Effects of Water and Solvation in Biological Systems: Developments and Applications. 2014. (Congresso).
3rd Workshop Adesão Microbiana e Superfícies (Invited speaker).Molecular Perspective on Bacterial Outer Membrane: Remodeling and Polymorphism.. 2014. (Oficina).
VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos (Invited speaker).Simulação de Membranas Biológicas. 2014. (Seminário).
XXXIV Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. Scalability of Molecular Dynamics Simulations of Lipopolysaccharide Membranes Using the GROMACS Software Package on Different Architectures. 2014. (Congresso).
XXXIV Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. Post-Processing Challenges in Simulations of Lipopolysaccharide Membranes and Aggregates. 2014. (Congresso).
17º Simpósio da Sociedade Brasileira de Química Teórica.The Electrostatic Potential of the Rough LPS Membrane and Chemotypes. 2013. (Simpósio).
17º Simpósio da Sociedade Brasileira de Química Teórica.The Mechanism of Action of Pediocin-Plantaricin Hybrid Peptide in Pure and Binary POPG-POPC bilayers. 2013. (Simpósio).
2nd Workshop Adesão Microbiana e Superfícies (Invited speaker).Simulations of Biological Membranes in the BioMat Group. 2013. (Simpósio).
II Escola Brasileira de Modelagem Molecular (invited speaker).The Effect of Temperature, Cations and number of ACYL Chains on the Lamellar to Non-lamellar transation in Lipid-A Membranes: A Microscopic View. 2013. (Simpósio).
XLII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. What Can We Learn from Computer Simulations of the Bacterial Outer Membrane? (invited speaker). 2013. (Congresso).
1st Workshop Adesão Microbiana e Superfícies (Invited speaker).Simulations of Rough LPS Chemotypes. 2012. (Simpósio).
II USP Conference on Nanotechnology (invited speaker).II USP Conference on Nanotechnology. 2012. (Simpósio).
1st Workshop Adesão Microbiana e Superfícies (Invited speaker).A novel atomistic force field for simulations of lipopolysaccharide membranes. 2011. (Seminário).
34a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química. Um Novo Scaffold Molecular Baseado na Proteina Top7 Resistente `a Condicoes Extremas de Temperatura e pH. 2011. (Congresso).
I Escola Brasileira de Modelagem Molecular (invited speaker).Computational Simulations in the Interface with Experiments. 2011. (Simpósio).
II Reunião Anual da Rede de NanoBiotecnologia (invited guest). 2011. (Encontro).
I Workshop de Nanotecnologia Aplicada da Amazônia (invited speaker).Simulações computacionais como uma ferramenta no desenvolvimento de sistemas biomoleculares com funcionalidades remodeladas. 2011. (Simpósio).
XI Workshop Pos-Graduacao em Quimica.Participação em Debates Coletivos. 2011. (Encontro).
XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica (invited speaker). A New Set of Parameters for Atomistic Simulations of Lipopolysaccharide Membranes. 2011. (Congresso).
39a Reunião da Sociedade Brasileira de Bioquímica. Computational Simulations of Outer Membrane Proteins of Pseudomonas aeruginosa Embedded in Lipopolysaccharide Membranes. 2010. (Congresso).
II Reunião Geral do Instituto Nacional de Nanotecnologia para Marcadores Integrados (INAMI) (invited speaker). Simulations of Organophosphorus Hydrolase in Functionalized Mesoporous Silica Surfaces. 2010. (Congresso).
Molecular Simulation 2010 (invited speaker).Molecular simulations of bacterial outer membrane and outer membrane proteins. 2010. (Simpósio).
V Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos (invited speaker).Simulações atomísticas de membranas lipopolissacarídicas e proteínas de membrana externa. 2010. (Simpósio).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (12)

Soares, T. A.; Ruud, K. ; Brandas, E. ; Nakai, H. ; Gill, P. ; Clark, A. ; Clary, D.. 10th Congress of the International Society of Theoretical Chemical Physics (ISTCP-X). 2018. Congresso
Soares, Thereza A. ; Nogueira, R. ; Fontes, A. ; Rodrigues, C.. V Congresso Regional da Sociedade Brasileira de Biofísica. 2018. Congresso
SOARES, T. A. ; Coutinho K. ; Vequi-Suplicy, Cíntia. III Advanced School on Biomolecular Simulation. 2017. Congresso
Soares, Thereza A. ; RAMSTEDT, MADELEINE. UCMR Mini-Symposium on Structural Dynamics of Biological Membranes. 2016. Congresso
Soares, Thereza A.. V STINT Workshop - Understanding Biocompatibility fo Polymeric Biomaterial Surfaces. 2015. Congresso
Soares, Thereza A. ; Coutinho, Kaline ; Vequi-Suplicy, Cíntia. Advanced School on Biomolecular Simulation. 2015. Congresso
SOARES, T. A. ; da Gama, A. S. ; Longo, R. L. ; Lins, R. D. ; Alves Jr., S. ; Anjos, J. V.. III Escola de Química Ricardo Ferreira. 2014. Congresso
Borges Jr, I. ; Coutinho-Neto, M. D. ; Galembeck, S. E. ; Pliego Jr., J. R. ; Silva-Filho, D. A. ; Segala, M. ; Rocha, A. B. ; SOARES, T. A.. XVII Simpósio Brasileiro de Química Teórica. 2013. Congresso
SOARES, T. A. ; Princival, J.L. ; Longo, R. L. ; Galembeck, A.. I Escola de Química Ricardo Ferreira. 2012. Outro
SOARES, T. A. ; Lins, R. D.. II STINT Workshop - Understanding Biocompatibility fo Polymeric Biomaterial Surfaces. 2012. Congresso
SOARES, T. A.. Introdução à Administração de Sistemas Operacionais Linux. 2011. Outro
Calado, S.C.S. ; Hallwass, F. ; Pavão, A. C. ; SOARES, T. A. ; et. al.. Semana de Comemoração ao Ano Internacional da Química. 2011. Congresso

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (2)

Thereza Amélia Soares da Silva ⇔ Eduardo Maffud Cilli (2.0)
LORENZÓN, ESTEBAN N. ; NOBRE, THATYANE M. ; CASELI, LUCIANO ; Cilli, Eduardo M. ; DA HORA, GABRIEL C.A. ; SOARES, THEREZA A. ; OLIVEIRA, OSVALDO N.. The -pre-assembled state- of magainin 2 lysine-linked dimer determines its enhanced antimicrobial activity. COLLOIDS AND SURFACES B-BIOINTERFACES. v. 167, p. 432-440, issn: 0927-7765, 2018.
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Lorenzón, E.N. ; RISKE, K. A. ; FELICIANO, G. T. ; HORA, G. C. ; SOARES, T. A. ; Cilli, Eduardo Maffud. Effect of dimerization on the mechanism of action of aurein 1.2. Biochimica et Biophysica Acta. Biomembranes. v. 1858, p. 1129-1138, issn: 0005-2736, 2016.
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Thereza Amélia Soares da Silva ⇔ Hercílio Martelli Junior (1.0)
Martelli H Jr. Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Científica - PIBIC-CNPq. 2011.
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(*) Relatório criado com produções desde 2010 até 2020
Data de processamento: 14/09/2020 20:04:25

Relatório gerado por scriptLattes V8.11. Os resultados estão sujeitos a falhas devido a inconsistências no preenchimento dos CVs Lattes. E-mail de contato: marcos.hir@far.fiocruz.br