UFABC-professores-CCNH

Luiz Roberto Nunes

Luiz Roberto Nunes é graduado em Ciências Biológicas e Mestre em Parasitologia pela Universidade de São Paulo. Concluiu o doutorado em Biologia Molecular e Genética pela Virginia Commonwealth University (USA) em 1996. Atualmente, é Professor Associado na Universidade Federal do ABC. Durante 1997 e 2011, foi professor da Universidade de Mogi das Cruzes, onde desempenhou diversas funções de natureza docente e acadêmico-administrativas. Publicou mais de 40 artigos em periódicos especializados, dois capítulos de livro e mais de 80 trabalhos em anais de eventos. Possui 6 produtos tecnológicos registrados, entre patentes e software. Supervisionou dois projetos de Pós-Doutoramento; orientou 6 teses de doutorado, 10 dissertações de mestrado e vários trabalhos de iniciação científica nas áreas de Genética e Bioquímica. Recebeu 2 prêmios e/ou homenagens, incluindo a Medalha do Mérito Científico e Tecnológico do Governo do Estado de São Paulo. Atua na área de Microbiologia, com ênfase em Biologia Molecular e Genômica. Em suas atividades profissionais, interagiu com 167 colaboradores em co-autorias de trabalhos científicos. Em seu currículo Lattes, os termos mais freqüentes na contextualização da produção científica, tecnológica e artístico-cultural são: microarray, Xylella fastidiosa, Paracoccidioides brasiliensis, Trypanosoma cruzi e genômica. (Texto informado pelo autor)

http://lattes.cnpq.br/5439106437713254 (08/10/2024)

Rótulo/Grupo: CCNH

Bolsa CNPq:

Período de análise: 2012-HOJE

Endereço: Universidade Federal do ABC, Centro de Ciências Naturais e Humanas. Rua Santa Adélia 166, Bloco A, Torre 3 Santa Terezinha 09210-170 - Santo Andre, SP - Brasil URL da Homepage: www.ufabc.edu.br

Grande área: Ciências Biológicas

Área: Bioquímica

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (18)
1. BATISTA DA SILVA, IURI ; BARBOSA, D. A. ; KAVALCO, KARINE FREHNER ; NUNES, L. R. ; PASA, RUBENS ; MENEGIDIO, FABIANO B.. Discovery of putative long non-coding RNAs expressed in the eyes of Astyanax mexicanus (Actinopterygii: Characidae). Scientific Reports. v. 13, p. 1, issn: 2045-2322, 2023.
2. ACIOLE BARBOSA, DAVID ; ARAÚJO, BRUNO C. ; BRANCO, GIOVANA SOUZA ; SIMEONE, ALEXANDRE S. ; HILSDORF, ALEXANDRE W. S. ; JABES, DANIELA L. ; Nunes, Luiz R. ; MOREIRA, RENATA G. ; MENEGIDIO, FABIANO B.. Transcriptomic Profiling and Microsatellite Identification in Cobia (Rachycentron canadum), Using High-Throughput RNA Sequencing. MARINE BIOTECHNOLOGY. v. 24, p. 255-262, issn: 1436-2228, 2022.
3. ALENCAR, VALQUÍRIA CAMPOS ; SILVA, JULIANA DE FÁTIMA DOS SANTOS ; VILAS BOAS, RENATA OZELAMI ; FARNÉZIO, VINÍCIUS MANGANARO ; DE MARIA, YARA N. L. F. ; ACIOLE BARBOSA, DAVID ; ALMEIDA, ALEX TRAMONTIN ; DE SOUZA, EMANUEL MALTEMPI ; MÜLLER-SANTOS, MARCELO ; JABES, DANIELA L. ; MENEGIDIO, FABIANO B. ; COSTA DE OLIVEIRA, REGINA ; RODRIGUES, Tiago ; TERSARIOL, IVARNE LUIS DOS SANTOS ; WALMSLEY, ADRIAN R. ; NUNES, L. R.. The Quorum Sensing Auto-Inducer 2 (AI-2) Stimulates Nitrogen Fixation and Favors Ethanol Production over Biomass Accumulation in Zymomonas mobilis. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES. v. 22, p. 5628, issn: 1422-0067, 2021.
4. DE MARIA, YARA N. L. F. ; ACIOLE BARBOSA, DAVID ; MENEGIDIO, FABIANO B. ; SANTOS, KALTINAITIS B. N. H. ; HUMBERTO, ANA CAROLINA ; ALENCAR, VALQUÍRIA C. ; SILVA, JULIANA F. S. ; COSTA DE OLIVEIRA, REGINA ; BATISTA JR, MIGUEL L. ; Nunes, Luiz R. ; JABES, DANIELA L.. Analysis of mouse faecal dysbiosis, during the development of cachexia, induced by transplantation with Lewis lung carcinoma cells. MICROBIOLOGY-SGM. v. 167, p. 001088, issn: 1350-0872, 2021.
5. ACIOLE BARBOSA, DAVID ; ARAÚJO, BRUNO C. ; BRANCO, GIOVANA SOUZA ; SIMEONE, ALEXANDRE S. ; HILSDORF, ALEXANDRE W. S. ; JABES, DANIELA L. ; NUNES, L. R. ; MOREIRA, RENATA G. ; MENEGIDIO, F. B.. Transcriptomic Profiling and Microsatellite Identification in Cobia (Rachycentron canadum), Using High-Throughput RNA Sequencing. MARINE BIOTECHNOLOGY. v. X, p. X, issn: 1436-2228, 2021.
6. MUÑOZ, JULIÁN E. ; ROSSI, DIEGO C. P. ; JABES, DANIELA L. ; BARBOSA, DAVID ACIOLE ; CUNHA, FERNANDA F. M. ; Nunes, Luiz R. ; ARRUDA, DENISE C. ; PELLESCHI TABORDA, CARLOS. In Vitro and In Vivo Inhibitory Activity of Limonene against Different Isolates of Candida spp.. JOURNAL OF FUNGI. v. 6, p. 183, issn: 2309-608X, 2020.
7. JABES, DANIELA L. ; DE MARIA, YARA N. L. F. ; ACIOLE BARBOSA, DAVID ; SANTOS, KALTINAITIS B. N. H. ; CARVALHO, LUCAS M. ; HUMBERTO, ANA CAROLINA ; ALENCAR, VALQUÍRIA C. ; COSTA DE OLIVEIRA, REGINA ; BATISTA, MIGUEL L. ; MENEGIDIO, F. B. ; NUNES, L. R.. Fungal Dysbiosis Correlates with the Development of Tumor-Induced Cachexia in Mice. JOURNAL OF FUNGI. v. 6, p. 364, issn: 2309-608X, 2020.
8. MENEGIDIO, FABIANO B ; ACIOLE BARBOSA, DAVID ; ALENCAR, VALQUÍRIA C ; VILAS BOAS, RENATA O ; OLIVEIRA, R. L. B. C. ; JABES, DANIELA L ; NUNES, L. R.. Transcriptomic profiling identifies novel transcripts, isomorphs, and noncoding RNAs in Paracoccidioides brasiliensis. MEDICAL MYCOLOGY. v. 59, p. 197-200, issn: 1369-3786, 2020.
9. ACIOLE BARBOSA, DAVID ; MENEGIDIO, FABIANO BEZERRA ; ALENCAR, VALQUÍRIA CAMPOS ; GONÇALVES, RAFAEL S. ; SILVA, JULIANA DE FÁTIMA SANTOS ; VILAS BOAS, RENATA OZELAMI ; FAUSTINO DE MARIA, YARA NATÉRCIA LIMA ; JABES, DANIELA LEITE ; COSTA DE OLIVEIRA, REGINA ; Nunes, Luiz R.. ParaDB: A manually curated database containing genomic annotation for the human pathogenic fungi Paracoccidioides spp.. PLoS Neglected Tropical Diseases. v. 13, p. e0007576, issn: 1935-2735, 2019.
10. MENEGIDIO, FABIANO B ; ACIOLE BARBOSA, DAVID ; GONÇALVES, RAFAEL DOS S ; NISHIME, MARCIO M ; JABES, DANIELA L ; OLIVEIRA, R. L. B. C. ; NUNES, L. R.. Bioportainer Workbench: a versatile and user-friendly system that integrates implementation, management, and use of bioinformatics resources in Docker environments. GigaScience. v. 8, p. 1-9, issn: 2047-217X, 2019.
11. MENEGIDIO, FABIANO B ; JABES, DANIELA L ; COSTA DE OLIVEIRA, REGINA ; NUNES, LUIZ R. Dugong: a Docker image, based on Ubuntu Linux, focused on reproducibility and replicability for bioinformatics analyses. BIOINFORMATICS. v. 34, p. 514-515, issn: 1367-4803, 2018.
12. ALENCAR, VALQUÍRIA CAMPOS ; JABES, DANIELA LEITE ; MENEGIDIO, FABIANO BEZERRA ; SASSAKI, GUILHERME LANZI ; DE SOUZA, LUCAS RODRIGO ; PUZER, LUCIANO ; MENEGHETTI, MARIA CECÍLIA ZORÉL ; LIMA, MARCELO ANDRADE ; TERSARIOL, IVARNE LUIS DOS SANTOS ; OLIVEIRA, R. L. B. C. ; NUNES, L. R.. Functional and Evolutionary Characterization of a UDP-Xylose Synthase Gene from the Plant Pathogen Xylella fastidiosa , Involved in the Synthesis of Bacterial Lipopolysaccharide. BIOCHEMISTRY. v. 56, p. 779-792, issn: 0006-2960, 2017.
13. NIZA, BÁRBARA ; MERFA, MARCUS V. ; ALENCAR, VALQUÍRIA C. ; MENEGIDIO, FABIANO B. ; NUNES, L. R. ; Machado, Marcos A. ; TAKITA, M. A. ; DE SOUZA, ALESSANDRA A.. Draft Genome Sequence of 11399, a Transformable Citrus-Pathogenic Strain of. Genome Announcements. v. 4, p. e01124-16, issn: 2169-8287, 2016.
14. JABES, DANIELA LEITE ; DE FREITAS OLIVEIRA, ANA CLAUDIA ; ALENCAR, VALQUÍRIA CAMPOS ; MENEGIDIO, FABIANO BEZERRA ; RENO, DÉBORA LILIANE SOUZA ; SANTOS, Daiene Souza ; BARBOSA, DAVID ACIOLE ; VILAS BOAS, RENATA OZELAMI ; DE OLIVEIRA RODRIGUES CUNHA, RODRIGO LUIZ ; Rodrigues, Tiago ; COSTA DE OLIVEIRA, REGINA ; Nunes, Luiz R.. Thioridazine inhibits gene expression control of the cell wall signaling pathway (CWI) in the human pathogenic fungus Paracoccidioides brasiliensis. Molecular Genetics and Genomics (Print). v. 291, p. 1347-1362, issn: 1617-4615, 2016.
15. BARBOSA, D. ; ALENCAR, V. C. ; SANTOS, D. S. ; OLIVEIRA, A. C. D. F. ; DE SOUZA, A. A. ; COLLETA-FILHO, H. D. ; OLIVEIRA, R. L. B. C. ; NUNES, L. R.. Comparative genomic analysis of coffee-infecting Xylella fastidiosa strains isolated from Brazil. Microbiology (Reading. Print). v. 161, p. 1018-1033, issn: 1350-0872, 2015.
16. DOURADO, MANUELLA NÓBREGA ; Santos, Daiene Souza ; NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, R. L. B. C. ; DE OLIVEIRA, MARCUS VINICIUS ; ARAÚJO, WELINGTON LUIZ. Differential gene expression in Xylella fastidiosa 9a5c during co-cultivation with the endophytic bacterium Methylobacterium mesophilicum SR1.6/6. Journal of Basic Microbiology. v. 55, p. 1357-1366, issn: 0233-111X, 2015.
17. ALENCAR, V. C. ; BARBOSA, D. ; SANTOS, D. S. ; OLIVEIRA, A. C. F. ; OLIVEIRA, R. L. B. C. ; NUNES, L. R.. Genomic Sequencing of Two Coffee-Infecting Strains of Xylella fastidiosa Isolated from Brazil. Genome Announcements. v. 2, p. e01190-13-e01190-13, issn: 2169-8287, 2014.
18. OLIVEIRA, Marcus Vinícius de ; OLIVEIRA, ANA CLAUDIA DE FREITAS ; SHIDA, CLÁUDIO S. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; Nunes, Luiz R.. Gene expression modulation by paraquat-induced oxidative stress conditions in Paracoccidioides brasiliensis. Fungal Genetics and Biology (Print). v. -, p. 101-109, issn: 1087-1845, 2013.
Livros publicados/organizados ou edições (0)
Capítulos de livros publicados (1)
1. WUO, M. ; MUNHAE, C. B. ; MORINI, M. S. C. ; MIRANDA, V. F. O. ; CLIVATI, D. ; NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, R. C.. Biodiversidade na Serra do Itapety: pesquisa para o ensino. Em: Maria Santina de Castro Morini; Vitor Ferandes Oliveira de Miranda. (Org.). Serra do Itapety: aspectos históricos, sociais e naturalísticos. 1ed.Bauru, SP. : Canal6. 2012.p. 311-328.
Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (13)
1. ACIOLE BARBOSA, DAVID ; Menegidio F.B. ; FAUSTINO DE MARIA, YARA NATÉRCIA LIMA ; GONÇALVES, RAFAEL DOS S ; Yano, M.V. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; JABES, D. L. ; Nunes, Luiz R.. AmpFLow: a containerized pipeline to assist in Reproducible and Replicable Microbiome research. Em: X-meeting 2019 - 15th International Conference of the AB3C, 2019, Campos do Jordão. -. -: -, v. -, p. ---, 2019.
2. JABES, D. L. ; BARBOSA, DAVID ACIOLE ; VILAS BOAS, RENATA OZELAMI ; SILVA, J. F. S. ; DE OLIVEIRA RODRIGUES CUNHA, RODRIGO LUIZ ; COSTA DE OLIVEIRA, REGINA ; NUNES, L. R.. Analysis of the antifungal activity of the organotellurane RF07 on growth and global gene expression of Paracoccidioides brasiliensis. Em: 62° Congresso Brasileiro de Genética, 2016. Anais do 62° Congresso Brasileiro de Genética. Caxambu, v. 1, p. --1, 2016.
3. ALENCAR, V. C. ; JABES, DANIELA LEITE ; SOUZA, L. R. ; MENEGHETTI, MARIA CECÍLIA ZORÉL ; PUZER, LUCIANO ; TERSARIOL, IVARNE LUIS DOS SANTOS ; SASSAKI, GUILHERME LANZI ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; NUNES, L. R.. Functional and Evolutionary characterization of UDP-xylose synthase gene from the plant pathogen Xylella fastidiosa, involves in the synthesis of bacterial lipopolysaccharide (LPS). Em: .62° Congresso Brasileiro de Genética, 2016, Caxambu, MG. Anais do 62° Congresso Brasileiro de Genética, v. 1, p. 1-1, 2016.
4. Menegidio F.B. ; NUNES, L. R.. DUGONG: A DOCKER IMAGE, INSPIRED ON UBUNTU LINUX, DESIGNED TO ENHANCE REPRODUCIBILITY AND REPLICABILITY DURING COMPUTATIONAL ANALYSES OF BIOLOGICAL DATA. Em: X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the AB3C, 2016, Belo Horizonte, MG. Anais do X-Meeting 2016, v. 1, p. 1-1, 2016.
5. ALENCAR, V. C. ; SASSAKI, GUILHERME LANZI ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; NUNES, L. R.. Evolutionary and functional characterization of a UDP-Xylose synthase from the plant pathogen Xylella fastidiosa, involved in the synthesis of bacterial lipopolysaccharide (LPS). Em: 61º Congresso brasileiro de genético, 2015, Águas de Lindía, SP. Anais do 61º Congresso brasileiro de genético, v. 1, p. 1-1, 2015.
6. JABES, D. L. ; Barbosa, D.A. ; OLIVEIRA, Y. T. ; Vilas Boas, R.O. ; USUGINU, T. H. ; RODRIGUES, T. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; NUNES, L. R.. Minimum inhibitory concentration and minimum fungicidal concentration for the human pathogenic fungus Paracoccidioides brasiliensis exposed to thioridazine. Em: 61º Congresso Brasileiro de Genética, 2015, Águas de Lindóia. Anais do 61º Congresso Brasileiro de Genética, v. 1, p. 1-1, 2015.
7. Menegidio F.B. ; SANTOS, D. S. ; ALENCAR, V. C. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; ALMEIDA, R. P. P. ; NUNES, L. R.. RNA-SEQ ANALYSIS OF VITIS VINIFERA DISPLAYING SYMPTOMS OF PIERCE´S DISEASE, AFTER EXPERIMENTAL INFECTION WITH THE PHYTOBACTERIUM XYLELLA FASTIDIOSA. Em: 61º Congresso Brasileiro de Genética, 2015, Águas de Lindóia. Anais do 61º Congresso Brasileiro de Genética, v. 1, p. 1-1, 2015.
8. RENO, D. L. S. ; JABES, D. L. ; CUNHA, R. L. O. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; NUNES, L. R.. Analysis of the antifungal activity of the organotellurane rf-28 on growth and global gene expression of Paracoccidioides brasiliensis. Em: 60 Congresso Brasileiro de Genética, 2014, Guarujá, SP. Anais do 60 Congresso Brasileiro de Genética, 2014.
9. Oliveira, A.C.F. ; JABES, D. L. ; ALENCAR, V. C. ; Menegidio F.B. ; RODRIGUES, T. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; NUNES, L. R.. THIORIDAZINE INDUCES MAJOR TRANSCRIPTIONAL MODULATION IN THE HUMAN PATHOGENIC FUNGUS PARACOCCIDIOIDES BRASILIENSIS, INHIBITING GENE EXPRESSION CONTROL OF THE CELL WALL SIGNALING PATHWAY. Em: 60 Congresso Brasileiro de Genética, 2014, Guarujá, SP. Anais do 60 Congresso Brasileiro de Genética, 2014.
10. ALENCAR, V. C. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; NUNES, L. R.. DISTRIBUTION OF A FRAMESHIFT MUTATION IN DTDP-GLUCOSE 4-6-DEHYDRATASE, INVOLVED WITH THE SYNTHESIS OF DTDP-RHAMNOSE, AMONG COFFEE-INFECTING STRAINS OF XYLELLA FASTIDIOSA. Em: 60 Congresso Nacional de Genética, 2014, Guarujá, SP. Anais do 60 Congresso Nacional de Genética, 2014.
11. DOURADO, M. N. ; SANTOS, Daiene Souza ; NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, Regina Costa de ; OLIVEIRA, Marcus Vinícius de ; ARAUJO, W. L.. DIFFERENTIAL GENE EXPRESSION IN XYLELLA FASTIDIOSA 9A5C DURING CO-CULTIVATION WITH THE ENDOPHYTIC BACTERIA METHYLOBACTERIUM MESOPHILICUM SR1.6/6. Em: 60 Congresso Brasileiro de Genética, 2014, Guarujá, SP. Anais do 60 Congresso Brasileiro de Genética, 2014.
12. Rodrigues, A.C.F.O. ; ALENCAR, V. C. ; RODRIGUES, T. ; NUNES, L. R. ; OLIVEIRA, R. C.. Global modulation of gene expression in Paracoccidioides brasiliensis in response to thioridazine. Em: 58 Congresso Brasileiro de Genética, 2012, Foz do Iguaçu. Resumos do 58o Congresso Brasileiro de Genética, 2012.
13. SANTOS, D. S. ; SHARMA, A. M. ; Barbosa, D. ; ALENCAR, V. C. ; OLIVEIRA, R. C. ; NUNES, L. R. ; ALMEIDA, R. P. P.. Transcriptional profile of Xylella fastidiosa infecting the xylem vessels of Vitis vinifera. Em: 58 Congresso Brasileiro de Genética, 2012, Foz do Iguaçu. Resumos do 58o Congresso Brasileiro de Genética, 2012.
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (0)
Demais tipos de produção bibliográfica (0)

Produção técnica

Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (0)

Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (1)
1. Higor Barreto Campos. Desenvolvimento de um equipamento integrado parta a detecção quantitativa de microrganismos deteriorantes de cerveja em ambiente industrial. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2024.
  Orientador: Luiz Roberto Nunes.
Dissertação de mestrado (1)
1. Domingos Pereira Pazzo Filho. Desenvolvimento de uma estratégia diagnóstica do tipo ?point of care? para a detecção quantitativa de infecção pelo citomegalovírus humano (HCMV). Dissertação (Mestrado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Fundação Universidade Federal do ABC. Início: 2024.
  Orientador: Luiz Roberto Nunes.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (2)
1. Valquiria Campos Alencar. . Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2017.
  Supervisor: Luiz Roberto Nunes.
2. Daniela Leite Jabes. . Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2015.
  Supervisor: Luiz Roberto Nunes.
Tese de doutorado (5)

Juliana de Fátima Santos Silva. CARACTERIZAÇÃO DO MECANISMO DE QUORUM SENSING (QS) EM Zymomonas mobilis EM RESPOSTA AO AUTO-INDUTOR DO TIPO 2 (AI-2). Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Fundação Universidade Federal do ABC. 2022.
Orientador: Luiz Roberto Nunes.
David Aciole Barbosa. ANÁLISE DA COMPOSIÇÃO E DA INFLUÊNCIA EXERCIDA PELA MICROBIOTA INTESTINAL FÚNGICA DE CAMUNDONGOS DURANTE O DESENVOLVIMENTO DE CAQUEXIA INDUZIDA POR TRANSPLANTE DE CÉLULAS DE CÂNCER PULMONAR (LLC). Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2022.
Orientador: Luiz Roberto Nunes.
Fabiano Bezerra Menegidio. Reprodutibilidade e replicabilidade em análises de bioinformática utilizando contêineres Docker. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2020.
Orientador: Luiz Roberto Nunes.
Valquíria Campos Alencar. Caracterização funcional e evolutiva do gene UDP-xilose sintase em Xylella fastidiosa, envolvido na síntese de Lipopolissacarídeos (LPS). Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2016.
Orientador: Luiz Roberto Nunes.
Daiene Souza Santos. Análise in planta da expressão de genes potencialmente envolvidos com o processo infeccioso da Xylella fastidiosa. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, . 2013.
Orientador: Luiz Roberto Nunes.
Dissertação de mestrado (6)

René Aduan Júnior. Desenvolvimento de um sistema de Point of Care Testing (PoCT) para a detecção e quantificação de microrganismos deteriorantes de cerveja em ambiente industrial. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2023.
Orientador: Luiz Roberto Nunes.
Vinicius Manganaro Farnézio. Construção de uma linhagem geneticamente modificada de Zymomonas mobilis com vistas à produção de álcoois de cadeia longa. Dissertação (Mestrado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Fundação Universidade Federal do ABC. 2021.
Orientador: Luiz Roberto Nunes.
Renata Ozelami Vilas Boas. Análise Transcriptômica Global de Zymomonas mobilis (ZM4) na presença do Auto Indutor de Quorum Sensing (QS) Tipo 2 (AI-2). Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2019.
Orientador: Luiz Roberto Nunes.
Fabiano Bezerra Menegidio. Perfil transcricional de Vitis vinifera apresentando sintomas da doença de Pierce. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2016.
Orientador: Luiz Roberto Nunes.
Flávio Francisco da Silva. Montagem e análise genômica: estudo de casos de isolados de Xylella fastidiosa oriundos de Taiwan. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de Mogi das Cruzes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2016.
Orientador: Luiz Roberto Nunes.
Débora Liliane de Souza Renó. ANÁLISE DOS EFEITOS DA TELURANA RF-28 SOBRE O CRESCIMENTO E A EXPRESSÃO GÊNICA GLOBAL EM Paracoccidioides brasiliensis. Dissertação (Mestrado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2015.
Orientador: Luiz Roberto Nunes.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (4)

Juliana de Fátima Santos Silva. Clonagem, expressão e purificação da enzima recombinante 4-Hidroxifenil Piruvato Dioxigenase (4-HPPD) de Paracoccidioides brasiliensis. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de Mogi das Cruzes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2016.
Orientador: Luiz Roberto Nunes.
Renata Ozelami Vilas Boas. ANÁLISE DA AÇÃO DA TIORIDAZINA SOBRE A VIA CWI (CELL WALL INTEGRITY SIGNALLING PATHWAY) NA PAREDE CELULAR DE LEVEDURAS DE Paracoccidioides brasiliensis. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de Mogi das Cruzes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2015.
Orientador: Luiz Roberto Nunes.
Nayara Ribeiro Magalhães. Efeito de novas drogas sobre o crescimento e a expressão gênica de Xylella fastidiosa. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de Mogi das Cruzes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2014.
Orientador: Luiz Roberto Nunes.
David Aciole Barbosa. Análise de efeitos da Telurana RF-07 sobre a expressão gênica de Paracoccidioides brasiliensis. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de Mogi das Cruzes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2013.
Orientador: Luiz Roberto Nunes.
Orientações de outra natureza (0)

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (1)

2017-Atual. Caracterização de elementos promotores responsivos ao auto-indutor de quorum sensing (QS) tipo 2 (AI-2) em Zymomonas mobilis
Descrição: A bactéria Gram-negativa Zymomonas mobilis apresenta diversas características que a tornam atrativa para a produção industrial de diferentes bioprodutos, incluindo o bioetanol. Por exemplo, Z. mobilis pode ser cultivada tanto em condições aeróbicas como anaeróbicas, é capaz de converter glicose a etanol com uma eficiência ainda maior do que a própria Saccharomyces cerevisiae e tolera maiores concentrações deste álcool durante o processo de fermentação. Além disso, técnicas de manipulação genética foram desenvolvidas para esta bactéria, que vem sendo modificada geneticamente e/ou adaptada para produzir diversos produtos de alto valor agregado (como levano, sorbitol, lactato, polihidroxibutirato e 2,3-butanodiol, entre outros), além de incorporar fontes alternativas de carbono às suas vias metabólicas, como as pentoses xilose e arabinose. Dessa forma, Z. mobilis vem sendo vista como um microrganismo de grande potencial para a indústria de bioconversão e um melhor entendimento acerca dos mecanismos por ela utilizados para o controle de sua expressão gênica pode auxiliar no desenvolvimento de novas linhagens geneticamente manipuladas, com elevada capacidade de produção industrial. Nesse sentido, foi demonstrado recentemente que Z. mobilis é capaz de responder ao indutor de quorum sensing (QS) do tipo 2 (denominado auto-indutor 2, ou AI-2). O AI-2 é uma das moléculas utilizadas por bactérias para controlar o processo de QS, responsável por avaliar a densidade populacional do meio e sincronizar seu comportamento em escala comunitária. A ativação da resposta QS leva à diminuição no ritmo de crescimento celular, ao mesmo tempo em que ativa a expressão de genes envolvidos com uma série de atividades alternativas. Nesse sentido, se genes de interesse industrial forem incorporados ao genoma de Z. mobilis, sob o controle de promotores responsivos a AI-2, seria possível induzir sua expressão de maneira controlada, através da adição deste sinalizador às culturas, já que Z. mobilis, embora sensível a AI-2, não é capaz de sintetizá-lo. Dessa forma, o projeto aqui proposto tem por objetivo caracterizar a resposta de Z. mobilis ao sinalizador de QS AI-2, identificando os genes/operons que têm sua expressão modulada em resposta a esta molécula, bem como os elementos cis-ativadores (promotores) e trans-ativadores (fatores de transcrição) que medeiam este processo. Estes estudos levarão ao isolamento e compreensão acerca do funcionamento dos primeiros promotores indutíveis em Z. mobilis, que poderão ser desenvolvidos (e futuramente patenteados) em uma importante ferramenta para a manipulação desta bactéria, com amplas possibilidades de aplicação na indústria de bioprocessamento, já que permitirá a expressão de transgenes nesta bactéria, sob situações controladas e otimizadas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Luiz Roberto Nunes - Coordenador / Ivarne Tersariol - Integrante / Valquíria Campos Alencar - Integrante / Fabiano Bezerra Menegidio - Integrante / COSTA DE OLIVEIRA, REGINA LÚCIA BATISTA DA - Integrante / Renata Ozelami Vilas Boas - Integrante / Juliana de Fátima Santos Silva - Integrante / Adrian Robert Walmsley - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Luiz Roberto Nunes.

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (0)

Participação em eventos

Total de participação em eventos (0)

Organização de eventos

Total de organização de eventos (0)

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (2)

Luiz Roberto Nunes ⇔ Tiago Rodrigues (3.0)
ALENCAR, VALQUÍRIA CAMPOS ; SILVA, JULIANA DE FÁTIMA DOS SANTOS ; VILAS BOAS, RENATA OZELAMI ; FARNÉZIO, VINÍCIUS MANGANARO ; DE MARIA, YARA N. L. F. ; ACIOLE BARBOSA, DAVID ; ALMEIDA, ALEX TRAMONTIN ; DE SOUZA, EMANUEL MALTEMPI ; MÜLLER-SANTOS, MARCELO ; JABES, DANIELA L. ; MENEGIDIO, FABIANO B. ; COSTA DE OLIVEIRA, REGINA ; RODRIGUES, TIAGO ; TERSARIOL, IVARNE LUIS DOS SANTOS ; WALMSLEY, ADRIAN R. ; Nunes, Luiz R.. The Quorum Sensing Auto-Inducer 2 (AI-2) Stimulates Nitrogen Fixation and Favors Ethanol Production over Biomass Accumulation in Zymomonas mobilis. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES. v. 22, p. 5628, issn: 1422-0067, 2021.
JABES, DANIELA LEITE ; DE FREITAS OLIVEIRA, ANA CLAUDIA ; ALENCAR, VALQUÍRIA CAMPOS ; MENEGIDIO, FABIANO BEZERRA ; RENO, DÉBORA LILIANE SOUZA ; Santos, Daiene Souza ; BARBOSA, DAVID ACIOLE ; VILAS BOAS, RENATA OZELAMI ; DE OLIVEIRA RODRIGUES CUNHA, RODRIGO LUIZ ; Rodrigues, Tiago ; COSTA DE OLIVEIRA, REGINA ; Nunes, Luiz R.. Thioridazine inhibits gene expression control of the cell wall signaling pathway (CWI) in the human pathogenic fungus Paracoccidioides brasiliensis. Molecular Genetics and Genomics (Print). v. 291, p. 1347-1362, issn: 1617-4615, 2016.
OLIVEIRA, A. C. F. ; JABES, DANIELA LEITE ; ALENCAR, VALQUÍRIA CAMPOS ; MENEGIDIO, FABIANO BEZERRA ; RODRIGUES, Tiago ; COSTA DE OLIVEIRA, R. L. ; NUNES, L. R.. Thioridazine induces major transcriptional modulation in the human pathogenic fungus Paracoccidioides brasiliensis, inhibiting gene expression control of the Cell Wall Signaling Pathway. Em: 60 Congresso Brasileiro de Genética, 2014, Guarujá, SP. Anais do 60 Congresso Brasileiro de Genética, 2014.

Luiz Roberto Nunes ⇔ Rodrigo Luiz Oliveira Rodrigues Cunha (1.0)
JABES, DANIELA LEITE ; DE FREITAS OLIVEIRA, ANA CLAUDIA ; ALENCAR, VALQUÍRIA CAMPOS ; MENEGIDIO, FABIANO BEZERRA ; RENO, DÉBORA LILIANE SOUZA ; Santos, Daiene Souza ; BARBOSA, DAVID ACIOLE ; VILAS BOAS, RENATA OZELAMI ; DE OLIVEIRA RODRIGUES CUNHA, RODRIGO LUIZ ; Rodrigues, Tiago ; COSTA DE OLIVEIRA, REGINA ; Nunes, Luiz R.. Thioridazine inhibits gene expression control of the cell wall signaling pathway (CWI) in the human pathogenic fungus Paracoccidioides brasiliensis. Molecular Genetics and Genomics (Print). v. 291, p. 1347-1362, issn: 1617-4615, 2016.

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