INCT da Internet do Futuro

Junior Barrera

possui graduação em Engenharia Elétrica pela Escola Politécnica da Universidade de São Paulo (1983); mestrado em Computação Aplicada pelo Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais (1987); doutorado em Engenharia Elétrica pela Escola Politécnica da Universidade de São Paulo (1992) - parte da pesquisa realizada na École National des Mines de Paris; livre docência pelo Instituto de Matemática e Estatística da USP (1998); titularidade em Ciência da Computação pelo Instituto de Matemática e Estatística da USP (2005) e pela Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto (2008). Atualmente, é professor titular do Departamento de Ciência da Computação do IME-USP. Tem experiência na área de Ciência da Computação, com ênfase em Matemática da Computação, tendo realizado desenvolvimentos teóricos nos seguintes temas: morfologia matemática, aprendizado de operadores morfológicos, modelagem e identificação de sistemas dinâmicos de reticulado. Ainda, tem realizado aplicações dessas técnicas em processamento e análise de imagens, vídeo digital, análise de expressão gênica, modelagem de sistemas biológicos e esportes coletivos de invasão. (Texto informado pelo autor)

  • http://lattes.cnpq.br/0362417828475021 (16/03/2022)
  • Rótulo/Grupo:
  • Bolsa CNPq:
  • Período de análise:
  • Endereço: Universidade de São Paulo, Instituto de Matemática e Estatística. Rua do Matão Butantã 05508090 - São Paulo, SP - Brasil Telefone: (11) 30916135 Fax: (11) 30916134 URL da Homepage: www.esience.ime.usp.br
  • Grande área: Ciências Exatas e da Terra
  • Área: Ciência da Computação
  • Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

Prêmios e títulos

Participação em eventos

Organização de eventos

Lista de colaborações


Produção bibliográfica

Produção técnica

Produção artística

Orientações em andamento

Supervisões e orientações concluídas

Projetos de pesquisa

  • Total de projetos de pesquisa (12)
    1. 2016-Atual. torage, Modeling and Analysis of Dynamical Systems for e-Science Applications.
      Descrição: The astonishing fast rate of technology evolution has given rise to a new era of scientific knowledge discovery. This new age of science, known as e-Science, is described as the new great computational and multidisciplinary team science requiring novel methodologies for data storage, modeling and analysis. In particular, the development of transactional and analytical software systems for e-Science applications when viewed from a dynamic systems perspective, presents a number of new computational challenges. Among them are the scientific knowledge discovery processes, which involve frequent changes of requirements for data storage, modeling and analysis. The need to address scientific dynamic systems in order to cope with complex applications of e-Science has woken up the scientific community for the development of robust and evolutionary software systems to meet these new challenges. Dynamical system is the classical mathematical formalism to represent phenomena that evolute with time, which are of great interest in science. In this project, our main goal is to develop computational models and methodologies to support e-Science applications viewed as dynamic systems. Our fundamental research covers three key research areas, namely storage, modeling, and analysis of dynamic systems. These research areas are significant and relevant to the FAPESP e-Science Program since many of the present e-Science challenges are related to the proper treatment of dynamic systems. Hence, we plan to develop and apply computational methodologies that will ease the development of e-Science applications, thereby contributing to the improvement of worldwide scientific knowledge, while respecting legal and ethical restrictions in data management... Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Junior Barrera - Integrante / João eduardo Ferreira - Coordenador.
      Membro: Junior Barrera.
      Descrição: The astonishing fast rate of technology evolution has given rise to a new era of scientific knowledge discovery. This new age of science, known as e-Science, is described as the new great computational and multidisciplinary team science requiring novel methodologies for data storage, modeling and analysis. In particular, the development of transactional and analytical software systems for e-Science applications when viewed from a dynamic systems perspective, presents a number of new computational challenges. Among them are the scientific knowledge discovery processes, which involve frequent changes of requirements for data storage, modeling and analysis. The need to address scientific dynamic systems in order to cope with complex applications of e-Science has woken up the scientific community for the development of robust and evolutionary software systems to meet these new challenges. Dynamical system is the classical mathematical formalism to represent phenomena that evolute with time, which are of great interest in science. In this project, our main goal is to develop computational models and methodologies to support e-Science applications viewed as dynamic systems. Our fundamental research covers three key research areas, namely storage, modeling, and analysis of dynamic systems. These research areas are significant and relevant to the FAPESP e-Science Program since many of the present e-Science challenges are related to the proper treatment of dynamic systems. Hence, we plan to develop and apply computational methodologies that will ease the development of e-Science applications, thereby contributing to the improvement of worldwide scientific knowledge, while respecting legal and ethical restrictions in data management.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
      Membro: João Eduardo Ferreira.
    2. 2016-Atual. INCT da Internet do Futuro para Cidades Inteligentes
      Descrição: bjetivo: Desenvolvimento de modelos, técnicas, métodos e sistemas de software visando à melhoria da vida da população urbana por meio da utilização da tecnologia da informação e da comunicação. Essa pesquisa envolve técnicas avançadas de Computação em Nuvem, Internet das Coisas, Computação de Alto Desempenho, Engenharia de Software, Big Data e Aprendizado de Máquina... Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Junior Barrera - Integrante / Fabio Kon - Coordenador.
      Membro: Junior Barrera.
      Descrição: Objetivo: Desenvolvimento de modelos, técnicas, métodos e sistemas de software visando à melhoria da vida da população urbana por meio da utilização da tecnologia da informação e da comunicação. Essa pesquisa envolve técnicas avançadas de Computação em Nuvem, Internet das Coisas, Computação de Alto Desempenho, Engenharia de Software, Big Data e Aprendizado de Máquina.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (20) / Doutorado: (10) . Integrantes: Jesús Pascual Mena Chalco - Integrante / Fabio Kon - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
      Membro: Jesús Pascual Mena Chalco.
      Descrição: Desenvolvimento de modelos, técnicas, métodos e sistemas de software visando à melhoria da vida da população urbana por meio da utilização da tecnologia da informação e da comunicação. Essa pesquisa envolve técnicas avançadas de Computação em Nuvem, Internet das Coisas, Computação de Alto Desempenho, Engenharia de Software, Big Data e Aprendizado de Máquina.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Henrique Mongelli - Integrante / Fábio Kon - Integrante / Markus Endler - Integrante / Alfredo Goldman vel Lejbman - Coordenador / Fábio Costa - Integrante / Ronaldo Alves Ferreira - Integrante.
      Membro: Henrique Mongelli.
      Descrição: Objetivo: Desenvolvimento de modelos, técnicas, métodos e sistemas de software visando à melhoria da vida da população urbana por meio da utilização da tecnologia da informação e da comunicação. Essa pesquisa envolve técnicas avançadas de Computação em Nuvem, Internet das Coisas, Computação de Alto Desempenho, Engenharia de Software, Big Data e Aprendizado de Máquina.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (20) / Doutorado: (10) . Integrantes: Fabio Kon - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / (FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.
      Membro: Fabio Kon.
      Descrição: Objetivo: Desenvolvimento de modelos, técnicas, métodos e sistemas de software visando à melhoria da vida da população urbana por meio da utilização da tecnologia da informação e da comunicação. Essa pesquisa envolve técnicas avançadas de Computação em Nuvem, Internet das Coisas, Computação de Alto Desempenho, Engenharia de Software, Big Data e Aprendizado de Máquina.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (20) / Doutorado: (10) . Integrantes: Daniel de Angelis Cordeiro - Integrante / Fabio Kon - Coordenador. Financiador(es): CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
      Membro: Daniel de Angelis Cordeiro.
      Descrição: Objetivo: Desenvolvimento de modelos, técnicas, métodos e sistemas de software visando à melhoria da vida da população urbana por meio da utilização da tecnologia da informação e da comunicação. Essa pesquisa envolve técnicas avançadas de Computação em Nuvem, Internet das Coisas, Computação de Alto Desempenho, Engenharia de Software, Big Data e Aprendizado de Máquina.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (5) / Doutorado: (3) . Integrantes: Álvaro Luiz Fazenda - Integrante / Arlindo Flávio da Conceição - Integrante / Raphael Y. Camargo - Integrante / Denise Stringhini - Integrante / Fabio Kon - Coordenador / Alfredo Goldman - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T & A: 1
      Membro: Álvaro Luiz Fazenda.
      Descrição: Desenvolvimento de modelos, técnicas, métodos e sistemas de software visando à melhoria da vida da população urbana por meio da utilização da tecnologia da informação e da comunicação. Essa pesquisa envolve técnicas avançadas de Computação em Nuvem, Internet das Coisas, Computação de Alto Desempenho, Engenharia de Software, Big Data e Aprendizado de Máquina.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (20) / Doutorado: (10) . Integrantes: Alfredo Goldman vel Lejbman - Integrante / Fabio Kon - Coordenador / Otto Carlos Muniz Bandeira Duarte - Integrante. Financiador(es): CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
      Membro: Alfredo Goldman vel Lejbman.
    3. 2014-Atual. Biologia Sistêmica do Câncer
      Descrição: Rede de pesquisa, extensão e ensino financiada pela Capes. Para maiores detalhes, ver http://neuro.ufrn.br/bsc. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Junior Barrera - Integrante / Sandro José de Souza - Coordenador / Dirce M Carraro - Integrante / José Miguel Ortega - Integrante.
      Membro: Junior Barrera.
    4. 2013-Atual. CeTICS - Centro de Toxinas, Imuno-Resposta e Sinalização Celulkar
      Descrição: No Instituto Butantan toxinologia e regulação da resposta imune são, tradicionalmente, áreas conexas de pesquisa científica e desenvolvimento biotecnológico, através das quais o Instituto, historicamente, construiu sua reputação internacional de excelência. Na cultura do Instituto, venenos são misturas complexas de toxinas, selecionadas ao longo da evolução para sinergicamente exercerem efeitos biológicos sistêmicos, através de mecanismos bioquímicos, moleculares e celulares altamente específicos. Portanto, a análise química de venenos tem boas chances de levar à descoberta de novas moléculas de toxinas com potencial terapêutico. Essas premissas foram seguidas com sucesso por pesquisadores do Centro de Toxinologia Aplicada (CAT CEPID-FAPESP), projeto iniciado há 10 anos, que isolaram, caracterizaram quimicamente e patentearam diversas toxinas de natureza proteica, que se tornaram pontos de partida para desenvolvimento de inovação farmacêutica em parceria com indústrias locais. A ênfase em proteínas e peptídeos levou o CAT CEPID a instalar laboratórios no estado da arte para transcriptômica, proteômica, biologia molecular do DNA recombinante e síntese de peptídeos. Mais recentemente, estudos dos mecanismos de ação, bioquímicas, moleculares e celulares, dessas promissoras moléculas foram iniciados com o objetivo de estabelecer provas de conceito. Assim, o CAT estabeleceu, no Instituto Butantan, as condições iniciais para a criação de um centro de toxinas e resposta imune fundamentado nas abordagens atuais da biologia sistêmica. Por conseguinte, 10 pesquisadores, entre os mais competitivos do Instituto Butantan, propõem a criação do novo Centro de Toxinas, Resposta-imune e Sinalização Celular, com aspirações a centro de excelência de classe mundial, aproveitando a histórica reputação internacional do Butantan e o sucesso recente do CAT CEPID. O Plano de pesquisa do Centro Integra subprojetos voltados para a pesquisa científica com subprojetos de vocação para a inovação tecnológica. Um grande grupo de cientistas seniores do Instituto Butantan, de outras instituições brasileiras e de renomadas instituições estrangeiras serão colaboradores do Centro proposto. (AU). Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Junior Barrera - Integrante / Hugo Aguirre Armelin - Coordenador.
      Membro: Junior Barrera.
    5. 2012-Atual. NAP ESCIENCE
      Descrição: Análise e nodelagem de fenômenos naturais mensuráveis por técnicas matemático computacionais.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Junior Barrera - Integrante / Roberto Marcondes Cesar Junior - Coordenador. Financiador(es): Proreitoria de Pesquisas da USP - Cooperação.
      Membro: Junior Barrera.
      Descrição: Modern science is interdisciplinary and data-intensive. For instance, in the 1000 Genomes Project (www.1000genomes.org), the comparative study of 629 individuals has already generated 7.3 TB of data. Analogous situations exist in fields such as astronomy, agriculture, social sciences, etc. Ten years ago, the problem was how to obtain data. Today, the bottleneck is the need for new computational strategies and tools so that scientists can manage these massive volumes of heterogeneous, distributed, data, so that they can generate new knowledge from the processing, analysis and visualization of the data. This launched the basis of the so-called eScience: the combination of advanced research in computer science and mathematical modeling to allow and accelerate research in other knowledge domains. National programs in eScience have been created in the US, GB, Australia and other countries, that recognized the importance of this theme for the advancement of science. The main goal of this project is the design and construction of a collaborative network for research in eScience, in a partnership that involves computer science, mathematical modeling and specific domains in the exact, life, agricultural sciences and social sciences.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Jesús Pascual Mena Chalco - Integrante / CESAR JUNIOR, R. M. - Coordenador. Financiador(es): Universidade de São Paulo - Auxílio financeiro.
      Membro: Jesús Pascual Mena Chalco.
    6. 2009-2010. Modelagem do ciclo celular
      Descrição: Este projeto visa construir modelos quantitativos que permitam prever fenõmenos relacionados com o ciclo celular.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Junior Barrera - Integrante / Hugo Aguirre Armelin - Coordenador.
      Membro: Junior Barrera.
    7. 2005-2010. Modelagem por redes (grafos) e técnicas de reconhecimento de padrões: estrutura, dinâmica e aplicações
      Descrição: Dentre os desafios enfrentados atualmente pela pesquisa em reconhecimento de padrões, cabe ressaltar três linhas fundamentais: (a) problemas em que elementos devem ser descritos estruturalmente através de uma rede indicando conexões entre tais elementos; (b) problemas envolvendo a evolução da informação ao longo de alguma variável independente (e.g. tempo, no caso de sequências de vídeo); (c) problemas envolvendo ambos aspectos, i.e. uma rede de elementos cuja dinâmica evolui ao longo de alguma variável independente. O presente projeto temático, unindo os grupos de visão do IME-USP e IFSC-USP, além de pesquisadores colaboradores de outras instituições, prevê o estudo, desenvolvimento e aplicação de técnicas de reconhecimento de padrões com esses três ítens formando o tema de integração da pesquisa. Além da área de reconhecimento de padrões, o projeto inclui técnicas e problemas de visão computacional, processamento de imagens e de sinais e bioinformática, todas sendo áreas de trabalho dos pesquisadores proponentes.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Junior Barrera - Integrante / COSTA - Integrante / R M Cesar Jr - Coordenador.
      Membro: Junior Barrera.
    8. 2004-Atual. Biomedical Research Informatics for Global Health Training Program - BRIGHT
      Descrição: Projeto conjunto com o IME-USP, MIT e Harvard Medical School, no qual aplicaremos técnicas de análise de imagens por nós desenvolvidas para resolução de problemas em expressão gênica e bioinformática.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Junior Barrera - Coordenador / Lucila Ohno Machado - Integrante / Richard Maas - Integrante / Eduardo Massad - Integrante.
      Membro: Junior Barrera.
    9. 2002-2007. Aproximação Genômica e Pós-Genômica ao Estudo da Malária Humana na Amazônia Brasileira
      Descrição: Análise de dados de biologia molecular, particularmente de expressão gênica, para entender mecanismos biológicos presentes no parasita da malária.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Junior Barrera - Coordenador / Hernando A del Portillo Obando - Integrante.
      Membro: Junior Barrera.
    10. 2002-2004. Cursos / Organização Mundial da Saúde
      Descrição: Organização de cursos de Bioinformática de curta duração para alunos latino-americanos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Junior Barrera - Coordenador / Hernando A del Portillo Obando - Integrante.
      Membro: Junior Barrera.
    11. 2002-2004. Identificação de Genes que Regulam Fenótipos de Interesse em Agropecuária através da Análise Computacional de Seqüências de Expressão
      Descrição: Análise de dados de biologia molecular, particularmente de expressão gênica, para pesquisar melhorias vegetais e animais.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Junior Barrera - Coordenador.
      Membro: Junior Barrera.
    12. 2000-2005. Cooperation for Gene Analysis Expression
      Descrição: Desenvolver técnicas de análise de expressão gênica e aplica-las ao entendimento de Problemas biológicos, como o controle do ciclo celular.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Junior Barrera - Coordenador / Hugo Aguirre Armelin - Integrante.
      Membro: Junior Barrera.

Prêmios e títulos

  • Total de prêmios e títulos (10)
    1. Professor Titular da Faculdade de Filosofia Ciências e Letras da USP de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Matemática da FFCLRP.. 2008.
      Membro: Junior Barrera.
    2. Presidente da Assoicação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional.. 2007.
      Membro: Junior Barrera.
    3. Professor Titular do Instituto de Matemática e Estatística da USP, Depto de Ciência da Computação do IME-USP.. 2005.
      Membro: Junior Barrera.
    4. Melhor apresentação no CAMDA 2004, Critical Assessment of Microarray Data Analysis / Duke University.. 2004.
      Membro: Junior Barrera.
    5. Membro do Comitê Assessor Externo da EMBRAPA Informática Agropecuária, CNPTIA - EMBRAPA.. 2004.
      Membro: Junior Barrera.
    6. Vice-presidente da AB3C, Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional.. 2004.
      Membro: Junior Barrera.
    7. Participação de duas bancas de doutorado na Universidade de Amsterdam, Universidade de Amsterdam, Holanda.. 2002.
      Membro: Junior Barrera.
    8. Orientador da dissertação primeira colocada em concurso da SBC, Sociedade Brasileira de Computação.. 1996.
      Membro: Junior Barrera.
    9. Uma das três melhores teses de doutorado da USP em Ciências Exatas em 1992, Universidade de São Paulo.. 1992.
      Membro: Junior Barrera.
    10. Segundo colocado em concurso de trabalhos de iniciação científica da SBC, Sociedade Brasileira de Computação.. 1983.
      Membro: Junior Barrera.

Participação em eventos

  • Total de participação em eventos (46)
    1. Latin America eScience Workshop 2013. 2013. (Seminário).
    2. Workshop do projeto de Modelagem do Ciclo Celular.Modeling and inference of genes network. 2009. (Seminário).
    3. Workshop on Gene Regulation and Noise.Design of PGNs for malaria parasite and cell cycle control. 2008. (Seminário).
    4. Seminários da EMBRAPA Informática.Design of PGNs for malaria parasite and cell cycle control. 2007. (Seminário).
    5. Seminários de Bioinformática na Université Claude Bernard, Lyon I.Cell cycle control modeling. 2007. (Seminário).
    6. Seminários do Barcelona Centre for International Health.Anotating malare genes by genetic network estimation. 2007. (Seminário).
    7. 51 Congresso Brasileiro de Genética. Design of PGNs for malaria parasite and cell cycle control system. 2005. (Congresso).
    8. Seminários de Computação Gráfica do IMPA.Futebol: inteligência do jogo. 2005. (Seminário).
    9. Critical Assesment of Microarray Data Analysis - CAMDA 2004. A New Annotation Tool For Malaria Based On Inference Of Probabilistic Genetic Networks. 2004. (Congresso).
    10. Seminários do Tgen Institute.A new anotation tool for malaria based on inference of PGN. 2004. (Seminário).
    11. II Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research. Data mining and dynamical modeling in Biology: a semiotic view. 2003. (Congresso).
    12. Programa de Seminários em Biologia Computacional - USP/ Ínformática Médica.Dos sinais de Microarrays à descoberta de conhecimento biológico. 2003. (Encontro).
    13. Encontro França-Brasil de Bioinformática.An integrated environment for analysis of genetic data. 2002. (Encontro).
    14. II Simpósio Brasileiro de Biologia Matemática e computacional. From Microarray images to biological knowledge. 2002. (Congresso).
    15. IMPA 50 anos - Seção Especial de Computação Gráfica. Automatic programming of morphological machines by PAC learning. 2002. (Congresso).
    16. Meeting of the American Mathematical Society.Modeling of genetic networks form microarray data. 2002. (Seminário).
    17. Seminários de Parasitologia do ICB-USP.Análise de dados de microarray. 2002. (Seminário).
    18. Seminários do curso de pós-graduação do Programa de Fisiopatologia Experimental da MED-USP.Bioinformática. 2002. (Seminário).
    19. VI Brazilian School of Probability - Session Probability in Genetics.Microarray data analysis. 2002. (Outra).
    20. Pesquisa científica e internet" - 14o Reunião Anual do Instituto Biológico.Descoberta de conhecimento em biologia molecular através da bioinformática. 2001. (Seminário).
    21. Série de Seminários do Instituto de Computação da UNICAMP.Um ambiente integrado para a análise de dados de genética. 2001. (Seminário).
    22. VI Encontro Regional de Matemática Aplicada e Computacional.Design of morphological operators by computational learning. 2001. (Encontro).
    23. SBMAC. Automatic Programing of morphological machines. 2000. (Congresso).
    24. Seminários do Departamento de Informática da Universidade de Amsterdam.Genomic Signal Processing. 2000. (Seminário).
    25. Seminários do departamento de informática da universidade de Groningen.Genomic Signal Processing. 2000. (Seminário).
    26. Seminários do Grupo de Morfologia Matemática do CWI.Automatic programming of morphological machines. 2000. (Seminário).
    27. SIAM Annual Conference. Model-Based Design of Optimal Morphological Filters. 2000. (Congresso).
    28. 22o Colóquio Brasileiro de Matemática - IMPA.Design of aperture filters for motion tracking and segmentation. 1999. (Encontro).
    29. Centre de Morphologie mathématique.Design of aperture filters. 1999. (Seminário).
    30. Centre de Morphologie Mathématique.Non linear filters in genomic control. 1999. (Encontro).
    31. Centre de Morphologie Mathématique.Hybrid human-machine design of morphological operators. 1999. (Encontro).
    32. Centre de Morphologie Mathematique em Fontainebleau.The switching algorithm for designing increasing operators. 1999. (Seminário).
    33. Ciclo de Seminários do Serviço de Informática do Instituto do Coração.Nonlinear filters in genomic control. 1999. (Seminário).
    34. Departamento de Informática da Universitée d'Orsé.Non linear filters for genomic control. 1999. (Seminário).
    35. Departamento de Informática da Universitée d'Orsé.Design of morphological operators by generalized PAC learning. 1999. (Outra).
    36. IEEE-EURASIP Workshop on Nonlinear Signal and Image Processing (NSIP'99).Non linear filters in genomic control. 1999. (Encontro).
    37. Seminários do Departamento de Bioquímica da USP.Non linear filters in genomic control. 1999. (Seminário).
    38. Signal Processing Laboratory.Non linear filters in genomic control. 1999. (Seminário).
    39. Encontro da Academia Brasileira de Ciências.Programação Automática de Máquinas Morfológicas por PAC Learning. 1998. (Encontro).
    40. Nonlineaar Filters at Electronic Imaging - SPIE. Automatic algorithm design in the context of Morphological Machines. 1997. (Congresso).
    41. Centre de Morphologie Mathematuque em Fontainebleau.Parallelisation des operateurs morphologiques. 1995. (Seminário).
    42. Curso de Palestras do DCC-UNICAMP.Programação Automática de Máquinas Morfológicas. 1995. (Outra).
    43. Palestra conidada do Centre de Morphologie Mathematique em Fontainebleau.Programmation automatique des systems morphologiques par apprentissage. 1995. (Seminário).
    44. Palestra convidada no INRIA de Sophia-Antipolis.Palestra convidada: Morphological Representation of Translation Invariant Set Operators. 1994. (Seminário).
    45. Congresso da EletroPaulo. Uma caixa de ferramentas de Morfologia Matemática para o Sistema KHOROS. 1993. (Congresso).
    46. I Simpósio de Processamento de Imagens em Medicina.Palestra convidada: Experiência do INPE em processamento de imagens médicas. 1991. (Simpósio).

Organização de eventos

  • Total de organização de eventos (8)
    1. BARRERA, Junior; HIRATA JR, Roberto. International Symposium on Mathematical Morphology. 2007. Congresso
    2. Falcão, P. K. ; BARRERA, Junior. X-meeting. 2007. Congresso
    3. BARRERA, Junior; CP/IME-USP. III SImpósio de Iniciação Científica e Pós-Graduação do IME-USP. 2007. Congresso
    4. BARRERA, Junior; CP/IME-USP. II Simpósio de Iniciação Científica e Pós-Graduação do IME-USP. 2006. Congresso
    5. BARRERA, Junior; CP/IME-USP. I simpósio de Iniciação Científica e Pós-Graduação do IME-USP. 2005. Congresso
    6. BARRERA, Junior; Goldman, G. ; COSTA, Luciano Fontoura ; CESAR JR, Roberto M. Icobicobi - International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. 2003. Congresso
    7. BARRERA, Junior; OBANDO, Hernando A Del Portillo. I Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research. 2002. Congresso
    8. BARRERA, Junior. Mathematical Morphology. 2001. (Congresso).. . 0.

Lista de colaborações

  • Colaborações endôgenas (7)
    • Junior Barrera ⇔ Nina Sumiko Tomita Hirata (22.0)
      1. DELLAMONICA JUNIOR, D. ; SILVA, P. J. S. ; HUMES C. ; Hirata, N.S.T. ; BARRERA, J.. An Exact Algorithm for Optimal MAE Stack Filter Design. IEEE Transactions on Image Processing. v. 16, p. 453-462, issn: 1057-7149, 2007.
      2. HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior. A unifying view for stack filter design based on graph search methods. Pattern Recognition. v. 38, p. 2088-2098, issn: 0031-3203, 2005.
      3. Hirata, Nina S. T.; Dougherty, Edward R. ; Barrera, Junior. Iterative design of morphological binary image operators. Optical Engineering (Bellingham). v. 39, n. 12, p. 3106-3123, issn: 0091-3286, 2000.
      4. TOMITA, N. S. T. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior. A switching algorithm for design of optimal increasing binary filters over large windows. Pattern Recognition. v. 33, n. 6, p. 1059-1081, issn: 0031-3203, 2000.
      5. BARRERA, Junior; TERADA, R. ; HIRATA JR, R. ; TOMITA, N. S. T.. Automatic Programming of Morphological Machines by PAC Learning. Fundamenta Mathematicae. v. 41, n. 1-2, p. 229-258, issn: 0016-2736, 2000.
      6. BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R ; TOMITA, N. S. T.. Design of Optimal Morphological Operators from Prior Filters. Image Analysis and Stereology. v. 16, n. 3, p. 193-200, issn: 1580-3139, 1997.
      7. BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R ; TOMITA, N. S. T.. Automatic Programming Of Binary Morphological Machines By Design Of Statistically Optimal Operators In The Context Of Computational Learning Theory. JOURNAL OF ELECTRONIC IMAGING. v. 6, n. 1, p. 54-67, issn: 1017-9909, 1997.
      8. HIRATA, N. S. T. ; HIRATA JR, Roberto ; BARRERA, Junior. Basis Computation Algorithms. Em: 8th International Symposium on Mathematical Morphology, v. 1, p. 15-26, 2007.
      9. HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; TERADA, R.. The Incremental Splitting of Intervals Algorithm for the Design of Binary Image Operators. Em: International Symposium on Mathematical Morphology, p. 219-227, 2002.
      10. BARRERA, J. ; MARTIN, P. A. ; DOUGHERTY, E. R. ; GUBITOSO, M. D. ; HIRATA, N. S. T. ; TREPODE, N. W.. Identification of Input-free Finite Lattice Dynamical Systems under Envelope Constraints. Em: 6th International Symposium on Mathematical Morphology, p. 337-345, 2002.
      11. TORRES, Martha ; BARRERA, Junior ; HIRATA, N. S. T.. High-performance algorithm for Boolean function minimization: the partitioned incremental splitting of intervals (PISI). Em: Photonics West' 2002, v. 4667, p. 386-395, 2002.
      12. ARMELIN, H. A. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; GUBITOSO, M. D. ; FERREIRA, J. E. ; HIRATA, N. S. T. ; NEVES, E. J.. A simulator for gene expression networks. Em: SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics, v. 4266, p. 248-259, 2001.
      13. BRUN, Marcel ; BARRERA, Junior ; HIRATA, N. S. T. ; TREPODE, N. W. ; DANTAS, D. O. ; TERADA, R.. Multi-resolution Classification Trees in OCR Design. Em: Sibgrapi 2001, p. 59-66, 2001.
      14. BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R ; GUBITOSO, M. D. ; HIRATA, N. S. T.. Modeling Temporal Morphological Systems via Lattice Dynamical Systems. Em: Non Linear Image Processing and Pattern Analysis XII - SPIE, v. 4304, p. 265-276, 2001.
      15. HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R. Bayesian Switching Algorithm for the Optimal Increasing Binary Filter. Em: European Signal and Image Processing Conference (EUSIPCO), v. IV, p. 1889-1892, 2000.
      16. HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; TERADA, R.. Text Segmentation by Automatically Designed Morphological Operators. Em: SIBGRAPI'00 (Brazilian Synposium on Computer Graphics and Image Processing), v. 2000, p. 284-291, 2000.
      17. TOMITA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R. Design of Statistically Optimal Stack Filters. Em: SIBGRAPI'99 (Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing), p. 265-274, 1999.
      18. DOUGHERTY, Edward R ; GREGORYAN, A. M. ; BARRERA, Junior ; TOMITA, N. S. T.. Binary Filter Design: Optimization, Prior Information and Robustness. Em: Conference of the International Society for Optical Engineering, v. 3457, p. 230-241, 1998.
      19. TOMITA, N. S. T. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior. Design of Large-Window Binary Filters via Iteration. Em: Conference of the International Society for Optical Engineering, v. 3522, p. 173-182, 1998.
      20. BARRERA, J. ; TERADA, R. ; LOTUFO, R. A. ; HIRATA, N. S. T. ; HIRATA JR., R. ; ZAMPIROLLI, F. A.. An OCR based on Mathematical Morphology. Em: Conference of the International Society for Optical Engineering, v. 3304, p. 197-208, 1998.
      21. DOUGHERTY, E. R. ; BARRERA, J. ; HIRATA, N. S. T.. Optimal Filters From Prior Filters. Em: Conference of the International Society for Mathematical Morphology, v. VIII, p. 2-7, 1997.
      22. BARRERA, Junior; TOMITA, N. S. T. ; SILVA, F. S. C. ; TERADA, R.. Automatic programming of binary morphological machines by PAC Learning. Em: Conference of the International Society fr Optical Engineering, v. 2568, p. 233-244, 1995.

    • Junior Barrera ⇔ Roberto Hirata Junior (20.0)
      1. Brun, Marcel ; Hirata Jr., Roberto ; Barrera, Junior ; Dougherty, Edward R.. Nonlinear Filter Design Using Envelopes. Journal of Mathematical Imaging and Vision. v. 21, n. 1, p. 81-97, issn: 0924-9907, 2004.
      2. BRUN, Marcel ; DOUGHERTY, Edward R ; HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior. Design of optimal binary filters under joint multiresolution-envelope constraint.. Pattern Recognition Letters. v. 24, p. 937-945, issn: 0167-8655, 2003.
      3. Hirata Jr., Roberto; Brun, Marcel ; Barrera, Junior ; Dougherty, Edward R.. Multiresolution Design of Aperture Operators. Journal of Mathematical Imaging and Vision. v. 16, p. 199-222, issn: 0924-9907, 2002.
      4. HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; DANTAS, D. O. ; ESTEVES, G. P.. Segmentation of Microarray Images by Mathematical Morphology. Real-Time Imaging. v. 8, n. 8, p. 491-505, issn: 1077-2014, 2002.
      5. BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R ; HIRATA JR, R.. Aperture filters. Signal Processing. v. 80, n. 4, p. 697-721, issn: 0165-1684, 2000.
      6. BARRERA, Junior; TERADA, R. ; HIRATA JR, R. ; TOMITA, N. S. T.. Automatic Programming of Morphological Machines by PAC Learning. Fundamenta Mathematicae. v. 41, n. 1-2, p. 229-258, issn: 0016-2736, 2000.
      7. Barrera, Junior ; BANON, G. J. F. ; LOTUFO, R. A. ; Hirata Jr., Roberto. MMach: a mathematical morphology toolbox for the KHOROS system. Journal of Electronic Imaging (Springfield). v. 7, n. 7, p. 54-67, issn: 1017-9909, 1998.
      8. HIRATA, N. S. T. ; HIRATA JR, Roberto ; BARRERA, Junior. Basis Computation Algorithms. Em: 8th International Symposium on Mathematical Morphology, v. 1, p. 15-26, 2007.
      9. VAQUERO, Daniel André ; BARRERA, Junior ; HIRATA JR, R.. A maximum likelyhood approach for multi-resolution W-operator design. Em: SIBGRAPI, p. 71-78, 2005.
      10. HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; DANTAS, D. O.. Microarray Gridding by Mathematical Morphology. Em: SIBGRAPI'2001, v. 1, p. 112-119, 2001.
      11. BRUN, Marcel ; HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R. Hybrid Human-machine Non-linear Filter Design Using Envelopes. Em: SIBGRAPI'2001, v. 1, p. 106-111, 2001.
      12. HIRATA JR, R. ; BRUN, Marcel ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R. Image restoration by multiresolution aperture filters. Em: Nonlinear Image Processing and Pattern Analysis XII, v. 4304, p. 256-264, 2001.
      13. HIRATA JR, R. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior. Some applications of aperture filters. Em: International Simposium on Mathematical Morphology, p. 119-128, 2000.
      14. HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R. Design of gray-scale nonlinear filters via multiresolution apertures. Em: European Signal Processing Conference, v. IV, p. 1905-1908, 2000.
      15. HIRATA JR, R. ; FLORES, F. C. ; BARRERA, Junior ; LOTUFO, R. A. ; MEYER, F.. Color Image Gradients for Morphological Segmentation. Em: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, v. 1, p. 316-322, 2000.
      16. BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R ; HIRATA JR, R.. Optimal Range-Domain Window Filters. Em: Conference of the International Society for Mathematical Morphology, v. 3646, p. 38-45, 1999.
      17. HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; FLORES, F. C. ; LOTUFO, R. A.. Automatic dessign of morphological operators for motion segmentation. Em: Brazilian Symposium on Computer Graphics, v. 1, p. 283-292, 1999.
      18. BARRERA, J. ; TERADA, R. ; LOTUFO, R. A. ; HIRATA, N. S. T. ; HIRATA JR., R. ; ZAMPIROLLI, F. A.. An OCR based on Mathematical Morphology. Em: Conference of the International Society for Optical Engineering, v. 3304, p. 197-208, 1998.
      19. BARRERA, Junior; HIRATA JR, R.. Fast algorithms to compute the elementary operators of Maathematical Morphology. Em: BrazilianSymposium on Computer Graphics and Image Processing, v. 1, p. 163-170, 1997.
      20. HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; LOTUFO, R. A.. A Tutorial on Image Segmentation via Mathematical Morphology with Khoros. Em: Khoros 97 proceedings, v. 1, p. 192-206, 1997.

    • Junior Barrera ⇔ Carlos Eduardo Ferreira (3.0)
      1. REIS, MARCELO S. ; ESTRELA, GUSTAVO ; FERREIRA, CARLOS EDUARDO ; BARRERA, JUNIOR. featsel: A framework for benchmarking of feature selection algorithms and cost functions. SoftwareX. v. 6, p. 193-197, issn: 2352-7110, 2017.
      2. HASHIMOTO, Ronaldo F ; BARRERA, Junior ; FERREIRA, C. E.. A combinatorial optimization technique for the sequential decomposition of erosions and dilations. Journal of Mathematical Imaging and Vision. v. 14, n. 1, p. 17-33, issn: 0924-9907, 2000.
      3. BARRERA, Junior; FERREIRA, C. E. ; HASHIMOTO, Ronaldo F. Finding Optimal Sequential Decompositions of Erosions and Dilations. Em: International Simposium on Mathematical Morphology, p. 299-306, 1998.

    • Junior Barrera ⇔ Routo Terada (3.0)
      1. BARRERA, Junior; TERADA, R. ; HIRATA JR, R. ; TOMITA, N. S. T.. Automatic Programming of Morphological Machines by PAC Learning. Fundamenta Mathematicae. v. 41, n. 1-2, p. 229-258, issn: 0016-2736, 2000.
      2. HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; TERADA, R.. Text Segmentation by Automatically Designed Morphological Operators. Em: SIBGRAPI'00 (Brazilian Synposium on Computer Graphics and Image Processing), v. 2000, p. 284-291, 2000.
      3. BARRERA, Junior; TOMITA, N. S. T. ; SILVA, F. S. C. ; TERADA, R.. Automatic programming of binary morphological machines by PAC Learning. Em: Conference of the International Society fr Optical Engineering, v. 2568, p. 233-244, 1995.

    • Junior Barrera ⇔ Flavio Soares Correa da Silva (2.0)
      1. BARRERA, Junior; TOMITA, N. S. T. ; SILVA, F. S. C. ; TERADA, R.. Automatic programming of binary morphological machines by PAC Learning. Em: Conference of the International Society fr Optical Engineering, v. 2568, p. 233-244, 1995.
      2. BARRERA, Junior; SILVA, F. S. C. ; BANON, G. J. F.. Automating Programming Of Binary Morphological Machines. Em: Conference of the International Society for Optical Engineering, v. 2300, p. 229-240, 1994.

    • Junior Barrera ⇔ Alfredo Goldman vel Lejbman (1.0)
      1. TORRES, Martha ; BARRERA, Junior ; GOLDMAN, A.. A parallel Algorithm for enumerating combinations. Em: International Conference on Parallel Processing (ICPP'03), v. 1, p. 581-588, 2003.

    • Junior Barrera ⇔ João Eduardo Ferreira (1.0)
      1. BARRERA, Junior; CESAR JUNIOR, R. M. ; FERREIRA, J. E. ; GUBITOSO, M. D.. An environment for knowledge discovery in Biology. Computers in Medicine and Biology. v. 34, n. 5, p. 427-447, issn: 0010-4825, 2004.




Data de processamento: 01/07/2025 10:12:49