Atualmente, é Professora Adjunta no Centro de Ciências Naturais e Humanas da Universidade Federal do ABC (CCNH-UFABC), atuando na área de Biotecnologia, com foco em Biologia Sintética. Sua experiência inclui o design, montagem e validação de circuitos gênicos em sistemas cell-free e modelos biológicos, principalmente procariotos. Obteve o Doutorado em Biociências e Biotecnologias Aplicadas à Farmácia pela UNESP Araraquara, com ênfase em Biotecnologia e Biologia Sintética; nessa instituição, desenvolveu e validou pequenos RNAs não codificantes sintéticos para edição gênica e regulação da expressão de genes. Realizou estágio de doutorado sanduíche no Laboratório de Microbiologia da Hochschule Mannheim, Alemanha (2018-2019), com apoio do CNPq/DAAD e concluiu o pós-doutorado na UNESP Araraquara, desenvolvendo circuitos gênicos aplicados a biossensores para diagnóstico de doenças associadas a microRNAs. É coordenadora do grupo de pesquisa SynBio UFABC, que integra a Rede Brasileira de Biologia Sintética, atuando nas linhas de pesquisa: Biologia Sintética aplicada à engenharia metabólica de procariotos, biossensores baseados em circuitos gênicos sintéticos e construção e validação de circuitos para regulação da expressão gênica. Utiliza técnicas de biologia molecular, engenharia genética e microbiologia, incluindo clonagem molecular, montagem in vitro de DNA, ensaios de fluorescência e luminescência, análise funcional in vitro e in vivo de circuitos gênicos, entre outras. (Texto informado pelo autor)
SILVA, BRUNA F. ; CORRÊA, GRACIELY G. ; ZOCCA, VITÓRIA F. B. ; PICHELI, FLAVIO P. ; LINS, MILCA R. C. R. ; Pedrolli, Danielle B.. Expanding the Functionality of an Autoinduction Device for Repression of Gene Expression in Bacillus subtilis. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES. v. 24, p. 84, issn: 1422-0067, 2023.
TAVARES, LEONARDO F. ; Ribeiro, Nathan V. ; ZOCCA, VITÓRIA F. B. ; CORRÊA, GRACIELY G. ; AMORIM, LAURA A. S. ; LINS, MILCA R. C. R. ; Pedrolli, Danielle B.. Preventing Production Escape Using an Engineered Glucose-Inducible Genetic Circuit. ACS Synthetic Biology. v. 12, p. 3124-3130, issn: 2161-5063, 2023.
FRANCO, RAFAEL A. L. ; BRENNER, GABRIEL ; ZOCCA, VITÓRIA F. B. ; DE PAIVA, GABRIELA B. ; LIMA, RAYANE N. ; RECH, ELIBIO L. ; AMARAL, DANILO T. ; LINS, MILCA R. C. R. ; Pedrolli, Danielle B.. Signal Amplification for Cell-Free Biosensors, an Analog-to-Digital Converter. ACS Synthetic Biology. v. 12, p. 2819-2826, issn: 2161-5063, 2023.
LINS, MILCA RACHEL DA COSTA RIBEIRO; CORRÊA, GRACIELY GOMES ; AMORIM, LAURA ARAUJO DA SILVA ; FRANCO, RAFAEL AUGUSTO LOPES ; RIBEIRO, NATHAN VINICIUS ; JESUS, VICTOR NUNES DE ; PEDROLLI, DANIELLE BISCARO. Characterization of Five Purine Riboswitches in Cellular and Cell-Free Expression Systems. CURRENT MICROBIOLOGY. v. 79, p. 1-11, issn: 0343-8651, 2022.
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Capítulos de livros publicados (0)
Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (2)
LEAL, G. G. ; CARVALHO, L. C. ; CAETANO, Y. B. ; LINS, M. R. C. R.. Synthetic Biology as an approach to engineer microbial chassis for the biosynthesis of vitamin B12. Em: I Congresso Brasileiro de Biotecnologia Industrial (I COBBIND), 2024, Florianópolis. I Congresso Brasileiro de Biotecnologia Industrial (I COBBIND), 2024.
AMORIM, LAURA ARAUJO DA SILVA ; LINS, M.R.C.R. ; PEDROLLI, D. B.. Synthetic small RNAs designed to rationally interfere with riboswitch regulation in Bacillus subtilis. Em: XIII Simpósio Nacional de Bioprocessos / XIV Seminário de Hidrólise Enzimática de Biomassas / XIV Seminário Brasileiro de Tecnologia Enzimática, 2022, Armação dos Búzios. XIII Simpósio Nacional de Bioprocessos / XIV Seminário de Hidrólise Enzimática de Biomassas / XIV Seminário Brasileiro de Tecnologia Enzimática, 2022.
Resumos publicados em anais de congressos (13)
LEAL, G. G. ; SOUZA, W. R. ; LINS, M. R. C. R.. Análise de genes off-targets de RNAs de interferência projetados para regular a produção de alfa-amilase em trigo. Em: III Semana de Biotecnologia da UFABC, 2024, Santo André. III Semana de Biotecnologia da UFABC, 2024.
CAETANO, Y. B. ; ARROYAVE, C. G. C. ; LINS, M.R.C.R.. Boolean logic applied to developing synthetic gene circuits based on the SplitGFP protein. Em: I Congresso Brasileiro de Biologia Sintética, 2024, São Paulo. I Congresso Brasileiro de Biologia Sintética, 2024.
CARVALHO, L. C. ; RESENDE, J. C. ; LINS, M.R.C.R.. Desenvolvimento e avaliação in silico de biossensores baseados em circuitos genéticos para a detecção de microplásticos. Em: III Semana de Biotecnologia da UFABC, 2024, Santo André. III Semana de Biotecnologia da UFABC, 2024.
LEAL, G. G. ; SOUZA, W. R. ; LINS, M.R.C.R.. Genetic circuit based on synthetic interference RNAs to regulate gene expression of the wheat alpha-amylase. Em: I Congresso Brasileiro de Biologia Sintética, 2024, São Paulo. I Congresso Brasileiro de Biologia Sintética, 2024.
LEAL, G. G. ; SOUZA, W. R. ; LINS, M.R.C.R.. In silico design and structure prediction of synthetic small interfering RNAs to regulate Triticum aestivum?s alpha-amylase expression. Em: 69º CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA (GENETICA 2024), 2024, Campos do Jordão. 69º CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA (GENETICA 2024), 2024.
CARVALHO, L. C. ; RESENDE, J. C. ; LINS, M.R.C.R.. In silico performance analysis of a PET derivative microplastic biosensor based on synthetic gene circuits. Em: I Congresso Brasileiro de Biologia Sintética, 2024, São Paulo. I Congresso Brasileiro de Biologia Sintética, 2024.
CAETANO, Y. B. ; ARROYAVE, C. G. C. ; LINS, M.R.C.R.. Lógica booleana aplicada ao desenvolvimento de circuito genético sintético baseado na proteína SplitGFP. Em: XIV Encontro de Iniciação Científica da UFABC, 2024, Santo André. XIV Encontro de Iniciação Científica da UFABC, 2024.
CARVALHO, L. C. ; RESENDE, J. C. ; LINS, M.R.C.R.. Biossensor de microplástico baseado em circuito genético: uma análise in silico do seus funcionamento. Em: XIV Encontro de Iniciação Científica da UFABC, 2024, Santo André. XIV Encontro de Iniciação Científica da UFABC, 2024.
LEAL, G. G. ; SOUZA, W. R. ; LINS, M.R.C.R.. Circuito genético constituído de RNAs de interferências sintéticos para regular a expressão gênica da enzima alfa-amilase. Em: XIV Encontro de Iniciação Científica da UFABC, 2024, Santo André. XIV Encontro de Iniciação Científica da UFABC, 2024.
BRENNER, G. ; FRANCO, RAFAEL AUGUSTO LOPES ; ZOCCA, VITÓRIA F. B. ; BARBOSA DE PAIVA, GABRIELA ; LIMA, R. N. ; RECH, E. ; LINS, M.R.C.R. ; PEDROLLI, DANIELLE B.. Signal-amplification for cell-free biosensors, an analog-to-digital converter. Em: SynCell 2023, 2023, Minneapolis. SynCell 2023: International Conference on Engineering Synthetic Cells and Organelles, 2023.
TAVARES, L. F. ; Ribeiro, Nathan V. ; ZOCCA, V.F.B. ; AMORIM, L. A. S. ; LINS, M. R. C. R. ; PEDROLLI, D.B.. Preventing production escape using an engineered glucose-inducible genetic circuit. Em: 32° Congresso Brasileiro Microbiologia 2023, 2023, Foz do Iguaçu. 32° Congresso Brasileiro Microbiologia 2023, 2023.
BRENNER, G. ; LINS, M. R. C. R. ; PEDROLLI, D. B.. Design e análise in silico de um biossensor do tipo toehold switch para detecção de SARS-Cov-2. Em: IV Simpósio Latino-Americano de Biotecnologia, 2022, Parnaíba. IV Simpósio Latino-Americano de Biotecnologia, 2022.
LINS, MILCA R. C. R.; MACK, M. ; SILVA, A.J. ; LIMA, A. M. ; PAULA, A. V. ; BAPTISTA NETO, A. ; ZOCCA, V.F.B. ; AMORIM, L. A. S. ; PICHELI, FLAVIO PEREIRA ; PEDROLLI, D. B.. Development of a sustainable platform for the production of glutamate derivates. Em: Key Technologies in the Bioeconomy, 2022, Straubing. KTB 2022 - Abstract Book, 2022.
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (11)
LINS, M. R. C. R. O potencial da Biologia Sintética como estratégia para construção de sistemas cell-free e biológicos. 2024. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
LINS, M. R. C. R. Explorando a diversidade metabólica para produção sustentável de bioprodutos. 2024. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
LINS, M.R.C.R. Aplicações da Biologia Sintética: Transformando microrganismo em plataformas de produção de vitaminas B12. 2024. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
LINS, M. R. C. R.; PEDROLLI, D. B.. Palestra sobre a experiência internacional na Alemanha durante o doutorado sanduíche com bolsa CNPq/DAAD. 2024. Apresentação de Trabalho/Outra
LINS, M.R.C.R. Engineering of Bacillus subtilis strains with Synthetic Biology strategies for the production of aminolevulinic acid. 2023. Apresentação de Trabalho/Congresso
LINS, M.R.C.R. Circuitos genéticos em sistema cell-free. 2022. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
LINS, M.R.C.R. Biologia Sintética aplicada ao design de circuitos gênicos: sistemas cell-free e engenharia de bactérias. 2022. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
LINS, M. R. C. R. O que você pode fazer com Biologia Sintética?. 2022. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
LINS, M.R.C.R.; PEDROLLI, D. B. ; MACK, M. ; SILVA, A.J. ; LIMA, A. M. ; PAULA, A. V. ; BAPTISTA NETO, A. ; ZOCCA, V.F.B. ; AMORIM, L. A. S. ; PICHELI, F. P.. Development of a sustainable platform for the production of glutamate derivates. 2022. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
LINS, M. R. C. R. Introdução à Biologia Sintética. 2022. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
LINS, M. R. C. R. Técnicas em biologia sintética. 2022. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
Demais tipos de produção bibliográfica (0)
Produção técnica
Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (1)
LINS, M. R. C. R. CRISPR-CAS na prática computacional: design in silico de gRNA e estratégias de edição genômica. 2024. Curso de curta duração ministrado/Extensão
Produção artística
Total de produção artística (0)
Orientações em andamento
Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (2)
Iris Campanella Cabral. Análise filogenética e reconstrução evolutiva de genes primordiais relacionados a Magnetorecepção em bactérias magnetotáticas. Iniciação científica (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2024. Orientador: Milca Rachel da Costa Ribeiro Lins.
Luan César Carvalho. Caracterização in silico por docking molecular do reconhecimento do tereftalato (TPA) pelo fator transcricional ativador TphR. Iniciação científica (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal do ABC, UFABC. Início: 2024. Orientador: Milca Rachel da Costa Ribeiro Lins.
Orientações de outra natureza (0)
Supervisões e orientações concluídas
Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (1)
Gabriel Brenner. Desenvolvimento de biosensores para identificação do vírus SARS-CoV2. Dissertação (Mestrado em Biociências e Biotecnologia Aplicadas à Farmácia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, . 2022. Supervisor: Milca Rachel da Costa Ribeiro Lins.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (4)
Gabriel Gonçalves Leal. Circuito genético com RNAs de interferência sintéticos para regulação da expressão gênica da enzima alfa-amilase do trigo (Triticum aestivum). (Graduação em Biotecnologia) - Universidade Federal do ABC, . 2024. Orientador: Milca Rachel da Costa Ribeiro Lins.
Anderson Sousa da Silva. Um panorama de métodos de modelagem para o design in silico de riboswitches artificiais. (Graduação em Biotecnologia) - Universidade Federal do ABC, . 2024. Orientador: Milca Rachel da Costa Ribeiro Lins.
Adriano Henrique Bonatti. A edição de genomas como biotecnologia de uso dual e seu impacto sobre questões bioéticas. (Graduação em Biotecnologia) - Universidade Federal do ABC, . 2024. Orientador: Milca Rachel da Costa Ribeiro Lins.
Isadora Arcanjo Gori. Lovelace?s Note in Gene: Construção de um circuito de regulação autônomo e temporal da expressão gênica. (Graduação em Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2022. Orientador: Milca Rachel da Costa Ribeiro Lins.
Iniciação científica (3)
Gabriel Gonçalves Leal. Circuito genético constituído de RNAs de interferência sintéticos para regular a expressão gênica da enzima alfa-amilase. (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal do ABC, UFABC. 2024. Orientador: Milca Rachel da Costa Ribeiro Lins.
Luan César Carvalho. Biossensor de microplástico baseado em circuito genético sintético: uma análise in silico de seu funcionamento. (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, UFABC. 2024. Orientador: Milca Rachel da Costa Ribeiro Lins.
Yuri Barros Caetano. Lógica booleana aplicada ao desenvolvimento de circuito genético sintético baseado na proteína SplitGFP. (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, . 2024. Orientador: Milca Rachel da Costa Ribeiro Lins.
Orientações de outra natureza (0)
Projetos de pesquisa
Total de projetos de pesquisa (2)
2022-Atual. Desenvolvimento de uma plataforma sustentável para a produção de derivados do glutamato Descrição: Nas últimas décadas, muitos processos químicos foram substituídos com sucesso por processos biológicos. A transição de uma economia baseada em combustíveis fósseis para uma bioeconomia é um passo importante para reduzir as emissões globais de carbono e aumentar a sustentabilidade dos processos industriais. Além disso, as preocupações com segurança e saúde associadas à produção e uso de compostos sintéticos têm fomentado uma demanda crescente por produtos naturais ambientalmente sustentáveis. Uma parte crescente da bioeconomia é desempenhada pela produção de biocompostos a partir da biomassa. Entre os biocompostos que podem ser produzidos a partir de biomassa, aminoácidos, peptídeos não ribossomais e policetídeos despertam grande interesse devido ao seu uso potencial em uma ampla gama de produtos indústrias, incluindo produtos farmacêuticos, polímeros, aromas e fragrâncias e corantes naturais. No entanto, esses produtos não podem ser suficientemente produzidos e extraídos de fontes naturais, como plantas e microrganismos selvagens. Ferramentas de biologia sintética e engenharia metabólica desenvolvidas recentemente aumentaram muito nossa capacidade de construir linhagens com uma capacidade ampliada de produzir compostos naturais e não naturais. Neste projeto propomos a engenharia sistemática de linhagens microbianas para desenvolver uma plataforma de produção de derivados do L-glutamato. Para atingir esse objetivo, usaremos análise de balanço de fluxos metabólicos para prever os melhores alvos para engenharia e ferramentas moleculares modernas, como edição por CRISPR, tecnologia de RNAs sintéticos e controle dinâmico de expressão gênica. Para demonstrar o potencial da plataforma, a produção de glutamato será direcionada para a biossíntese de surfactina e indigoidina, compostos de alto interesse industrial.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Milca Rachel da Costa Ribeiro Lins - Integrante / Danielle Biscaro Pedrolli - Coordenador / Vitória Fernanda Bertolazzi Zocca - Integrante / Matthias Mack - Integrante / Laura Araujo da Silva Amorim - Integrante / PICHELI, FLAVIO PEREIRA - Integrante / Adilson José da Silva - Integrante / Ariela Veloso de Paula - Integrante / Álvaro de Baptista Neto - Integrante / Alice Medeiros de Lima - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro. Membro: Milca Rachel da Costa Ribeiro Lins.
2022-Atual. Produção integrada de biodiesel e bioativos a partir da biomassa microalgal usando efluente da indústriasucroalcooleira Descrição: A diversificação da matriz energética voltada para o desenvolvimento de um modelo sustentável é umaimportante estratégia para o crescimento do País. O Brasil é o segundo maior produtor de bioetanol no mundo,gerando alta quantidade de CO2 e vinhaça como subprodutos. A vinhaça pode ser tratada por biodigestãoanaeróbia, gerando CH4 (metano), que é considerado uma energia renovável no mercado emergente. O efluentelíquido biodigerido ainda será rico em nitrogênio, fósforo e potássio, o que, juntamente com o CO2, pode serutilizado como meio nutriente para o cultivo de microalgas. As microalgas têm se destacado como a próximaplataforma de biotecnologia industrial para produzir biocombustível e/ou bioativos. O problema do emprego damicroalga para a produção de biocombustível é o alto custo de produção, o que pode ser reduzido pelo uso doefluentes industriais, emprego de microalga geneticamente modificada visando um aumento na produtividade emóleo, e associação da produção do biocombustível com outros compostos de alto valor agregado nas indústriasalimentícias, farmacêuticas e cosméticas. As microalgas são conhecidas por serem fontes naturais, renováveis,sustentáveis e promissoras de vários bioativos. Neste contexto, será avaliado o uso de água residual provenientedo tratamento anaeróbio da vinhaça associado ao CO2 proveniente da digestão para cultivo de microalgasselvagens e geneticamente modificadas para inibição de síntese de carboidrato de reserva visando o acúmulo delipídios. Ademais, serão analisadas a produção e a purificação de peptídeos e proteínas com atividade (in vitro)anti-hipertensiva, fibrinolítica e leishmanicida obtidos a partir da biomassa microalgal selvagem e mutada visandoagregar valor aos produtos gerados. Desse modo, esse projeto contribuiria com o desenvolvimento de umapossível matriz energética sustentável a partir do uso da biomassa microalgal, oferecendo um processosustentável e eficiente por meio da maximização dos benefícios econômicos, ambientais e sociais.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Milca Rachel da Costa Ribeiro Lins - Coordenador / MARCELO CHUEI MATSUDO - Integrante / Livia Seno Ferreira Camargo - Integrante / João Carlos Monteiro de Carvalho - Integrante / Raquel Pedrosa Bezerra - Integrante / ANA LUCIA FIGUEIREDOPORTO - Integrante / Marina Ishii - Integrante / Milena de Paiva Cavalcanti - Integrante / ROMERO MARCOS PEDROSABRANDAO COSTA - Integrante. Membro: Milca Rachel da Costa Ribeiro Lins.
I Congresso Brasileiro de biologia Sintética. 2024. (Congresso).
Key Technologies in the Bioeconomy: A Global Bioeconomy Alliance Conference. Engineering of Bacillus subtilis strains with Synthetic Biology strategies for the production of aminolevulinic acid. 2023. (Congresso).
UFABC para todos. Apresentação sobre o curso do Bacharelado em Biotecnologia da UFABC para alunos de ensino médio (Projeto ProEC EV048-2023). 2023. (Feira).
Key Technologies in the Bioeconomy. Development of a sustainable platform for the production of glutamate derivates. 2022. (Congresso).
Organização de eventos
Total de organização de eventos (3)
LINS, M. R. C. R.. III Semana de Biotecnologia da UFABC. 2024. (Congresso).. . 0.
LINS, M. R. C. R.. II Semana de Biotecnologia da UFABC. 2023. (Congresso).. . 0.
LINS, M.R.C.R.. I Semana da Biotecnologia UFABC. 2022. (Congresso).. . 0.
FRANCO, RAFAEL A. L. ; BRENNER, GABRIEL ; ZOCCA, VITÓRIA F. B. ; DE PAIVA, GABRIELA B. ; LIMA, RAYANE N. ; RECH, ELIBIO L. ; AMARAL, DANILO T. ; LINS, MILCA R. C. R. ; Pedrolli, Danielle B.. Signal Amplification for Cell-Free Biosensors, an Analog-to-Digital Converter. ACS Synthetic Biology. v. 12, p. 2819-2826, issn: 2161-5063, 2023.